Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1E3BJH4

Protein Details
Accession A0A1E3BJH4    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
338-365YDRHQDTKRTLKRKRAPSRDNNRQQPICHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
349-352KRKR
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 10.5, mito 5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR043502  DNA/RNA_pol_sf  
IPR032567  LDOC1-rel  
IPR021109  Peptidase_aspartic_dom_sf  
CDD cd00303  retropepsin_like  
cd01647  RT_LTR  
Amino Acid Sequences MPPRTRTNGRNSTPHEQEPLDLQQMEQPMMEPSRNSVDLGPEATTEANILAQRSADTETNPENLPDDALDAALQKLRQEETRLLKLQQWHELKNRTEAQRARLERLQEQKEQTSISECSTPFDDRSVTTGHESTPASHIDLPIRQSAWMASDDTHQNIKLPPNAVNISPFQATNLKEYESFINKLENYFLQFDYFFSLSDKNKVTSAAAHLSTELMNCWMRENKHLRIARTWDDFKQFCRRETSDPKVTQRDAAAAYHRAQQRERQNVSEFANYLDSLEDQLPERYTNDQRKMHLYAKLRPEVQRESQRSAREPESYADYISWLSHARTRFLNDETHYDRHQDTKRTLKRKRAPSRDNNRQQPICWKCHKGRHPPEECRILAAATALGIHAMQSEPSRRKRMAFSLWIETPKGPVEAFCLLDSGAESSFVQQRWAKQYLPDIDATVRQVRAINDTTVKSYGSRRLHLTVGDANGELRDQYETVESVDMLEYDIILGYPWLEHVDPDSKKLEDNLEMTSAQTCAMLALNGAPVYVLHAQPLIDGDTIGLFSASASTENTVPQEYTDFTHVFSEEEASILAPHRDHDHAIELEHGATPPLRPLYALSPKELEVVREYINTALEKGWIRPSTSPAGAPILFAPKKDGSLRLCVDYRGLNNITIKNRYPLPLVGEIMDRLSGATIYTQLDLRDAYHRLRIRKGDEWKTAFRT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.7
2 0.64
3 0.54
4 0.5
5 0.46
6 0.43
7 0.39
8 0.33
9 0.29
10 0.27
11 0.29
12 0.28
13 0.22
14 0.18
15 0.17
16 0.2
17 0.21
18 0.18
19 0.19
20 0.25
21 0.26
22 0.26
23 0.23
24 0.25
25 0.26
26 0.27
27 0.24
28 0.18
29 0.18
30 0.17
31 0.16
32 0.12
33 0.1
34 0.11
35 0.11
36 0.12
37 0.11
38 0.11
39 0.11
40 0.13
41 0.16
42 0.15
43 0.15
44 0.19
45 0.21
46 0.24
47 0.24
48 0.23
49 0.21
50 0.2
51 0.2
52 0.15
53 0.13
54 0.1
55 0.1
56 0.1
57 0.09
58 0.1
59 0.11
60 0.12
61 0.11
62 0.14
63 0.16
64 0.19
65 0.23
66 0.3
67 0.35
68 0.43
69 0.46
70 0.45
71 0.47
72 0.51
73 0.51
74 0.53
75 0.51
76 0.48
77 0.53
78 0.6
79 0.58
80 0.59
81 0.62
82 0.57
83 0.6
84 0.58
85 0.56
86 0.58
87 0.59
88 0.58
89 0.53
90 0.54
91 0.52
92 0.57
93 0.56
94 0.53
95 0.54
96 0.51
97 0.49
98 0.45
99 0.39
100 0.34
101 0.3
102 0.25
103 0.25
104 0.22
105 0.23
106 0.25
107 0.26
108 0.22
109 0.23
110 0.22
111 0.18
112 0.2
113 0.2
114 0.18
115 0.19
116 0.19
117 0.18
118 0.21
119 0.21
120 0.2
121 0.21
122 0.2
123 0.19
124 0.2
125 0.21
126 0.2
127 0.22
128 0.23
129 0.23
130 0.23
131 0.2
132 0.19
133 0.18
134 0.17
135 0.15
136 0.14
137 0.12
138 0.15
139 0.18
140 0.2
141 0.21
