Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1C1CSQ7

Protein Details
Accession A0A1C1CSQ7    Localization Confidence High Confidence Score 23.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
12-37ATDETTKKGKKSKPVDKKNATKTEAGHydrophilic
63-85LDKSTVVKSKRSRKRAADFMDGDHydrophilic
102-130AQISDEPAKKKAKKSKKTKKSEDGEPLTAHydrophilic
217-239SKIPALPKSKKLQKKLDKAKANGHydrophilic
357-381EEQWQKKVDKEQRKRDKKAEKMKAIBasic
432-456VAIKEGKKSKKEKKSKKEAKDEAAPBasic
469-493VDADAKKEKKSKKEKKSDPQTVPDAHydrophilic
501-524VVNGESKKEKKSKKGKKNEGAAVPHydrophilic
670-704SPNGGRGRLKPLKVKKPKKERKNLVKARGPKSKLVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
18-28KKGKKSKPVDK
109-121AKKKAKKSKKTKK
224-236KSKKLQKKLDKAK
334-379ANKKFRKIPHEKLERERLAAPKTEEQWQKKVDKEQRKRDKKAEKMK
435-451KEGKKSKKEKKSKKEAK
474-484KKEKKSKKEKK
507-518KKEKKSKKGKKN
583-614AEKKKLTKAEKKALNADRKALQAEKKALHKAQ
672-710NGGRGRLKPLKVKKPKKERKNLVKARGPKSKLVATKPKP
740-748MKKKIVAER
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12307  RRM_NIFK_like  
Amino Acid Sequences MGSTKRKESSVATDETTKKGKKSKPVDKKNATKTEAGDGTTPAADPDTSSNMPSDVMPKSAALDKSTVVKSKRSRKRAADFMDGDEAADSDGGVKLPENVPAQISDEPAKKKAKKSKKTKKSEDGEPLTADGVNGVIEHTGEEELETATKHKPVSTSMQAEAERTVDHELENGFGGFASEADEDDDQVEADDNAAALLTGFDSDTEDKQEDEGLDLSKIPALPKSKKLQKKLDKAKANGGHEGPGTVYVGRIPHGFYEKEMRAYFSQFGEITRLRLSRNKKTGASKHFAFIEFAHDSVAKIAAEAMDNYLMFGHILKCKYAEPGSLHPDVWKGANKKFRKIPHEKLERERLAAPKTEEQWQKKVDKEQRKRDKKAEKMKAIGLEMPLSTLTSPSAALKERLADQGVPQPIEDGNTAPAGAIEPPADVPKDEVAIKEGKKSKKEKKSKKEAKDEAAPIPDPNPSVEASVVDADAKKEKKSKKEKKSDPQTVPDANPAPVSSVVNGESKKEKKSKKGKKNEGAAVPISDPSEKSAQATTKKAAEVKDAEAAPQPQAMEVDAPVSTTDATSHDAATDSNQTGLTKAEKKKLTKAEKKALNADRKALQAEKKALHKAQKSANKPTDVPEPADIGDADEQAEEGPTPLPDANAELSADFISLGQFDDKEGKAAQSPNGGRGRLKPLKVKKPKKERKNLVKARGPKSKLVATKPKPDPNAQSMIPGLPVMGKGKYDKATRMAYKEMKKKIVAERAARGLPPHRVRGEDY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.48
2 0.5
3 0.53
4 0.47
5 0.47
6 0.52
7 0.56
8 0.58
9 0.66
10 0.72
11 0.75
12 0.83
13 0.88
14 0.9
15 0.93
16 0.93
17 0.92
18 0.85
19 0.78
20 0.69
21 0.67
22 0.59
23 0.5
24 0.41
25 0.32
26 0.31
27 0.26
28 0.24
29 0.15
30 0.13
31 0.11
32 0.11
33 0.14
34 0.18
35 0.19
36 0.2
37 0.2
38 0.19
39 0.2
40 0.19
41 0.2
42 0.15
43 0.16
44 0.16
45 0.16
46 0.18
47 0.23
48 0.24
49 0.22
50 0.22
51 0.21
52 0.27
53 0.31
54 0.35
55 0.31
56 0.38
57 0.46
58 0.55
59 0.65
60 0.67
61 0.73
62 0.77
63 0.84
64 0.85
65 0.83
66 0.82
67 0.74
68 0.68
69 0.63
70 0.53
71 0.44
72 0.34
73 0.27
74 0.17
75 0.14
76 0.1
77 0.05
78 0.06
79 0.06
80 0.06
81 0.06
82 0.09
83 0.1
84 0.16
85 0.17
86 0.17
87 0.18
88 0.19
89 0.22
90 0.2
91 0.22
92 0.22
93 0.27
94 0.29
95 0.35
96 0.43
97 0.46
98 0.54
99 0.62
100 0.68
101 0.72
102 0.8
103 0.86
104 0.87
105 0.92
106 0.94
107 0.93
108 0.89
109 0.89
110 0.88
111 0.83
112 0.76
113 0.65
114 0.55
115 0.46
116 0.38
117 0.28
118 0.17
119 0.1
