FuNGI

A0A1C1CWD2

Protein Details

Accession

A0A1C1CWD2

Localization Confidence

Low

Confidence Score

8.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
191-210	IEPPQPKRRHSGQRRQAVTP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

mito 11, nucl 10, cyto 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039745 Vps54 IPR012501 Vps54_C
Gene Ontology	GO:0005829 C:cytosol GO:0000938 C:GARP complex GO:0015031 P:protein transport GO:0042147 P:retrograde transport, endosome to Golgi
Pfam	View protein in Pfam PF07928 Vps54

Amino Acid Sequences

MASPMRPGSSQSSVGSPVVTSPMTEYPFPTTPQRKLGGSRNDLQRIATSSSVTSIGGTLDSASGKENAIPEFGQNAISTLLQHPIVHTGLRANVPPSSGYKAPGPREIPPVVLTNIPHIEAKAFHPYLSQVGSLYEAFQRAKNEGEGETSLFHRDRKDNKHEEWEAILAKGVQRPGHSRAGSMSSTASTPIEPPQPKRRHSGQRRQAVTPLSTIPSVYTEEDFHLENPRTFDIVSENSEIVRDPTGAPSGRKSLATNAILQEKLSWYMDTVEVHLINSISTASKSFFSALGSLRELHNEAADSVDRIQKLRKELARLDKEMAIDGLKVVNLKQRRDNVRQLAQAIMQLEDVVKSVQTCEANVEKGEIEEALDGLDEVELLMAGKESRVDSNQTSARYQRRDLRRIRALEGAFDDLRQLRYTAGRGYEARFHASLLTDIRRHVEQTETGVTLQRWGVAYTRTRPGQRRAPSSFPGYMSIGNELRAELEAEMKGLSRARYTTPAATSFRAIVLRELKSMIRKQLPSSNDDDAVSTVSASTTGGRSMSQQEKSSVLARNLRALDSDDCYHMLATIYTNISECLRRLSVQVKILLDITSNLPDSMLKSPPRSPDPASIDNVMSPQPGRPRATSSVQAEMQQVLDLSSLLGEGVDLAQAQITKVVKVRSQQNSDLPLPDFLRYFTLNRLFADECEAISGRSGTGLKTVLDAQIKDFVARFADSQKHNVVRVMDADKWDARDFGERENVILNRVIEGGTMDAPSWIESVMIWLKPSNGVETSNGITTNGNAAAAAKVRSAVIDEQKYILPESAIAMLQSMEMFQHLAAGIPSMSHDIATSLLESLKLFNSRSSQLILGAGATRSAGLKNITTKHLALSSQALSFIVALIPYVREFFRRHLPSSTAQQVMTDFDKVKRLFQEHQNGIHEKLVDIMSGRASMHVKAMKNIDWEEAAKNMSVSVSPYMETLTKETGTLQKVLAKHLPEPVVAGIMIPVFASYREQWTNAYRDVTIKSAAAKARLLADAEFFNSRISKIDGSGDLGEQIVKVIQAKTILSTVAPPEPSTEAATQIKAADEKTEPTAQKVTTEVEDTEKKEEVKA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.32
2	0.29
3	0.22
4	0.18
5	0.18
6	0.16
7	0.14
8	0.14
9	0.19
10	0.22
11	0.23
12	0.23
13	0.27
14	0.29
15	0.32
16	0.39
17	0.41
18	0.44
19	0.5
20	0.53
21	0.5
22	0.54
23	0.61
24	0.61
25	0.6
26	0.63
27	0.65
28	0.67
29	0.64
30	0.58
31	0.52
32	0.46
33	0.43
34	0.36
35	0.28
36	0.23
37	0.24
38	0.23
39	0.19
40	0.15
41	0.12
42	0.11
43	0.09
44	0.09
45	0.08
46	0.08
47	0.09
48	0.09
49	0.1
50	0.11
51	0.11
52	0.13
53	0.15
54	0.15
55	0.17
56	0.17
57	0.16
58	0.17
59	0.17
60	0.16
61	0.13
62	0.14
63	0.13
64	0.12
65	0.13
66	0.13
67	0.15
68	0.15
69	0.15
70	0.15
71	0.17
