FuNGI

C1GN90

Protein Details

Accession

C1GN90

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
309-334	IYTLERGKKNDKSRRWKEVTHRRYHS	Basic
766-787	AVQKGQSKRKRGDDDRKILKTN	Hydrophilic
968-993	VPSLTPHKRSLPQRRWWHTHKYRDIL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 15, mito 5, cyto 5, cyto_mito 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR046351 UTP4 IPR015943 WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf IPR001680 WD40_repeat IPR036322 WD40_repeat_dom_sf
Gene Ontology	GO:0030686 C:90S preribosome GO:0000462 P:maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)
KEGG	pbn:PADG_08726 -
PROSITE	View protein in PROSITE PS50082 WD_REPEATS_2

Amino Acid Sequences

MDIHRCRFVPFKPRAINALAFSHPPSADVSGRGVPTLRLAIGRANGDIEIWNPLRGAWLQESILRGGKDLSIEGLAWTQDPSEDGTDGSGFRIPGKLRLFSIGSSSVVTEWNLEEARPARHSNGNFGEIWCLAAQPRWRPTEKDKDGKFLPPAEGEYTGQHLAVGCADGSIVILSTQDGDLRYIRTMRPSTKKARVLSLTFQDRNTVVAGYTDSTIRIFDIRNGVILRTVSMGKGLVKGSKEVLVWSVKCLPDGTIISGDSTGEIRFWDAKNYSLIQRIQGHLADVLDIAVSADGESVISGGADQRTTIYTLERGKKNDKSRRWKEVTHRRYHSHDVKAFAVYETRNISIVVSGGLDTVPVVVPLREYGSEHHRKLSNLPQVPQISSAPSPRLLMSWWDREVSLWYISGSSGNDGRLLDGMSHELVGKVLFQGEENLTSATLSSDGKFFVAATIAEVKMFSVKWRRGGSQPVLRFKKIDLPPSVARHGAKTVAISPNRQWLCLVRPNNQISLAKIVPSSDPKKNPRILPQILDLDRIPRQIRHKEMYGTLGEYERSIRCIAFSEDSRIMASGDLAGCIDSWILEDVRASTQGTMLKVNGKPSTNSSDDESSCDDDDSPAVLDGQRWIQTPSESPIPRLKAGILLLSFRPSSRSQPKDLTNGTTRVHVSCPSFSITERLMVLTAEHQLSEFEILKGKLSDWSRRNPTAYLPKEFTILKDRAMGAIWDINKSRERLWLYGPTWMWMFDLSLDFPPPNGSTSKDIADGAVQKGQSKRKRGDDDRKILKTNTGAGDRIPVSKSDVGLGRKMRKIVDGDELNVQWIDITRKSERDDILDEDEHKQYNEASIANDSTLARLRREQNLAQLGSDGMEDEDVDKETNHHDQHLPNGRSTHLPSSSTDSNAKSQVAFAVVIDNRPQVNSDTVLPQAKQGRSQNIHSSGSDKLERKQATPSTRSAINPSSSTDVEAQVPSLTPHKRSLPQRRWWHTHKYRDILGIVSLDEPDSRSDPNQKLEDGFNIEVAVVERPMWEIELPGRYLRDYE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.62
2	0.61
3	0.59
4	0.52
5	0.49
6	0.41
7	0.35
8	0.34
9	0.34
10	0.28
11	0.25
12	0.24
13	0.23
14	0.22
15	0.22
16	0.24
17	0.24
18	0.25
19	0.25
20	0.23
21	0.2
22	0.21
23	0.21
24	0.19
25	0.15
26	0.16
27	0.19
28	0.22
29	0.23
30	0.21
31	0.2
32	0.19
33	0.18
34	0.18
35	0.14
36	0.18
37	0.17
38	0.17
39	0.16
40	0.16
41	0.18
42	0.18
43	0.22
44	0.18
45	0.2
46	0.21
47	0.23
48	0.25
49	0.25
50	0.29
51	0.24
52	0.21
53	0.19
54	0.2
55	0.18
56	0.17
57	0.16
58	0.12
59	0.12
60	0.12
61	0.13
62	0.12
63	0.11
64	0.11
65	0.09
66	0.09
67	0.09
68	0.11
69	0.12
70	0.12
71	0.11
72	0.12
73	0.13
74	0.13
75	0.14
76	0.14
77	0.12
78	0.13
79	0.18
80	0.18
81	0.25
82	0.28
83	0.3
84	0.29
85	0.33
86	0.34
87	0.29
88	0.32
89	0.27
90	0.23
91	0.21
92	0.2
93	0.16
94	0.16
95	0.16
96	0.13
97	0.11
98	0.14
99	0.13
100	0.13
101	0.17
102	0.18
103	0.22
104	0.25
105	0.27
106	0.28
107	0.35
108	0.36
109	0.4
110	0.42
111	0.41
112	0.38
113	0.36
114	0.35
115	0.27