142 0.19
143 0.2
144 0.22
145 0.26
146 0.26
147 0.26
148 0.26
149 0.3
150 0.31
151 0.3
152 0.29
153 0.26
154 0.24
155 0.23
156 0.2
157 0.17
158 0.2
159 0.2
160 0.21
161 0.21
162 0.19
163 0.19
164 0.21
165 0.24
166 0.24
167 0.24
168 0.22
169 0.25
170 0.24
171 0.24
172 0.25
173 0.2
174 0.19
175 0.2
176 0.19
177 0.16
178 0.16
179 0.16
180 0.18
181 0.17
182 0.14
183 0.13
184 0.17
185 0.17
186 0.22
187 0.24
188 0.21
189 0.21
190 0.22
191 0.21
192 0.19
193 0.22
194 0.21
195 0.2
196 0.19
197 0.18
198 0.18
199 0.17
200 0.15
201 0.11
202 0.09
203 0.1
204 0.1
205 0.13
206 0.16
207 0.17
208 0.26
209 0.32
210 0.33
211 0.42
212 0.45
213 0.44
214 0.46
215 0.5
216 0.48
217 0.49
218 0.47
219 0.42
220 0.45
221 0.44
222 0.42
223 0.47
224 0.43
225 0.39
226 0.43
227 0.43
228 0.45
229 0.53
230 0.57
231 0.56
232 0.59
233 0.62
234 0.61
235 0.58
236 0.52
237 0.43
238 0.38
239 0.3
240 0.26
241 0.23
242 0.2
243 0.21
244 0.25
245 0.27
246 0.27
247 0.27
248 0.33
249 0.38
250 0.46
251 0.47
252 0.44
253 0.45
254 0.46
255 0.48
256 0.42
257 0.34
258 0.25
259 0.24
260 0.19
261 0.16
262 0.13
263 0.1
264 0.09
265 0.09
266 0.08
267 0.08
268 0.09
269 0.1
270 0.1
271 0.11
272 0.14
273 0.21
274 0.29
275 0.36
276 0.38
277 0.39
278 0.43
279 0.47
280 0.46
281 0.45
282 0.42
283 0.41
284 0.44
285 0.47
286 0.45
287 0.43
288 0.44
289 0.42
290 0.45
291 0.48
292 0.45
293 0.46
294 0.48
295 0.48
296 0.46
297 0.45
298 0.41
299 0.34
300 0.31
301 0.27
302 0.28
303 0.25
304 0.22
305 0.18
306 0.16
307 0.14
308 0.12
309 0.12
310 0.07
311 0.07
312 0.11
313 0.11
314 0.13
315 0.14
316 0.16
317 0.18
318 0.19
319 0.22
320 0.2
321 0.25
322 0.28
323 0.29
324 0.27
325 0.27
326 0.25
327 0.29
328 0.32
329 0.31
330 0.31
331 0.39
332 0.46
333 0.54
334 0.59
335 0.63
336 0.67
337 0.74
338 0.8
339 0.8
340 0.82
341 0.83
342 0.87
343 0.88
344 0.89
345 0.86
346 0.82
347 0.73
348 0.64
349 0.63
350 0.58
351 0.54
352 0.5
353 0.47
354 0.46
355 0.54
356 0.62
357 0.63
358 0.67
359 0.71
360 0.74
361 0.75
362 0.75
363 0.72
364 0.64
365 0.54
366 0.44
367 0.34
368 0.25
369 0.19
370 0.12
371 0.06
372 0.06
373 0.04
374 0.03
375 0.03
376 0.03
377 0.03
378 0.03
379 0.04
380 0.05
381 0.11
382 0.18
383 0.23
384 0.28
385 0.29
386 0.32
387 0.35
388 0.4
389 0.41
390 0.41
391 0.39
392 0.4
393 0.41
394 0.4
395 0.37
396 0.31
397 0.26
398 0.19
399 0.17
400 0.11
401 0.09
402 0.11
403 0.12
404 0.13
405 0.12
406 0.11
407 0.1
408 0.1
409 0.1
410 0.08
411 0.06
412 0.06
413 0.06
414 0.07
