Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1C1CGD6

Protein Details
Accession A0A1C1CGD6    Localization Confidence High Confidence Score 23.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
282-302AKDPTGPKKPRGRPRKDASAQBasic
726-746TEEQRMKRLRKEARRKLRVAWBasic
1058-1084DDEYGRKGGNKKKKAEAKPYNYKTQTCHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
282-297AKDPTGPKKPRGRPRK
521-550KKAAAGIEKKPDKPGSPRSVGSPADGSRKD
553-601AGTKRTREGEAASQPAAKKAVRVIPQASKPLAVRLEEKRKAEEAAKRAK
731-743MKRLRKEARRKLR
1063-1073RKGGNKKKKAE
Subcellular Location(s) nucl 25, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000637  HMGI/Y_DNA-bd_CS  
IPR000571  Znf_CCCH  
IPR036855  Znf_CCCH_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00354  HMGI_Y  
PS50103  ZF_C3H1  
Amino Acid Sequences MNPSTNMNGSQHAKGQSYNMLDGMQSYAGPETLQNGEDLSRFFDPDLFESTAIGKGFSQPSLPRSDAGGSRQSHTPDMHQYSAPQQNYSQSQYPQPFYTSQQMNQSSFDPRFYSRPSPTPVSFDGGYPYQAHVGFTPQHFTSQQMNVPQRQTPTPTQSYPPRQQQPAQFVNIAQRPPPMSHVPSADMMRFGSFHVQDQTQQPSNRFVDPSMLTANQPTNTSTKNGNHTFQAQQPYLPSSYFNPGPTVDPRSLQSPQSMPSAKMPQPVVIVPKLEQATKPAAAKDPTGPKKPRGRPRKDASAQAGDQAAGSAASSDDELEIEDEEPPEMIPALLAVSMPADERGRALYRAVQAVWSPRNKPVDPEKVRGGIANYGDTIRGLRDAWKTKNETLRKAELPNSPTAAEAARLKEEVARYRQLLETVMLRSLQYSHPAILKRLGENQFTMSALSSFILDRINVSDFDSPLTNAILKFVVNFETLDSEMLEMTKLSKILQRLTKKATSDIKTLAQTVLDNAAAASAKKAAAGIEKKPDKPGSPRSVGSPADGSRKDVSAGTKRTREGEAASQPAAKKAVRVIPQASKPLAVRLEEKRKAEEAAKRAKTGEKTAAVASTAAPSTSAANPTTKSKVAVSAPPKASIFAALSSVPKKPGTPNAERAAVAAKEKTSPVAGPSVPSRTLKKESPPRNVGPTGGAKGASSSSFLGVLLDMEKKPDKEVKKETEMPNETEEQRMKRLRKEARRKLRVAWKADDKLVETRFFTHDPDEELGQGDRLKANAGGGREGEALKLHKNMEDLDDEEDEDAFEEFEPYTPPSEVDFTYLEDASLGEDSPHKTNSPKFGGSLKPESRSREAQDKYEQDTLMAIYTSKVDRPPTPKEPAEEEDFEPAEPETPFGEPTELTREREKAHQARQVRTVPQPSIDLNALAQAMAAQQRPQQQSAGLTPELQRALGMFAQPAPPAPVPQATPAPGVNLQAILQSVLGQQMPSQTQQPVYPATTDSAPYAQNNLSALLASMQQGTQGASAANALPLGMGGNPNPFPGGVEDSSRKHGRSDSDGVDDEYGRKGGNKKKKAEAKPYNYKTQTCTFWQQGKCLKGDSCTYRHGEDDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.35
3 0.35
4 0.35
5 0.33
6 0.28
7 0.25
8 0.23
9 0.22
10 0.21
11 0.15
12 0.11
13 0.1
14 0.1
15 0.1
16 0.1
17 0.1
18 0.11
19 0.13
20 0.13
21 0.12
22 0.13
23 0.14
24 0.15
25 0.16
26 0.17
27 0.16
28 0.16
29 0.17
30 0.19
31 0.2
32 0.21
33 0.26
34 0.23
35 0.22
36 0.22
37 0.23
38 0.24
39 0.21
40 0.2
41 0.14
42 0.18
43 0.2
44 0.2
45 0.23
46 0.23
47 0.27
48 0.33
49 0.34
50 0.29
