Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1C1CIB2

Protein Details
Accession A0A1C1CIB2    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-20MPPRKRAAKQPARTARQPASHydrophilic
93-115AAASNPRPSKRRKTSEEPSSKIEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
4-18RKRAAKQPARTARQP
Subcellular Location(s) mito 12, nucl 10, cyto_nucl 8.5, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018327  BHD_2  
IPR004583  DNA_repair_Rad4  
IPR038765  Papain-like_cys_pep_sf  
IPR018325  Rad4/PNGase_transGLS-fold  
IPR018326  Rad4_beta-hairpin_dom1  
IPR018328  Rad4_beta-hairpin_dom3  
IPR042488  Rad4_BHD3_sf  
IPR036985  Transglutaminase-like_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003684  F:damaged DNA binding  
GO:0006289  P:nucleotide-excision repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF10403  BHD_1  
PF10404  BHD_2  
PF10405  BHD_3  
PF03835  Rad4  
Amino Acid Sequences MPPRKRAAKQPARTARQPASQRGKAKNDVPDVYDELLTEAAEQEYAAASTPKPVKQRPTQIAGRPEHRRGRAEHEIGGVYSDMLAEALAEEHAAASNPRPSKRRKTSEEPSSKIELDVNLFSAPTDGGIPAPVESEPARLQQVTLTEFDTATESDPEFEDVNLEPVVGEAEYDDEPDEKPLELNLSKISTPTRATPKRKPVSAAEKRLRLDVHKAHLVMLLANLKCRNQWCNSETVQAILKPLAQRKTTSLLHVDERKTQYERNQSFMKGIEEVFSTWKNLWIMDGRGMTRAYWTDDVDAVKESDDAEDLDFDDFKAAAISKRGSRDLAAQLFCALLRSLALDARLVCSLQVLPFSRVAKGQTPQKPKAEYIRAPPQDYGSTSGTSPQRRKVFSESMFPIFWVEVFSPAIQTWIPLDPTVRQTINKPKTGFEPYANDNYNKMTYVIAFEDDGSAKDVTRRYTQFYNSKIRKQRVESTPGGEKWWDKTMRFFEKPFREARDDIEDAFLQTRAESEPMPNNIEDFRGHSVYVLERHLRKNEVIHPRRESGKVKIGYGKDAKLVSVFRRRDVHVCRTADAWYRRGRDVNQGEQPLKRAVPRRKQTPATDDFDDDEDAASGTALYAEFQTSLYEPPPVVDGKVPRNAYGNLDVYVASMIPAGAVHIRHPLAAKAARILGIDYADAVTGFQFKGRQGTAVIDGVVVAMSMTNAMITVIEALESQASEEAEEARSKILLATWKRWLTALRVREHVQHQYGDREEGTKGKGLLVDDGDENDITYRPEDDGGGFMLEGAEPDESDEGATTALTPSRMPNLRPLELPLEVVHQEVIVVRSPHKLPQPPAQEQPMQQSNYQGNRSDVAEGGGFMLDNNHPTILAAEKLNSGAAANAESGGFVREDKVDDDNEGGGFLPDDTDEAGGGFVAETEASKAHAQASRTGEEQAGGFLLRPGTGAASANEAAAAAADHATASATPGGPGSNNMRHEYGDAGDGENPEAATGYSTGVGPSTAQPPPRPSPVRADEGTLNLNLNQNEASHGGSPASAPTPGSLLSHDPEEDDAEPEWLLNSLGEMD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.82
2 0.78
3 0.76
4 0.74
5 0.73
6 0.73
7 0.73
8 0.75
9 0.76
10 0.77
11 0.75
12 0.74
13 0.72
14 0.7
15 0.65
16 0.59
17 0.54
18 0.5
19 0.45
20 0.38
21 0.3
22 0.23
23 0.2
24 0.17
25 0.13
26 0.1
27 0.08
28 0.08
29 0.07
30 0.07
