Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1E3BJA5

Protein Details
Accession A0A1E3BJA5    Localization Confidence Low Confidence Score 6.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
402-436NLECSCRRPKSPHHFYYCRKGRKASPQPWGSRQVDHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) extr 21, nucl 3, mito 1, cyto 1, plas 1, cyto_mito 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR046936  BIM1-like  
IPR046530  BIM1-like_dom  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR002156  RNaseH_domain  
IPR036397  RNaseH_sf  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0004523  F:RNA-DNA hybrid ribonuclease activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF20238  DUF6595  
PF00075  RNase_H  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50879  RNASE_H_1  
CDD cd21176  LPMO_auxiliary-like  
cd09276  Rnase_HI_RT_non_LTR  
Amino Acid Sequences MKLSILSLAALTPLVAAHFKLDYPTPRGENEDIMTTFPCGGLAQSSERTKVSISDGSFPVVVTMGHMQTAFEVLLSLGNDPGTNFNVTLVPAFGARGLGSLCIPHVAFDEDTLGINITDGMNATVQVQSNGDPTGGLYACADIEFSSSTEYSKPSSCKNNTNVAAAPFTGEAAQRNANESTANGGVQSGGSSTSDSDSASTSTGGAVALQTAAWGMLGAAVVGGLKAALNSAQAPYTQHLYVLLDNQEVARQLQGCPRGSSQHTILDFQELTNNWPNRPLRCQAIPPGRVHVHWIPGHAGITGNEQADEQAKRGTMSTSQTNSSPARYAWALRTLKEEFWRRFQLYWTENAPQQYRDLSISLDKRPHELSLPRATLGRLLAARSGHGDFAQYHERFRHEDANLECSCRRPKSPHHFYYCRKGRKASPQPWGSRQVDEILRSKSGTRDFHEWLQESHFYSSICPAH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.07
2 0.07
3 0.07
4 0.09
5 0.1
6 0.1
7 0.13
8 0.18
9 0.22
10 0.27
11 0.33
12 0.33
13 0.35
14 0.4
15 0.4
16 0.39
17 0.35
18 0.36
19 0.3
20 0.29
21 0.28
22 0.23
23 0.21
24 0.16
25 0.15
26 0.09
27 0.09
28 0.09
29 0.11
30 0.14
31 0.2
32 0.23
33 0.25
34 0.26
35 0.26
36 0.25
37 0.24
38 0.26
39 0.25
40 0.25
41 0.28
42 0.29
43 0.3
44 0.29
45 0.26
46 0.21
47 0.16
48 0.14
49 0.1
50 0.12
51 0.11
52 0.12
53 0.12
54 0.11
55 0.11
56 0.12
57 0.1
58 0.06
59 0.06
60 0.06
61 0.08
62 0.08
63 0.08
64 0.07
65 0.08
66 0.08
67 0.08
68 0.11
69 0.11
70 0.12
71 0.11
72 0.12
73 0.13
74 0.13
75 0.13
76 0.11
77 0.09
78 0.08
79 0.08
80 0.07
81 0.07
82 0.07
83 0.07
84 0.07
85 0.07
86 0.07
87 0.07
88 0.07
89 0.08
90 0.08
91 0.08
92 0.09
93 0.11
94 0.11
95 0.11
96 0.13
97 0.11
98 0.12
99 0.11
100 0.1
101 0.08
102 0.08
103 0.08
104 0.06
105 0.05
106 0.05
107 0.06
108 0.05
109 0.06
110 0.07
111 0.08
112 0.08
113 0.09
114 0.09
115 0.09
116 0.11
117 0.11
118 0.1
119 0.08
120 0.07
121 0.11
122 0.1
123 0.09
124 0.08
125 0.08
126 0.08
127 0.08
128 0.08
129 0.04
130 0.05
131 0.06
132 0.06
133 0.08
134 0.08
135 0.09
136 0.1
137 0.11
138 0.12
139 0.16
140 0.18
141 0.21
142 0.31
143 0.35
144 0.42
145 0.45
146 0.52
147 0.5
148 0.51
149 0.47
