Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1C1CPZ4

Protein Details
Accession A0A1C1CPZ4    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
409-428APEKAPKERKAKPQAPKLSKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
408-425LAPEKAPKERKAKPQAPK
624-649EMRMKLERERRARAAEERLKRMQGGR
Subcellular Location(s) cyto 11, cyto_nucl 10, nucl 7, mito 4, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002110  Ankyrin_rpt  
IPR036770  Ankyrin_rpt-contain_sf  
IPR047139  ANKZ1/VMS1  
IPR003604  Matrin/U1-like-C_Znf_C2H2  
IPR041175  VLRF1/Vms1  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF13857  Ank_5  
PF18826  bVLRF1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50088  ANK_REPEAT  
Amino Acid Sequences MADTSQAETNPLLRRPLYIYDLPPELLFTLTVAGKEHSQPPDHTPPDEPTVRRTNNNEDGVTNSTSCSLCKVIFNSVQDQRNHVKSDFHRYNLKLSIKQQPLVDEATFVRLIGDLDESLSGSDSDDSEDENDDGLKAGDSTLTALLRKQAKISHQEADGETEGSGKRGYGNAPLIWLSSPKLGDDVRLGVYRAILSSEEQEQAPTSLVDIIQKKQLKPVPAKLSGQAQKDAIQAAQSDPHFFLCMIGGGHFAAMVVSLVPELRKGPGGVEERHAVVKAHKTFHRYTTRRKQGGSQSANDNAKGNAHSAGSSIRRYNEMALEADVRAVLHDWRATIDTAELLLIRATGSTNRRTLFGPYDGQVLRSTDKRIRGFPFSTRRATQAELLRSFQELTRLKVSKLVEPAPEKLAPEKAPKERKAKPQAPKLSKEEEALQFHTSQLQALIRRSKAPGVLLYLTKNELSPDFTFFPAAEHRHAPTPLHLSASTNSPALILALLTKARANPTIRNDDGKTAYDIAGDAKTRDAFRIARHQLGENAFDWAAAHIPAALSQEEVDAKAAQEKAISDAAEAQRRKADLERLRQEEEKRSVTRIERKAGAGKTLAAAVEKTGAEKREEEARGLTPEMRMKLERERRARAAEERLKRMQGGR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.33
3 0.37
4 0.38
5 0.37
6 0.37
7 0.38
8 0.4
9 0.38
10 0.33
11 0.29
12 0.23
13 0.18
14 0.15
15 0.11
16 0.12
17 0.11
18 0.12
19 0.12
20 0.13
21 0.15
22 0.19
23 0.26
24 0.27
25 0.31
26 0.33
27 0.4
28 0.49
29 0.49
30 0.47
31 0.45
32 0.45
33 0.48
34 0.52
35 0.45
36 0.42
37 0.49
38 0.52
39 0.54
40 0.56
41 0.57
42 0.6
43 0.63
44 0.57
45 0.48
46 0.48
47 0.45
48 0.42
49 0.32
50 0.23
51 0.21
52 0.2
53 0.2
54 0.19
55 0.17
56 0.16
57 0.2
58 0.22
59 0.26
60 0.31
61 0.34
62 0.38
63 0.44
64 0.49
65 0.46
66 0.5
67 0.49
68 0.5
69 0.51
70 0.44
71 0.45
72 0.43
73 0.53
74 0.53
75 0.51
76 0.53
77 0.51
78 0.56
79 0.56
80 0.57
81 0.52
82 0.51
83 0.57
84 0.54
85 0.55
86 0.51
87 0.45
88 0.42
89 0.39
90 0.34
91 0.26
92 0.22
93 0.22
94 0.2
95 0.17
96 0.15
97 0.11
98 0.12
99 0.1
100 0.11
101 0.07
102 0.08
103 0.08
104 0.08
105 0.08
106 0.08
107 0.07
108 0.06
109 0.07
110 0.07
111 0.08
