Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A1E3BQR4

Protein Details
Accession A0A1E3BQR4    Localization Confidence High Confidence Score 16.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
138-159DESEKWDKRMNKKQRHRDDVAFBasic
245-268DLKKAEEVRLKKRRDRRGDDEADVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
253-260RLKKRRDR
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 12.5, cyto 1.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013260  mRNA_splic_SYF2  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF08231  SYF2  
Amino Acid Sequences MPPKRETDDSTATPADSEQAPESLPIGGEDDASKETNSKKPAEGGSADATAEKEEDDAAAKARQRQERFKALQARAKSGAERNLKETAAETQRLATDPALMSNLSRKHAFASHNLLKADTEASGEDFERKRAWDWTVDESEKWDKRMNKKQRHRDDVAFQDYTQDARKVYKRQMRELNPNLEAYEREKMAAIEKAASNGDLEIVETNDGEMIAIDKNGSFYSTADSVGFTESKPDRAAVDKLVGDLKKAEEVRLKKRRDRRGDDEADVTYINEKNKQFNMKLSRFYNKYTTEIRDSFERGTMI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.25
3 0.18
4 0.18
5 0.14
6 0.14
7 0.14
8 0.14
9 0.15
10 0.13
11 0.12
12 0.1
13 0.1
14 0.1
15 0.1
16 0.1
17 0.11
18 0.13
19 0.14
20 0.14
21 0.15
22 0.19
23 0.25
24 0.29
25 0.3
26 0.3
27 0.35
28 0.37
29 0.38
30 0.35
31 0.33
32 0.31
33 0.29
34 0.27
35 0.22
36 0.2
37 0.15
38 0.14
39 0.1
40 0.07
41 0.06
42 0.07
43 0.08
44 0.08
45 0.1
46 0.13
47 0.16
48 0.21
49 0.29
50 0.37
51 0.41
52 0.5
53 0.55
54 0.62
55 0.64
56 0.66
57 0.68
58 0.66
59 0.67
60 0.6
61 0.58
62 0.51
63 0.49
64 0.44
65 0.39
66 0.41
67 0.42
68 0.41
69 0.39
70 0.39
71 0.37
72 0.34
73 0.31
74 0.29
75 0.26
76 0.25
77 0.22
78 0.2
79 0.21
80 0.21
81 0.21
82 0.15
83 0.13
84 0.11
85 0.12
86 0.12
87 0.1
88 0.1
89 0.14
90 0.17
91 0.16
92 0.17
93 0.16
94 0.18
95 0.22
96 0.24
97 0.23
98 0.3
99 0.33
100 0.36
101 0.36
102 0.34
103 0.3
104 0.28
105 0.24
106 0.15
107 0.1
108 0.07
109 0.07
110 0.08
111 0.08
112 0.12
113 0.12
114 0.13
115 0.13
116 0.14
117 0.15
118 0.17
119 0.18
120 0.18
121 0.21
122 0.24
123 0.28
124 0.28
125 0.26
126 0.27
127 0.32
128 0.28
129 0.28
130 0.28
131 0.29
132 0.38
133 0.48
134 0.56
135 0.6
136 0.69
137 0.77
138 0.82
139 0.85
140 0.8
141 0.74
142 0.7
143 0.66
144 0.61
145 0.51
146 0.4
147 0.34
148 0.29
149 0.26
150 0.21
151 0.15
152 0.11
153 0.14
154 0.2
155 0.23
156 0.31
157 0.36
158 0.38
159 0.45
160 0.54
161 0.56
162 0.62
163 0.63
164 0.6
165 0.56
166 0.52
167 0.44
168 0.36
169 0.3
170 0.23
171 0.19
172 0.14
173 0.13
174 0.13
175 0.13
176 0.14
177 0.15
178 0.13
179 0.12
180 0.12
181 0.13
182 0.13
183 0.13
184 0.11
185 0.08
186 0.09
187 0.06
188 0.06
189 0.05
190 0.06
191 0.06
192 0.05
193 0.05
194 0.05
195 0.05
196 0.04
197 0.04
198 0.04
199 0.04
200 0.05
201 0.05
202 0.05
203 0.06
204 0.06
205 0.07
206 0.06
207 0.06
208 0.1
209 0.11
210 0.11
211 0.1
212 0.11
213 0.11
214 0.12
215 0.12
216 0.09
217 0.15
218 0.16
219 0.18
220 0.18
221 0.18
222 0.18
223 0.21
224 0.24
225 0.19
226 0.23
227 0.2
228 0.21
229 0.26
230 0.24
231 0.21
232 0.21
233 0.19
234 0.22
235 0.22
236 0.24
237 0.27
238 0.34
239 0.44
240 0.52
241 0.58
242 0.61
243 0.7
244 0.77
245 0.8
246 0.83
247 0.8
248 0.82
249 0.81
250 0.76
251 0.7
252 0.6
253 0.5
254 0.41
255 0.33
256 0.26
257 0.22
258 0.21
259 0.24
260 0.24
261 0.29
262 0.35
263 0.43
264 0.42
265 0.48
266 0.56
267 0.55
268 0.62
269 0.61
270 0.65
271 0.6
272 0.62
273 0.61
274 0.54
275 0.54
276 0.52
277 0.53
278 0.51
279 0.5
280 0.49
281 0.46
282 0.46
283 0.43