116	0.28
117	0.19
118	0.15
119	0.12
120	0.16
121	0.21
122	0.25
123	0.32
124	0.37
125	0.4
126	0.46
127	0.54
128	0.61
129	0.65
130	0.67
131	0.63
132	0.65
133	0.65
134	0.64
135	0.6
136	0.52
137	0.45
138	0.37
139	0.37
140	0.32
141	0.32
142	0.27
143	0.24
144	0.24
145	0.21
146	0.19
147	0.17
148	0.14
149	0.12
150	0.12
151	0.11
152	0.06
153	0.06
154	0.06
155	0.05
156	0.05
157	0.05
158	0.04
159	0.04
160	0.04
161	0.04
162	0.05
163	0.06
164	0.07
165	0.08
166	0.09
167	0.11
168	0.13
169	0.15
170	0.17
171	0.18
172	0.25
173	0.3
174	0.37
175	0.44
176	0.5
177	0.57
178	0.64
179	0.7
180	0.66
181	0.68
182	0.66
183	0.61
184	0.6
185	0.59
186	0.59
187	0.53
188	0.51
189	0.45
190	0.39
191	0.36
192	0.3
193	0.21
194	0.13
195	0.11
196	0.12
197	0.1
198	0.11
199	0.1
200	0.1
201	0.09
202	0.1
203	0.09
204	0.1
205	0.1
206	0.12
207	0.18
208	0.17
209	0.21
210	0.21
211	0.2
212	0.21
213	0.2
214	0.17
215	0.14
216	0.14
217	0.11
218	0.11
219	0.12
220	0.11
221	0.14
222	0.14
223	0.16
224	0.16
225	0.18
226	0.18
227	0.2
228	0.19
229	0.17
230	0.19
231	0.21
232	0.2
233	0.22
234	0.26
235	0.24
236	0.24
237	0.24
238	0.21
239	0.21
240	0.22
241	0.2
242	0.17
243	0.17
244	0.17
245	0.16
246	0.15
247	0.11
248	0.1
249	0.08
250	0.06
251	0.06
252	0.08
253	0.11
254	0.12
255	0.17
256	0.17
257	0.19
258	0.22
259	0.24
260	0.25
261	0.27
262	0.28
263	0.27
264	0.3
265	0.3
266	0.29
267	0.27
268	0.26
269	0.2
270	0.2
271	0.14
272	0.11
273	0.09
274	0.06
275	0.06
276	0.05
277	0.03
278	0.03
279	0.03
280	0.03
281	0.03
282	0.03
283	0.03
284	0.03
285	0.03
286	0.03
287	0.03
288	0.04
289	0.05
290	0.05
291	0.05
292	0.06
293	0.07
294	0.09
295	0.09
296	0.09
297	0.13
298	0.21
299	0.29
300	0.33
301	0.37
302	0.43
303	0.5
304	0.6
305	0.65
306	0.68
307	0.71
308	0.76
309	0.82
310	0.8
311	0.8
312	0.8
313	0.81
314	0.81
315	0.8
316	0.77
317	0.71
318	0.72
319	0.74
320	0.71
321	0.69
322	0.62
323	0.55
324	0.5
325	0.47
326	0.41
327	0.32
328	0.27
329	0.18
330	0.17
331	0.16
332	0.15
333	0.14
334	0.14
335	0.14
336	0.11
337	0.11
338	0.08
339	0.06
340	0.05
341	0.05
342	0.05
343	0.04
344	0.04
345	0.04
346	0.04
347	0.04
348	0.04
349	0.04
350	0.05
351	0.05
352	0.07
353	0.07
354	0.08
355	0.1
356	0.2
357	0.28
358	0.28
359	0.33
360	0.34
361	0.34
362	0.38
363	0.45
364	0.44
365	0.4
366	0.41
367	0.43
368	0.42
369	0.42
370	0.39
371	0.3
372	0.24
373	0.21
374	0.22
375	0.17
376	0.16
377	0.17
378	0.15
379	0.15
380	0.13
381	0.16
382	0.19
383	0.22
384	0.22
385	0.21
386	0.21
387	0.21
388	0.23
389	0.2
390	0.16
391	0.11
392	0.1
393	0.1
394	0.1
395	0.11
396	0.09
397	0.08
398	0.09
399	0.08
400	0.1
401	0.09
402	0.1
403	0.09
404	0.09
405	0.08
406	0.07
407	0.07
408	0.06
409	0.06
410	0.06
411	0.06
412	0.06
413	0.05
414	0.05
415	0.04
416	0.05
417	0.04
418	0.05
419	0.06
420	0.07
421	0.08