112 0.08
113 0.09
114 0.1
115 0.11
116 0.11
117 0.1
118 0.1
119 0.08
120 0.09
121 0.08
122 0.07
123 0.06
124 0.06
125 0.06
126 0.05
127 0.07
128 0.09
129 0.09
130 0.1
131 0.1
132 0.16
133 0.21
134 0.21
135 0.22
136 0.25
137 0.3
138 0.37
139 0.41
140 0.39
141 0.35
142 0.38
143 0.36
144 0.36
145 0.31
146 0.24
147 0.2
148 0.18
149 0.16
150 0.14
151 0.14
152 0.09
153 0.09
154 0.11
155 0.12
156 0.15
157 0.18
158 0.18
159 0.19
160 0.19
161 0.19
162 0.17
163 0.17
164 0.13
165 0.12
166 0.12
167 0.11
168 0.14
169 0.13
170 0.14
171 0.15
172 0.15
173 0.15
174 0.16
175 0.16
176 0.14
177 0.14
178 0.13
179 0.11
180 0.1
181 0.08
182 0.08
183 0.1
184 0.12
185 0.12
186 0.12
187 0.12
188 0.12
189 0.12
190 0.12
191 0.1
192 0.08
193 0.07
194 0.08
195 0.12
196 0.14
197 0.15
198 0.22
199 0.26
200 0.26
201 0.32
202 0.35
203 0.38
204 0.41
205 0.49
206 0.49
207 0.5
208 0.51
209 0.46
210 0.52
211 0.5
212 0.47
213 0.4
214 0.33
215 0.3
216 0.3
217 0.28
218 0.19
219 0.15
220 0.13
221 0.11
222 0.14
223 0.12
224 0.13
225 0.13
226 0.13
227 0.13
228 0.12
229 0.12
230 0.08
231 0.08
232 0.07
233 0.07
234 0.07
235 0.06
236 0.06
237 0.05
238 0.05
239 0.04
240 0.03
241 0.03
242 0.02
243 0.02
244 0.03
245 0.03
246 0.03
247 0.04
248 0.05
249 0.05
250 0.06
251 0.07
252 0.07
253 0.14
254 0.18
255 0.19
256 0.21
257 0.21
258 0.21
259 0.22
260 0.22
261 0.15
262 0.14
263 0.2
264 0.21
265 0.25
266 0.26
267 0.31
268 0.33
269 0.41
270 0.49
271 0.46
272 0.53
273 0.59
274 0.67
275 0.65
276 0.64
277 0.63
278 0.61
279 0.67
280 0.61
281 0.53
282 0.46
283 0.49
284 0.48
285 0.42
286 0.34
287 0.23
288 0.21
289 0.18
290 0.15
291 0.1
292 0.09
293 0.09
294 0.08
295 0.11
296 0.12
297 0.14
298 0.14
299 0.14
300 0.15
301 0.16
302 0.16
303 0.15
304 0.14
305 0.12
306 0.12
307 0.12
308 0.1
309 0.1
310 0.08
311 0.07
312 0.05
313 0.05
314 0.05
315 0.05
316 0.05
317 0.05
318 0.06
319 0.07
320 0.08
321 0.07
322 0.07
323 0.06
324 0.06
325 0.06
326 0.05
327 0.04
328 0.04
329 0.04
330 0.03
331 0.03
332 0.04
333 0.08
334 0.11
335 0.14
336 0.17
337 0.17
338 0.19
339 0.2
340 0.22
341 0.22
342 0.22
343 0.2
344 0.18
345 0.22
346 0.21
347 0.21
348 0.19
349 0.17
350 0.16
351 0.16
352 0.2
353 0.19
354 0.26
355 0.27
356 0.31
357 0.33
358 0.37
359 0.38
360 0.42
361 0.47
362 0.45
363 0.47
364 0.43
365 0.43
366 0.39
367 0.39
368 0.36
369 0.33
