Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1C1CP89

Protein Details
Accession A0A1C1CP89    Localization Confidence Low Confidence Score 7.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
192-212YRDSRPRRDHHQQQQKYQREDBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 12.333, mito_nucl 9.832, cyto 8, mito 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR037318  Hex1_S1  
IPR001884  IF5A-like  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
IPR014722  Rib_L2_dom2  
IPR020189  Transl_elong_IF5A_C  
IPR008991  Translation_prot_SH3-like_sf  
Gene Ontology GO:0043022  F:ribosome binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003746  F:translation elongation factor activity  
GO:0045901  P:positive regulation of translational elongation  
GO:0045905  P:positive regulation of translational termination  
Pfam View protein in Pfam  
PF01287  eIF-5a  
CDD cd04469  S1_Hex1  
Amino Acid Sequences MSRASVPRSGWLELDGAAYGLRDGWDNARVASVAALVRHKGKTRPMIGVHAGFVGATGWDDDGSPQRGRTGGVSVCCAIRSLGTMLLEVNGVSLQKRLNKECFSPDKPKKTASPASPASEKRVKAPLKTGNLDFDARVPIPPSVFPSTYRSDASAQETTITKVEGEVQLPQPSSRVGREDTRFSKEEVDISYRDSRPRRDHHQQQQKYQREDVRIHEERDRQYPEVELTREKYRAPAEYKATNVDIEIDRRDTRDHVEVDYDRRQTYDKTYESQLDVTEREYRRRVDPTYDVEYERRRPTGAAVSVQKEEVKVDQPIRNDMGYYDDEGQYHSFRRGVERAADRLLHPFSHHHHDGGREEVVVTESRESAGPTRVRDGTVEQVRFVEPRFGGRGVPIQCHFIRIGDILLLQGRPSQVIRITMSSQTGQYRYLGVDLFTRQLHEETSFISNPAPSVVVQTMLGPVFKQYRVLDIREDGQIVCMTETGDVKQGLPVVDQGGLFKRIDRAFSDGRGSVRVLVINDGGRELIVDMKIIHGSRL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.16
3 0.12
4 0.1
5 0.1
6 0.08
7 0.07
8 0.07
9 0.07
10 0.09
11 0.12
12 0.16
13 0.17
14 0.17
15 0.18
16 0.17
17 0.16
18 0.15
19 0.15
20 0.12
21 0.14
22 0.17
23 0.18
24 0.23
25 0.27
26 0.31
27 0.34
28 0.41
29 0.48
30 0.5
31 0.56
32 0.54
33 0.57
34 0.58
35 0.54
36 0.46
37 0.37
38 0.32
39 0.23
40 0.2
41 0.13
42 0.07
43 0.06
44 0.05
45 0.05
46 0.06
47 0.06
48 0.08
49 0.13
50 0.18
51 0.19
52 0.19
53 0.2
54 0.21
55 0.22
56 0.22
57 0.22
58 0.22
59 0.22
60 0.25
61 0.24
62 0.24
63 0.23
64 0.22
65 0.16
66 0.12
67 0.13
68 0.12
69 0.13
70 0.13
71 0.13
72 0.13
73 0.13
74 0.13
75 0.1
76 0.09
77 0.06
78 0.06
79 0.07
80 0.08
81 0.11
82 0.17
83 0.24
84 0.29
85 0.36
86 0.4
87 0.43
88 0.51
89 0.56
90 0.57
91 0.62
92 0.66
93 0.68
94 0.68
95 0.69
96 0.65
97 0.65
98 0.66
99 0.6
100 0.6
101 0.55
102 0.57
103 0.59
104 0.55
105 0.53
106 0.52
107 0.47
108 0.42
109 0.47
110 0.45
111 0.41
112 0.48
113 0.49
114 0.5
115 0.53
116 0.51
117 0.45
118 0.45
119 0.43
120 0.34
121 0.28
122 0.24
123 0.2
124 0.2
125 0.17
126 0.15
127 0.15
128 0.16
129 0.19
130 0.2
131 0.2
132 0.22
133 0.25
134 0.28
135 0.3
136 0.3
137 0.27
138 0.25
139 0.27
140 0.3
141 0.26
142 0.22
143 0.22
144 0.22
145 0.21
146 0.19
147 0.17
148 0.11
149 0.1
150 0.13
151 0.12
152 0.12
153 0.14
154 0.16
155 0.19
156 0.19
157 0.19
158 0.17
159 0.17
160 0.18
161 0.16
162 0.17
163 0.17
164 0.24
165 0.27
166 0.35
167 0.37
168 0.4
169 0.4
170 0.38
171 0.39
172 0.32
173 0.31
174 0.26
175 0.26
176 0.2
177 0.23
178 0.29
179 0.27
180 0.33
181 0.34
