FuNGI

A0A1E3B0J0

Protein Details

Accession

A0A1E3B0J0

Localization Confidence

High

Confidence Score

21.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
17-39	ATQKNAPAKKAPKPPAPRLKLLV	Hydrophilic
337-356	TEPSKKETAKPPKQPKGKAS	Hydrophilic
521-541	GSSRGRGGRGRNRGGNKPEKE	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
23-37	PAKKAPKPPAPRLKL
197-273	KKANKAKEQTAAKSSRKSEKEAKPEKVQAKKLLQRPDRETAPVTEKTEKKSKSDKATKEAVKAANKAANVAAKQSGR
285-299	PASERKRERGNAAAA
312-354	SGGRRKGGKGGSEADAKKENVPSTPTEPSKKETAKPPKQPKGK
383-390	KPPKPSKG
481-486	KPRKGR
511-543	GGKPEGSSGGGSSRGRGGRGRNRGGNKPEKERA

Subcellular Location(s)

nucl 14.5, mito 11, cyto_nucl 8.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR000504 RRM_dom IPR039722 Upf3 IPR005120 UPF3_dom
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding GO:0000184 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
Pfam	View protein in Pfam PF00076 RRM_1 PF03467 Smg4_UPF3
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM
CDD	cd12455 RRM_like_Smg4_UPF3 cd00590 RRM_SF

