Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1GMF5

Protein Details
Accession C1GMF5    Localization Confidence High Confidence Score 18.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
113-134AGDGRRQVRRPRHLEDRPKSKHBasic
396-420ATPKLYWPEFKRKYRKEPEMKDIQLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
117-126RRQVRRPRHL
516-524KRRAEREKR
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto 6, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002713  FF_domain  
IPR036517  FF_domain_sf  
IPR045148  TCRG1-like  
IPR001202  WW_dom  
IPR036020  WW_dom_sf  
Gene Ontology GO:0070063  F:RNA polymerase binding  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
KEGG pbn:PADG_08441  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01846  FF  
PF00397  WW  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50020  WW_DOMAIN_2  
CDD cd00201  WW  
Amino Acid Sequences MIYGQDNWALVTKMLKSTYSSLNPLPPGWTEHKAPSGHLYYYNAETKQSTYRRPPAVPAGLQPAAALPPRPAFGFPAHPQVGPAPGFGYPVPQGGGLPFNIADSFDKFRRDGAGDGRRQVRRPRHLEDRPKSKHTIPGCEPWALVKTKLGRRFVHNPDTNESFWKFPQDVLKGVIEYDRLERERKERRERGELSEEQEEDRGFKRVSLEWGRSASVANEAEGRKEEDSDEYEEVEVTDDEAEDREGEDIQSKRLRTEGENANQPGYIEFNEDDIEYQLAAMGEEYGLDPGEYGEPGEEGWEEGAEGLPLTEEDSTTLFRDLLDDFRINPYTPWEKIIEEGKIIDDARYTILPNMKSRQEAWSNWSRDRMQELKERREKEVKKDPRIRYLAFLQEHATPKLYWPEFKRKYRKEPEMKDIQLSDKDREKLYRDHIPRLKLPEATRKSDLSTLLKSTPLHALNRLSTPDMLPASILTDLRYISLPPEIRDPLIEAYISTLSPAPEPKGISTEEQMERDKRRAEREKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.22
3 0.24
4 0.27
5 0.35
6 0.36
7 0.38
8 0.37
9 0.41
10 0.42
11 0.4
12 0.38
13 0.31
14 0.33
15 0.34
16 0.35
17 0.33
18 0.35
19 0.41
20 0.4
21 0.4
22 0.41
23 0.39
24 0.37
25 0.36
26 0.35
27 0.31
28 0.36
29 0.39
30 0.33
31 0.3
32 0.3
33 0.3
34 0.35
35 0.38
36 0.42
37 0.46
38 0.54
39 0.59
40 0.6
41 0.62
42 0.62
43 0.63
44 0.57
45 0.51
46 0.49
47 0.43
48 0.41
49 0.35
50 0.27
51 0.22
52 0.21
53 0.19
54 0.13
55 0.15
56 0.16
57 0.17
58 0.17
59 0.18
60 0.2
61 0.27
62 0.27
63 0.34
64 0.35
65 0.34
66 0.34
67 0.32
68 0.33
69 0.26
70 0.24
71 0.16
72 0.14
73 0.16
74 0.15
75 0.17
76 0.13
77 0.13
78 0.13
79 0.12
80 0.12
81 0.12
82 0.14
83 0.11
84 0.11
85 0.1
86 0.1
87 0.1
88 0.11
89 0.11
90 0.13
91 0.18
92 0.19
93 0.23
94 0.22
95 0.23
96 0.26
97 0.26
98 0.27
99 0.31
100 0.38
101 0.39
102 0.45
103 0.52
104 0.52
105 0.55
106 0.6
107 0.61
108 0.61
109 0.65
110 0.66
111 0.69
112 0.75
113 0.81
114 0.82
115 0.83
116 0.8
117 0.78
118 0.75
119 0.67
120 0.65
121 0.59
122 0.59
123 0.52
124 0.53
125 0.5
126 0.47
127 0.43
128 0.37
129 0.37
130 0.29
131 0.25
132 0.22
133 0.27
134 0.33
135 0.4
136 0.44
137 0.43
138 0.48
139 0.57
140 0.6
141 0.63
142 0.61
143 0.58
144 0.56
145 0.58
146 0.51
147 0.46
148 0.4
149 0.32
150 0.26
151 0.27
152 0.23
153 0.21
154 0.27
155 0.25
156 0.25
157 0.26
158 0.26
159 0.22
160 0.22
161 0.2
162 0.14
163 0.13
164 0.13
165 0.15
166 0.16
167 0.18
168 0.21
169 0.28
170 0.38
171 0.46
172 0.54
173 0.57
174 0.61
175 0.69
176 0.7