120 0.07
121 0.06
122 0.05
123 0.04
124 0.04
125 0.05
126 0.06
127 0.06
128 0.05
129 0.06
130 0.06
131 0.06
132 0.07
133 0.07
134 0.08
135 0.1
136 0.13
137 0.14
138 0.15
139 0.16
140 0.19
141 0.27
142 0.33
143 0.35
144 0.34
145 0.39
146 0.38
147 0.37
148 0.34
149 0.27
150 0.19
151 0.16
152 0.16
153 0.11
154 0.11
155 0.12
156 0.11
157 0.11
158 0.12
159 0.1
160 0.08
161 0.07
162 0.08
163 0.06
164 0.05
165 0.07
166 0.06
167 0.07
168 0.09
169 0.09
170 0.09
171 0.09
172 0.09
173 0.06
174 0.07
175 0.07
176 0.05
177 0.05
178 0.05
179 0.05
180 0.04
181 0.04
182 0.04
183 0.03
184 0.03
185 0.03
186 0.03
187 0.03
188 0.03
189 0.06
190 0.08
191 0.09
192 0.12
193 0.12
194 0.12
195 0.13
196 0.14
197 0.12
198 0.12
199 0.12
200 0.1
201 0.1
202 0.1
203 0.1
204 0.1
205 0.11
206 0.1
207 0.13
208 0.19
209 0.23
210 0.3
211 0.39
212 0.48
213 0.55
214 0.64
215 0.7
216 0.74
217 0.8
218 0.84
219 0.85
220 0.83
221 0.78
222 0.79
223 0.75
224 0.68
225 0.62
226 0.51
227 0.43
228 0.35
229 0.32
230 0.22
231 0.16
232 0.13
233 0.09
234 0.08
235 0.07
236 0.08
237 0.08
238 0.09
239 0.09
240 0.1
241 0.14
242 0.14
243 0.14
244 0.21
245 0.22
246 0.26
247 0.26
248 0.27
249 0.24
250 0.27
251 0.27
252 0.2
253 0.21
254 0.16
255 0.17
256 0.18
257 0.18
258 0.17
259 0.18
260 0.19
261 0.18
262 0.25
263 0.31
264 0.36
265 0.43
266 0.46
267 0.48
268 0.56
269 0.63
270 0.64
271 0.64
272 0.55
273 0.5
274 0.47
275 0.43
276 0.35
277 0.27
278 0.25
279 0.19
280 0.18
281 0.16
282 0.14
283 0.13
284 0.12
285 0.13
286 0.07
287 0.06
288 0.06
289 0.06
290 0.06
291 0.06
292 0.06
293 0.06
294 0.06
295 0.06
296 0.06
297 0.05
298 0.05
299 0.05
300 0.07
301 0.1
302 0.11
303 0.11
304 0.12
305 0.13
306 0.16
307 0.16
308 0.18
309 0.18
310 0.22
311 0.27
312 0.27
313 0.27
314 0.24
315 0.24
316 0.21
317 0.19
318 0.2
319 0.19
320 0.23
321 0.32
322 0.34
323 0.39
324 0.45
325 0.5
326 0.54
327 0.6
328 0.64
329 0.65
330 0.73
331 0.72
332 0.72
333 0.74
334 0.66
335 0.59
336 0.53
337 0.47
338 0.39
339 0.37
340 0.33
341 0.27
342 0.28
343 0.33
344 0.36
345 0.36
346 0.39
347 0.41
348 0.42
349 0.41
350 0.48
351 0.5
352 0.54
353 0.61
354 0.66
355 0.73
356 0.79
357 0.82
358 0.83
359 0.83
360 0.82
361 0.83
362 0.82
363 0.76
364 0.69
365 0.65
366 0.58
367 0.49
368 0.4
369 0.3
370 0.21
371 0.15
372 0.12
373 0.1
374 0.07
375 0.06
376 0.05
377 0.05
378 0.04
379 0.05
380 0.05
381 0.07
382 0.08
383 0.09
384 0.09
385 0.1
386 0.11
387 0.12
388 0.13
389 0.11
390 0.11
391 0.16
392 0.17
393 0.16
394 0.14
395 0.14
396 0.13
397 0.14
398 0.13
399 0.08
400 0.07
401 0.07
402 0.07
403 0.06
404 0.06
405 0.05
406 0.05
407 0.05
408 0.04
409 0.05
410 0.05
411 0.06
412 0.06
413 0.06
414 0.07
415 0.07
416 0.08
417 0.08
418 0.08
419 0.1
420 0.14
421 0.15
422 0.21
423 0.27
424 0.3
425 0.37
426 0.47
427 0.55
428 0.61
429 0.71
430 0.76
