Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1GC24

Protein Details
Accession C1GC24    Localization Confidence High Confidence Score 20.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
18-42PTPADPPSKKSKKSVSKLAKTHENEHydrophilic
115-137NKDLEKPSKKKSKKGAETQTASAHydrophilic
225-248AIPDAKQLKRRLRKMKKTGTETQEHydrophilic
442-474EEVKPAPIKAKKDRKKKAEKKDTPVKEGKKTKDBasic
509-528AAAGKSEKKEEKSKGKKSNAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
5-38KKDKKRKAAVTSAPTPADPPSKKSKKSVSKLAKT
50-50K
120-128KPSKKKSKK
222-241KIPAIPDAKQLKRRLRKMKK
341-376RRFKKTPWNAIERRRLDAGKTREQWARKIKQEEARR
446-528PAPIKAKKDRKKKAEKKDTPVKEGKKTKDMEQKKDGKASSKDKKVKVDTPEKLGKEKKIKASLAAAGKSEKKEEKSKGKKSNA
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 14.333, mito_nucl 11.166, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG pbn:PADG_04546  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12307  RRM_NIFK_like  
Amino Acid Sequences MAVEKKDKKRKAAVTSAPTPADPPSKKSKKSVSKLAKTHENENVPKPILKKSKSAEATNGDSPKAVPVKVTSAPARQIRPRKRAADFMSEEEEGDLEESKKKPVMSSPVATNPINKDLEKPSKKKSKKGAETQTASASSTKKAATNVDTEEEILSTSKVSKKSKVDIKPSKEIHTQIAEDENEGSAAEKEYDDDQTAALIQGFDSSGDEDVSGDEGFAPGKKIPAIPDAKQLKRRLRKMKKTGTETQEPGTIYVGRVPHGFYEHEMRAYFSQFGPITRLRLSRNRTTGRSKHFAFIEFASSSVAQIVADTMDNYLMFGHILKCKFVPQENVHPQLWKGANRRFKKTPWNAIERRRLDAGKTREQWARKIKQEEARRVARVEKMKELGYEFEMPVLKGVEEVVVVRDVEGKGRGEVEGAEEPAAIEASQKEAEKAELVSGVVEEVKPAPIKAKKDRKKKAEKKDTPVKEGKKTKDMEQKKDGKASSKDKKVKVDTPEKLGKEKKIKASLAAAGKSEKKEEKSKGKKSNA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.79
2 0.79
3 0.76
4 0.67
5 0.58
6 0.5
7 0.44
8 0.44
9 0.38
10 0.37
11 0.42
12 0.5
13 0.55
14 0.62
15 0.68
16 0.7
17 0.76
18 0.82
19 0.81
20 0.82
21 0.84
22 0.84
23 0.83
24 0.76
25 0.74
26 0.72
27 0.69
28 0.65
29 0.63
30 0.62
31 0.54
32 0.54
33 0.49
34 0.51
35 0.52
36 0.5
37 0.52
38 0.5
39 0.58
40 0.6
41 0.61
42 0.59
43 0.55
44 0.58
45 0.56
46 0.54
47 0.44
48 0.38
49 0.35
50 0.34
51 0.31
52 0.25
53 0.19
54 0.2
55 0.25
56 0.27
57 0.32
58 0.3
59 0.31
60 0.39
61 0.43
62 0.47
63 0.5
64 0.58
65 0.63
66 0.68
67 0.72
68 0.73
69 0.71
70 0.74
71 0.71
72 0.7
73 0.64
74 0.59
75 0.55
76 0.47
77 0.43
78 0.34
79 0.28
80 0.18
81 0.15
82 0.12
83 0.08
84 0.13
85 0.14
86 0.17
87 0.2
88 0.2
89 0.21
90 0.26
91 0.33
92 0.35
93 0.38
94 0.4
95 0.44
96 0.48
97 0.47
98 0.44
99 0.39
100 0.38
101 0.37
102 0.32
103 0.3
104 0.34
105 0.45
106 0.5
107 0.52
108 0.55
109 0.64
110 0.7
111 0.74
112 0.76
113 0.77
114 0.78
115 0.83
116 0.84
117 0.83
118 0.81
119 0.75
120 0.68
121 0.58
122 0.49
123 0.41
124 0.32
125 0.23
126 0.21
127 0.2
128 0.18
129 0.19
130 0.22
131 0.22
132 0.24
133 0.25
134 0.24
135 0.23
136 0.22
137 0.2
138 0.16
139 0.14
140 0.1
141 0.08
142 0.07
143 0.1
144 0.13
145 0.2
146 0.23
147 0.3
148 0.34
149 0.43
150 0.52
151 0.57
152 0.63
153 0.66
154 0.7
155 0.73
156 0.7
157 0.67
158 0.63
159 0.57
160 0.5
161 0.43
162 0.37
163 0.29
164 0.3
165 0.25
166 0.2
167 0.19
168 0.15
169 0.11
170 0.1
171 0.1
172 0.06
173 0.06
174 0.06
175 0.06
176 0.07