177 0.69
178 0.66
179 0.59
180 0.53
181 0.49
182 0.44
183 0.34
184 0.32
185 0.25
186 0.19
187 0.17
188 0.17
189 0.13
190 0.13
191 0.15
192 0.16
193 0.23
194 0.27
195 0.28
196 0.27
197 0.29
198 0.28
199 0.26
200 0.25
201 0.18
202 0.17
203 0.14
204 0.12
205 0.14
206 0.14
207 0.15
208 0.15
209 0.17
210 0.13
211 0.13
212 0.13
213 0.11
214 0.13
215 0.15
216 0.15
217 0.13
218 0.13
219 0.12
220 0.12
221 0.11
222 0.08
223 0.05
224 0.05
225 0.04
226 0.04
227 0.05
228 0.05
229 0.04
230 0.04
231 0.04
232 0.05
233 0.05
234 0.1
235 0.1
236 0.13
237 0.17
238 0.17
239 0.16
240 0.18
241 0.2
242 0.17
243 0.24
244 0.28
245 0.28
246 0.34
247 0.35
248 0.33
249 0.32
250 0.3
251 0.22
252 0.16
253 0.12
254 0.08
255 0.08
256 0.08
257 0.08
258 0.08
259 0.08
260 0.07
261 0.07
262 0.05
263 0.05
264 0.05
265 0.04
266 0.04
267 0.04
268 0.03
269 0.03
270 0.03
271 0.04
272 0.03
273 0.03
274 0.03
275 0.03
276 0.04
277 0.04
278 0.04
279 0.04
280 0.04
281 0.04
282 0.04
283 0.04
284 0.04
285 0.04
286 0.04
287 0.04
288 0.03
289 0.03
290 0.04
291 0.03
292 0.03
293 0.03
294 0.03
295 0.03
296 0.04
297 0.04
298 0.03
299 0.04
300 0.05
301 0.07
302 0.08
303 0.08
304 0.07
305 0.07
306 0.09
307 0.09
308 0.1
309 0.12
310 0.12
311 0.12
312 0.15
313 0.17
314 0.16
315 0.15
316 0.19
317 0.2
318 0.2
319 0.22
320 0.2
321 0.19
322 0.22
323 0.25
324 0.2
325 0.16
326 0.16
327 0.14
328 0.15
329 0.15
330 0.12
331 0.09
332 0.09
333 0.1
334 0.1
335 0.1
336 0.11
337 0.15
338 0.18
339 0.21
340 0.25
341 0.26
342 0.27
343 0.28
344 0.31
345 0.32
346 0.32
347 0.34
348 0.39
349 0.41
350 0.41
351 0.45
352 0.4
353 0.36
354 0.41
355 0.4
356 0.35
357 0.4
358 0.46
359 0.51
360 0.58
361 0.59
362 0.58
363 0.64
364 0.64
365 0.64
366 0.67
367 0.67
368 0.7
369 0.77
370 0.76
371 0.76
372 0.77
373 0.69
374 0.63
375 0.58
376 0.56
377 0.47
378 0.43
379 0.35
380 0.34
381 0.36
382 0.32
383 0.29
384 0.21
385 0.22
386 0.3
387 0.29
388 0.3
389 0.33
390 0.44
391 0.51
392 0.61
393 0.7
394 0.7
395 0.79
396 0.84
397 0.88
398 0.88
399 0.87
400 0.85
401 0.85
402 0.78
403 0.71
404 0.63
405 0.56
406 0.52
407 0.47
408 0.44
409 0.4
410 0.41
411 0.4
412 0.42
413 0.42
414 0.41
415 0.44
416 0.49
417 0.47
418 0.55
419 0.58
420 0.6
421 0.6
422 0.61
423 0.59
424 0.54
425 0.55
426 0.55
427 0.55
428 0.56
429 0.54
430 0.49
431 0.47
432 0.45
433 0.45
434 0.4
435 0.38
436 0.35
437 0.33
438 0.35
439 0.32
440 0.31
441 0.33
442 0.32
443 0.3
444 0.31
445 0.34
446 0.34
447 0.37
448 0.37
449 0.32
450 0.29
451 0.27
452 0.28
453 0.24
454 0.21
455 0.18
456 0.15
457 0.15
458 0.16
459 0.15
460 0.11
461 0.12
462 0.12
463 0.13
464 0.14
465 0.12
466 0.12
467 0.19
468 0.2
469 0.2
470 0.26
471 0.27
472 0.27
473 0.28
474 0.29
475 0.25
476 0.24
477 0.22
478 0.16
479 0.17
480 0.17
481 0.16
482 0.14
483 0.13
484 0.12
485 0.15
486 0.18
487 0.18
488 0.21
489 0.23
490 0.23
491 0.25
492 0.27
493 0.28
494 0.28
495 0.34
496 0.34
497 0.37
498 0.41
499 0.45
500 0.47
501 0.51
502 0.55
503 0.53
504 0.59