Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1C1CJ29

Protein Details
Accession A0A1C1CJ29    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
259-286GVWSPQLAAKRRQRKKERFGRNPISGMLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
268-277KRRQRKKERF
Subcellular Location(s) nucl 10, mito 8, cyto 5, extr 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034751  Yippee  
IPR004910  Yippee/Mis18/Cereblon  
IPR039058  Yippee_fam  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF03226  Yippee-Mis18  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51792  YIPPEE  
Amino Acid Sequences MSFLRKTSDPPAFFPLFPIYLLPSLPFRRKSRQSSTDSNGSTDTTTSTLSAQSSSSSNPFTRSPTPTPIPTSSSSAIIIPPDDKFLNGHSSHIQCAKCSTDLCLTSQIISKGFMGRHGRAFLVQGTTSHIETMTPALPNTFQNKSISRNLVTGQHVVSDISCAICGNILGWKYVEASEESQKYKVGKFILETKRIRVSVCWENDEDDTTPVQTHDEALPLPSHELRRLIDGPSTGATRADGDLQFDSQDEDECEDLFAGVWSPQLAAKRRQRKKERFGRNPISGMLNFGAGSSNDTLA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.39
3 0.31
4 0.29
5 0.25
6 0.21
7 0.19
8 0.19
9 0.17
10 0.2
11 0.26
12 0.33
13 0.39
14 0.42
15 0.52
16 0.61
17 0.68
18 0.72
19 0.75
20 0.75
21 0.76
22 0.77
23 0.76
24 0.68
25 0.6
26 0.51
27 0.43
28 0.36
29 0.27
30 0.22
31 0.14
32 0.13
33 0.12
34 0.12
35 0.12
36 0.12
37 0.12
38 0.11
39 0.11
40 0.12
41 0.14
42 0.15
43 0.18
44 0.18
45 0.2
46 0.22
47 0.25
48 0.3
49 0.35
50 0.36
51 0.4
52 0.44
53 0.45
54 0.49
55 0.46
56 0.44
57 0.4
58 0.41
59 0.34
60 0.31
61 0.28
62 0.23
63 0.21
64 0.17
65 0.16
66 0.12
67 0.11
68 0.12
69 0.12
70 0.12
71 0.12
72 0.13
73 0.19
74 0.18
75 0.2
76 0.21
77 0.23
78 0.25
79 0.3
80 0.28
81 0.22
82 0.24
83 0.24
84 0.22
85 0.21
86 0.21
87 0.21
88 0.21
89 0.22
90 0.24
91 0.22
92 0.21
93 0.23
94 0.21
95 0.16
96 0.16
97 0.15
98 0.15
99 0.14
100 0.2
101 0.22
102 0.23
103 0.24
104 0.25
105 0.24
106 0.21
107 0.22
108 0.17
109 0.14
110 0.13
111 0.1
112 0.13
113 0.14
114 0.14
115 0.13
116 0.11
117 0.09
118 0.09
119 0.11
120 0.09
121 0.08
122 0.07
123 0.08
124 0.09
125 0.11
126 0.15
127 0.14
128 0.14
129 0.17
130 0.19
131 0.23
132 0.27
133 0.27
134 0.24
135 0.24
136 0.23
137 0.25
138 0.25
139 0.22
140 0.17
141 0.15
142 0.14
143 0.13
144 0.12
145 0.08
146 0.06
147 0.05
148 0.05
149 0.04
150 0.04
151 0.04
152 0.04
153 0.03
154 0.06
155 0.06
156 0.06
157 0.07
158 0.07
159 0.08
160 0.08
161 0.09
162 0.08
163 0.1
164 0.15
165 0.18
166 0.19
167 0.19
168 0.21
169 0.21
170 0.21
171 0.22
172 0.19
173 0.17
174 0.18
175 0.27
176 0.33
177 0.4
178 0.4
179 0.4
180 0.44
181 0.43
182 0.42
183 0.33
184 0.32
185 0.32
186 0.34
187 0.33
188 0.28
189 0.3
190 0.3
191 0.3
192 0.25
193 0.18
194 0.16
195 0.13
196 0.13
197 0.11
198 0.11
199 0.09
200 0.1
201 0.09
202 0.1
203 0.09
204 0.1
205 0.11
206 0.1
207 0.13
208 0.14
209 0.15
210 0.16
211 0.19
212 0.19
213 0.24
214 0.25
215 0.24
216 0.23
217 0.22
218 0.21
219 0.2
220 0.21
221 0.15
222 0.14
223 0.13
224 0.12
225 0.12
226 0.15
227 0.13
228 0.15
229 0.15
230 0.16
231 0.15
232 0.14
233 0.15
234 0.11
235 0.12
236 0.11
237 0.11
238 0.11
239 0.11
240 0.12
241 0.1
242 0.1
243 0.08
244 0.07
245 0.06
246 0.06
247 0.07
248 0.06
249 0.07
250 0.09
251 0.16
252 0.21
253 0.3
254 0.4
255 0.5
256 0.59
257 0.7
258 0.79
259 0.84
260 0.9
261 0.91
262 0.92
263 0.92
264 0.93
265 0.92
266 0.88
267 0.8
268 0.72
269 0.67
270 0.56
271 0.49
272 0.39
273 0.3
274 0.22
275 0.19
276 0.19
277 0.13
278 0.16