Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1C1D2S4

Protein Details
Accession A0A1C1D2S4    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
46-77HARLRSRRKTPAAAVRKKRVRPQPPRGLHLPKBasic
389-411AGRVGKLKQGKARTKHKNAIDDLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
47-82ARLRSRRKTPAAAVRKKRVRPQPPRGLHLPKVRRPL
Subcellular Location(s) mito 10, cyto 8.5, cyto_nucl 7, nucl 4.5, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR047205  RMP1  
IPR047204  RMP1_RBD  
Gene Ontology GO:0000172  C:ribonuclease MRP complex  
GO:0042134  F:rRNA primary transcript binding  
CDD cd22573  RMP1_RBD  
Amino Acid Sequences MSDGGRKPRNGPGPLVNASTATATETDTRNPKRQKLSHGPFQSGFHARLRSRRKTPAAAVRKKRVRPQPPRGLHLPKVRRPLADRSRTGADAKTNIMRSATALSSNSEGHITALSFAKNLLDKIWVRNKNQHRTQPWWRTLSSLRKATSRLTALEDEERRLKSESRLLGSHSRGHHVRKRFERESQLRTEKEAWVQWVREVLLPKAYIGFSSLVGDTQFANLGVVLVGVLADIVSVTPAPARGSGDRLGGTKITESQNLREAVATGEARRLEATSLRVTGPHSGELIERQYDSDDVGEIVERNTSEDDAKKRQNIRSDKKEEVTNTPSDGGHLRRASPTADIPKILEEEKPSPTTNRLASAWPHPAVGRMIVPDETVAQAKGETTINGAGRVGKLKQGKARTKHKNAIDDLFAGLT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.57
2 0.55
3 0.47
4 0.38
5 0.35
6 0.3
7 0.21
8 0.15
9 0.12
10 0.12
11 0.15
12 0.17
13 0.22
14 0.31
15 0.38
16 0.46
17 0.53
18 0.6
19 0.66
20 0.71
21 0.75
22 0.77
23 0.79
24 0.8
25 0.78
26 0.75
27 0.67
28 0.63
29 0.6
30 0.53
31 0.46
32 0.41
33 0.43
34 0.4
35 0.47
36 0.54
37 0.57
38 0.6
39 0.67
40 0.7
41 0.7
42 0.76
43 0.77
44 0.79
45 0.8
46 0.81
47 0.82
48 0.84
49 0.84
50 0.84
51 0.84
52 0.84
53 0.84
54 0.86
55 0.86
56 0.84
57 0.83
58 0.83
59 0.8
60 0.77
61 0.76
62 0.75
63 0.71
64 0.73
65 0.7
66 0.65
67 0.62
68 0.65
69 0.65
70 0.65
71 0.61
72 0.56
73 0.57
74 0.55
75 0.52
76 0.44
77 0.38
78 0.31
79 0.31
80 0.32
81 0.29
82 0.28
83 0.26
84 0.23
85 0.2
86 0.21
87 0.18
88 0.15
89 0.14
90 0.15
91 0.16
92 0.16
93 0.16
94 0.13
95 0.12
96 0.1
97 0.1
98 0.09
99 0.09
100 0.1
101 0.1
102 0.09
103 0.09
104 0.11
105 0.11
106 0.11
107 0.1
108 0.14
109 0.15
110 0.23
111 0.33
112 0.37
113 0.4
114 0.49
115 0.58
116 0.63
117 0.7
118 0.71
119 0.67
120 0.7
121 0.77
122 0.77
123 0.74
124 0.68
125 0.6
126 0.56
127 0.57
128 0.59
129 0.55
130 0.51
131 0.46
132 0.45
133 0.47
134 0.44
135 0.42
136 0.35
137 0.28
138 0.26
139 0.26
140 0.25
141 0.3
142 0.29
143 0.26
144 0.28
145 0.27
146 0.25
147 0.25
148 0.25
149 0.21
150 0.27
151 0.28
152 0.27
153 0.27
154 0.29
155 0.33
156 0.33
157 0.35
158 0.3
159 0.31
160 0.31
161 0.37
162 0.4
163 0.42
164 0.48
165 0.52
166 0.6
167 0.59
168 0.61
169 0.65
170 0.66
171 0.64
172 0.64
173 0.62
174 0.53
175 0.53
176 0.49
177 0.4
178 0.36
179 0.31
180 0.27
181 0.23
182 0.22
183 0.2
184 0.19
185 0.18
186 0.18
187 0.18
188 0.14
189 0.14
190 0.14
191 0.13
192 0.12
193 0.12
194 0.09
195 0.09
196 0.09
197 0.07
198 0.08
199 0.08
200 0.07
201 0.07
202 0.08
203 0.06
204 0.06
205 0.06
206 0.05
207 0.05
208 0.04
209 0.04
210 0.03
211 0.03
212 0.03
213 0.02
214 0.02
215 0.02
216 0.02
217 0.02
218 0.01
219 0.02
220 0.02
221 0.02
222 0.02
223 0.02
224 0.03
225 0.03
226 0.04
227 0.05
228 0.07
229 0.08
230 0.11
231 0.13
232 0.14
233 0.15
234 0.15
235 0.15
236 0.14
237 0.13
238 0.11
239 0.14
240 0.14
241 0.17
242 0.18
243 0.19
244 0.24
245 0.25
246 0.24
247 0.2
248 0.19
249 0.15
250 0.17
251 0.16
252 0.11
253 0.13
254 0.13
255 0.13
256 0.13
257 0.12
258 0.1
259 0.12
260 0.14
261 0.13
262 0.15
263 0.15
264 0.15
265 0.16
266 0.19
267 0.19
268 0.17
269 0.15
270 0.14
271 0.15
272 0.16
273 0.17
274 0.14
275 0.13
276 0.12
277 0.13
278 0.12
279 0.12
280 0.1
281 0.08
282 0.07
283 0.07
284 0.07
285 0.07
286 0.07
287 0.07
288 0.07
289 0.08
290 0.09
291 0.1
292 0.12
293 0.17
294 0.23
295 0.29
296 0.35
297 0.41
298 0.47
299 0.51
300 0.58
301 0.63
302 0.68
303 0.71
304 0.72
305 0.71
306 0.68
307 0.69
308 0.63
309 0.59
310 0.54
311 0.45
312 0.4
313 0.36
314 0.32
315 0.28
316 0.28
317 0.24
318 0.27
319 0.26
320 0.26
321 0.26
322 0.28
323 0.27
324 0.26
325 0.3
326 0.31
327 0.31
328 0.3
329 0.29
330 0.3
331 0.31
332 0.28
333 0.24
334 0.22
335 0.23
336 0.27
337 0.3
338 0.29
339 0.3
340 0.33
341 0.36
342 0.33
343 0.33
344 0.3
345 0.31
346 0.32
347 0.36
348 0.39
349 0.34
350 0.33
351 0.29
352 0.3
353 0.28
354 0.27
355 0.22
356 0.16
357 0.18
358 0.17
359 0.17
360 0.15
361 0.14
362 0.14
363 0.14
364 0.12
365 0.11
366 0.1
367 0.1
368 0.12
369 0.12
370 0.11
371 0.12
372 0.17
373 0.17
374 0.18
375 0.18
376 0.18
377 0.19
378 0.24
379 0.22
380 0.24
381 0.3
382 0.36
383 0.43
384 0.51
385 0.59
386 0.65
387 0.74
388 0.78
389 0.82
390 0.85
391 0.85
392 0.83
393 0.79
394 0.76
395 0.68
396 0.58