422	0.08
423	0.08
424	0.08
425	0.07
426	0.07
427	0.06
428	0.06
429	0.06
430	0.06
431	0.06
432	0.06
433	0.07
434	0.06
435	0.06
436	0.05
437	0.06
438	0.05
439	0.06
440	0.08
441	0.07
442	0.07
443	0.07
444	0.07
445	0.07
446	0.08
447	0.1
448	0.16
449	0.18
450	0.24
451	0.27
452	0.29
453	0.31
454	0.38
455	0.41
456	0.42
457	0.46
458	0.49
459	0.5
460	0.49
461	0.46
462	0.4
463	0.43
464	0.38
465	0.39
466	0.32
467	0.34
468	0.38
469	0.41
470	0.41
471	0.34
472	0.31
473	0.26
474	0.24
475	0.19
476	0.15
477	0.13
478	0.15
479	0.18
480	0.19
481	0.2
482	0.2
483	0.27
484	0.27
485	0.26
486	0.23
487	0.19
488	0.23
489	0.29
490	0.32
491	0.29
492	0.36
493	0.37
494	0.38
495	0.38
496	0.34
497	0.27
498	0.28
499	0.22
500	0.16
501	0.14
502	0.14
503	0.12
504	0.18
505	0.21
506	0.22
507	0.29
508	0.33
509	0.4
510	0.45
511	0.46
512	0.49
513	0.53
514	0.5
515	0.45
516	0.44
517	0.43
518	0.38
519	0.37
520	0.28
521	0.22
522	0.21
523	0.22
524	0.19
525	0.17
526	0.23
527	0.28
528	0.33
529	0.33
530	0.35
531	0.34
532	0.34
533	0.34
534	0.28
535	0.23
536	0.18
537	0.15
538	0.13
539	0.11
540	0.12
541	0.09
542	0.1
543	0.1
544	0.09
545	0.09
546	0.11
547	0.12
548	0.13
549	0.13
550	0.17
551	0.17
552	0.17
553	0.17
554	0.15
555	0.14
556	0.11
557	0.1
558	0.06
559	0.06
560	0.05
561	0.05
562	0.05
563	0.05
564	0.05
565	0.04
566	0.03
567	0.03
568	0.04
569	0.04
570	0.04
571	0.05
572	0.06
573	0.07
574	0.08
575	0.07
576	0.06
577	0.09
578	0.11
579	0.11
580	0.11
581	0.11
582	0.16
583	0.17
584	0.21
585	0.21
586	0.2
587	0.21
588	0.23
589	0.28
590	0.25
591	0.25
592	0.24
593	0.25
594	0.24
595	0.25
596	0.24
597	0.2
598	0.18
599	0.17
600	0.15
601	0.11
602	0.11
603	0.09
604	0.08
605	0.06
606	0.06
607	0.06
608	0.06
609	0.07
610	0.09
611	0.1
612	0.1
613	0.11
614	0.12
615	0.13
616	0.14
617	0.16
618	0.22
619	0.21
620	0.23
621	0.27
622	0.29
623	0.29
624	0.28
625	0.25
626	0.2
627	0.2
628	0.19
629	0.14
630	0.13
631	0.13
632	0.14
633	0.14
634	0.12
635	0.15
636	0.14
637	0.22
638	0.3
639	0.33
640	0.36
641	0.42
642	0.46
643	0.49
644	0.5
645	0.47
646	0.41
647	0.41
648	0.37
649	0.34
650	0.31
651	0.26
652	0.25
653	0.23
654	0.21
655	0.18
656	0.19
657	0.18
658	0.18
659	0.17
660	0.19
661	0.16
662	0.15
663	0.15
664	0.13
665	0.12
666	0.11
667	0.11
668	0.09
669	0.1
670	0.09
671	0.08
672	0.08
673	0.08
674	0.08
675	0.1
676	0.1
677	0.08
678	0.11
679	0.12
680	0.13
681	0.13
682	0.13
683	0.16
684	0.19
685	0.27
686	0.28
687	0.37
688	0.43
689	0.46
690	0.47
691	0.43
692	0.47
693	0.49
694	0.49
695	0.46
696	0.42
697	0.39
698	0.39
699	0.38
700	0.33
701	0.3
702	0.27
703	0.22
704	0.23
705	0.23
706	0.21
707	0.21
708	0.19
709	0.12
710	0.15
711	0.15
712	0.14
713	0.15
714	0.17
715	0.2
716	0.21
717	0.21
718	0.24
719	0.27
720	0.26
721	0.3
722	0.36
723	0.34
724	0.38
725	0.37