51 0.29
52 0.33
53 0.32
54 0.34
55 0.38
56 0.33
57 0.35
58 0.39
59 0.39
60 0.39
61 0.37
62 0.37
63 0.39
64 0.43
65 0.43
66 0.39
67 0.39
68 0.43
69 0.5
70 0.46
71 0.38
72 0.34
73 0.37
74 0.41
75 0.45
76 0.42
77 0.36
78 0.43
79 0.47
80 0.49
81 0.45
82 0.43
83 0.4
84 0.39
85 0.45
86 0.42
87 0.39
88 0.45
89 0.48
90 0.46
91 0.46
92 0.43
93 0.41
94 0.38
95 0.37
96 0.31
97 0.29
98 0.32
99 0.37
100 0.42
101 0.41
102 0.47
103 0.51
104 0.55
105 0.53
106 0.54
107 0.5
108 0.47
109 0.42
110 0.35
111 0.33
112 0.27
113 0.27
114 0.22
115 0.21
116 0.19
117 0.19
118 0.2
119 0.16
120 0.19
121 0.21
122 0.21
123 0.24
124 0.21
125 0.24
126 0.24
127 0.27
128 0.29
129 0.3
130 0.32
131 0.37
132 0.42
133 0.44
134 0.47
135 0.47
136 0.44
137 0.43
138 0.46
139 0.44
140 0.46
141 0.47
142 0.47
143 0.5
144 0.56
145 0.62
146 0.65
147 0.68
148 0.68
149 0.67
150 0.7
151 0.71
152 0.71
153 0.67
154 0.62
155 0.53
156 0.46
157 0.49
158 0.47
159 0.41
160 0.33
161 0.31
162 0.29
163 0.29
164 0.33
165 0.31
166 0.3
167 0.32
168 0.33
169 0.32
170 0.34
171 0.35
172 0.3
173 0.25
174 0.22
175 0.19
176 0.17
177 0.15
178 0.18
179 0.16
180 0.18
181 0.21
182 0.21
183 0.24
184 0.28
185 0.34
186 0.34
187 0.37
188 0.36
189 0.4
190 0.42
191 0.42
192 0.38
193 0.32
194 0.31
195 0.29
196 0.3
197 0.26
198 0.24
199 0.21
200 0.23
201 0.26
202 0.21
203 0.21
204 0.2
205 0.2
206 0.2
207 0.22
208 0.26
209 0.28
210 0.36
211 0.39
212 0.39
213 0.39
214 0.41
215 0.42
216 0.41
217 0.44
218 0.35
219 0.32
220 0.32
221 0.32
222 0.29
223 0.26
224 0.22
225 0.18
226 0.23
227 0.24
228 0.23
229 0.22
230 0.22
231 0.25
232 0.27
233 0.29
234 0.25
235 0.24
236 0.25
237 0.28
238 0.29
239 0.27
240 0.27
241 0.24
242 0.25
243 0.31
244 0.31
245 0.28
246 0.31
247 0.38
248 0.35
249 0.38
250 0.37
251 0.32
252 0.32
253 0.33
254 0.31
255 0.25
256 0.25
257 0.2
258 0.25
259 0.24
260 0.23
261 0.21
262 0.2
263 0.23
264 0.25
265 0.26
266 0.22
267 0.25
268 0.25
269 0.27
270 0.3
271 0.36
272 0.4
273 0.48
274 0.5
275 0.54
276 0.63
277 0.71
278 0.74
279 0.75
280 0.78
281 0.79
282 0.83
283 0.86
284 0.8
285 0.78
286 0.75
287 0.71
288 0.62
289 0.54
290 0.46
291 0.34
292 0.3
293 0.21
294 0.15
295 0.07
296 0.06
297 0.04
298 0.04
299 0.04
300 0.04
301 0.04
302 0.04
303 0.04
304 0.05
305 0.05
306 0.06
307 0.06
308 0.07
309 0.07
310 0.07
311 0.07
312 0.06
313 0.06
314 0.05
315 0.05
