Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1C1CUK5

Protein Details
Accession A0A1C1CUK5    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
226-252ELSADTAGRRRRRRWRPPPAQCSKVTYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
233-242GRRRRRRWRP
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 12.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000743  Glyco_hydro_28  
IPR012334  Pectin_lyas_fold  
IPR011050  Pectin_lyase_fold/virulence  
Gene Ontology GO:0005576  C:extracellular region  
GO:0004650  F:polygalacturonase activity  
GO:0005975  P:carbohydrate metabolic process  
GO:0071555  P:cell wall organization  
Pfam View protein in Pfam  
PF00295  Glyco_hydro_28  
Amino Acid Sequences MTFLRSIDIENQGYIQFTNGTDYWQAHSPKQVFQSATTFFKLGGEDVNVYRGGTLDGNGQMWYDLYGQDIYILRPILFGNVGVHSGTISDFKLVYSPQYYNWVANSSNVIFSHISITGFSTSNNTAKNTDGWGHVPERRDHDPELGRQQRRRLRQLSSPTSTNMLVAGHALQWARTASASAVSPSTPPRPTTYATSTPTCTTYLSMANVTDGARARIKVWPGSPSELSADTAGRRRRRRWRPPPAQCSKVTYDTFCRCTTSTTPSSITRCYRPERTHHALQRVPLRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.16
3 0.11
4 0.11
5 0.15
6 0.14
7 0.16
8 0.17
9 0.19
10 0.21
11 0.26
12 0.29
13 0.26
14 0.35
15 0.35
16 0.37
17 0.41
18 0.43
19 0.38
20 0.38
21 0.41
22 0.37
23 0.39
24 0.35
25 0.31
26 0.25
27 0.25
28 0.23
29 0.17
30 0.15
31 0.13
32 0.14
33 0.14
34 0.16
35 0.15
36 0.14
37 0.13
38 0.11
39 0.11
40 0.09
41 0.09
42 0.1
43 0.11
44 0.12
45 0.12
46 0.12
47 0.1
48 0.1
49 0.11
50 0.08
51 0.07
52 0.08
53 0.08
54 0.08
55 0.1
56 0.11
57 0.1
58 0.12
59 0.12
60 0.11
61 0.11
62 0.11
63 0.1
64 0.1
65 0.1
66 0.09
67 0.09
68 0.09
69 0.09
70 0.09
71 0.07
72 0.07
73 0.07
74 0.07
75 0.07
76 0.07
77 0.07
78 0.07
79 0.08
80 0.08
81 0.1
82 0.12
83 0.12
84 0.12
85 0.19
86 0.2
87 0.19
88 0.2
89 0.2
90 0.17
91 0.17
92 0.19
93 0.13
94 0.14
95 0.13
96 0.15
97 0.13
98 0.13
99 0.14
100 0.12
101 0.11
102 0.09
103 0.1
104 0.1
105 0.1
106 0.1
107 0.1
108 0.11
109 0.14
110 0.15
111 0.15
112 0.15
113 0.15
114 0.16
115 0.15
116 0.15
117 0.14
118 0.14
119 0.15
120 0.16
121 0.18
122 0.2
123 0.2
124 0.24
125 0.26
126 0.27
127 0.26
128 0.29
129 0.29
130 0.3
131 0.38
132 0.4
133 0.41
134 0.42
135 0.49
136 0.5
137 0.55
138 0.59
139 0.54
140 0.5
141 0.53
142 0.6
143 0.59
144 0.56
145 0.51
146 0.44
147 0.41
148 0.37
149 0.29
150 0.2
151 0.13
152 0.09
153 0.08
154 0.07
155 0.05
156 0.06
157 0.06
158 0.06
159 0.07
160 0.07
161 0.07
162 0.07
163 0.07
164 0.06
165 0.07
166 0.08
167 0.07
168 0.08
169 0.08
170 0.09
171 0.12
172 0.16
173 0.16
174 0.17
175 0.2
176 0.23
177 0.25
178 0.3
179 0.34
180 0.36
181 0.38
182 0.39
183 0.37
184 0.35
185 0.35
186 0.3
187 0.24
188 0.18
189 0.16
190 0.16
191 0.15
192 0.15
193 0.13
194 0.13
195 0.13
196 0.12
197 0.13
198 0.12
199 0.13
200 0.14
201 0.14
202 0.15
203 0.18
204 0.21
205 0.22
206 0.24
207 0.25
208 0.27
209 0.31
210 0.31
211 0.28
212 0.28
213 0.25
214 0.24
215 0.21
216 0.19
217 0.17
218 0.23
219 0.3
220 0.36
221 0.43
222 0.51
223 0.61
224 0.71
225 0.79
226 0.84
227 0.87
228 0.9
229 0.93
230 0.95
231 0.94
232 0.89
233 0.81
234 0.76
235 0.71
236 0.67
237 0.59
238 0.52
239 0.51
240 0.51
241 0.52
242 0.47
243 0.44
244 0.37
245 0.4
246 0.4
247 0.39
248 0.36
249 0.36
250 0.39
251 0.41
252 0.44
253 0.46
254 0.48
255 0.46
256 0.49
257 0.53
258 0.59
259 0.59
260 0.64
261 0.67
262 0.69
263 0.73
264 0.74
265 0.76
266 0.7
267 0.7