177 0.08
178 0.09
179 0.09
180 0.09
181 0.08
182 0.08
183 0.08
184 0.07
185 0.06
186 0.05
187 0.04
188 0.05
189 0.05
190 0.05
191 0.05
192 0.05
193 0.05
194 0.05
195 0.05
196 0.05
197 0.05
198 0.06
199 0.06
200 0.05
201 0.04
202 0.05
203 0.05
204 0.05
205 0.06
206 0.06
207 0.07
208 0.07
209 0.08
210 0.1
211 0.17
212 0.21
213 0.21
214 0.3
215 0.37
216 0.41
217 0.47
218 0.53
219 0.55
220 0.6
221 0.68
222 0.7
223 0.74
224 0.8
225 0.83
226 0.86
227 0.85
228 0.83
229 0.82
230 0.77
231 0.72
232 0.63
233 0.54
234 0.47
235 0.38
236 0.31
237 0.24
238 0.19
239 0.12
240 0.13
241 0.13
242 0.1
243 0.1
244 0.1
245 0.1
246 0.11
247 0.11
248 0.09
249 0.14
250 0.14
251 0.15
252 0.15
253 0.16
254 0.15
255 0.15
256 0.15
257 0.1
258 0.14
259 0.13
260 0.13
261 0.16
262 0.16
263 0.17
264 0.18
265 0.21
266 0.2
267 0.27
268 0.32
269 0.35
270 0.43
271 0.45
272 0.48
273 0.54
274 0.57
275 0.57
276 0.58
277 0.53
278 0.48
279 0.45
280 0.42
281 0.35
282 0.29
283 0.25
284 0.19
285 0.17
286 0.14
287 0.13
288 0.11
289 0.09
290 0.09
291 0.05
292 0.04
293 0.04
294 0.04
295 0.04
296 0.04
297 0.04
298 0.04
299 0.04
300 0.05
301 0.04
302 0.04
303 0.04
304 0.05
305 0.07
306 0.11
307 0.11
308 0.12
309 0.13
310 0.16
311 0.18
312 0.21
313 0.26
314 0.27
315 0.37
316 0.44
317 0.48
318 0.46
319 0.44
320 0.41
321 0.4
322 0.39
323 0.34
324 0.34
325 0.37
326 0.46
327 0.5
328 0.57
329 0.55
330 0.57
331 0.62
332 0.64
333 0.67
334 0.65
335 0.7
336 0.7
337 0.74
338 0.79
339 0.71
340 0.65
341 0.58
342 0.52
343 0.45
344 0.47
345 0.45
346 0.44
347 0.44
348 0.46
349 0.47
350 0.49
351 0.54
352 0.55
353 0.56
354 0.54
355 0.57
356 0.59
357 0.62
358 0.69
359 0.7
360 0.68
361 0.66
362 0.61
363 0.57
364 0.54
365 0.52
366 0.51
367 0.44
368 0.42
369 0.39
370 0.38
371 0.38
372 0.35
373 0.3
374 0.26
375 0.25
376 0.19
377 0.2
378 0.19
379 0.18
380 0.17
381 0.16
382 0.12
383 0.09
384 0.09
385 0.07
386 0.06
387 0.07
388 0.07
389 0.07
390 0.07
391 0.07
392 0.11
393 0.1
394 0.12
395 0.15
396 0.14
397 0.14
398 0.15
399 0.15
400 0.12
401 0.12
402 0.14
403 0.14
404 0.13
405 0.13
406 0.12
407 0.12
408 0.11
409 0.12
410 0.07
411 0.06
412 0.06
413 0.09
414 0.11
415 0.12
416 0.12
417 0.13
418 0.14
419 0.14
420 0.15
421 0.12
422 0.11
423 0.11
424 0.1
425 0.09
426 0.09
427 0.08
428 0.07
429 0.07
430 0.07
431 0.1
432 0.11
433 0.11
434 0.18
435 0.23
436 0.32
437 0.41
438 0.52
439 0.59
440 0.7
441 0.8
442 0.83
443 0.89
444 0.91
445 0.92
446 0.92
447 0.93
448 0.92
449 0.92
450 0.89
451 0.87
452 0.86
453 0.82
454 0.81
455 0.8
456 0.77
457 0.75
458 0.7
459 0.71
460 0.72
461 0.74
462 0.72
463 0.73
464 0.76
465 0.73
466 0.78
467 0.71
468 0.69
469 0.69
470 0.7
471 0.7
472 0.71
473 0.74
474 0.73
475 0.8
476 0.79
477 0.77
478 0.77
479 0.77
480 0.72
481 0.72
482 0.75
483 0.68
484 0.69
485 0.68
486 0.68
487 0.67
488 0.7
489 0.7
490 0.71
491 0.7
492 0.65
493 0.64
494 0.62
495 0.59
496 0.53
497 0.46
498 0.42
499 0.46
500 0.44
501 0.46
502 0.45
503 0.44
504 0.51
505 0.59
506 0.65
507 0.7
508 0.78