Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1C1CSQ4

Protein Details
Accession A0A1C1CSQ4    Localization Confidence Low Confidence Score 8.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
8-28ADKIRNKRLAKLQQSQPQQSQHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 12, cyto 9.5, mito 2, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019474  Ub_conjug_fac_E4_core  
IPR045132  UBE4  
IPR003613  Ubox_domain  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0000151  C:ubiquitin ligase complex  
GO:0034450  F:ubiquitin-ubiquitin ligase activity  
GO:0016567  P:protein ubiquitination  
GO:0030433  P:ubiquitin-dependent ERAD pathway  
Pfam View protein in Pfam  
PF04564  U-box  
PF10408  Ufd2P_core  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51698  U_BOX  
CDD cd16657  RING-Ubox_UBE4A  
Amino Acid Sequences MEDPSMDADKIRNKRLAKLQQSQPQQSQDAGSAASVPAEEGSTSTPPSRPETPQADTHQEPSETESAPASINIAKPPSPPVRIRIAPATVTPQKREMDGLERPSSRQGARQNESIEQWEDRTLRSVFRITLDPDQTKDTAGQPLHVISQLKEELESDGKPLMLNTDLLDQAIMEAGAKLGKLTPHDWLFGCWKRITRLSKSVKDRSPENKKWTIIAEAKRLCMSWCILSITTPDVFEAQYDGVAALAEHLLADPEDDGGVCPDFLTEVIGRFDEDETIKDAFVGAVENLSRRLASMSMDSDFRRYTTMLRYLIRYKPVAVAITRSPMFVDKSVPAAELEVKTILGPYFQLSPLQAATTQSYFSSPKTMDPGRIRNSQQSLQLALRTHQSELFDIINTLVRASPEARDRVLDWFALVVNSNHKRRAIQVDKKTVSSDGFMINVTTVLDQLCEPFMDAQFSKIDRVDIDYLRRHPRVDIKDETKINSDQDHSDEFYKNQLEGTNNFISECFFLTVAAHHYGTEAARNMLKDMDRSLKHMAKQIEEFETQRHRYINNPAQLTMFENALKKYKTEHDKGLSYKHAVTGVLLDELTQTRSMQFMRFVTVWILRQVSSHRQFPKQNLTLPLSPDEPEAFKNLPEYFLDVISGNFGFIMYNLPQLISSTQSDELIMLCITFLRNSEYIKNPYLKASLVTILFRGTWTWRQGGRGILADQYNSMPFATEHLLHSLMRFFIEAEFMGGHGQFFDKFNVRFEIFQIIKCIWPNTVYRDHLLREAKVNMEFFVRFVNLLLNDVTFVLDESFTAFHTIYDTSKELSMAGTSLDQEQRQAKEEILEQAKGRAKSYMQLTNETVAMLKLFTEALADAFTMPEIVQRLADMLDYNLDAMVGPKSNNLKVENLQEYNFNPKALLSEIIDVYLNLGEKENFVLAVARDGRSYKPDNFVSAGNIMRKFMLKGPEELDRWHRLTEKFAQAKKEDEAADADLGEIPDEFLDPLMYTLMEDPVRLPVSKIVIDRSTIRSHLLSDPHDPFNRVPLKIEDVIPATDVKEQIQKFKDERMGSARREFVETVKTEPAGNADGEPMDLS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.53
2 0.63
3 0.68
4 0.69
5 0.72
6 0.75
7 0.76
8 0.84
9 0.83
10 0.79
11 0.74
12 0.66
13 0.58
14 0.5
15 0.43
16 0.35
17 0.27
18 0.21
19 0.16
20 0.14
21 0.12
22 0.1
23 0.08
24 0.07
25 0.07
26 0.07
27 0.07
28 0.1
29 0.12
30 0.15
31 0.17
32 0.19
33 0.22
34 0.28
35 0.32
36 0.34
37 0.41
38 0.46
39 0.47
