Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1C1C8N8

Protein Details
Accession A0A1C1C8N8    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
29-50HTSPVAQKRKPKFPSVKADFNQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
203-205RKK
Subcellular Location(s) mito 17.5, cyto_mito 10, nucl 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000851  Ribosomal_S5  
IPR005324  Ribosomal_S5_C  
IPR020568  Ribosomal_S5_D2-typ_fold  
IPR014721  Ribosomal_S5_D2-typ_fold_subgr  
IPR013810  Ribosomal_S5_N  
Gene Ontology GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0005840  C:ribosome  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0006412  P:translation  
Pfam View protein in Pfam  
PF00333  Ribosomal_S5  
PF03719  Ribosomal_S5_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50881  S5_DSRBD  
Amino Acid Sequences MSAARSSECVFCLFTRTSRPKALPRRQFHTSPVAQKRKPKFPSVKADFNQVDLNERAKEFPSAQDAPAHYSPEQRAAIQAAQKLIDFEKLQKQTGMRTDPWKLKYYDELTKIDPVVDKPVRAPMTNIDDNARLKTDEEIEDDFIKFMNEIPDPKHENDYDQDLWDKFDKNLRLTVGREEAERNPPTALAPDLPKVAEPKPPQRKKSKDGEGETERNDQRVVSPALLQLMQMTGYSQKEIARLRVKTVVSHRVVNQTRLGKIQKIYCLSVAGNGQGLIGIGEGKSAEDAQAILQSQYRAIRNMTPILRYEDRTIYGDLSAKVSATELELYARPPGFGLRCQQYIWEICRCAGIHDLAARVTRSRNPMNTVKATVQALLSQKHPEEIARARGKKLVDVRKVYYAGQT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.33
3 0.39
4 0.43
5 0.49
6 0.55
7 0.6
8 0.69
9 0.77
10 0.76
11 0.77
12 0.78
13 0.77
14 0.74
15 0.69
16 0.68
17 0.65
18 0.65
19 0.68
20 0.71
21 0.7
22 0.76
23 0.79
24 0.79
25 0.77
26 0.78
27 0.77
28 0.76
29 0.82
30 0.81
31 0.82
32 0.73
33 0.77
34 0.67
35 0.59
36 0.53
37 0.42
38 0.4
39 0.31
40 0.33
41 0.26
42 0.26
43 0.25
44 0.22
45 0.25
46 0.21
47 0.23
48 0.27
49 0.27
50 0.27
51 0.3
52 0.3
53 0.34
54 0.34
55 0.35
56 0.28
57 0.31
58 0.31
59 0.33
60 0.33
61 0.27
62 0.26
63 0.26
64 0.29
65 0.27
66 0.28
67 0.23
68 0.22
69 0.22
70 0.22
71 0.19
72 0.2
73 0.17
74 0.19
75 0.27
76 0.29
77 0.3
78 0.31
79 0.32
80 0.33
81 0.39
82 0.41
83 0.36
84 0.38
85 0.44
86 0.49
87 0.52
88 0.51
89 0.46
90 0.42
91 0.46
92 0.45
93 0.46
94 0.43
95 0.42
96 0.39
97 0.4
98 0.38
99 0.32
100 0.28
101 0.21
102 0.26
103 0.25
104 0.23
105 0.21
106 0.28
107 0.29
108 0.27
109 0.28
110 0.24
111 0.3
112 0.32
113 0.32
114 0.26
115 0.28
116 0.29
117 0.29
118 0.25
119 0.17
120 0.16
121 0.17
122 0.18
123 0.15
124 0.17
125 0.17
126 0.18
127 0.19
128 0.18
129 0.16
130 0.13
131 0.12
132 0.09
133 0.09
134 0.1
135 0.1
136 0.11
137 0.14
138 0.2
139 0.24
140 0.25
141 0.28
142 0.25
143 0.26
144 0.27
145 0.31
146 0.25
147 0.22
148 0.23
149 0.2
150 0.21
151 0.21
152 0.21
153 0.15
154 0.2
155 0.22
156 0.21
157 0.24
158 0.24
159 0.24
160 0.24
161 0.26
162 0.25
163 0.22
164 0.21
165 0.21
166 0.22
167 0.27
168 0.27
169 0.24
170 0.2
171 0.2
172 0.19
173 0.17
174 0.15
175 0.1
176 0.1
177 0.11
178 0.11
179 0.11
180 0.11
181 0.13
182 0.13
183 0.19
184 0.21
185 0.3
186 0.41
187 0.48
188 0.54
189 0.62
190 0.68
191 0.67
192 0.73
193 0.73
194 0.7
195 0.66
196 0.67
197 0.64
198 0.6
199 0.56
200 0.53
201 0.44
202 0.36
203 0.32
204 0.24
205 0.19
206 0.2
207 0.19
208 0.13
209 0.13
210 0.13
211 0.14
212 0.14
213 0.13
214 0.08
215 0.07
216 0.06
217 0.05
218 0.05
219 0.07
220 0.07
221 0.08
222 0.09
223 0.09
224 0.14
225 0.15
226 0.22
227 0.26
228 0.26
229 0.29
230 0.33
231 0.33
232 0.33
233 0.38
234 0.4
235 0.35
236 0.37
237 0.37
238 0.41
239 0.42
240 0.4
241 0.4
242 0.35
243 0.34
244 0.36
245 0.36
246 0.3
247 0.32
248 0.34
249 0.33
250 0.33
251 0.33
252 0.28
253 0.28
254 0.24
255 0.23
256 0.19
257 0.15
258 0.12
259 0.11
260 0.1
261 0.08
262 0.08
263 0.05
264 0.04
265 0.04
266 0.03
267 0.04
268 0.04
269 0.04
270 0.04
271 0.04
272 0.05
273 0.04
274 0.05
275 0.05
276 0.07
277 0.08
278 0.08
279 0.1
280 0.1
281 0.12
282 0.16
283 0.17
284 0.17
285 0.18
286 0.22
287 0.23
288 0.3
289 0.3
290 0.28
291 0.28
292 0.33
293 0.35
294 0.33
295 0.34
296 0.3
297 0.31
298 0.31
299 0.3
300 0.24
301 0.22
302 0.23
303 0.2
304 0.19
305 0.17
306 0.14
307 0.13
308 0.12
309 0.11
310 0.09
311 0.09
312 0.08
313 0.1
314 0.11
315 0.11
316 0.15
317 0.15
318 0.14
319 0.13
320 0.18
321 0.18
322 0.21
323 0.27
324 0.28
325 0.3
326 0.3
327 0.31
328 0.32
329 0.35
330 0.36
331 0.35
332 0.31
333 0.29
334 0.33
335 0.32
336 0.29
337 0.27
338 0.24
339 0.2
340 0.21
341 0.22
342 0.2
343 0.22
344 0.21
345 0.2
346 0.22
347 0.25
348 0.31
349 0.37
350 0.4
351 0.45
352 0.51
353 0.57
354 0.58
355 0.57
356 0.51
357 0.48
358 0.44
359 0.39
360 0.32
361 0.29
362 0.28
363 0.26
364 0.26
365 0.27
366 0.27
367 0.27
368 0.27
369 0.24
370 0.27
371 0.31
372 0.39
373 0.44
374 0.47
375 0.47
376 0.51
377 0.5
378 0.51
379 0.55
380 0.55
381 0.54
382 0.58
383 0.6
384 0.63
385 0.64