72	0.18
73	0.17
74	0.16
75	0.16
76	0.19
77	0.21
78	0.22
79	0.2
80	0.2
81	0.21
82	0.22
83	0.23
84	0.25
85	0.24
86	0.24
87	0.3
88	0.36
89	0.39
90	0.45
91	0.45
92	0.43
93	0.49
94	0.48
95	0.43
96	0.37
97	0.37
98	0.31
99	0.3
100	0.26
101	0.25
102	0.25
103	0.24
104	0.23
105	0.19
106	0.19
107	0.18
108	0.21
109	0.25
110	0.24
111	0.22
112	0.23
113	0.24
114	0.25
115	0.25
116	0.23
117	0.13
118	0.13
119	0.16
120	0.15
121	0.15
122	0.14
123	0.16
124	0.16
125	0.19
126	0.21
127	0.2
128	0.23
129	0.23
130	0.23
131	0.21
132	0.23
133	0.21
134	0.2
135	0.2
136	0.19
137	0.21
138	0.21
139	0.22
140	0.24
141	0.31
142	0.39
143	0.47
144	0.57
145	0.6
146	0.64
147	0.72
148	0.69
149	0.63
150	0.57
151	0.51
152	0.42
153	0.34
154	0.29
155	0.2
156	0.2
157	0.21
158	0.21
159	0.19
160	0.2
161	0.25
162	0.3
163	0.38
164	0.35
165	0.33
166	0.33
167	0.36
168	0.33
169	0.29
170	0.25
171	0.17
172	0.17
173	0.18
174	0.15
175	0.11
176	0.12
177	0.15
178	0.23
179	0.26
180	0.33
181	0.43
182	0.5
183	0.53
184	0.59
185	0.65
186	0.68
187	0.74
188	0.79
189	0.78
190	0.79
191	0.81
192	0.76
193	0.72
194	0.65
195	0.55
196	0.47
197	0.4
198	0.32
199	0.27
200	0.24
201	0.19
202	0.17
203	0.18
204	0.16
205	0.15
206	0.14
207	0.15
208	0.17
209	0.17
210	0.16
211	0.21
212	0.21
213	0.22
214	0.24
215	0.23
216	0.23
217	0.22
218	0.21
219	0.19
220	0.2
221	0.21
222	0.2
223	0.19
224	0.18
225	0.18
226	0.18
227	0.15
228	0.13
229	0.11
230	0.09
231	0.11
232	0.16
233	0.18
234	0.19
235	0.21
236	0.24
237	0.25
238	0.25
239	0.25
240	0.26
241	0.31
242	0.32
243	0.31
244	0.3
245	0.32
246	0.31
247	0.3
248	0.25
249	0.19
250	0.2
251	0.17
252	0.15
253	0.11
254	0.13
255	0.15
256	0.14
257	0.14
258	0.15
259	0.14
260	0.14
261	0.14
262	0.12
263	0.1
264	0.1
265	0.09
266	0.06
267	0.07
268	0.08
269	0.08
270	0.09
271	0.1
272	0.11
273	0.11
274	0.11
275	0.13
276	0.14
277	0.16
278	0.16
279	0.17
280	0.16
281	0.17
282	0.17
283	0.15
284	0.14
285	0.11
286	0.1
287	0.11
288	0.11
289	0.11
290	0.11
291	0.14
292	0.14
293	0.15
294	0.19
295	0.21
296	0.25
297	0.32
298	0.34
299	0.37
300	0.44
301	0.53
302	0.55
303	0.54
304	0.52
305	0.46
306	0.43
307	0.37
308	0.31
309	0.21
310	0.14
311	0.12
312	0.09
313	0.07
314	0.07
315	0.08
316	0.13
317	0.18
318	0.21
319	0.27
320	0.35
321	0.43
322	0.49
323	0.58
324	0.59
325	0.61
326	0.61
327	0.56
328	0.49
