Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1C1CHS0

Protein Details
Accession A0A1C1CHS0    Localization Confidence High Confidence Score 20.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
31-52FESTYKALRKELKRKNHTADLEHydrophilic
120-146REEATKTKPSKMRRAKPKKREASPSSSHydrophilic
345-372LSVTRGKGFTKEKNKKKRGSYRGGAIDIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
125-140KTKPSKMRRAKPKKRE
352-364GFTKEKNKKKRGS
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 13.5, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006594  LisH  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50896  LISH  
Amino Acid Sequences MVSKTEGPQATLEPSSQVLSLVSAFLNEYGFESTYKALRKELKRKNHTADLEALEDGVSLEDIVKSWKEQETQGSTSDDDTPKESDASSSESESDSSSDASDQSSSSESTSESESDSESREEATKTKPSKMRRAKPKKREASPSSSSSSSDSDADDENEDGRKVKPARKNSPAVIQKIEPVRSVKRKAASSSSDSESSSSVDRSAKRTKVANGDERSSSDSGASSASSEEETSSTADTSSAEEEQDDNEDDSPTQLQTLAKMSAQAAVAPSDSSSNTVMGDVVERSEEDSHLAHGRGGKQSVARKTHVGARPTPLAQLSAQSTASDHISNAYKSYEYADRAYNDLSVTRGKGFTKEKNKKKRGSYRGGAIDISGGKSFKFED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.19
3 0.18
4 0.16
5 0.11
6 0.11
7 0.11
8 0.1
9 0.09
10 0.08
11 0.08
12 0.09
13 0.09
14 0.08
15 0.09
16 0.1
17 0.11
18 0.11
19 0.13
20 0.14
21 0.19
22 0.23
23 0.23
24 0.27
25 0.36
26 0.46
27 0.55
28 0.63
29 0.69
30 0.74
31 0.82
32 0.84
33 0.84
34 0.78
35 0.71
36 0.67
37 0.59
38 0.52
39 0.42
40 0.34
41 0.24
42 0.2
43 0.16
44 0.1
45 0.06
46 0.04
47 0.05
48 0.05
49 0.05
50 0.08
51 0.08
52 0.09
53 0.12
54 0.16
55 0.18
56 0.2
57 0.28
58 0.32
59 0.33
60 0.35
61 0.34
62 0.3
63 0.3
64 0.34
65 0.28
66 0.23
67 0.23
68 0.22
69 0.21
70 0.21
71 0.2
72 0.14
73 0.14
74 0.18
75 0.17
76 0.16
77 0.16
78 0.16
79 0.16
80 0.16
81 0.15
82 0.11
83 0.1
84 0.09
85 0.09
86 0.09
87 0.09
88 0.09
89 0.08
90 0.09
91 0.1
92 0.1
93 0.1
94 0.1
95 0.09
96 0.1
97 0.12
98 0.11
99 0.1
100 0.1
101 0.11
102 0.12
103 0.13
104 0.12
105 0.11
106 0.12
107 0.12
108 0.13
109 0.14
110 0.18
111 0.24
112 0.26
113 0.34
114 0.39
115 0.44
116 0.54
117 0.63
118 0.68
119 0.71
120 0.8
121 0.84
122 0.88
123 0.92
124 0.91
125 0.87
126 0.88
127 0.83
128 0.8
129 0.74
130 0.68
131 0.6
132 0.51
133 0.45
134 0.36
135 0.31
136 0.24
137 0.19
138 0.15
139 0.13
140 0.13
141 0.13
142 0.11
143 0.1
144 0.1
145 0.1
146 0.1
147 0.09
148 0.09
149 0.15
150 0.18
151 0.25
152 0.32
153 0.41
154 0.49
155 0.55
156 0.6
157 0.55
158 0.61
159 0.6
160 0.55
161 0.48
162 0.4
163 0.36
164 0.35
165 0.34
166 0.27
167 0.24
168 0.28
169 0.32
170 0.36
171 0.36
172 0.37
173 0.38
174 0.38
175 0.4
176 0.38
177 0.35
178 0.35
179 0.33
180 0.29
181 0.27
182 0.25
183 0.2
184 0.17
185 0.14
186 0.11
187 0.1
188 0.13
189 0.14
190 0.19
191 0.25
192 0.26
193 0.29
194 0.32
195 0.34
196 0.39
197 0.43
198 0.46
199 0.42
200 0.43
201 0.41
202 0.38
203 0.38
204 0.29
205 0.24
206 0.15
207 0.13
208 0.11
209 0.1
210 0.09
211 0.06
212 0.06
213 0.06
214 0.06
215 0.06
216 0.06
217 0.06
218 0.07
219 0.07
220 0.07
221 0.07
222 0.06
223 0.06
224 0.06
225 0.07
226 0.08
227 0.08
228 0.08
229 0.08
230 0.08
231 0.09
232 0.1
233 0.1
234 0.09
235 0.09
236 0.1
237 0.09
238 0.1
239 0.1
240 0.08
241 0.07
242 0.08
243 0.08
244 0.09
245 0.12
246 0.12
247 0.11
248 0.13
249 0.13
250 0.14
251 0.13
252 0.13
253 0.11
254 0.1
255 0.1
256 0.09
257 0.09
258 0.08
259 0.08
260 0.09
261 0.09
262 0.09
263 0.09
264 0.09
265 0.09
266 0.08
267 0.09
268 0.07
269 0.07
270 0.07
271 0.07
272 0.08
273 0.09
274 0.09
275 0.1
276 0.1
277 0.12
278 0.14
279 0.15
280 0.14
281 0.17
282 0.2
283 0.23
284 0.23
285 0.23
286 0.26
287 0.33
288 0.4
289 0.41
290 0.4
291 0.39
292 0.4
293 0.47
294 0.48
295 0.45
296 0.41
297 0.41
298 0.43
299 0.42
300 0.41
301 0.33
302 0.29
303 0.25
304 0.24
305 0.22
306 0.19
307 0.19
308 0.17
309 0.17
310 0.16
311 0.18
312 0.15
313 0.12
314 0.14
315 0.17
316 0.17
317 0.18
318 0.18
319 0.17
320 0.17
321 0.21
322 0.22
323 0.22
324 0.24
325 0.27
326 0.27
327 0.29
328 0.3
329 0.27
330 0.22
331 0.2
332 0.2
333 0.18
334 0.19
335 0.19
336 0.21
337 0.21
338 0.28
339 0.35
340 0.43
341 0.51
342 0.6
343 0.68
344 0.76
345 0.85
346 0.86
347 0.9
348 0.91
349 0.9
350 0.9
351 0.87
352 0.86
353 0.84
354 0.77
355 0.67
356 0.56
357 0.49
358 0.4
359 0.34
360 0.26
361 0.19
362 0.16