370 0.34
371 0.31
372 0.31
373 0.29
374 0.27
375 0.27
376 0.21
377 0.24
378 0.19
379 0.21
380 0.27
381 0.28
382 0.27
383 0.31
384 0.33
385 0.28
386 0.31
387 0.3
388 0.28
389 0.3
390 0.31
391 0.3
392 0.3
393 0.26
394 0.24
395 0.25
396 0.23
397 0.27
398 0.31
399 0.37
400 0.45
401 0.51
402 0.58
403 0.61
404 0.69
405 0.73
406 0.76
407 0.76
408 0.77
409 0.81
410 0.79
411 0.78
412 0.73
413 0.67
414 0.6
415 0.53
416 0.48
417 0.43
418 0.4
419 0.36
420 0.32
421 0.27
422 0.25
423 0.25
424 0.19
425 0.14
426 0.12
427 0.13
428 0.15
429 0.19
430 0.25
431 0.24
432 0.26
433 0.27
434 0.28
435 0.26
436 0.25
437 0.22
438 0.21
439 0.22
440 0.22
441 0.22
442 0.21
443 0.2
444 0.19
445 0.17
446 0.14
447 0.12
448 0.15
449 0.15
450 0.18
451 0.18
452 0.19
453 0.19
454 0.18
455 0.19
456 0.2
457 0.22
458 0.2
459 0.2
460 0.22
461 0.26
462 0.27
463 0.26
464 0.25
465 0.28
466 0.26
467 0.27
468 0.25
469 0.23
470 0.23
471 0.26
472 0.23
473 0.18
474 0.17
475 0.14
476 0.13
477 0.11
478 0.1
479 0.06
480 0.05
481 0.07
482 0.07
483 0.07
484 0.08
485 0.1
486 0.12
487 0.18
488 0.2
489 0.25
490 0.32
491 0.4
492 0.41
493 0.45
494 0.44
495 0.44
496 0.44
497 0.39
498 0.34
499 0.28
500 0.26
501 0.21
502 0.2
503 0.16
504 0.16
505 0.15
506 0.13
507 0.13
508 0.16
509 0.16
510 0.17
511 0.2
512 0.19
513 0.23
514 0.34
515 0.35
516 0.38
517 0.39
518 0.4
519 0.41
520 0.42
521 0.4
522 0.29
523 0.28
524 0.23
525 0.21
526 0.19
527 0.14
528 0.12
529 0.1
530 0.09
531 0.06
532 0.06
533 0.08
534 0.09
535 0.09
536 0.08
537 0.08
538 0.1
539 0.1
540 0.11
541 0.11
542 0.1
543 0.1
544 0.15
545 0.15
546 0.14
547 0.14
548 0.14
549 0.16
550 0.18
551 0.18
552 0.13
553 0.2
554 0.25
555 0.32
556 0.32
557 0.31
558 0.32
559 0.33
560 0.35
561 0.33
562 0.38
563 0.39
564 0.49
565 0.56
566 0.58
567 0.62
568 0.65
569 0.65
570 0.65
571 0.63
572 0.6
573 0.53
574 0.5
575 0.52
576 0.55
577 0.6
578 0.58
579 0.58
580 0.54
581 0.56
582 0.61
583 0.56
584 0.52
585 0.43
586 0.37
587 0.31
588 0.29
589 0.25
590 0.18
591 0.16
592 0.13
593 0.15
594 0.14
595 0.15
596 0.18
597 0.2
598 0.21
599 0.23
600 0.25
601 0.3
602 0.32
603 0.31
604 0.3
605 0.32
606 0.33
607 0.34
608 0.33
609 0.28
610 0.33
611 0.33
612 0.34
613 0.33
614 0.33
615 0.42
616 0.5
617 0.55
618 0.57
619 0.63
620 0.65
621 0.69
622 0.71
623 0.68
624 0.69
625 0.69
626 0.7
627 0.69
628 0.69
629 0.65