31 0.07
32 0.07
33 0.08
34 0.08
35 0.08
36 0.16
37 0.21
38 0.26
39 0.34
40 0.4
41 0.48
42 0.57
43 0.68
44 0.68
45 0.71
46 0.74
47 0.74
48 0.77
49 0.75
50 0.74
51 0.72
52 0.74
53 0.74
54 0.72
55 0.69
56 0.64
57 0.66
58 0.67
59 0.62
60 0.56
61 0.5
62 0.46
63 0.4
64 0.37
65 0.28
66 0.18
67 0.14
68 0.11
69 0.07
70 0.05
71 0.05
72 0.04
73 0.04
74 0.04
75 0.04
76 0.04
77 0.04
78 0.04
79 0.05
80 0.06
81 0.07
82 0.09
83 0.17
84 0.22
85 0.28
86 0.35
87 0.43
88 0.54
89 0.64
90 0.71
91 0.73
92 0.77
93 0.82
94 0.87
95 0.89
96 0.82
97 0.77
98 0.72
99 0.64
100 0.55
101 0.46
102 0.37
103 0.3
104 0.27
105 0.23
106 0.17
107 0.16
108 0.15
109 0.14
110 0.11
111 0.08
112 0.08
113 0.07
114 0.07
115 0.08
116 0.08
117 0.08
118 0.09
119 0.08
120 0.1
121 0.1
122 0.14
123 0.15
124 0.17
125 0.19
126 0.18
127 0.19
128 0.19
129 0.22
130 0.2
131 0.2
132 0.18
133 0.17
134 0.16
135 0.17
136 0.16
137 0.13
138 0.13
139 0.13
140 0.12
141 0.13
142 0.13
143 0.15
144 0.13
145 0.13
146 0.13
147 0.11
148 0.13
149 0.12
150 0.11
151 0.09
152 0.08
153 0.09
154 0.07
155 0.06
156 0.04
157 0.07
158 0.07
159 0.08
160 0.08
161 0.08
162 0.09
163 0.11
164 0.12
165 0.1
166 0.1
167 0.1
168 0.16
169 0.15
170 0.16
171 0.17
172 0.19
173 0.19
174 0.2
175 0.22
176 0.2
177 0.22
178 0.27
179 0.35
180 0.42
181 0.5
182 0.59
183 0.68
184 0.72
185 0.73
186 0.71
187 0.69
188 0.71
189 0.73
190 0.74
191 0.71
192 0.69
193 0.67
194 0.66
195 0.59
196 0.51
197 0.5
198 0.45
199 0.44
200 0.42
201 0.41
202 0.38
203 0.38
204 0.34
205 0.26
206 0.22
207 0.22
208 0.17
209 0.2
210 0.21
211 0.2
212 0.23
213 0.26
214 0.28
215 0.27
216 0.34
217 0.33
218 0.38
219 0.39
220 0.4
221 0.37
222 0.34
223 0.31
224 0.24
225 0.23
226 0.18
227 0.19
228 0.19
229 0.25
230 0.29
231 0.28
232 0.29
233 0.32
234 0.38
235 0.37
236 0.36
237 0.34
238 0.32
239 0.37
240 0.42
241 0.41
242 0.41
243 0.43
244 0.43
245 0.42
246 0.42
247 0.44
248 0.48
249 0.47
250 0.45
251 0.46
252 0.42
253 0.42
254 0.4
255 0.34
256 0.24
257 0.22
258 0.18
259 0.15
260 0.15
261 0.16
262 0.15
263 0.15
264 0.13
265 0.17
266 0.16
267 0.15
268 0.16
269 0.16
270 0.17
271 0.2
272 0.22
273 0.19
274 0.21
275 0.21
276 0.19
277 0.18
278 0.17
279 0.17
280 0.17
281 0.17
282 0.16
283 0.18
284 0.18
285 0.17
286 0.17
287 0.13
288 0.11
289 0.11
290 0.1
291 0.08
292 0.08