40 0.53
41 0.56
42 0.58
43 0.55
44 0.53
45 0.5
46 0.43
47 0.4
48 0.37
49 0.35
50 0.28
51 0.27
52 0.23
53 0.19
54 0.19
55 0.19
56 0.15
57 0.14
58 0.16
59 0.18
60 0.21
61 0.21
62 0.22
63 0.3
64 0.35
65 0.38
66 0.39
67 0.41
68 0.47
69 0.48
70 0.51
71 0.5
72 0.46
73 0.41
74 0.4
75 0.44
76 0.43
77 0.45
78 0.43
79 0.43
80 0.41
81 0.4
82 0.41
83 0.36
84 0.35
85 0.38
86 0.42
87 0.43
88 0.43
89 0.43
90 0.46
91 0.47
92 0.41
93 0.41
94 0.42
95 0.45
96 0.49
97 0.53
98 0.51
99 0.5
100 0.51
101 0.48
102 0.42
103 0.34
104 0.3
105 0.3
106 0.28
107 0.25
108 0.28
109 0.25
110 0.24
111 0.26
112 0.28
113 0.23
114 0.26
115 0.29
116 0.28
117 0.35
118 0.39
119 0.38
120 0.37
121 0.39
122 0.36
123 0.33
124 0.31
125 0.26
126 0.26
127 0.24
128 0.24
129 0.22
130 0.22
131 0.23
132 0.24
133 0.23
134 0.16
135 0.22
136 0.22
137 0.21
138 0.2
139 0.19
140 0.19
141 0.2
142 0.2
143 0.16
144 0.15
145 0.15
146 0.15
147 0.14
148 0.13
149 0.11
150 0.11
151 0.11
152 0.13
153 0.13
154 0.13
155 0.12
156 0.1
157 0.09
158 0.09
159 0.07
160 0.04
161 0.04
162 0.04
163 0.05
164 0.05
165 0.05
166 0.07
167 0.09
168 0.12
169 0.14
170 0.2
171 0.21
172 0.24
173 0.25
174 0.26
175 0.33
176 0.35
177 0.38
178 0.34
179 0.36
180 0.38
181 0.46
182 0.5
183 0.49
184 0.54
185 0.59
186 0.65
187 0.71
188 0.76
189 0.73
190 0.7
191 0.7
192 0.7
193 0.71
194 0.71
195 0.7
196 0.69
197 0.64
198 0.63
199 0.57
200 0.55
201 0.52
202 0.49
203 0.5
204 0.45
205 0.45
206 0.43
207 0.41
208 0.34
209 0.29
210 0.25
211 0.18
212 0.18
213 0.19
214 0.18
215 0.18
216 0.19
217 0.19
218 0.18
219 0.15
220 0.14
221 0.12
222 0.11
223 0.11
224 0.11
225 0.08
226 0.07
227 0.08
228 0.07
229 0.06
230 0.06
231 0.05
232 0.04
233 0.04
234 0.04
235 0.04
236 0.04
237 0.04
238 0.04
239 0.05
240 0.04
241 0.04
242 0.04
243 0.04
244 0.05
245 0.06
246 0.06
247 0.06
248 0.05
249 0.05
250 0.05
251 0.05
252 0.08
253 0.07
254 0.08
255 0.1
256 0.1
257 0.1
258 0.11
259 0.11
260 0.11
261 0.11
262 0.11
263 0.13
264 0.13
265 0.13
266 0.12
267 0.12
268 0.09
269 0.09
270 0.08
271 0.05
272 0.06
273 0.07
274 0.08
275 0.08
276 0.09
277 0.09
278 0.08
279 0.09
280 0.08
281 0.09
282 0.11
283 0.12
284 0.13
285 0.16
286 0.16
287 0.18
288 0.17
289 0.16
290 0.16
291 0.14
292 0.16
293 0.2
294 0.26
295 0.28
296 0.29
297 0.33
298 0.37
299 0.4
300 0.42
301 0.36
