Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1C1D110

Protein Details
Accession A0A1C1D110    Localization Confidence Low Confidence Score 9.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
29-49FYEEKRFQKLWRKLRQEPLIPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
105-122KRKAFEAKLEEKKVAEKR
Subcellular Location(s) mito 12, cyto 7.5, cyto_nucl 6.5, nucl 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007667  Hypoxia_induced_domain  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
Pfam View protein in Pfam  
PF04588  HIG_1_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51503  HIG1  
Amino Acid Sequences MSNEAPPPSEPSPLSSSAIPSSFDSTPEFYEEKRFQKLWRKLRQEPLIPLGCAATCYALYMATKSIRAGDHHQTNRMFRARIYAQGFTLLALVAGSIFYKDERLKRKAFEAKLEEKKVAEKREKWLAELEARDKEDREWRDRIEKASVAARDAAEGVKEKAGRMIDGGKVEELVPPPGDLQSQEEGKKKAGWLFGNKSVLEEVGEEGWGPGKWAQRARDAWRRA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.28
3 0.29
4 0.27
5 0.28
6 0.25
7 0.22
8 0.24
9 0.22
10 0.23
11 0.22
12 0.21
13 0.22
14 0.24
15 0.23
16 0.2
17 0.28
18 0.33
19 0.35
20 0.39
21 0.39
22 0.42
23 0.52
24 0.61
25 0.63
26 0.67
27 0.71
28 0.73
29 0.82
30 0.83
31 0.79
32 0.74
33 0.71
34 0.64
35 0.55
36 0.47
37 0.38
38 0.29
39 0.23
40 0.18
41 0.11
42 0.07
43 0.07
44 0.07
45 0.08
46 0.08
47 0.08
48 0.1
49 0.11
50 0.11
51 0.11
52 0.13
53 0.14
54 0.17
55 0.21
56 0.27
57 0.35
58 0.37
59 0.42
60 0.42
61 0.43
62 0.46
63 0.45
64 0.37
65 0.28
66 0.33
67 0.29
68 0.33
69 0.34
70 0.29
71 0.25
72 0.26
73 0.26
74 0.18
75 0.17
76 0.1
77 0.06
78 0.05
79 0.04
80 0.03
81 0.03
82 0.03
83 0.03
84 0.03
85 0.03
86 0.06
87 0.09
88 0.15
89 0.22
90 0.27
91 0.3
92 0.31
93 0.38
94 0.44
95 0.43
96 0.44
97 0.44
98 0.48
99 0.53
100 0.53
101 0.46
102 0.38
103 0.43
104 0.41
105 0.41
106 0.39
107 0.34
108 0.37
109 0.46
110 0.46
111 0.41
112 0.39
113 0.35
114 0.31
115 0.31
116 0.29
117 0.23
118 0.25
119 0.24
120 0.22
121 0.22
122 0.26
123 0.28
124 0.3
125 0.3
126 0.31
127 0.38
128 0.39
129 0.4
130 0.36
131 0.33
132 0.29
133 0.31
134 0.29
135 0.23
136 0.22
137 0.19
138 0.15
139 0.15
140 0.13
141 0.09
142 0.1
143 0.1
144 0.12
145 0.12
146 0.12
147 0.15
148 0.15
149 0.15
150 0.15
151 0.16
152 0.16
153 0.17
154 0.18
155 0.15
156 0.15
157 0.15
158 0.15
159 0.14
160 0.13
161 0.12
162 0.11
163 0.12
164 0.12
165 0.13
166 0.11
167 0.14
168 0.16
169 0.2
170 0.24
171 0.29
172 0.3
173 0.32
174 0.34
175 0.32
176 0.32
177 0.34
178 0.36
179 0.39
180 0.44
181 0.49
182 0.51
183 0.49
184 0.46
185 0.4
186 0.34
187 0.26
188 0.2
189 0.15
190 0.11
191 0.11
192 0.09
193 0.09
194 0.1
195 0.09
196 0.11
197 0.13
198 0.18
199 0.24
200 0.3
201 0.34
202 0.4
203 0.48
204 0.55