329	0.42
330	0.36
331	0.28
332	0.2
333	0.14
334	0.11
335	0.09
336	0.08
337	0.08
338	0.06
339	0.05
340	0.05
341	0.06
342	0.09
343	0.09
344	0.09
345	0.13
346	0.15
347	0.16
348	0.16
349	0.16
350	0.12
351	0.12
352	0.12
353	0.08
354	0.07
355	0.06
356	0.06
357	0.04
358	0.04
359	0.04
360	0.04
361	0.03
362	0.03
363	0.03
364	0.02
365	0.02
366	0.02
367	0.03
368	0.03
369	0.03
370	0.03
371	0.04
372	0.05
373	0.07
374	0.08
375	0.12
376	0.12
377	0.18
378	0.22
379	0.23
380	0.24
381	0.29
382	0.35
383	0.35
384	0.39
385	0.41
386	0.47
387	0.55
388	0.59
389	0.62
390	0.63
391	0.63
392	0.61
393	0.59
394	0.5
395	0.43
396	0.38
397	0.32
398	0.24
399	0.21
400	0.19
401	0.14
402	0.15
403	0.13
404	0.12
405	0.09
406	0.11
407	0.13
408	0.14
409	0.14
410	0.16
411	0.16
412	0.18
413	0.22
414	0.22
415	0.23
416	0.21
417	0.2
418	0.18
419	0.17
420	0.17
421	0.14
422	0.16
423	0.14
424	0.14
425	0.16
426	0.16
427	0.16
428	0.16
429	0.15
430	0.13
431	0.15
432	0.17
433	0.15
434	0.15
435	0.16
436	0.15
437	0.15
438	0.14
439	0.12
440	0.1
441	0.1
442	0.11
443	0.12
444	0.16
445	0.18
446	0.23
447	0.25
448	0.3
449	0.34
450	0.4
451	0.45
452	0.49
453	0.53
454	0.53
455	0.55
456	0.53
457	0.53
458	0.48
459	0.4
460	0.36
461	0.29
462	0.24
463	0.2
464	0.2
465	0.15
466	0.14
467	0.13
468	0.11
469	0.1
470	0.09
471	0.09
472	0.06
473	0.07
474	0.06
475	0.06
476	0.06
477	0.06
478	0.07
479	0.08
480	0.08
481	0.08
482	0.09
483	0.1
484	0.14
485	0.16
486	0.18
487	0.18
488	0.22
489	0.23
490	0.23
491	0.22
492	0.18
493	0.17
494	0.16
495	0.14
496	0.14
497	0.16
498	0.16
499	0.16
500	0.17
501	0.17
502	0.21
503	0.23
504	0.25
505	0.25
506	0.26
507	0.28
508	0.33
509	0.33
510	0.32
511	0.33
512	0.3
513	0.25
514	0.24
515	0.22
516	0.16
517	0.16
518	0.12
519	0.08
520	0.06
521	0.05
522	0.04
523	0.04
524	0.05
525	0.04
526	0.04
527	0.05
528	0.05
529	0.07
530	0.12
531	0.17
532	0.18
533	0.19
534	0.2
535	0.21
536	0.22
537	0.25
538	0.23
539	0.2
540	0.23
541	0.22
542	0.26
543	0.25
544	0.24
545	0.21
546	0.2
547	0.19
548	0.16
549	0.16
550	0.13
551	0.12
552	0.13
553	0.12
554	0.09
555	0.08
556	0.06
557	0.06
558	0.07
559	0.06
560	0.06
561	0.07
562	0.07
563	0.08
564	0.08
565	0.08
566	0.09
567	0.1
568	0.1
569	0.12
570	0.14
571	0.18
572	0.2
573	0.23
574	0.2
575	0.2
576	0.2
577	0.19
578	0.16
579	0.12
580	0.1
581	0.08
582	0.08