302 0.31
303 0.29
304 0.3
305 0.28
306 0.23
307 0.22
308 0.19
309 0.24
310 0.23
311 0.2
312 0.18
313 0.18
314 0.19
315 0.17
316 0.18
317 0.13
318 0.16
319 0.16
320 0.16
321 0.14
322 0.13
323 0.15
324 0.13
325 0.13
326 0.11
327 0.1
328 0.1
329 0.11
330 0.09
331 0.07
332 0.07
333 0.07
334 0.08
335 0.09
336 0.1
337 0.09
338 0.11
339 0.11
340 0.11
341 0.1
342 0.1
343 0.11
344 0.11
345 0.11
346 0.1
347 0.12
348 0.13
349 0.13
350 0.16
351 0.14
352 0.15
353 0.21
354 0.22
355 0.27
356 0.33
357 0.4
358 0.41
359 0.47
360 0.48
361 0.48
362 0.52
363 0.47
364 0.45
365 0.39
366 0.36
367 0.31
368 0.32
369 0.26
370 0.22
371 0.23
372 0.2
373 0.19
374 0.18
375 0.18
376 0.16
377 0.17
378 0.17
379 0.12
380 0.11
381 0.11
382 0.11
383 0.1
384 0.1
385 0.08
386 0.08
387 0.09
388 0.1
389 0.12
390 0.15
391 0.17
392 0.17
393 0.17
394 0.18
395 0.2
396 0.2
397 0.17
398 0.13
399 0.11
400 0.11
401 0.1
402 0.1
403 0.07
404 0.14
405 0.2
406 0.23
407 0.24
408 0.25
409 0.26
410 0.29
411 0.39
412 0.41
413 0.45
414 0.51
415 0.59
416 0.59
417 0.6
418 0.57
419 0.47
420 0.38
421 0.29
422 0.22
423 0.13
424 0.11
425 0.11
426 0.1
427 0.08
428 0.08
429 0.07
430 0.05
431 0.05
432 0.04
433 0.05
434 0.05
435 0.05
436 0.05
437 0.05
438 0.05
439 0.06
440 0.06
441 0.09
442 0.09
443 0.09
444 0.11
445 0.12
446 0.13
447 0.12
448 0.13
449 0.1
450 0.14
451 0.16
452 0.15
453 0.19
454 0.22
455 0.27
456 0.33
457 0.34
458 0.31
459 0.3
460 0.37
461 0.38
462 0.41
463 0.42
464 0.4
465 0.46
466 0.47
467 0.46
468 0.4
469 0.36
470 0.31
471 0.25
472 0.23
473 0.17
474 0.18
475 0.18
476 0.16
477 0.17
478 0.17
479 0.16
480 0.18
481 0.17
482 0.15
483 0.14
484 0.15
485 0.14
486 0.14
487 0.2
488 0.17
489 0.17
490 0.17
491 0.16
492 0.14
493 0.13
494 0.13
495 0.07
496 0.06
497 0.06
498 0.06
499 0.07
500 0.09
501 0.1
502 0.09
503 0.08
504 0.09
505 0.09
506 0.09
507 0.1
508 0.08
509 0.08
510 0.09
511 0.09
512 0.09
513 0.1
514 0.11
515 0.09
516 0.11
517 0.17
518 0.16
519 0.2
520 0.25
521 0.26
522 0.27
523 0.32
524 0.31
525 0.26
526 0.28
527 0.26
528 0.24
529 0.23
530 0.21
531 0.19
532 0.24
533 0.23
534 0.23
535 0.22
536 0.2
537 0.22
538 0.31
539 0.34
540 0.34
541 0.33
542 0.32
543 0.31
544 0.31
545 0.3
546 0.21
547 0.15
548 0.11
549 0.11
550 0.12
551 0.15
552 0.15
553 0.13
554 0.15
555 0.22
556 0.27
557 0.3
558 0.35