415 0.11
416 0.11
417 0.14
418 0.15
419 0.19
420 0.24
421 0.27
422 0.26
423 0.25
424 0.32
425 0.32
426 0.33
427 0.29
428 0.24
429 0.22
430 0.23
431 0.23
432 0.2
433 0.15
434 0.14
435 0.16
436 0.15
437 0.19
438 0.2
439 0.19
440 0.2
441 0.21
442 0.22
443 0.2
444 0.2
445 0.17
446 0.18
447 0.25
448 0.26
449 0.27
450 0.29
451 0.31
452 0.32
453 0.3
454 0.3
455 0.25
456 0.22
457 0.2
458 0.17
459 0.14
460 0.13
461 0.12
462 0.09
463 0.07
464 0.06
465 0.05
466 0.06
467 0.07
468 0.08
469 0.08
470 0.09
471 0.08
472 0.08
473 0.08
474 0.07
475 0.06
476 0.06
477 0.05
478 0.04
479 0.04
480 0.03
481 0.03
482 0.03
483 0.03
484 0.03
485 0.03
486 0.05
487 0.05
488 0.05
489 0.08
490 0.17
491 0.17
492 0.2
493 0.23
494 0.21
495 0.22
496 0.24
497 0.24
498 0.19
499 0.2
500 0.19
501 0.18
502 0.18
503 0.18
504 0.17
505 0.14
506 0.11
507 0.09
508 0.07
509 0.06
510 0.06
511 0.05
512 0.05
513 0.05
514 0.06
515 0.06
516 0.06
517 0.05
518 0.05
519 0.09
520 0.11
521 0.1
522 0.09
523 0.1
524 0.11
525 0.11
526 0.12
527 0.1
528 0.08
529 0.08
530 0.07
531 0.07
532 0.07
533 0.07
534 0.06
535 0.04
536 0.03
537 0.04
538 0.05
539 0.05
540 0.06
541 0.07
542 0.08
543 0.09
544 0.11
545 0.11
546 0.11
547 0.11
548 0.12
549 0.12
550 0.13
551 0.16
552 0.16
553 0.15
554 0.17
555 0.17
556 0.15
557 0.14
558 0.15
559 0.11
560 0.11
561 0.1
562 0.08
563 0.09
564 0.1
565 0.11
566 0.09
567 0.1
568 0.13
569 0.15
570 0.16
571 0.17
572 0.21
573 0.2
574 0.21
575 0.22
576 0.19
577 0.18
578 0.17
579 0.15
580 0.11
581 0.1
582 0.1
583 0.13
584 0.13
585 0.13
586 0.12
587 0.15
588 0.23
589 0.32
590 0.33
591 0.32
592 0.33
593 0.33
594 0.37
595 0.35
596 0.28
597 0.22
598 0.23
599 0.22
600 0.2
601 0.21
602 0.18
603 0.2
604 0.19
605 0.16
606 0.14
607 0.16
608 0.17
609 0.19
610 0.26
611 0.25
612 0.28
613 0.29
614 0.33
615 0.36
616 0.36
617 0.34
618 0.28
619 0.31
620 0.28
621 0.27
622 0.24
623 0.27
624 0.26
625 0.26
626 0.29
627 0.25
628 0.29
629 0.31
630 0.36
631 0.3
632 0.38
633 0.4
634 0.4
635 0.41
636 0.37
637 0.37
638 0.35
639 0.34
640 0.32
641 0.31
642 0.29
643 0.32
644 0.38
645 0.41
646 0.42
647 0.43
648 0.4
649 0.42
650 0.41
651 0.39
652 0.36
653 0.36
654 0.35
655 0.34
656 0.31
657 0.3
658 0.28
659 0.25
660 0.22
661 0.16
662 0.11
663 0.1
664 0.09
665 0.07
666 0.08
667 0.09
668 0.1
669 0.12
670 0.13
671 0.13
672 0.14
673 0.15
674 0.16
675 0.19
676 0.21
677 0.23
678 0.3
679 0.36
680 0.4
681 0.48
682 0.54
683 0.55
684 0.61
685 0.68
686 0.69
687 0.73
688 0.74