583	0.08
584	0.07
585	0.07
586	0.09
587	0.11
588	0.15
589	0.15
590	0.18
591	0.21
592	0.26
593	0.29
594	0.3
595	0.3
596	0.34
597	0.39
598	0.39
599	0.38
600	0.35
601	0.32
602	0.29
603	0.27
604	0.19
605	0.13
606	0.1
607	0.1
608	0.14
609	0.18
610	0.2
611	0.21
612	0.25
613	0.29
614	0.32
615	0.36
616	0.33
617	0.33
618	0.31
619	0.32
620	0.28
621	0.24
622	0.2
623	0.15
624	0.12
625	0.08
626	0.07
627	0.05
628	0.04
629	0.04
630	0.03
631	0.03
632	0.03
633	0.02
634	0.02
635	0.02
636	0.02
637	0.02
638	0.02
639	0.03
640	0.03
641	0.04
642	0.07
643	0.07
644	0.08
645	0.11
646	0.13
647	0.15
648	0.19
649	0.28
650	0.33
651	0.38
652	0.4
653	0.42
654	0.45
655	0.44
656	0.42
657	0.34
658	0.29
659	0.25
660	0.23
661	0.19
662	0.14
663	0.15
664	0.15
665	0.15
666	0.17
667	0.21
668	0.21
669	0.21
670	0.24
671	0.22
672	0.21
673	0.25
674	0.2
675	0.15
676	0.16
677	0.15
678	0.12
679	0.12
680	0.12
681	0.06
682	0.08
683	0.08
684	0.07
685	0.08
686	0.09
687	0.09
688	0.1
689	0.11
690	0.13
691	0.14
692	0.14
693	0.14
694	0.18
695	0.18
696	0.17
697	0.17
698	0.14
699	0.13
700	0.14
701	0.14
702	0.12
703	0.18
704	0.19
705	0.23
706	0.28
707	0.29
708	0.29
709	0.31
710	0.28
711	0.23
712	0.25
713	0.24
714	0.21
715	0.19
716	0.21
717	0.2
718	0.21
719	0.21
720	0.17
721	0.15
722	0.2
723	0.2
724	0.21
725	0.26
726	0.23
727	0.23
728	0.27
729	0.26
730	0.2
731	0.22
732	0.19
733	0.13
734	0.13
735	0.13
736	0.09
737	0.09
738	0.08
739	0.07
740	0.07
741	0.06
742	0.06
743	0.06
744	0.07
745	0.07
746	0.05
747	0.05
748	0.04
749	0.08
750	0.1
751	0.1
752	0.1
753	0.11
754	0.11
755	0.14
756	0.14
757	0.14
758	0.12
759	0.13
760	0.14
761	0.16
762	0.17
763	0.16
764	0.15
765	0.13
766	0.12
767	0.11
768	0.12
769	0.1
770	0.08
771	0.07
772	0.08
773	0.08
774	0.1
775	0.1
776	0.08
777	0.08
778	0.08
779	0.08
780	0.1
781	0.13
782	0.18
783	0.2
784	0.21
785	0.22
786	0.23
787	0.24
788	0.22
789	0.18
790	0.12
791	0.09
792	0.1
793	0.1
794	0.09
795	0.08
796	0.07
797	0.07
798	0.07
799	0.07
800	0.06
801	0.04
802	0.04
803	0.05
804	0.04
805	0.05
806	0.05
807	0.05
808	0.05
809	0.06
810	0.06
811	0.05
812	0.06
813	0.07
814	0.07
815	0.07
816	0.07
817	0.07
818	0.08
819	0.08
820	0.08
821	0.07
822	0.07
823	0.07
824	0.08
825	0.09
826	0.11
827	0.13
828	0.13
829	0.15
830	0.18
831	0.2
832	0.21
833	0.22
834	0.2
835	0.19
836	0.19