Amino Acid Sequences

MTQIKSTGGVLPIPAAATQKNAPAKKAPKPPAPRLKLLVRRLPPGLTEEEFRNAVGEEWMVGAGKVDWFQYRPGKVSKDPAKPSRPSRAYIHVISSDHIAPLADKVRQSSFLDAQNTASDPVLLGPPSVEFAPYAKIPGNRVRKDARQGTIDQDPDFFAFLESLTQPITKPSAESTEPEEKKETMTTTPLVQYIKDKKANKAKEQTAAKSSRKSEKEAKPEKVQAKKLLQRPDRETAPVTEKTEKKSKSDKATKEAVKAANKAANVAAKQSGRATPTGKETPTAPASERKRERGNAAAAAKILQRDLGLSSSGGRRKGGKGGSEADAKKENVPSTPTEPSKKETAKPPKQPKGKASETTPQPSEPSTPQPQPTPPPSAPAASKPPKPSKGKQPAASPSATATQAFLKHANPSQGVTEPLLETAFSPFGQVVSVEIDKKKGFGYVDFAEPSGLQKAIAASPVTVAQSQVVVLERKTNPGGDKPRKGRGGGAVGGEQAVANSGNGNNNGSARGGKPEGSSGGGSSRGRGGRGRNRGGNKPEKERA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.15
2	0.13
3	0.12
4	0.16
5	0.17
6	0.24
7	0.32
8	0.33
9	0.36
10	0.43
11	0.51
12	0.56
13	0.65
14	0.67
15	0.68
16	0.76
17	0.83
18	0.84
19	0.83
20	0.8
21	0.77
22	0.78
23	0.77
24	0.76
25	0.75
26	0.69
27	0.68
28	0.63
29	0.58
30	0.49
31	0.44
32	0.41
33	0.33
34	0.31
35	0.29
36	0.3
37	0.29
38	0.27
39	0.24
40	0.19
41	0.17
42	0.15
43	0.12
44	0.08
45	0.09
46	0.09
47	0.08
48	0.07
49	0.07
50	0.07
51	0.08
52	0.08
53	0.09
54	0.11
55	0.12
56	0.19
57	0.26
58	0.28
59	0.32
60	0.37
61	0.41
62	0.44
63	0.53
64	0.56
65	0.58
66	0.65
67	0.69
68	0.72
69	0.74
70	0.77
71	0.78
72	0.72
73	0.67
74	0.63
75	0.62
76	0.6
77	0.55
78	0.52
79	0.45
80	0.42
81	0.38
82	0.35
83	0.27
84	0.21
85	0.19
86	0.14
87	0.1
88	0.14
89	0.16
90	0.15
91	0.15
92	0.18
93	0.2
94	0.24
95	0.26
96	0.27
97	0.28
98	0.32
99	0.34
100	0.31
101	0.31
102	0.28
103	0.27
104	0.23
105	0.18
106	0.12
107	0.1
108	0.1
109	0.11
110	0.09
111	0.08
112	0.07
113	0.07
114	0.09
115	0.09
116	0.08
117	0.07
118	0.07
119	0.1
120	0.1
121	0.12
122	0.14
123	0.16
124	0.21
125	0.3
126	0.39
127	0.39
128	0.44
129	0.49
130	0.51
131	0.59
132	0.61
133	0.56
134	0.5
135	0.49
136	0.48
137	0.48
138	0.44
139	0.35
140	0.28
141	0.25
142	0.21
143	0.2
144	0.16
145	0.1
146	0.08
147	0.07
148	0.08
149	0.08
150	0.08
151	0.08
152	0.08
153	0.08
154	0.1
155	0.12
156	0.1
157	0.11
158	0.12
159	0.16
160	0.16
161	0.18
162	0.23
163	0.31
164	0.32
165	0.33
166	0.34
167	0.3
168	0.3
169	0.3
170	0.26
171	0.17
172	0.19
173	0.18
174	0.18
175	0.19
176	0.2
177	0.18
178	0.17
179	0.22
180	0.27
181	0.34
182	0.39
183	0.41
184	0.46
185	0.56
186	0.63
187	0.64
188	0.65
189	0.62
190	0.63
191	0.65
192	0.61
193	0.59
194	0.59
195	0.54
196	0.5
197	0.51
198	0.51
199	0.49
200	0.51
201	0.53
202	0.54
203	0.61
204	0.64
205	0.65
206	0.63
207	0.68
208	0.7
209	0.67
210	0.64
211	0.61
212	0.6
213	0.62
214	0.62
215	0.64
216	0.62
217	0.61
218	0.61
219	0.59
220	0.52
221	0.47
222	0.42
223	0.36
224	0.36
225	0.32
226	0.3
227	0.32
228	0.32
229	0.34
230	0.41
231	0.39
232	0.39
233	0.44
234	0.48
235	0.51
236	0.59
237	0.59
238	0.56
239	0.63
240	0.61
241	0.55
242	0.54
243	0.48
244	0.42
245	0.39
246	0.36
247	0.3
248	0.27
249	0.25
250	0.21
251	0.18
252	0.15
253	0.14
254	0.15
255	0.12
256	0.13
257	0.14
258	0.15
259	0.13
260	0.15
261	0.16
262	0.14
263	0.19
264	0.22
265	0.21
266	0.2
267	0.19
268	0.22
269	0.21
270	0.21
271	0.17
272	0.22
273	0.26
274	0.35
275	0.37
276	0.38
277	0.41
278	0.42
279	0.44
280	0.42
281	0.41
282	0.37
283	0.35
284	0.31
285	0.26
286	0.25
287	0.22
288	0.17
289	0.14
290	0.08
291	0.07
292	0.07
293	0.07
294	0.07
295	0.07
296	0.06
297	0.08
298	0.13
299	0.15
300	0.16
301	0.16
302	0.18
303	0.19
304	0.25
305	0.26
306	0.24
307	0.25
308	0.27
309	0.29
310	0.33
311	0.32
312	0.29
313	0.3
314	0.28
315	0.27
316	0.27
317	0.24
318	0.19
319	0.21
320	0.22
321	0.22
322	0.28
323	0.29
324	0.31
325	0.32
326	0.34
327	0.4
328	0.4
329	0.4
330	0.44
331	0.52
332	0.57
333	0.65
334	0.73
335	0.75
336	0.8
337	0.82
338	0.78
339	0.76
340	0.73
341	0.67
342	0.61
343	0.6
344	0.57
345	0.56
346	0.51
347	0.43
348	0.37
349	0.34
350	0.32
351	0.27
352	0.28
353	0.29
354	0.31
355	0.33
356	0.35
357	0.38
358	0.4
359	0.42
360	0.43
361	0.37
362	0.37
363	0.36
364	0.36
365	0.34
366	0.32
367	0.37
368	0.35
369	0.4
370	0.45
371	0.52
372	0.58
373	0.64
374	0.66
375	0.67
376	0.73
377	0.76
378	0.73
379	0.73
380	0.71
381	0.67
382	0.61
383	0.5
384	0.41
385	0.36
386	0.31
387	0.23
388	0.17
389	0.16
390	0.17
391	0.18
392	0.18
393	0.16
394	0.2
395	0.23
396	0.26
397	0.23
398	0.23
399	0.23
400	0.23
401	0.24
402	0.2
403	0.19
404	0.15
405	0.14
406	0.13
407	0.11
408	0.1
409	0.1
410	0.1
411	0.09
412	0.09
413	0.08
414	0.08
415	0.09
416	0.08
417	0.07
418	0.1
419	0.12
420	0.14
421	0.15
422	0.19
423	0.19
424	0.2
425	0.19
426	0.19
427	0.18
428	0.16
429	0.22
430	0.21
431	0.25
432	0.25
433	0.24
434	0.22
435	0.2
436	0.21
437	0.17
438	0.14
439	0.1
440	0.1
441	0.12
442	0.12
443	0.14
444	0.13
445	0.11
446	0.12
447	0.13
448	0.14
449	0.12
450	0.12
451	0.1
452	0.1
453	0.1
454	0.1
455	0.12
456	0.12
457	0.12
458	0.2
459	0.2
460	0.25
461	0.26
462	0.28
463	0.29
464	0.36
465	0.47
466	0.49
467	0.59
468	0.61
469	0.69
470	0.7
471	0.68
472	0.64
473	0.6
474	0.57
475	0.5
476	0.46
477	0.38
478	0.33
479	0.32
480	0.27
481	0.19
482	0.11
483	0.09
484	0.07
485	0.06
486	0.07
487	0.09
488	0.13
489	0.14
490	0.16
491	0.17
492	0.17
493	0.18
494	0.18
495	0.19
496	0.16
497	0.21
498	0.22
499	0.22
500	0.23
501	0.25
502	0.26
503	0.26
504	0.26
505	0.2
506	0.21
507	0.25
508	0.24
509	0.22
510	0.27
511	0.26
512	0.28
513	0.32
514	0.39
515	0.44
516	0.54
517	0.61
518	0.63
519	0.68
520	0.75
521	0.8
522	0.81
523	0.79

A0A1E3B0J0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer