Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1C1C8U1

Protein Details
Accession A0A1C1C8U1    Localization Confidence Medium Confidence Score 10
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
250-269RPEARRVKSGGRPKSRGKPEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
207-212AKGGKR
251-269PEARRVKSGGRPKSRGKPE
Subcellular Location(s) plas 11, extr 5, E.R. 4, mito 2, pero 2, vacu 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005595  TRAP_alpha  
Gene Ontology GO:0005789  C:endoplasmic reticulum membrane  
Pfam View protein in Pfam  
PF03896  TRAP_alpha  
Amino Acid Sequences MGRFLDLALLLFGFQAAGVFAQASPEVEEEIENPSTSPALAVSVEATFPDAEIFGIKITNGKPYESRLSFLNEEPDPVTVQFVGGSLWTFEGTQANPTPRIVRNLTTAQYAVEIPPGEKQTLPYRFQTNLHPQDLRLNLAAVVSSQNTFYTLNAFNGTVTVVEPDASIFDPQLLFLYFFLLACAVGVGYSFYTIWIVPYFPKQRRVAKGGKRADMAKKADTGVTSDSEGPAVSTGKAYNEDWIPSHHIQRPEARRVKSGGRPKSRGKPE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.04
2 0.04
3 0.04
4 0.04
5 0.04
6 0.05
7 0.05
8 0.06
9 0.07
10 0.07
11 0.09
12 0.09
13 0.09
14 0.09
15 0.1
16 0.09
17 0.13
18 0.13
19 0.12
20 0.12
21 0.12
22 0.12
23 0.11
24 0.11
25 0.07
26 0.07
27 0.07
28 0.07
29 0.08
30 0.08
31 0.08
32 0.08
33 0.09
34 0.07
35 0.07
36 0.07
37 0.06
38 0.05
39 0.06
40 0.07
41 0.06
42 0.06
43 0.06
44 0.09
45 0.1
46 0.17
47 0.17
48 0.19
49 0.2
50 0.25
51 0.34
52 0.31
53 0.32
54 0.27
55 0.31
56 0.32
57 0.31
58 0.32
59 0.23
60 0.23
61 0.23
62 0.22
63 0.17
64 0.15
65 0.15
66 0.09
67 0.09
68 0.08
69 0.07
70 0.06
71 0.05
72 0.05
73 0.05
74 0.05
75 0.05
76 0.05
77 0.06
78 0.08
79 0.08
80 0.11
81 0.14
82 0.15
83 0.16
84 0.17
85 0.2
86 0.2
87 0.25
88 0.24
89 0.23
90 0.26
91 0.28
92 0.28
93 0.25
94 0.24
95 0.19
96 0.18
97 0.16
98 0.11
99 0.1
100 0.09
101 0.08
102 0.11
103 0.12
104 0.11
105 0.11
106 0.13
107 0.2
108 0.25
109 0.27
110 0.27
111 0.29
112 0.3
113 0.32
114 0.36
115 0.38
116 0.37
117 0.38
118 0.35
119 0.33
120 0.37
121 0.36
122 0.3
123 0.21
124 0.15
125 0.13
126 0.12
127 0.12
128 0.06
129 0.06
130 0.05
131 0.05
132 0.05
133 0.05
134 0.07
135 0.07
136 0.07
137 0.1
138 0.1
139 0.11
140 0.12
141 0.12
142 0.1
143 0.1
144 0.1
145 0.07
146 0.06
147 0.05
148 0.05
149 0.05
150 0.05
151 0.05
152 0.05
153 0.06
154 0.06
155 0.05
156 0.06
157 0.06
158 0.06
159 0.07
160 0.06
161 0.06
162 0.06
163 0.07
164 0.07
165 0.07
166 0.07
167 0.06
168 0.05
169 0.05
170 0.05
171 0.03
172 0.03
173 0.03
174 0.03
175 0.03
176 0.04
177 0.04
178 0.04
179 0.05
180 0.05
181 0.07
182 0.07
183 0.08
184 0.08
185 0.17
186 0.25
187 0.29
188 0.38
189 0.43
190 0.51
191 0.57
192 0.63
193 0.65
194 0.66
195 0.72
196 0.71
197 0.69
198 0.64
199 0.63
200 0.63
201 0.61
202 0.56
203 0.49
204 0.43
205 0.39
206 0.38
207 0.33
208 0.28
209 0.22
210 0.19
211 0.18
212 0.17
213 0.16
214 0.15
215 0.14
216 0.12
217 0.11
218 0.1
219 0.09
220 0.09
221 0.1
222 0.11
223 0.15
224 0.15
225 0.18
226 0.19
227 0.2
228 0.2
229 0.23
230 0.29
231 0.29
232 0.35
233 0.37
234 0.4
235 0.42
236 0.51
237 0.56
238 0.59
239 0.65
240 0.61
241 0.6
242 0.6
243 0.65
244 0.64
245 0.66
246 0.66
247 0.68
248 0.72
249 0.76