726	0.31
727	0.28
728	0.26
729	0.22
730	0.14
731	0.13
732	0.08
733	0.09
734	0.09
735	0.1
736	0.11
737	0.1
738	0.1
739	0.12
740	0.12
741	0.12
742	0.12
743	0.14
744	0.17
745	0.19
746	0.21
747	0.2
748	0.19
749	0.17
750	0.19
751	0.19
752	0.17
753	0.18
754	0.17
755	0.19
756	0.25
757	0.34
758	0.38
759	0.43
760	0.48
761	0.55
762	0.65
763	0.72
764	0.78
765	0.79
766	0.83
767	0.84
768	0.82
769	0.76
770	0.66
771	0.6
772	0.51
773	0.46
774	0.41
775	0.34
776	0.29
777	0.26
778	0.3
779	0.27
780	0.27
781	0.22
782	0.18
783	0.2
784	0.21
785	0.21
786	0.2
787	0.24
788	0.24
789	0.29
790	0.35
791	0.37
792	0.39
793	0.41
794	0.38
795	0.37
796	0.38
797	0.35
798	0.37
799	0.32
800	0.31
801	0.33
802	0.31
803	0.28
804	0.25
805	0.22
806	0.13
807	0.13
808	0.14
809	0.13
810	0.18
811	0.2
812	0.24
813	0.27
814	0.32
815	0.32
816	0.33
817	0.33
818	0.32
819	0.35
820	0.34
821	0.33
822	0.31
823	0.32
824	0.28
825	0.25
826	0.22
827	0.17
828	0.17
829	0.17
830	0.14
831	0.13
832	0.15
833	0.15
834	0.15
835	0.16
836	0.14
837	0.14
838	0.19
839	0.19
840	0.19
841	0.25
842	0.3
843	0.35
844	0.41
845	0.41
846	0.44
847	0.49
848	0.48
849	0.41
850	0.37
851	0.3
852	0.25
853	0.22
854	0.14
855	0.07
856	0.06
857	0.06
858	0.06
859	0.07
860	0.08
861	0.08
862	0.08
863	0.09
864	0.13
865	0.2
866	0.2
867	0.22
868	0.25
869	0.27
870	0.37
871	0.46
872	0.44
873	0.41
874	0.41
875	0.39
876	0.39
877	0.42
878	0.39
879	0.32
880	0.32
881	0.31
882	0.37
883	0.38
884	0.37
885	0.37
886	0.33
887	0.33
888	0.35
889	0.34
890	0.26
891	0.24
892	0.22
893	0.19
894	0.17
895	0.13
896	0.17
897	0.17
898	0.18
899	0.19
900	0.2
901	0.19
902	0.19
903	0.21
904	0.16
905	0.18
906	0.19
907	0.19
908	0.19
909	0.23
910	0.26
911	0.25
912	0.28
913	0.33
914	0.33
915	0.39
916	0.42
917	0.48
918	0.5
919	0.55
920	0.59
921	0.57
922	0.58
923	0.51
924	0.47
925	0.4
926	0.41
927	0.42
928	0.36
929	0.34
930	0.4
931	0.41
932	0.41
933	0.46
934	0.49
935	0.5
936	0.52
937	0.53
938	0.48
939	0.5
940	0.51
941	0.48
942	0.46
943	0.41
944	0.38
945	0.37
946	0.37
947	0.33
948	0.34
949	0.3
950	0.26
951	0.24
952	0.23
953	0.2
954	0.16
955	0.16
956	0.15
957	0.2
958	0.22
959	0.23
960	0.28
961	0.35
962	0.42
963	0.53
964	0.62
965	0.65
966	0.72
967	0.8
968	0.84
969	0.86
970	0.84
971	0.85
972	0.83
973	0.84
974	0.84
975	0.79
976	0.74
977	0.7
978	0.65
979	0.55
980	0.47
981	0.37
982	0.28
983	0.22
984	0.18
985	0.14
986	0.13
987	0.12
988	0.13
989	0.14
990	0.16
991	0.2
992	0.29
993	0.33
994	0.4
995	0.43
996	0.42
997	0.43
998	0.43
999	0.43
1000	0.4
1001	0.36
1002	0.29
1003	0.25
1004	0.23
1005	0.21
1006	0.19
1007	0.16
1008	0.1
1009	0.09
1010	0.09
1011	0.1
1012	0.11
1013	0.12
1014	0.11
1015	0.12
1016	0.16
1017	0.2
1018	0.22
1019	0.24
1020	0.24

C1GN90

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer