Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1C1CB01

Protein Details
Accession A0A1C1CB01    Localization Confidence High Confidence Score 18.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
351-374ESGPSRRSRTRSRTRSRSRSYSDSHydrophilic
580-599EDKDREEKDERRKRARVDDDAcidic
NLS Segment(s)
PositionSequence
221-238PPKFKHKKIPRGPPSPPP
336-369REMARKAREERQRNNESGPSRRSRTRSRTRSRSR
392-400RERARRERR
568-573GKGKKR
589-593ERRKR
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 13, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017862  SKI-int_prot_SKIP  
IPR004015  SKI-int_prot_SKIP_SNW-dom  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF02731  SKIP_SNW  
Amino Acid Sequences MATGLFASLPKPKYTGEHEEVPLHAQPKGPRIVGPGVIDESQIVLKRAGPPPYGQRSGWRPRSAEDYGDGGAFPEIPVAQYPLDMGRKGTSSTSNALAIQVDAEGKVKYDAIARQGHSESRIIHSSFKDLIPLRQRADAGDINLDRPTQEEAQATAERTKQALEKLVSGAVAAQRPKNVKGVTREEPTYVRYTPANQMGDTSKKNDRIFKIVKRQEDPMEPPKFKHKKIPRGPPSPPPPVMHSPPRKLTAEDQEAWKIPPPISNWKNPKGYTVPLDKRLAADGRGLQDVTINDKFAQFAEALFTADRHAREEVRLRAQMQQKLAEKEKLAKEDHLREMARKAREERQRNNESGPSRRSRTRSRTRSRSRSYSDSSDGGRSRSGPDDEYARERERARRERRAENERQLRQSRMGTEKRMQMLAREQNRDISEKVALGLAKPTQNKETMYDSRLFNQTSGFDSGFNEDQAYDKPLFAAHDAINSIYRPTAGGADEEEYGDDAAAGEMGKISKSNRFEVLGRAKEGFKGADVAEREAGPVQFEKDKDDPFGIDSLIGEERDRARGSDKDSGKGKKRYGLDTGEDKDREEKDERRKRARVDDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.43
3 0.42
4 0.47
5 0.48
6 0.49
7 0.48
8 0.46
9 0.42
10 0.34
11 0.3
12 0.27
13 0.28
14 0.33
15 0.38
16 0.35
17 0.33
18 0.37
19 0.4
20 0.39
21 0.37
22 0.33
23 0.3
24 0.29
25 0.27
26 0.22
27 0.19
28 0.18
29 0.17
30 0.16
31 0.14
32 0.16
33 0.24
34 0.29
35 0.33
36 0.32
37 0.35
38 0.44
39 0.52
40 0.53
41 0.47
42 0.49
43 0.54
44 0.62
45 0.67
46 0.63
47 0.56
48 0.54
49 0.61
50 0.56
51 0.49
52 0.4
53 0.34
54 0.29
55 0.27
56 0.24
57 0.17
58 0.15
59 0.12
60 0.09
61 0.07
62 0.07
63 0.07
64 0.08
65 0.09
66 0.09
67 0.09
68 0.1
69 0.14
70 0.18
71 0.17
72 0.18
73 0.18
74 0.2
75 0.21
76 0.23
77 0.22
78 0.22
79 0.24
80 0.25
81 0.24
82 0.23
83 0.23
84 0.2
85 0.16
86 0.13
87 0.11
88 0.09
89 0.08
90 0.09
91 0.08
92 0.08
93 0.09
94 0.09
95 0.09
96 0.13
97 0.15
98 0.2
99 0.26
100 0.26
101 0.3
102 0.31
103 0.33
104 0.31
105 0.31
106 0.27
107 0.25
108 0.29
109 0.26
110 0.29
111 0.28
112 0.3
113 0.29
114 0.28
115 0.29
116 0.26
117 0.32
118 0.36
119 0.4
120 0.38
121 0.38
122 0.39
123 0.33
124 0.37
125 0.33
126 0.26
127 0.27
128 0.26
129 0.23
130 0.24
131 0.23
132 0.17
133 0.16
134 0.19
135 0.13
136 0.15
137 0.15
138 0.16
139 0.2
140 0.22
141 0.23
142 0.22
143 0.22
144 0.21
145 0.2
146 0.21
147 0.18
148 0.19
149 0.24
150 0.22
151 0.22
152 0.22
153 0.23
154 0.21
155 0.18
156 0.17
157 0.13
158 0.15
159 0.15
160 0.16
161 0.19
162 0.22
163 0.24
164 0.29
165 0.28
166 0.3
167 0.36
168 0.42
169 0.44
170 0.45
171 0.45
172 0.41
173 0.4
174 0.38
175 0.35
176 0.28
177 0.23
178 0.2
179 0.22
180 0.25
181 0.3
182 0.28
183 0.24
184 0.26
185 0.27
186 0.32
187 0.3
188 0.3
189 0.28
190 0.34
191 0.37
192 0.42
193 0.41
194 0.45
195 0.5
196 0.54
197 0.6
198 0.59
199 0.62
200 0.58
201 0.59
202 0.54
203 0.52
204 0.5
205 0.48
206 0.5
207 0.45
208 0.44
209 0.51
210 0.54
211 0.5
212 0.54
213 0.55
214 0.58
215 0.67
216 0.77
217 0.75
218 0.77
219 0.8
220 0.78
221 0.76
222 0.72
223 0.66
224 0.56
225 0.53
226 0.49
227 0.5
228 0.5
229 0.5
230 0.48
231 0.49
232 0.51
233 0.47
234 0.43
235 0.43
236 0.42
237 0.4
238 0.37
239 0.35
240 0.33
241 0.33
242 0.31
243 0.29
244 0.22
245 0.16
246 0.18
247 0.2
248 0.28
249 0.31
250 0.39
251 0.43
252 0.48
253 0.53
254 0.5
255 0.5
256 0.43
257 0.42
258 0.38
259 0.41
260 0.38
261 0.38
262 0.4
263 0.36
264 0.33
265 0.33
266 0.29
267 0.2
268 0.18
269 0.15
270 0.15
271 0.15
272 0.14
273 0.12
274 0.13
275 0.12
276 0.15
277 0.14
278 0.13
279 0.12
280 0.12
281 0.13
282 0.11
283 0.12
284 0.06
285 0.06
286 0.07
287 0.07
288 0.07
289 0.07
290 0.07
291 0.07
292 0.09
293 0.09
294 0.1
295 0.11
296 0.11
297 0.14
298 0.2
299 0.22
300 0.25
301 0.27
302 0.26
303 0.32
304 0.37
305 0.38
306 0.34
307 0.36
308 0.35
309 0.37
310 0.39
311 0.35
312 0.3
313 0.33
314 0.34
315 0.33
316 0.3
317 0.3
318 0.32
319 0.35
320 0.37
321 0.36
322 0.33
323 0.3
324 0.34
325 0.36
326 0.34
327 0.32
328 0.33
329 0.36
330 0.45
331 0.53
332 0.56
333 0.6
334 0.62
335 0.61
336 0.6
337 0.57
338 0.52
339 0.5
340 0.47
341 0.43
342 0.41
343 0.45
344 0.48
345 0.52
346 0.59
347 0.63
348 0.68
349 0.73
350 0.79
351 0.84
352 0.89
353 0.87
354 0.85
355 0.8
356 0.77
357 0.71
358 0.66
359 0.58
360 0.5
361 0.44
362 0.41
363 0.36
364 0.3
365 0.25
366 0.21
367 0.2
368 0.21
369 0.21
370 0.17
371 0.17
372 0.2
373 0.21
374 0.25
375 0.27
376 0.25
377 0.28
378 0.29
379 0.35
380 0.42
381 0.5
382 0.55
383 0.61
384 0.65
385 0.7
386 0.77
387 0.79
388 0.78
389 0.78
390 0.79
391 0.75
392 0.77
393 0.71
394 0.65
395 0.59
396 0.53
397 0.48
398 0.47
399 0.47
400 0.44
401 0.46
402 0.49
403 0.47
404 0.47
405 0.41
406 0.35
407 0.39
408 0.42
409 0.44
410 0.42
411 0.41
412 0.43
413 0.44
414 0.44
415 0.36
416 0.29
417 0.23
418 0.19
419 0.19
420 0.16
421 0.14
422 0.11
423 0.13
424 0.14
425 0.18
426 0.2
427 0.22
428 0.23
429 0.26
430 0.27
431 0.27
432 0.32
433 0.32
434 0.33
435 0.35
436 0.33
437 0.35
438 0.38
439 0.35
440 0.27
441 0.25
442 0.23
443 0.21
444 0.24
445 0.2
446 0.16
447 0.16
448 0.2
449 0.19
450 0.18
451 0.15
452 0.12
453 0.13
454 0.14
455 0.17
456 0.14
457 0.13
458 0.13
459 0.13
460 0.14
461 0.14
462 0.16
463 0.13
464 0.14
465 0.15
466 0.15
467 0.16
468 0.15
469 0.15
470 0.11
471 0.11
472 0.09
473 0.1
474 0.11
475 0.1
476 0.1
477 0.11
478 0.13
479 0.13
480 0.13
481 0.12
482 0.1
483 0.1
484 0.08
485 0.07
486 0.05
487 0.05
488 0.05
489 0.05
490 0.04
491 0.05
492 0.06
493 0.06
494 0.08
495 0.1
496 0.16
497 0.2
498 0.24
499 0.26
500 0.29
501 0.3
502 0.38
503 0.46
504 0.43
505 0.42
506 0.41
507 0.39
508 0.38
509 0.38
510 0.3
511 0.21
512 0.19
513 0.17
514 0.2
515 0.21
516 0.22
517 0.22
518 0.21
519 0.21
520 0.21
521 0.21
522 0.17
523 0.17
524 0.17
525 0.2
526 0.21
527 0.26
528 0.28
529 0.3
530 0.31
531 0.32
532 0.29
533 0.27
534 0.27
535 0.21
536 0.17
537 0.15
538 0.15
539 0.15
540 0.14
541 0.13
542 0.15
543 0.17
544 0.21
545 0.22
546 0.21
547 0.24
548 0.28
549 0.34
550 0.4
551 0.41
552 0.44
553 0.51
554 0.59
555 0.64
556 0.68
557 0.66
558 0.64
559 0.67
560 0.65
561 0.64
562 0.61
563 0.58
564 0.58
565 0.58
566 0.59
567 0.54
568 0.5
569 0.5
570 0.45
571 0.44
572 0.42
573 0.46
574 0.49
575 0.59
576 0.67
577 0.7
578 0.76
579 0.78