Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1C1CIG1

Protein Details
Accession A0A1C1CIG1    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
115-136LSSSKAQKPGKKRKANGAAKAEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
120-132AQKPGKKRKANGA
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 13.833, mito_nucl 10.499, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019544  Tetratricopeptide_SHNi-TPR_dom  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF10516  SHNi-TPR  
Amino Acid Sequences MATNGDEVPATVPDPQHEGEPGMATATDKTSGTPADTDKRAQLTELIAQAAAEYAVKHYLEAAELYSQATELQAELNGEMAIENADLYYSYGKCLFFLAQQTSSVLGGTAASAQLSSSKAQKPGKKRKANGAAKAEASATNGGGAGATSQDASAAPPTSVANVGDIVPREDVQQPPQTASDKPYFQISGDAEGWDDSEDDEADEDGEAGEEEDDDDFATSYEFLDLARVLYLKKLDQSQAHAMEDSEKGKYVASIDLTPEVKSLKARVAEIYDLQAEVELEGEKYSDAATNLNACLALREELERPESSILAECHYKLSLALEFSASSEERDAAGNPTGKLLVDWKIRNEAIAQQEKAIDVCKLRVAAETAALDKLDVGPAKDKAMAQIEDVQDMIAEMEVRLEELRKPPVSVKAESENEMKQQIQGVLGSLLGSGVTEEEKQEKLAQVTEKATDISGMVKRKKPKATESNGGGSGHDSAASTPAAAPTVASGSSLGKRKVEFMDEAAQAETGKKAKVEDVEDSGV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.19
3 0.2
4 0.2
5 0.2
6 0.19
7 0.2
8 0.18
9 0.14
10 0.14
11 0.13
12 0.13
13 0.13
14 0.13
15 0.12
16 0.13
17 0.15
18 0.15
19 0.17
20 0.19
21 0.22
22 0.28
23 0.31
24 0.33
25 0.35
26 0.37
27 0.36
28 0.33
29 0.31
30 0.26
31 0.28
32 0.27
33 0.23
34 0.19
35 0.18
36 0.17
37 0.15
38 0.12
39 0.07
40 0.06
41 0.06
42 0.1
43 0.1
44 0.1
45 0.11
46 0.11
47 0.12
48 0.12
49 0.12
50 0.1
51 0.11
52 0.11
53 0.1
54 0.1
55 0.09
56 0.08
57 0.07
58 0.06
59 0.06
60 0.07
61 0.08
62 0.07
63 0.08
64 0.08
65 0.07
66 0.07
67 0.06
68 0.06
69 0.05
70 0.05
71 0.04
72 0.04
73 0.04
74 0.05
75 0.09
76 0.09
77 0.11
78 0.14
79 0.14
80 0.14
81 0.16
82 0.16
83 0.15
84 0.21
85 0.24
86 0.22
87 0.23
88 0.23
89 0.23
90 0.21
91 0.18
92 0.12
93 0.08
94 0.07
95 0.06
96 0.06
97 0.05
98 0.05
99 0.05
100 0.05
101 0.07
102 0.08
103 0.09
104 0.15
105 0.19
106 0.27
107 0.34
108 0.41
109 0.51
110 0.61
111 0.7
112 0.74
113 0.75
114 0.78
115 0.82
116 0.84
117 0.82
118 0.79
119 0.72
120 0.62
121 0.58
122 0.48
123 0.38
124 0.3
125 0.22
126 0.14
127 0.1
128 0.09
129 0.08
130 0.07
131 0.06
132 0.04
133 0.04
134 0.04
135 0.04
136 0.04
137 0.04
138 0.04
139 0.05
140 0.07
141 0.08
142 0.07
143 0.08
144 0.08
145 0.09
146 0.1
147 0.09
148 0.08
149 0.08
150 0.09
151 0.1
152 0.1
153 0.11
154 0.1
155 0.11
156 0.12
157 0.15
158 0.16
159 0.19
160 0.24
161 0.23
162 0.24
163 0.26
164 0.26
165 0.24
166 0.27
167 0.27
168 0.23
169 0.23
170 0.24
171 0.22
172 0.2
173 0.24
174 0.2
175 0.19
176 0.18
177 0.18
178 0.15
179 0.14
180 0.14
181 0.1
182 0.09
183 0.05
184 0.05
185 0.05
186 0.05
187 0.05
188 0.05
189 0.05
190 0.04
191 0.04
192 0.04
193 0.04
194 0.03
195 0.03
196 0.03
197 0.03