182 0.39
183 0.43
184 0.49
185 0.54
186 0.57
187 0.66
188 0.7
189 0.78
190 0.77
191 0.79
192 0.83
193 0.82
194 0.76
195 0.71
196 0.66
197 0.6
198 0.57
199 0.52
200 0.51
201 0.46
202 0.45
203 0.45
204 0.45
205 0.42
206 0.45
207 0.44
208 0.35
209 0.32
210 0.31
211 0.27
212 0.26
213 0.25
214 0.21
215 0.2
216 0.23
217 0.23
218 0.22
219 0.24
220 0.22
221 0.26
222 0.27
223 0.29
224 0.3
225 0.31
226 0.32
227 0.31
228 0.29
229 0.24
230 0.2
231 0.17
232 0.14
233 0.13
234 0.13
235 0.14
236 0.13
237 0.14
238 0.15
239 0.14
240 0.16
241 0.19
242 0.19
243 0.16
244 0.2
245 0.2
246 0.24
247 0.28
248 0.27
249 0.22
250 0.22
251 0.22
252 0.2
253 0.24
254 0.26
255 0.23
256 0.23
257 0.25
258 0.27
259 0.26
260 0.26
261 0.21
262 0.15
263 0.14
264 0.13
265 0.19
266 0.18
267 0.21
268 0.23
269 0.25
270 0.27
271 0.31
272 0.31
273 0.28
274 0.32
275 0.33
276 0.36
277 0.36
278 0.34
279 0.33
280 0.35
281 0.36
282 0.34
283 0.29
284 0.24
285 0.22
286 0.23
287 0.27
288 0.25
289 0.24
290 0.25
291 0.27
292 0.27
293 0.27
294 0.25
295 0.18
296 0.17
297 0.14
298 0.13
299 0.14
300 0.18
301 0.21
302 0.21
303 0.24
304 0.25
305 0.23
306 0.21
307 0.18
308 0.17
309 0.15
310 0.16
311 0.15
312 0.14
313 0.14
314 0.15
315 0.16
316 0.13
317 0.14
318 0.13
319 0.13
320 0.13
321 0.17
322 0.18
323 0.19
324 0.24
325 0.27
326 0.28
327 0.28
328 0.29
329 0.25
330 0.27
331 0.26
332 0.19
333 0.17
334 0.18
335 0.2
336 0.27
337 0.27
338 0.24
339 0.25
340 0.28
341 0.28
342 0.28
343 0.25
344 0.17
345 0.16
346 0.15
347 0.15
348 0.12
349 0.11
350 0.09
351 0.08
352 0.09
353 0.09
354 0.1
355 0.11
356 0.17
357 0.19
358 0.19
359 0.24
360 0.24
361 0.24
362 0.25
363 0.25
364 0.28
365 0.32
366 0.31
367 0.27
368 0.28
369 0.28
370 0.27
371 0.25
372 0.22
373 0.15
374 0.18
375 0.2
376 0.2
377 0.19
378 0.2
379 0.26
380 0.22
381 0.27
382 0.24
383 0.27
384 0.26
385 0.28
386 0.27
387 0.2
388 0.2
389 0.16
390 0.15
391 0.11
392 0.11
393 0.09
394 0.1
395 0.1
396 0.08
397 0.1
398 0.09
399 0.1
400 0.11
401 0.13
402 0.13
403 0.17
404 0.19
405 0.2
406 0.22
407 0.23
408 0.25
409 0.23
410 0.24
411 0.24
412 0.23
413 0.21
414 0.19
415 0.19
416 0.17
417 0.18
418 0.15
419 0.12
420 0.14
421 0.14
422 0.17
423 0.15
424 0.16
425 0.16
426 0.16
427 0.17
428 0.15
429 0.14
430 0.14
431 0.19
432 0.18
433 0.18
434 0.18
435 0.16
436 0.15
437 0.16
438 0.14
439 0.09
440 0.12
441 0.12
442 0.12
443 0.12
444 0.12
445 0.14
446 0.13
447 0.13
448 0.1
449 0.13
450 0.16
451 0.16
452 0.21
453 0.19
454 0.27
455 0.31
456 0.33
457 0.34
458 0.33
459 0.35
460 0.32
461 0.32
462 0.24
463 0.22
464 0.21
465 0.18
466 0.15
467 0.13
468 0.11
469 0.12
470 0.13
471 0.12
472 0.16
473 0.15
474 0.15
475 0.17
476 0.19
477 0.17
478 0.17
479 0.17
480 0.14
481 0.15
482 0.15
483 0.16
484 0.17
485 0.19
486 0.19
487 0.19
488 0.25
489 0.25
490 0.27
491 0.28
492 0.31
493 0.32
494 0.35
495 0.39
496 0.34
497 0.34
498 0.34
499 0.33
500 0.28
501 0.26
502 0.25
503 0.21
504 0.21
505 0.22
506 0.22
507 0.21
508 0.19
509 0.17
510 0.14
511 0.14
512 0.12
513 0.13
514 0.11
515 0.11
516 0.11
517 0.13
518 0.17