293 0.08
294 0.07
295 0.07
296 0.07
297 0.08
298 0.07
299 0.07
300 0.07
301 0.07
302 0.06
303 0.07
304 0.07
305 0.08
306 0.11
307 0.13
308 0.16
309 0.2
310 0.21
311 0.21
312 0.21
313 0.26
314 0.29
315 0.33
316 0.3
317 0.26
318 0.25
319 0.24
320 0.23
321 0.19
322 0.12
323 0.06
324 0.05
325 0.06
326 0.06
327 0.07
328 0.08
329 0.08
330 0.08
331 0.1
332 0.1
333 0.09
334 0.08
335 0.08
336 0.09
337 0.08
338 0.12
339 0.12
340 0.14
341 0.18
342 0.19
343 0.19
344 0.2
345 0.22
346 0.22
347 0.25
348 0.32
349 0.37
350 0.45
351 0.5
352 0.54
353 0.54
354 0.53
355 0.57
356 0.56
357 0.51
358 0.5
359 0.55
360 0.52
361 0.52
362 0.49
363 0.43
364 0.36
365 0.34
366 0.31
367 0.22
368 0.19
369 0.17
370 0.22
371 0.25
372 0.3
373 0.33
374 0.36
375 0.4
376 0.41
377 0.45
378 0.46
379 0.49
380 0.45
381 0.49
382 0.44
383 0.42
384 0.4
385 0.36
386 0.3
387 0.21
388 0.19
389 0.13
390 0.09
391 0.08
392 0.08
393 0.08
394 0.09
395 0.08
396 0.09
397 0.08
398 0.08
399 0.08
400 0.08
401 0.09
402 0.09
403 0.1
404 0.11
405 0.14
406 0.17
407 0.17
408 0.16
409 0.21
410 0.31
411 0.37
412 0.41
413 0.39
414 0.37
415 0.41
416 0.45
417 0.42
418 0.34
419 0.33
420 0.3
421 0.36
422 0.36
423 0.32
424 0.27
425 0.27
426 0.24
427 0.2
428 0.18
429 0.11
430 0.09
431 0.11
432 0.1
433 0.09
434 0.08
435 0.08
436 0.08
437 0.08
438 0.08
439 0.09
440 0.08
441 0.08
442 0.11
443 0.13
444 0.14
445 0.2
446 0.21
447 0.23
448 0.27
449 0.33
450 0.36
451 0.4
452 0.48
453 0.47
454 0.54
455 0.58
456 0.6
457 0.59
458 0.59
459 0.62
460 0.58
461 0.6
462 0.54
463 0.49
464 0.5
465 0.44
466 0.4
467 0.32
468 0.27
469 0.22
470 0.27
471 0.25
472 0.2
473 0.25
474 0.32
475 0.38
476 0.4
477 0.39
478 0.41
479 0.44
480 0.47
481 0.45
482 0.42
483 0.39
484 0.37
485 0.38
486 0.36
487 0.3
488 0.28
489 0.26
490 0.21
491 0.17
492 0.17
493 0.14
494 0.08
495 0.07
496 0.07
497 0.06
498 0.07
499 0.07
500 0.08
501 0.12
502 0.14
503 0.15
504 0.15
505 0.15
506 0.14
507 0.15
508 0.13
509 0.12
510 0.13
511 0.12
512 0.12
513 0.11
514 0.12
515 0.12
516 0.14
517 0.13
518 0.14
519 0.16
520 0.19
521 0.21
522 0.22
523 0.21
524 0.23
525 0.29
526 0.37
527 0.39
528 0.42
529 0.43
530 0.44
531 0.46
532 0.47
533 0.42
534 0.36
535 0.39
536 0.36
537 0.34
538 0.37
539 0.34
540 0.35
541 0.35
542 0.3
543 0.25
544 0.23
545 0.22
546 0.18
547 0.19
548 0.19
549 0.25
550 0.25
551 0.26
552 0.29
553 0.3
554 0.36
555 0.4
556 0.43
557 0.42
558 0.42
559 0.39
560 0.37
561 0.38
562 0.38
563 0.35
564 0.31
565 0.3
566 0.31
567 0.32
568 0.34
569 0.33
570 0.35
571 0.38
572 0.39
573 0.38
574 0.39
575 0.4
576 0.38
577 0.39
578 0.31
579 0.27
580 0.25
581 0.29
582 0.34
583 0.42
584 0.49
585 0.55
586 0.6
587 0.65
588 0.65
589 0.65
590 0.61
591 0.56
592 0.5
593 0.43
594 0.37
595 0.32
596 0.28
597 0.2
598 0.14
599 0.09
600 0.07
601 0.06
602 0.05
603 0.03
604 0.03
605 0.03
606 0.03
607 0.03
608 0.03
609 0.04
610 0.04
611 0.04
612 0.05
613 0.06
614 0.07
615 0.07
616 0.08
617 0.07
618 0.07
619 0.09
620 0.09
621 0.09
622 0.11
623 0.14
624 0.18
625 0.24
626 0.25
627 0.24
628 0.26
629 0.27
630 0.27
631 0.27
632 0.24
633 0.18
634 0.18
635 0.17
636 0.14
637 0.13
638 0.1
639 0.06
640 0.05
641 0.04
642 0.03
643 0.03
644 0.03
645 0.05
646 0.05
647 0.06
648 0.09
649 0.1
650 0.1
651 0.11
652 0.11
653 0.15
654 0.17
655 0.16
656 0.15
657 0.15
658 0.15
659 0.15
660 0.15
661 0.1
662 0.09
663 0.08
664 0.07
665 0.06
666 0.05
667 0.05
668 0.05
669 0.04
670 0.05
671 0.05
672 0.06
673 0.07
674 0.08
675 0.12
676 0.12
677 0.13
678 0.12
679 0.14
680 0.15
681 0.15
682 0.14
683 0.1
684 0.1
685 0.09
686 0.08
687 0.06
688 0.03
689 0.02
690 0.02
691 0.02
692 0.02
693 0.02
694 0.02
695 0.02
696 0.03
697 0.03
698 0.03
699 0.03
700 0.03
701 0.04
702 0.04
703 0.04
704 0.04
705 0.04
706 0.05
707 0.05
708 0.05
709 0.05
710 0.06
711 0.07
712 0.08
713 0.08
714 0.08
715 0.08
716 0.08
717 0.08
718 0.09
719 0.15
720 0.18
721 0.22
722 0.29
723 0.3
724 0.31
725 0.32
726 0.31
727 0.31
728 0.35
729 0.38
730 0.34
731 0.37
732 0.38
733 0.42
734 0.45
735 0.44
736 0.4
737 0.36
738 0.34
739 0.35
740 0.34
741 0.31
742 0.27
743 0.22
744 0.2
745 0.2
746 0.2
747 0.17
748 0.16
749 0.15
750 0.17
751 0.16
752 0.17
753 0.15
754 0.15
755 0.13
756 0.13
757 0.13
758 0.11
759 0.1
760 0.09
761 0.09
762 0.08
763 0.08
764 0.08
765 0.08
766 0.09
767 0.09
768 0.09
769 0.09
770 0.09
771 0.09
772 0.08
773 0.07
774 0.06
775 0.06
776 0.05
777 0.05
778 0.04
779 0.04
780 0.05
781 0.06
782 0.05
783 0.06
784 0.06
785 0.05
786 0.05
787 0.05
788 0.05
789 0.05
790 0.06
791 0.07
792 0.07
793 0.09
794 0.16
795 0.19
796 0.2
797 0.28
798 0.34
799 0.35
800 0.35