316 0.04
317 0.04
318 0.04
319 0.04
320 0.04
321 0.03
322 0.03
323 0.04
324 0.04
325 0.06
326 0.06
327 0.06
328 0.07
329 0.1
330 0.11
331 0.12
332 0.13
333 0.16
334 0.18
335 0.2
336 0.19
337 0.17
338 0.17
339 0.22
340 0.27
341 0.27
342 0.27
343 0.3
344 0.37
345 0.36
346 0.4
347 0.43
348 0.48
349 0.5
350 0.52
351 0.51
352 0.47
353 0.47
354 0.42
355 0.35
356 0.27
357 0.23
358 0.19
359 0.16
360 0.14
361 0.13
362 0.12
363 0.11
364 0.07
365 0.08
366 0.07
367 0.11
368 0.18
369 0.24
370 0.28
371 0.34
372 0.38
373 0.43
374 0.51
375 0.52
376 0.52
377 0.52
378 0.54
379 0.5
380 0.49
381 0.5
382 0.46
383 0.44
384 0.39
385 0.36
386 0.3
387 0.26
388 0.24
389 0.18
390 0.15
391 0.14
392 0.13
393 0.12
394 0.12
395 0.12
396 0.14
397 0.17
398 0.2
399 0.22
400 0.23
401 0.23
402 0.25
403 0.25
404 0.23
405 0.22
406 0.17
407 0.16
408 0.14
409 0.14
410 0.12
411 0.11
412 0.11
413 0.12
414 0.11
415 0.12
416 0.12
417 0.13
418 0.16
419 0.18
420 0.19
421 0.21
422 0.22
423 0.2
424 0.27
425 0.29
426 0.27
427 0.26
428 0.26
429 0.23
430 0.21
431 0.2
432 0.12
433 0.09
434 0.08
435 0.07
436 0.06
437 0.05
438 0.06
439 0.06
440 0.06
441 0.06
442 0.07
443 0.08
444 0.08
445 0.1
446 0.11
447 0.11
448 0.12
449 0.12
450 0.1
451 0.1
452 0.1
453 0.09
454 0.07
455 0.08
456 0.07
457 0.07
458 0.07
459 0.07
460 0.08
461 0.08
462 0.08
463 0.07
464 0.08
465 0.08
466 0.08
467 0.08
468 0.06
469 0.06
470 0.06
471 0.06
472 0.04
473 0.05
474 0.05
475 0.06
476 0.06
477 0.09
478 0.11
479 0.16
480 0.24
481 0.28
482 0.31
483 0.36
484 0.39
485 0.38
486 0.42
487 0.45
488 0.4
489 0.38
490 0.36
491 0.34
492 0.31
493 0.31
494 0.25
495 0.18
496 0.15
497 0.12
498 0.11
499 0.08
500 0.07
501 0.05
502 0.06
503 0.05
504 0.05
505 0.05
506 0.05
507 0.05
508 0.05
509 0.05
510 0.05
511 0.11
512 0.13
513 0.16
514 0.23
515 0.27
516 0.28
517 0.32
518 0.33
519 0.3
520 0.34
521 0.41
522 0.39
523 0.39
524 0.39
525 0.38
526 0.41
527 0.39
528 0.33
529 0.27
530 0.22
531 0.24
532 0.24
533 0.24
534 0.19
535 0.19
536 0.19
537 0.17
538 0.2
539 0.21
540 0.27
541 0.28
542 0.3
543 0.31
544 0.32
545 0.32
546 0.29
547 0.24
548 0.24
549 0.23
550 0.22
551 0.22
552 0.22
553 0.21
554 0.21
555 0.21
556 0.15
557 0.12
558 0.13
559 0.19
560 0.2
561 0.23
562 0.25
563 0.29
564 0.31
565 0.34
566 0.31
567 0.27
568 0.23
569 0.24
570 0.22
571 0.18
572 0.19
573 0.24
574 0.33
575 0.36
576 0.37
577 0.36
578 0.36
579 0.36
580 0.37
581 0.35
582 0.33
583 0.38
584 0.39
585 0.37
586 0.38
587 0.4
588 0.37
589 0.35
590 0.33
591 0.25
592 0.24
593 0.24
594 0.23
595 0.19
596 0.17
597 0.14
598 0.09
599 0.08
600 0.06
601 0.06
602 0.06
603 0.07
604 0.08
605 0.1
606 0.1
607 0.11
608 0.12
609 0.15
610 0.18
611 0.17
612 0.17
613 0.15
614 0.19
615 0.19
616 0.25
617 0.26
618 0.31
619 0.31
620 0.32
621 0.32
622 0.28
623 0.26
624 0.21
625 0.17
626 0.1
627 0.1
628 0.09
629 0.11
630 0.12
631 0.13
632 0.13
633 0.13
634 0.13
635 0.15
636 0.23
637 0.28
638 0.33
639 0.39
640 0.4
641 0.42
642 0.41
643 0.38
644 0.33
645 0.27
646 0.22
647 0.16
648 0.13
649 0.12
650 0.12
651 0.13
652 0.1
653 0.1
654 0.1
655 0.12
656 0.12
657 0.12
658 0.14
659 0.17
660 0.18
661 0.2
662 0.22
663 0.23
664 0.28
665 0.29
666 0.36
667 0.43
668 0.5
669 0.57
670 0.61
671 0.59
672 0.6
673 0.58
674 0.49
675 0.43
676 0.38
677 0.3
678 0.24
679 0.21
680 0.15
681 0.15
682 0.15
683 0.11
684 0.1
685 0.08
686 0.08
687 0.08
688 0.08
689 0.07
690 0.06
691 0.06
692 0.06
693 0.08
694 0.08
695 0.1
696 0.12
697 0.13
698 0.16
699 0.22
700 0.25
701 0.31
702 0.4
703 0.44
704 0.49
705 0.57
706 0.59
707 0.62
708 0.61
709 0.55
710 0.49
711 0.46
712 0.39
713 0.36
714 0.35
715 0.27
716 0.31
717 0.36
718 0.37
719 0.4
720 0.48
721 0.53
722 0.61
723 0.7
724 0.74
725 0.78
726 0.84
727 0.8
728 0.79
729 0.8
730 0.77
731 0.71
732 0.68
733 0.65
734 0.59
735 0.58
736 0.51
737 0.43
738 0.41
739 0.38
740 0.32
741 0.24
742 0.24
743 0.25
744 0.25
745 0.24
746 0.2
747 0.19
748 0.2
749 0.21
750 0.19
751 0.16
752 0.16
753 0.15
754 0.14
755 0.13
756 0.11
757 0.1
758 0.1
759 0.1
760 0.09
761 0.11
762 0.12
763 0.12
764 0.13
765 0.12
766 0.14
767 0.14
768 0.14
769 0.12
770 0.12
771 0.13
772 0.14
773 0.16
774 0.15
775 0.15
776 0.17
777 0.17
778 0.17
779 0.18
780 0.17
781 0.17
782 0.16
783 0.15
784 0.14
785 0.13
786 0.11
787 0.09
788 0.08
789 0.05
790 0.05
791 0.06
792 0.05
793 0.06
794 0.08
795 0.08
796 0.1
797 0.1
798 0.11
799 0.12
800 0.14
801 0.14
802 0.15
803 0.15
804 0.14
805 0.16
806 0.16
807 0.14
808 0.11
809 0.11
810 0.09
811 0.09
812 0.07
813 0.06
814 0.08
815 0.11
816 0.13
817 0.15
818 0.15
819 0.19
820 0.23
821 0.3
822 0.34
823 0.32
824 0.32
825 0.36
826 0.41
827 0.43
828 0.48
829 0.44
830 0.45
831 0.47
832 0.51
833 0.51
834 0.51
835 0.5
836 0.5
837 0.49
838 0.48
839 0.53
840 0.51
841 0.51
842 0.5
843 0.45
844 0.35
845 0.34
846 0.28
847 0.2
848 0.16
849 0.11
850 0.07
851 0.1
852 0.1
853 0.12
854 0.14
855 0.17
856 0.23
857 0.29
858 0.37
859 0.42
860 0.48
861 0.49
862 0.5
863 0.52
864 0.51
865 0.5
866 0.46
867 0.4
868 0.37
869 0.35
870 0.31
871 0.25
872 0.21
873 0.17
874 0.13
875 0.13
876 0.1
877 0.1
878 0.11
879 0.11
880 0.12
881 0.1
882 0.12
883 0.2
884 0.22
885 0.24
886 0.28
887 0.3
888 0.31
889 0.37
890 0.45
891 0.45
892 0.5
893 0.55
894 0.57
895 0.6
896 0.65
897 0.65
898 0.6
899 0.59
900 0.57
901 0.51
902 0.46
903 0.44
904 0.37
905 0.34
906 0.3
907 0.23
908 0.17
909 0.17
910 0.15
911 0.12
912 0.11
913 0.07
914 0.08
915 0.11
916 0.11
917 0.11
918 0.15
919 0.24
920 0.28
921 0.29
922 0.28
923 0.27
924 0.3
925 0.32
926 0.33
927 0.26
928 0.24
929 0.25
930 0.28
931 0.26
932 0.23
933 0.19
934 0.14
935 0.17
936 0.16
937 0.15
938 0.11
939 0.12
940 0.14
941 0.14
942 0.15
943 0.17
944 0.16
945 0.17
946 0.18
947 0.19
948 0.19
949 0.23
950 0.26
951 0.23
952 0.25
953 0.23
954 0.25
955 0.24
956 0.24
957 0.2
958 0.17
959 0.15
960 0.14
961 0.14
962 0.1
963 0.09
964 0.08
965 0.08
966 0.1
967 0.1
968 0.09
969 0.09
970 0.13
971 0.15
972 0.16
973 0.19
974 0.19
975 0.21
976 0.23
977 0.25
978 0.24
979 0.24
980 0.23
981 0.22
982 0.22
983 0.21
984 0.21
985 0.2
986 0.19
987 0.19
988 0.18
989 0.21
990 0.19
991 0.2
992 0.19
993 0.18
994 0.16
995 0.14
996 0.13
997 0.1
998 0.11
999 0.1
1000 0.1
1001 0.09
1002 0.09
1003 0.1
1004 0.1
1005 0.1
1006 0.09
1007 0.08
1008 0.07
1009 0.09
1010 0.09
1011 0.08
1012 0.07
1013 0.07
1014 0.06
1015 0.06
1016 0.06
1017 0.06
1018 0.07
1019 0.08
1020 0.13
1021 0.13
1022 0.14
1023 0.15
1024 0.14
1025 0.14
1026 0.16
1027 0.21
1028 0.18
1029 0.23
1030 0.28
1031 0.31
1032 0.39
1033 0.41
1034 0.39
1035 0.36
1036 0.39
1037 0.39
1038 0.42
1039 0.46
1040 0.42
1041 0.44
1042 0.45
1043 0.44
1044 0.42
1045 0.37
1046 0.3
1047 0.25
1048 0.22
1049 0.16
1050 0.19
1051 0.26
1052 0.34
1053 0.44
1054 0.52
1055 0.57
1056 0.67
1057 0.77
1058 0.82
1059 0.85
1060 0.86
1061 0.86
1062 0.88
1063 0.87
1064 0.88
1065 0.83
1066 0.77
1067 0.71
1068 0.67
1069 0.61
1070 0.57
1071 0.59
1072 0.56
1073 0.59
1074 0.59
1075 0.61
1076 0.63
1077 0.62
1078 0.58
1079 0.54
1080 0.49
1081 0.44
1082 0.5
1083 0.49
1084 0.45
1085 0.47
1086 0.48
1087 0.46