Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1GFD0

Protein Details
Accession C1GFD0    Localization Confidence Low Confidence Score 8.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
15-34IYPRARRRYHDASSHWRRKTBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cysk 10, nucl 9.5, mito_nucl 6.5, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR043519  NT_sf  
IPR045862  Trf4-like  
Gene Ontology GO:0005743  C:mitochondrial inner membrane  
GO:0031499  C:TRAMP complex  
GO:0043631  P:RNA polyadenylation  
KEGG pbn:PADG_05966  -  
Amino Acid Sequences MRCLIVGEVPKDVWIYPRARRRYHDASSHWRRKTQPEVVPSSLEETLRSHRFANRQTLIRKLPARESANPGMIRLKLNPDRFVPTEALKEQEVREADLHQILNEDGGAETRFDVLSIRSPNSSPMDPTKPNILWTKDTIYHRSTEYPWLSYLEESGSGSISRLSDEITAFEKYILPTREERDAVGRVQRDAIASLKFDEMNLPILTGSRRTGMAVPHSSVDFVILIEDPERVEGGRGPSATRPMMVQARLKRLHQIEDALKESKTLSKVMLRKEKNPTLSAVHAATGLQVQFQCATSPPASTDFILNYRAEFPTLRPLFMVLRMLLETRGFLGGDASSVDPYLLTMMIVAALKIQEGKYHRRNIGSQFLHVLEFYKDTDFTKYGVSVEPPGIFEKNMDSKMRDKKGKRLLMHEPYLRGQRSIGKRSLSLPRAGMLSLQDPTDFMNDLGCKASVIPEVKQLFQALYDDLRARMKSWDYDDKVPTDRERISFQDENSLEKSEKPPSPSLLSLALGMNYEDFERFRDKLLLAASQAGHVPIDEVNSDVEPCCQRSLEGVKTHMESWPSEKI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.27
3 0.33
4 0.43
5 0.51
6 0.56
7 0.62
8 0.66
9 0.69
10 0.71
11 0.72
12 0.71
13 0.73
14 0.78
15 0.83
16 0.78
17 0.75
18 0.72
19 0.72
20 0.73
21 0.72
22 0.68
23 0.68
24 0.71
25 0.67
26 0.64
27 0.56
28 0.5
29 0.43
30 0.35
31 0.27
32 0.23
33 0.28
34 0.29
35 0.3
36 0.29
37 0.33
38 0.41
39 0.46
40 0.53
41 0.52
42 0.56
43 0.58
44 0.64
45 0.63
46 0.63
47 0.62
48 0.56
49 0.56
50 0.57
51 0.6
52 0.57
53 0.6
54 0.57
55 0.58
56 0.54
57 0.49
58 0.43
59 0.4
60 0.36
61 0.31
62 0.35
63 0.36
64 0.4
65 0.42
66 0.41
67 0.45
68 0.45
69 0.46
70 0.39
71 0.34
72 0.35
73 0.33
74 0.33
75 0.27
76 0.28
77 0.25
78 0.28
79 0.26
80 0.23
81 0.23
82 0.21
83 0.22
84 0.24
85 0.23
86 0.17
87 0.17
88 0.15
89 0.14
90 0.12
91 0.1
92 0.06
93 0.07
94 0.08
95 0.07
96 0.07
97 0.08
98 0.08
99 0.07
100 0.08
101 0.09
102 0.15
103 0.18
104 0.19
105 0.2
106 0.2
107 0.25
108 0.28
109 0.28
110 0.25
111 0.29
112 0.34
113 0.35
114 0.37
115 0.4
116 0.36
117 0.39
118 0.42
119 0.4
120 0.36
121 0.37
122 0.4
123 0.39
124 0.42
125 0.43
126 0.38
127 0.36
128 0.35
129 0.35
130 0.32
131 0.34
132 0.32
133 0.29
134 0.28
135 0.28
136 0.27
137 0.23
138 0.22
139 0.14
140 0.12
141 0.11
142 0.1
143 0.09
144 0.08
145 0.08
146 0.09
147 0.08
148 0.08
149 0.07
150 0.08
151 0.09
152 0.09
153 0.11
154 0.12
155 0.13
156 0.12
157 0.13
158 0.13
159 0.12
160 0.19
161 0.18
162 0.19
163 0.22
164 0.24
165 0.28
166 0.27
167 0.27
168 0.25
169 0.26
170 0.26
171 0.28
172 0.26
173 0.22
174 0.22
175 0.22
176 0.18
177 0.17
178 0.17
179 0.13
180 0.13
181 0.13
182 0.13
183 0.12
184 0.12
185 0.12
186 0.1
187 0.13
188 0.12
189 0.11
190 0.09
191 0.1
192 0.11
193 0.11
194 0.11
195 0.09
196 0.09
197 0.1
198 0.12
199 0.14
200 0.19
201 0.2
202 0.2
203 0.2
204 0.19
205 0.18
206 0.16
207 0.15
208 0.09
209 0.06
210 0.06
211 0.05
212 0.05
213 0.05