431 0.8
432 0.86
433 0.89
434 0.9
435 0.91
436 0.87
437 0.82
438 0.79
439 0.71
440 0.63
441 0.55
442 0.46
443 0.35
444 0.29
445 0.25
446 0.17
447 0.14
448 0.12
449 0.1
450 0.1
451 0.1
452 0.09
453 0.09
454 0.09
455 0.08
456 0.08
457 0.07
458 0.08
459 0.13
460 0.14
461 0.16
462 0.23
463 0.29
464 0.38
465 0.5
466 0.59
467 0.65
468 0.75
469 0.83
470 0.86
471 0.92
472 0.92
473 0.86
474 0.82
475 0.77
476 0.69
477 0.6
478 0.54
479 0.45
480 0.35
481 0.3
482 0.23
483 0.19
484 0.16
485 0.15
486 0.11
487 0.1
488 0.11
489 0.15
490 0.15
491 0.15
492 0.22
493 0.24
494 0.31
495 0.38
496 0.42
497 0.49
498 0.6
499 0.69
500 0.73
501 0.81
502 0.85
503 0.86
504 0.89
505 0.86
506 0.79
507 0.72
508 0.62
509 0.52
510 0.42
511 0.33
512 0.25
513 0.18
514 0.14
515 0.13
516 0.14
517 0.13
518 0.14
519 0.16
520 0.21
521 0.25
522 0.28
523 0.28
524 0.29
525 0.31
526 0.32
527 0.3
528 0.3
529 0.28
530 0.27
531 0.29
532 0.26
533 0.25
534 0.25
535 0.25
536 0.2
537 0.19
538 0.17
539 0.12
540 0.12
541 0.11
542 0.09
543 0.08
544 0.08
545 0.07
546 0.07
547 0.07
548 0.07
549 0.06
550 0.06
551 0.07
552 0.07
553 0.1
554 0.1
555 0.1
556 0.1
557 0.11
558 0.11
559 0.12
560 0.14
561 0.12
562 0.12
563 0.13
564 0.13
565 0.13
566 0.15
567 0.18
568 0.23
569 0.28
570 0.35
571 0.41
572 0.44
573 0.53
574 0.61
575 0.67
576 0.68
577 0.73
578 0.75
579 0.75
580 0.76
581 0.77
582 0.76
583 0.74
584 0.66
585 0.61
586 0.55
587 0.5
588 0.49
589 0.44
590 0.41
591 0.38
592 0.42
593 0.42
594 0.45
595 0.5
596 0.52
597 0.55
598 0.55
599 0.54
600 0.57
601 0.62
602 0.62
603 0.66
604 0.68
605 0.64
606 0.6
607 0.57
608 0.57
609 0.5
610 0.46
611 0.38
612 0.33
613 0.29
614 0.29
615 0.25
616 0.18
617 0.16
618 0.14
619 0.12
620 0.1
621 0.09
622 0.08
623 0.09
624 0.06
625 0.06
626 0.06
627 0.06
628 0.08
629 0.08
630 0.09
631 0.09
632 0.11
633 0.12
634 0.12
635 0.12
636 0.1
637 0.11
638 0.11
639 0.1
640 0.08
641 0.06
642 0.06
643 0.06
644 0.07
645 0.07
646 0.07
647 0.08
648 0.14
649 0.14
650 0.16
651 0.17
652 0.17
653 0.21
654 0.23
655 0.25
656 0.29
657 0.3
658 0.36
659 0.4
660 0.4
661 0.38
662 0.4
663 0.48
664 0.47
665 0.51
666 0.53
667 0.59
668 0.68
669 0.78
670 0.83
671 0.83
672 0.87
673 0.92
674 0.93
675 0.94
676 0.95
677 0.95
678 0.95
679 0.95
680 0.94
681 0.92
682 0.91
683 0.89
684 0.88
685 0.8
686 0.75
687 0.71
688 0.68
689 0.66
690 0.66
691 0.68
692 0.65
693 0.72
694 0.75
695 0.77
696 0.74
697 0.74
698 0.72
699 0.67
700 0.67
701 0.57
702 0.51
703 0.44
704 0.4
705 0.33
706 0.25
707 0.19
708 0.13
709 0.15
710 0.14
711 0.14
712 0.15
713 0.17
714 0.24
715 0.3
716 0.33
717 0.36
718 0.4
719 0.48
720 0.52
721 0.54
722 0.57
723 0.6
724 0.65
725 0.69
726 0.71
727 0.69
728 0.66
729 0.69
730 0.69
731 0.7
732 0.69
733 0.67
734 0.66
735 0.66
736 0.65
737 0.58
738 0.54
739 0.5
740 0.52
741 0.51
742 0.52
743 0.48