801 0.37
802 0.33
803 0.31
804 0.31
805 0.23
806 0.2
807 0.18
808 0.17
809 0.14
810 0.1
811 0.1
812 0.1
813 0.1
814 0.11
815 0.12
816 0.13
817 0.17
818 0.19
819 0.23
820 0.29
821 0.34
822 0.36
823 0.44
824 0.51
825 0.52
826 0.56
827 0.56
828 0.54
829 0.49
830 0.53
831 0.5
832 0.44
833 0.39
834 0.4
835 0.41
836 0.43
837 0.44
838 0.38
839 0.33
840 0.33
841 0.33
842 0.29
843 0.22
844 0.18
845 0.15
846 0.12
847 0.11
848 0.09
849 0.08
850 0.06
851 0.09
852 0.08
853 0.09
854 0.1
855 0.09
856 0.09
857 0.09
858 0.11
859 0.1
860 0.11
861 0.11
862 0.11
863 0.12
864 0.12
865 0.12
866 0.11
867 0.09
868 0.08
869 0.08
870 0.08
871 0.07
872 0.07
873 0.07
874 0.07
875 0.07
876 0.07
877 0.07
878 0.06
879 0.08
880 0.08
881 0.1
882 0.12
883 0.15
884 0.15
885 0.15
886 0.17
887 0.16
888 0.15
889 0.13
890 0.12
891 0.09
892 0.08
893 0.07
894 0.06
895 0.05
896 0.06
897 0.06
898 0.06
899 0.06
900 0.06
901 0.06
902 0.05
903 0.05
904 0.04
905 0.04
906 0.04
907 0.04
908 0.04
909 0.05
910 0.06
911 0.08
912 0.09
913 0.09
914 0.14
915 0.17
916 0.18
917 0.25
918 0.29
919 0.3
920 0.3
921 0.31
922 0.26
923 0.24
924 0.23
925 0.16
926 0.12
927 0.1
928 0.09
929 0.09
930 0.09
931 0.08
932 0.08
933 0.08
934 0.08
935 0.1
936 0.11
937 0.1
938 0.14
939 0.14
940 0.13
941 0.13
942 0.12
943 0.1
944 0.09
945 0.08
946 0.04
947 0.04
948 0.04
949 0.04
950 0.04
951 0.05
952 0.05
953 0.07
954 0.08
955 0.08
956 0.08
957 0.09
958 0.1
959 0.1
960 0.14
961 0.2
962 0.24
963 0.28
964 0.31
965 0.32
966 0.32
967 0.32
968 0.31
969 0.25
970 0.21
971 0.18
972 0.17
973 0.18
974 0.18
975 0.17
976 0.16
977 0.14
978 0.11
979 0.11
980 0.09
981 0.08
982 0.08
983 0.08
984 0.08
985 0.08
986 0.09
987 0.08
988 0.09
989 0.09
990 0.11
991 0.16
992 0.19
993 0.23
994 0.28
995 0.35
996 0.4
997 0.49
998 0.51
999 0.49
1000 0.56
1001 0.58
1002 0.6
1003 0.54
1004 0.53
1005 0.46
1006 0.44
1007 0.44
1008 0.35
1009 0.3
1010 0.25
1011 0.29
1012 0.24
1013 0.23
1014 0.2
1015 0.17
1016 0.18
1017 0.18
1018 0.18
1019 0.15
1020 0.15
1021 0.14
1022 0.14
1023 0.14
1024 0.14
1025 0.14
1026 0.13
1027 0.12
1028 0.12
1029 0.13
1030 0.14
1031 0.14
1032 0.14
1033 0.16
1034 0.18
1035 0.2
1036 0.19
1037 0.19
1038 0.19
1039 0.22
1040 0.2
1041 0.19
1042 0.17
1043 0.16
1044 0.16
1045 0.15
1046 0.14
1047 0.11
1048 0.1
1049 0.08