214 0.06
215 0.05
216 0.05
217 0.05
218 0.05
219 0.05
220 0.07
221 0.09
222 0.11
223 0.11
224 0.12
225 0.13
226 0.17
227 0.16
228 0.15
229 0.13
230 0.14
231 0.17
232 0.19
233 0.23
234 0.24
235 0.32
236 0.34
237 0.34
238 0.37
239 0.35
240 0.36
241 0.32
242 0.32
243 0.27
244 0.28
245 0.31
246 0.26
247 0.24
248 0.21
249 0.2
250 0.18
251 0.16
252 0.14
253 0.13
254 0.18
255 0.22
256 0.29
257 0.38
258 0.38
259 0.42
260 0.5
261 0.53
262 0.5
263 0.47
264 0.42
265 0.35
266 0.33
267 0.29
268 0.21
269 0.17
270 0.13
271 0.12
272 0.1
273 0.08
274 0.07
275 0.06
276 0.06
277 0.06
278 0.06
279 0.07
280 0.07
281 0.06
282 0.09
283 0.09
284 0.09
285 0.1
286 0.12
287 0.13
288 0.13
289 0.13
290 0.11
291 0.12
292 0.14
293 0.13
294 0.11
295 0.12
296 0.12
297 0.12
298 0.11
299 0.11
300 0.19
301 0.19
302 0.19
303 0.17
304 0.18
305 0.18
306 0.19
307 0.19
308 0.09
309 0.1
310 0.1
311 0.1
312 0.09
313 0.09
314 0.07
315 0.06
316 0.07
317 0.06
318 0.05
319 0.06
320 0.05
321 0.05
322 0.06
323 0.06
324 0.05
325 0.05
326 0.05
327 0.04
328 0.04
329 0.05
330 0.04
331 0.03
332 0.03
333 0.03
334 0.04
335 0.04
336 0.04
337 0.04
338 0.04
339 0.04
340 0.06
341 0.06
342 0.09
343 0.13
344 0.22
345 0.29
346 0.36
347 0.39
348 0.41
349 0.45
350 0.46
351 0.52
352 0.45
353 0.39
354 0.34
355 0.32
356 0.29
357 0.25
358 0.22
359 0.12
360 0.12
361 0.12
362 0.11
363 0.11
364 0.11
365 0.15
366 0.14
367 0.14
368 0.14
369 0.14
370 0.14
371 0.14
372 0.15
373 0.13
374 0.14
375 0.14
376 0.14
377 0.15
378 0.15
379 0.14
380 0.13
381 0.16
382 0.19
383 0.22
384 0.22
385 0.23
386 0.3
387 0.4
388 0.48
389 0.52
390 0.51
391 0.57
392 0.65
393 0.71
394 0.67
395 0.65
396 0.66
397 0.65
398 0.69
399 0.63
400 0.55
401 0.51
402 0.54
403 0.48
404 0.39
405 0.32
406 0.33
407 0.38
408 0.42
409 0.43
410 0.38
411 0.38
412 0.43
413 0.5
414 0.45
415 0.4
416 0.35
417 0.31
418 0.3
419 0.29
420 0.25
421 0.17
422 0.16
423 0.14
424 0.13
425 0.12
426 0.11
427 0.12
428 0.12
429 0.11
430 0.09
431 0.12
432 0.12
433 0.13
434 0.14
435 0.13
436 0.12
437 0.11
438 0.14
439 0.15
440 0.17
441 0.17
442 0.24
443 0.26
444 0.26
445 0.27
446 0.26
447 0.21
448 0.19
449 0.2
450 0.13
451 0.12
452 0.14
453 0.14
454 0.15
455 0.19
456 0.19
457 0.19
458 0.22
459 0.24
460 0.26
461 0.32
462 0.4
463 0.41
464 0.47
465 0.49
466 0.48
467 0.49
468 0.49
469 0.44
470 0.4
471 0.39
472 0.35
473 0.37
474 0.37
475 0.41
476 0.41
477 0.39
478 0.42
479 0.39
480 0.41
481 0.38
482 0.38
483 0.3
484 0.3
485 0.33
486 0.32
487 0.35
488 0.36
489 0.38
490 0.4
491 0.44
492 0.42
493 0.41
494 0.35
495 0.32
496 0.28
497 0.25
498 0.2
499 0.16
500 0.14
501 0.12
502 0.1
503 0.1
504 0.09
505 0.09
506 0.12
507 0.16
508 0.17
509 0.2
510 0.23
511 0.23
512 0.25
513 0.28
514 0.27
515 0.24
516 0.27
517 0.25
518 0.22
519 0.22
520 0.19
521 0.16
522 0.13
523 0.13
524 0.09
525 0.1
526 0.1
527 0.1
528 0.11
529 0.11
530 0.13
531 0.12
532 0.16
533 0.18
534 0.2
535 0.22
536 0.2
537 0.2
538 0.26
539 0.34
540 0.36
541 0.39
542 0.4
543 0.41
544 0.43
545 0.44
546 0.4
547 0.35
548 0.29