198 0.03
199 0.03
200 0.03
201 0.04
202 0.04
203 0.04
204 0.04
205 0.04
206 0.04
207 0.04
208 0.04
209 0.04
210 0.04
211 0.04
212 0.05
213 0.05
214 0.05
215 0.05
216 0.05
217 0.07
218 0.08
219 0.08
220 0.1
221 0.12
222 0.15
223 0.16
224 0.2
225 0.24
226 0.25
227 0.25
228 0.23
229 0.21
230 0.2
231 0.21
232 0.17
233 0.12
234 0.1
235 0.1
236 0.09
237 0.1
238 0.08
239 0.08
240 0.09
241 0.09
242 0.09
243 0.12
244 0.13
245 0.12
246 0.12
247 0.11
248 0.1
249 0.1
250 0.1
251 0.11
252 0.12
253 0.12
254 0.13
255 0.14
256 0.14
257 0.14
258 0.14
259 0.11
260 0.1
261 0.09
262 0.08
263 0.06
264 0.05
265 0.05
266 0.04
267 0.04
268 0.04
269 0.04
270 0.04
271 0.04
272 0.04
273 0.05
274 0.05
275 0.06
276 0.06
277 0.08
278 0.08
279 0.08
280 0.07
281 0.06
282 0.06
283 0.07
284 0.07
285 0.06
286 0.08
287 0.09
288 0.1
289 0.13
290 0.13
291 0.13
292 0.13
293 0.12
294 0.11
295 0.13
296 0.12
297 0.11
298 0.12
299 0.11
300 0.12
301 0.12
302 0.11
303 0.08
304 0.1
305 0.09
306 0.09
307 0.09
308 0.08
309 0.08
310 0.09
311 0.11
312 0.09
313 0.08
314 0.08
315 0.08
316 0.08
317 0.09
318 0.09
319 0.09
320 0.13
321 0.15
322 0.14
323 0.14
324 0.14
325 0.13
326 0.13
327 0.13
328 0.16
329 0.2
330 0.21
331 0.22
332 0.27
333 0.27
334 0.27
335 0.26
336 0.25
337 0.27
338 0.31
339 0.3
340 0.26
341 0.27
342 0.26
343 0.25
344 0.21
345 0.15
346 0.1
347 0.11
348 0.12
349 0.12
350 0.12
351 0.13
352 0.14
353 0.13
354 0.15
355 0.14
356 0.14
357 0.13
358 0.13
359 0.11
360 0.09
361 0.09
362 0.09
363 0.09
364 0.09
365 0.12
366 0.13
367 0.15
368 0.17
369 0.17
370 0.17
371 0.22
372 0.21
373 0.2
374 0.25
375 0.24
376 0.22
377 0.22
378 0.18
379 0.13
380 0.12
381 0.11
382 0.05
383 0.04
384 0.04
385 0.04
386 0.04
387 0.05
388 0.06
389 0.07
390 0.1
391 0.14
392 0.2
393 0.21
394 0.23
395 0.25
396 0.34
397 0.38
398 0.37
399 0.37
400 0.39
401 0.41
402 0.42
403 0.42
404 0.35
405 0.33
406 0.33
407 0.29
408 0.21
409 0.22
410 0.2
411 0.17
412 0.15
413 0.14
414 0.12
415 0.12
416 0.11
417 0.07
418 0.06
419 0.05
420 0.05
421 0.03
422 0.04
423 0.05
424 0.06
425 0.07
426 0.1
427 0.11
428 0.13
429 0.16
430 0.18
431 0.19
432 0.23
433 0.25
434 0.27
435 0.28
436 0.28
437 0.26
438 0.24
439 0.22
440 0.18
441 0.15
442 0.16
443 0.19
444 0.26
445 0.32
446 0.37
447 0.46
448 0.54
449 0.62
450 0.64
451 0.69
452 0.72
453 0.74
454 0.77
455 0.75
456 0.72
457 0.67
458 0.61
459 0.5
460 0.4
461 0.34
462 0.24
463 0.19
464 0.13
465 0.1
466 0.11
467 0.11
468 0.1
469 0.09
470 0.1
471 0.1
472 0.1
473 0.09
474 0.08
475 0.1
476 0.09
477 0.09
478 0.09
479 0.12
480 0.19
481 0.25
482 0.27
483 0.28
484 0.29
485 0.34
486 0.37
487 0.38
488 0.34
489 0.33
490 0.37
491 0.35
492 0.36
493 0.31
494 0.28
495 0.23
496 0.22
497 0.21
498 0.16
499 0.17
500 0.16
501 0.18
502 0.22
503 0.27
504 0.31
505 0.32