150 0.39
151 0.36
152 0.27
153 0.24
154 0.14
155 0.13
156 0.1
157 0.09
158 0.08
159 0.1
160 0.13
161 0.12
162 0.15
163 0.15
164 0.15
165 0.14
166 0.13
167 0.14
168 0.11
169 0.11
170 0.08
171 0.08
172 0.07
173 0.07
174 0.07
175 0.04
176 0.04
177 0.04
178 0.05
179 0.05
180 0.06
181 0.06
182 0.06
183 0.06
184 0.07
185 0.07
186 0.07
187 0.07
188 0.06
189 0.06
190 0.06
191 0.05
192 0.05
193 0.04
194 0.03
195 0.03
196 0.03
197 0.03
198 0.03
199 0.03
200 0.02
201 0.02
202 0.02
203 0.02
204 0.02
205 0.02
206 0.02
207 0.02
208 0.02
209 0.02
210 0.02
211 0.02
212 0.02
213 0.02
214 0.02
215 0.02
216 0.03
217 0.04
218 0.04
219 0.05
220 0.05
221 0.06
222 0.07
223 0.1
224 0.09
225 0.09
226 0.09
227 0.1
228 0.1
229 0.11
230 0.11
231 0.08
232 0.08
233 0.09
234 0.09
235 0.08
236 0.08
237 0.07
238 0.07
239 0.08
240 0.12
241 0.17
242 0.18
243 0.19
244 0.2
245 0.23
246 0.24
247 0.26
248 0.24
249 0.25
250 0.24
251 0.24
252 0.23
253 0.22
254 0.2
255 0.17
256 0.18
257 0.13
258 0.16
259 0.22
260 0.23
261 0.2
262 0.27
263 0.29
264 0.29
265 0.33
266 0.33
267 0.3
268 0.32
269 0.34
270 0.37
271 0.43
272 0.44
273 0.41
274 0.44
275 0.4
276 0.37
277 0.4
278 0.33
279 0.3
280 0.27
281 0.27
282 0.23
283 0.22
284 0.22
285 0.17
286 0.16
287 0.1
288 0.13
289 0.13
290 0.12
291 0.11
292 0.11
293 0.11
294 0.14
295 0.14
296 0.12
297 0.11
298 0.11
299 0.12
300 0.12
301 0.13
302 0.13
303 0.16
304 0.21
305 0.22
306 0.23
307 0.24
308 0.27
309 0.27
310 0.26
311 0.24
312 0.17
313 0.18
314 0.18
315 0.2
316 0.18
317 0.27
318 0.26
319 0.25
320 0.31
321 0.3
322 0.32
323 0.37
324 0.43
325 0.37
326 0.43
327 0.49
328 0.46
329 0.45
330 0.46
331 0.46
332 0.4
333 0.41
334 0.38
335 0.35
336 0.35
337 0.38
338 0.37
339 0.29
340 0.28
341 0.25
342 0.23
343 0.21
344 0.19
345 0.17
346 0.22
347 0.25
348 0.28
349 0.32
350 0.31
351 0.32
352 0.33
353 0.33
354 0.32
355 0.32
356 0.34
357 0.38
358 0.39
359 0.37
360 0.36
361 0.35
362 0.31
363 0.28
364 0.25
365 0.17
366 0.16
367 0.18
368 0.17
369 0.18
370 0.18
371 0.19
372 0.15
373 0.14
374 0.15
375 0.13
376 0.17
377 0.26
378 0.23
379 0.25
380 0.27
381 0.3
382 0.32
383 0.36
384 0.39
385 0.31
386 0.38
387 0.37
388 0.42
389 0.4
390 0.41
391 0.37
392 0.34
393 0.41
394 0.39
395 0.42
396 0.42
397 0.52
398 0.59
399 0.7
400 0.74
401 0.76
402 0.81
403 0.82
404 0.85
405 0.85
406 0.83
407 0.78
408 0.75
409 0.74
410 0.76
411 0.8
412 0.78
413 0.78
414 0.78
415 0.8
416 0.8
417 0.81
418 0.72
419 0.64
420 0.57
421 0.53
422 0.48
423 0.45
424 0.44
425 0.39
426 0.37
427 0.36
428 0.36
429 0.35
430 0.39
431 0.4
432 0.4
433 0.43
434 0.46
435 0.52
436 0.58
437 0.53
438 0.47
439 0.47
440 0.46
441 0.42
442 0.39
443 0.35
444 0.27
445 0.26