Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1C1CVG0

Protein Details
Accession A0A1C1CVG0    Localization Confidence High Confidence Score 15.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
116-142GEEPAAKKKRKDKERKRPSRRADSEALBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
107-141KVNKRKRAEGEEPAAKKKRKDKERKRPSRRADSEA
144-158GANGVDGKKPRKSRA
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 13, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035441  TFIIS/LEDGF_dom_sf  
IPR017923  TFIIS_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF08711  Med26  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51319  TFIIS_N  
Amino Acid Sequences MADDELQSAAAPNLDSDGYPEEGPPPDAEGLDRPDEHEDKLDDLNDQFDDPDKEREPDTRPDGPENDLAADSDDESLLSEVDEAQFADFDPGAVEVAPDFDALKSIKVNKRKRAEGEEPAAKKKRKDKERKRPSRRADSEALSGANGVDGKKPRKSRATGEPRQRVEINEDDLSPEERRRRALDRAMDAAVKRTQGKRMRKGDGIDLEQAADAEIEDLRNRMITAAETDGELVRQGQPAAQKLKMLPEVVSLLNRNTYVQSILDPEMNLLEAVRFFLEPLTDGSLPAYNIQRELFAALAKLPMNKDALISSGIGKVILFYRKSKKAEPAIKRQATKLMEEWSRPILGKTDDHTKKYVATAQYDPYKVRDVASQRPLAVPKAKINRAPGERESNRARINHVPTTYTIAPKSHVIAHRSGPS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.09
3 0.11
4 0.14
5 0.15
6 0.15
7 0.16
8 0.17
9 0.18
10 0.2
11 0.18
12 0.18
13 0.17
14 0.17
15 0.18
16 0.19
17 0.22
18 0.25
19 0.24
20 0.23
21 0.29
22 0.3
23 0.3
24 0.3
25 0.27
26 0.26
27 0.28
28 0.27
29 0.22
30 0.21
31 0.22
32 0.18
33 0.17
34 0.14
35 0.16
36 0.2
37 0.2
38 0.26
39 0.26
40 0.28
41 0.29
42 0.34
43 0.36
44 0.39
45 0.44
46 0.45
47 0.46
48 0.49
49 0.5
50 0.48
51 0.47
52 0.4
53 0.34
54 0.27
55 0.24
56 0.2
57 0.18
58 0.15
59 0.11
60 0.1
61 0.08
62 0.08
63 0.08
64 0.07
65 0.06
66 0.05
67 0.05
68 0.06
69 0.07
70 0.06
71 0.06
72 0.06
73 0.06
74 0.08
75 0.07
76 0.07
77 0.07
78 0.07
79 0.07
80 0.07
81 0.06
82 0.04
83 0.06
84 0.06
85 0.06
86 0.06
87 0.06
88 0.08
89 0.09
90 0.1
91 0.12
92 0.2
93 0.27
94 0.36
95 0.46
96 0.53
97 0.6
98 0.66
99 0.7
100 0.71
101 0.71
102 0.7
103 0.69
104 0.68
105 0.64
106 0.65
107 0.67
108 0.61
109 0.6
110 0.6
111 0.62
112 0.65
113 0.73
114 0.76
115 0.79
116 0.87
117 0.93
118 0.95
119 0.95
120 0.94
121 0.94
122 0.88
123 0.83
124 0.78
125 0.69
126 0.62
127 0.52
128 0.43
129 0.31
130 0.25
131 0.18
132 0.13
133 0.1
134 0.08
135 0.1
136 0.16
137 0.2
138 0.26
139 0.31
140 0.37
141 0.44
142 0.48
143 0.5
144 0.56
145 0.63
146 0.65
147 0.7
148 0.73
149 0.67
150 0.67
151 0.61
152 0.51
153 0.45
154 0.4
155 0.33
156 0.25
157 0.24
158 0.2
159 0.2
160 0.21
161 0.17
162 0.18
163 0.19
164 0.2
165 0.22
166 0.25
167 0.29
168 0.33
169 0.39
170 0.41
171 0.39
172 0.4
173 0.39
174 0.36
175 0.32
176 0.29
177 0.23
178 0.19
179 0.19
180 0.18
181 0.25
182 0.32
183 0.41
184 0.48
185 0.54
186 0.57
187 0.57
188 0.57
189 0.55
190 0.5
191 0.43
192 0.35
193 0.28
194 0.23
195 0.2
196 0.18
197 0.12
198 0.07
199 0.04
200 0.03
201 0.03
202 0.04
203 0.04
204 0.04
205 0.04
206 0.04
207 0.04
208 0.04
209 0.05
210 0.05
211 0.06
212 0.07
213 0.07
214 0.07
215 0.08
216 0.07
217 0.07
218 0.07
219 0.06
220 0.06
221 0.06
222 0.06
223 0.08
224 0.1
225 0.15
226 0.18
227 0.18
228 0.18
229 0.18
230 0.22
231 0.23
232 0.21
233 0.17
234 0.15
235 0.17
236 0.16
237 0.17
238 0.14
239 0.12
240 0.13
241 0.13
242 0.12
243 0.1
244 0.1
245 0.1
246 0.09
247 0.1
248 0.11
249 0.12
250 0.12
251 0.11
252 0.11
253 0.1
254 0.1
255 0.09
256 0.06
257 0.05
258 0.04
259 0.05
260 0.05
261 0.05
262 0.05
263 0.05
264 0.06
265 0.06
266 0.08
267 0.11
268 0.11
269 0.11
270 0.12
271 0.13
272 0.13
273 0.15
274 0.16
275 0.12
276 0.14
277 0.14
278 0.13
279 0.12
280 0.13
281 0.11
282 0.08
283 0.08
284 0.07
285 0.1
286 0.1
287 0.12
288 0.12
289 0.13
290 0.14
291 0.14
292 0.14
293 0.12
294 0.13
295 0.12
296 0.12
297 0.11
298 0.11
299 0.11
300 0.1
301 0.1
302 0.09
303 0.12
304 0.16
305 0.17
306 0.22
307 0.3
308 0.38
309 0.43
310 0.47
311 0.52
312 0.57
313 0.65
314 0.68
315 0.7
316 0.73
317 0.76
318 0.73
319 0.67
320 0.65
321 0.57
322 0.52
323 0.44
324 0.41
325 0.38
326 0.37
327 0.38
328 0.33
329 0.32
330 0.29
331 0.26
332 0.23
333 0.23
334 0.24
335 0.25
336 0.33
337 0.37
338 0.39
339 0.41
340 0.38
341 0.37
342 0.37
343 0.4
344 0.33
345 0.33
346 0.33
347 0.38
348 0.43
349 0.44
350 0.41
351 0.38
352 0.39
353 0.35
354 0.32
355 0.33
356 0.32
357 0.39
358 0.45
359 0.46
360 0.42
361 0.45
362 0.47
363 0.45
364 0.46
365 0.41
366 0.43
367 0.49
368 0.54
369 0.54
370 0.59
371 0.62
372 0.62
373 0.64
374 0.62
375 0.63
376 0.59
377 0.62
378 0.61
379 0.6
380 0.59
381 0.54
382 0.53
383 0.51
384 0.56
385 0.56
386 0.52
387 0.46
388 0.42
389 0.49
390 0.47
391 0.43
392 0.39
393 0.33
394 0.33
395 0.33
396 0.34
397 0.34
398 0.36
399 0.35
400 0.37