559 0.35
560 0.4
561 0.41
562 0.43
563 0.38
564 0.33
565 0.29
566 0.25
567 0.21
568 0.17
569 0.15
570 0.12
571 0.1
572 0.08
573 0.07
574 0.06
575 0.06
576 0.06
577 0.07
578 0.06
579 0.06
580 0.06
581 0.08
582 0.08
583 0.09
584 0.11
585 0.1
586 0.13
587 0.13
588 0.13
589 0.14
590 0.15
591 0.15
592 0.14
593 0.15
594 0.12
595 0.13
596 0.15
597 0.23
598 0.25
599 0.31
600 0.33
601 0.38
602 0.41
603 0.46
604 0.52
605 0.47
606 0.48
607 0.45
608 0.46
609 0.42
610 0.4
611 0.37
612 0.28
613 0.25
614 0.21
615 0.18
616 0.14
617 0.13
618 0.14
619 0.13
620 0.12
621 0.14
622 0.13
623 0.14
624 0.13
625 0.15
626 0.12
627 0.12
628 0.12
629 0.1
630 0.09
631 0.1
632 0.09
633 0.06
634 0.05
635 0.05
636 0.04
637 0.04
638 0.07
639 0.06
640 0.07
641 0.08
642 0.08
643 0.08
644 0.09
645 0.09
646 0.09
647 0.09
648 0.1
649 0.11
650 0.11
651 0.11
652 0.1
653 0.1
654 0.08
655 0.08
656 0.05
657 0.04
658 0.05
659 0.05
660 0.05
661 0.05
662 0.08
663 0.09
664 0.11
665 0.16
666 0.21
667 0.24
668 0.28
669 0.3
670 0.28
671 0.29
672 0.28
673 0.24
674 0.2
675 0.18
676 0.16
677 0.14
678 0.14
679 0.12
680 0.12
681 0.11
682 0.11
683 0.1
684 0.11
685 0.14
686 0.16
687 0.2
688 0.21
689 0.23
690 0.25
691 0.26
692 0.25
693 0.22
694 0.21
695 0.2
696 0.19
697 0.17
698 0.15
699 0.14
700 0.12
701 0.1
702 0.09
703 0.07
704 0.07
705 0.09
706 0.1
707 0.1
708 0.11
709 0.12
710 0.14
711 0.13
712 0.14
713 0.13
714 0.11
715 0.1
716 0.09
717 0.08
718 0.07
719 0.08
720 0.07
721 0.07
722 0.07
723 0.07
724 0.07
725 0.07
726 0.06
727 0.05
728 0.06
729 0.06
730 0.07
731 0.1
732 0.14
733 0.15
734 0.17
735 0.21
736 0.22
737 0.21
738 0.22
739 0.28
740 0.24
741 0.24
742 0.25
743 0.21
744 0.22
745 0.23
746 0.22
747 0.14
748 0.16
749 0.17
750 0.21
751 0.27
752 0.27
753 0.28
754 0.3
755 0.31
756 0.35
757 0.36
758 0.31
759 0.29
760 0.29
761 0.29
762 0.28
763 0.27
764 0.21
765 0.2
766 0.19
767 0.15
768 0.15
769 0.13
770 0.11
771 0.11
772 0.13
773 0.1
774 0.12
775 0.12
776 0.1
777 0.1
778 0.1
779 0.09
780 0.06
781 0.06
782 0.06
783 0.05
784 0.05
785 0.06
786 0.06
787 0.06
788 0.08
789 0.08
790 0.07
791 0.09
792 0.1
793 0.1
794 0.13
795 0.14
796 0.13
797 0.14
798 0.14
799 0.12
800 0.12
801 0.11
802 0.08
803 0.07
804 0.07
805 0.07
806 0.1
807 0.13
808 0.12
809 0.16
810 0.2
811 0.21
812 0.24
813 0.25
814 0.22