837	0.16
838	0.13
839	0.12
840	0.11
841	0.08
842	0.08
843	0.07
844	0.07
845	0.07
846	0.09
847	0.09
848	0.12
849	0.18
850	0.21
851	0.24
852	0.26
853	0.26
854	0.26
855	0.27
856	0.24
857	0.2
858	0.21
859	0.2
860	0.18
861	0.18
862	0.15
863	0.13
864	0.13
865	0.11
866	0.07
867	0.05
868	0.05
869	0.05
870	0.06
871	0.06
872	0.08
873	0.08
874	0.12
875	0.14
876	0.19
877	0.28
878	0.33
879	0.36
880	0.38
881	0.42
882	0.43
883	0.49
884	0.51
885	0.43
886	0.38
887	0.35
888	0.32
889	0.31
890	0.28
891	0.23
892	0.19
893	0.18
894	0.27
895	0.26
896	0.3
897	0.33
898	0.36
899	0.4
900	0.47
901	0.56
902	0.53
903	0.58
904	0.6
905	0.57
906	0.53
907	0.49
908	0.41
909	0.3
910	0.28
911	0.22
912	0.16
913	0.14
914	0.13
915	0.11
916	0.12
917	0.12
918	0.12
919	0.13
920	0.13
921	0.18
922	0.23
923	0.23
924	0.27
925	0.31
926	0.31
927	0.34
928	0.35
929	0.31
930	0.28
931	0.28
932	0.25
933	0.23
934	0.21
935	0.17
936	0.16
937	0.14
938	0.12
939	0.11
940	0.11
941	0.12
942	0.12
943	0.12
944	0.12
945	0.14
946	0.15
947	0.16
948	0.17
949	0.17
950	0.17
951	0.17
952	0.19
953	0.24
954	0.25
955	0.25
956	0.24
957	0.25
958	0.26
959	0.31
960	0.33
961	0.3
962	0.29
963	0.34
964	0.34
965	0.29
966	0.3
967	0.25
968	0.22
969	0.19
970	0.16
971	0.11
972	0.09
973	0.09
974	0.06
975	0.06
976	0.05
977	0.06
978	0.1
979	0.1
980	0.17
981	0.19
982	0.2
983	0.24
984	0.29
985	0.34
986	0.34
987	0.35
988	0.29
989	0.31
990	0.32
991	0.31
992	0.27
993	0.24
994	0.22
995	0.26
996	0.28
997	0.27
998	0.25
999	0.25
1000	0.26
1001	0.26
1002	0.25
1003	0.2
1004	0.19
1005	0.18
1006	0.2
1007	0.19
1008	0.17
1009	0.17
1010	0.17
1011	0.16
1012	0.17
1013	0.2
1014	0.18
1015	0.19
1016	0.23
1017	0.22
1018	0.25
1019	0.26
1020	0.23
1021	0.2
1022	0.19
1023	0.17
1024	0.13
1025	0.12
1026	0.08
1027	0.08
1028	0.1
1029	0.1
1030	0.12
1031	0.14
1032	0.15
1033	0.16
1034	0.17
1035	0.16
1036	0.14
1037	0.16
1038	0.18
1039	0.2
1040	0.21
1041	0.19
1042	0.21
1043	0.23
1044	0.25
1045	0.26
1046	0.24
1047	0.25
1048	0.26
1049	0.27
1050	0.25
1051	0.23
1052	0.24
1053	0.22
1054	0.21
1055	0.2
1056	0.19
1057	0.21
1058	0.25
1059	0.32
1060	0.3
1061	0.33
1062	0.38
1063	0.34
1064	0.34
1065	0.33
1066	0.32
1067	0.27
1068	0.29
1069	0.26
1070	0.27
1071	0.32
1072	0.33
1073	0.35
1074	0.35

A0A1C1CWD2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer