Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1GFR0

Protein Details
Accession C1GFR0    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
31-59PPAALDPRGSHKKKRKRTKQIVEDPKDAGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
38-49RGSHKKKRKRTK
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR032704  Cms1  
IPR027417  P-loop_NTPase  
KEGG pbn:PADG_06096  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF14617  CMS1  
Amino Acid Sequences MGSPVQSAKAGKKRHREDDDDVQPATVSTAPPAALDPRGSHKKKRKRTKQIVEDPKDAGKKDGVDESIGKMDGRLLADFFAQQAKRHNSELTTVELDDVYVPEQAFLDTSSWKSPRKLENLAMFLKVYSKKRGNSLSTAPADMGSPHTIVITLAGLRAADITRALRQFQRKDCAVAKLFAKHIKLNEAKEFVKKKRVSIGIGTPVRLNDLASSGELSLKHLKRIVIDGSYVDQKKRGIFDMKDLHLPLLQFLNRADLRDRYTSADDNVEILVF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.75
2 0.8
3 0.78
4 0.78
5 0.79
6 0.78
7 0.71
8 0.63
9 0.52
10 0.44
11 0.36
12 0.3
13 0.2
14 0.12
15 0.09
16 0.11
17 0.11
18 0.11
19 0.12
20 0.13
21 0.14
22 0.15
23 0.17
24 0.24
25 0.35
26 0.39
27 0.48
28 0.56
29 0.65
30 0.74
31 0.83
32 0.85
33 0.87
34 0.94
35 0.94
36 0.95
37 0.95
38 0.96
39 0.91
40 0.84
41 0.75
42 0.69
43 0.62
44 0.51
45 0.42
46 0.34
47 0.28
48 0.27
49 0.28
50 0.22
51 0.21
52 0.21
53 0.21
54 0.2
55 0.19
56 0.17
57 0.13
58 0.13
59 0.13
60 0.13
61 0.11
62 0.09
63 0.1
64 0.1
65 0.1
66 0.1
67 0.13
68 0.13
69 0.14
70 0.22
71 0.27
72 0.29
73 0.32
74 0.32
75 0.27
76 0.3
77 0.31
78 0.26
79 0.22
80 0.19
81 0.17
82 0.16
83 0.15
84 0.11
85 0.1
86 0.07
87 0.07
88 0.06
89 0.06
90 0.06
91 0.06
92 0.06
93 0.07
94 0.07
95 0.07
96 0.08
97 0.12
98 0.15
99 0.17
100 0.19
101 0.24
102 0.3
103 0.35
104 0.38
105 0.4
106 0.43
107 0.45
108 0.44
109 0.38
110 0.32
111 0.26
112 0.25
113 0.24
114 0.21
115 0.24
116 0.27
117 0.28
118 0.33
119 0.39
120 0.38
121 0.37
122 0.38
123 0.37
124 0.34
125 0.32
126 0.27
127 0.22
128 0.19
129 0.15
130 0.14
131 0.08
132 0.07
133 0.07
134 0.07
135 0.07
136 0.07
137 0.07
138 0.05
139 0.04
140 0.04
141 0.04
142 0.04
143 0.04
144 0.05
145 0.04
146 0.04
147 0.05
148 0.06
149 0.09
150 0.11
151 0.12
152 0.16
153 0.24
154 0.3
155 0.35
156 0.4
157 0.38
158 0.42
159 0.43
160 0.45
161 0.4
162 0.36
163 0.33
164 0.3
165 0.32
166 0.31
167 0.31
168 0.27
169 0.26
170 0.32
171 0.34
172 0.35
173 0.36
174 0.37
175 0.36
176 0.41
177 0.47
178 0.43
179 0.48
180 0.46
181 0.44
182 0.48
183 0.51
184 0.46
185 0.44
186 0.47
187 0.46
188 0.46
189 0.44
190 0.37
191 0.32
192 0.31
193 0.26
194 0.2
195 0.11
196 0.11
197 0.11
198 0.1
199 0.11
200 0.09
201 0.11
202 0.11
203 0.14
204 0.22
205 0.22
206 0.25
207 0.27
208 0.28
209 0.27
210 0.32
211 0.31
212 0.23
213 0.23
214 0.22
215 0.22
216 0.29
217 0.29
218 0.26
219 0.26
220 0.26
221 0.29
222 0.3
223 0.33
224 0.32
225 0.32
226 0.4
227 0.46
228 0.46
229 0.48
230 0.46
231 0.41
232 0.35
233 0.34
234 0.26
235 0.24
236 0.22
237 0.19
238 0.19
239 0.26
240 0.25
241 0.27
242 0.29
243 0.27
244 0.32
245 0.35
246 0.37
247 0.34
248 0.38
249 0.38
250 0.37
251 0.37
252 0.32
253 0.28