815 0.22
816 0.24
817 0.28
818 0.27
819 0.27
820 0.24
821 0.3
822 0.35
823 0.33
824 0.32
825 0.27
826 0.25
827 0.28
828 0.33
829 0.34
830 0.31
831 0.34
832 0.35
833 0.33
834 0.33
835 0.27
836 0.22
837 0.14
838 0.12
839 0.08
840 0.07
841 0.06
842 0.05
843 0.05
844 0.06
845 0.06
846 0.06
847 0.06
848 0.06
849 0.06
850 0.06
851 0.06
852 0.05
853 0.05
854 0.07
855 0.08
856 0.09
857 0.08
858 0.08
859 0.09
860 0.09
861 0.1
862 0.08
863 0.07
864 0.08
865 0.08
866 0.08
867 0.07
868 0.06
869 0.06
870 0.06
871 0.08
872 0.08
873 0.08
874 0.13
875 0.17
876 0.19
877 0.23
878 0.25
879 0.27
880 0.29
881 0.36
882 0.38
883 0.36
884 0.35
885 0.34
886 0.33
887 0.38
888 0.35
889 0.28
890 0.22
891 0.2
892 0.21
893 0.2
894 0.21
895 0.14
896 0.16
897 0.16
898 0.16
899 0.16
900 0.14
901 0.13
902 0.12
903 0.11
904 0.08
905 0.1
906 0.09
907 0.1
908 0.11
909 0.1
910 0.09
911 0.09
912 0.11
913 0.09
914 0.16
915 0.18
916 0.17
917 0.18
918 0.2
919 0.22
920 0.26
921 0.31
922 0.28
923 0.33
924 0.35
925 0.36
926 0.37
927 0.36
928 0.33
929 0.31
930 0.31
931 0.29
932 0.28
933 0.26
934 0.25
935 0.25
936 0.24
937 0.25
938 0.29
939 0.26
940 0.29
941 0.31
942 0.37
943 0.37
944 0.39
945 0.4
946 0.39
947 0.39
948 0.39
949 0.41
950 0.36
951 0.41
952 0.45
953 0.5
954 0.52
955 0.54
956 0.58
957 0.54
958 0.57
959 0.53
960 0.5
961 0.4
962 0.33
963 0.32
964 0.27
965 0.25
966 0.21
967 0.19
968 0.15
969 0.14
970 0.12
971 0.09
972 0.07
973 0.07
974 0.07
975 0.07
976 0.06
977 0.06
978 0.06
979 0.07
980 0.07
981 0.07
982 0.07
983 0.08
984 0.12
985 0.11
986 0.12
987 0.12
988 0.17
989 0.19
990 0.19
991 0.19
992 0.19
993 0.23
994 0.27
995 0.28
996 0.28
997 0.28
998 0.31
999 0.34
1000 0.35
1001 0.35
1002 0.32
1003 0.33
1004 0.29
1005 0.3
1006 0.33
1007 0.35
1008 0.33
1009 0.36
1010 0.4
1011 0.44
1012 0.46
1013 0.46
1014 0.41
1015 0.45
1016 0.48
1017 0.41
1018 0.4
1019 0.37
1020 0.41
1021 0.41
1022 0.42
1023 0.36
1024 0.32
1025 0.32
1026 0.29
1027 0.25
1028 0.2
1029 0.2
1030 0.2
1031 0.18
1032 0.23
1033 0.24
1034 0.32
1035 0.36
1036 0.42
1037 0.4
1038 0.48
1039 0.54
1040 0.48
1041 0.52
1042 0.52
1043 0.56
1044 0.54
1045 0.59
1046 0.56
1047 0.49
1048 0.52
1049 0.48
1050 0.42
1051 0.42
1052 0.39
1053 0.36
1054 0.35
1055 0.34
1056 0.3
1057 0.3
1058 0.3
1059 0.23
1060 0.23
1061 0.18
1062 0.16
1063 0.15