Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1C1CIV0

Protein Details
Accession A0A1C1CIV0    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
22-64AAKAERKAAKHARKVEKLAKKGGVTKSKSKKEKEVNGKKDLEKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
13-70KASKAAAKAAAKAERKAAKHARKVEKLAKKGGVTKSKSKKEKEVNGKKDLEKKKARAE
180-204KKVFKSVKKAAAHRTLKRGVKEVVK
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 11.333, mito_nucl 10.166, cyto 8, mito 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002415  H/ACA_rnp_Nhp2-like  
IPR029064  L30e-like  
IPR004038  Ribosomal_L7Ae/L30e/S12e/Gad45  
IPR004037  Ribosomal_L7Ae_CS  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0042254  P:ribosome biogenesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF01248  Ribosomal_L7Ae  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS01082  RIBOSOMAL_L7AE  
Amino Acid Sequences MAKDKSSATGSSKASKAAAKAAAKAERKAAKHARKVEKLAKKGGVTKSKSKKEKEVNGKKDLEKKKARAERALDEIEAAKDAEDEESEEDEDVKVTAGDEVSSEEEEDTTMNGAGGEDSEAEDDDEGEDEEGEEKGEAVTSLKNAKTEAHPKKEGQASVVRPVGALVPFANPLADEKVAKKVFKSVKKAAAHRTLKRGVKEVVKALRKSPSSQDNESLPVGTVILAADISPMDVISHIPVLAEDHHIPYIYVTSRAELGIASMTKRPTSVVMVSRDVGKKAADKKDKDKGAESETETWGETYKGLVKVVEREGRHVKV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.36
3 0.34
4 0.33
5 0.37
6 0.33
7 0.36
8 0.41
9 0.47
10 0.47
11 0.47
12 0.49
13 0.49
14 0.48
15 0.54
16 0.58
17 0.59
18 0.65
19 0.73
20 0.75
21 0.76
22 0.82
23 0.83
24 0.81
25 0.78
26 0.76
27 0.72
28 0.65
29 0.65
30 0.66
31 0.65
32 0.61
33 0.65
34 0.68
35 0.72
36 0.77
37 0.75
38 0.76
39 0.77
40 0.81
41 0.83
42 0.83
43 0.81
44 0.81
45 0.82
46 0.77
47 0.77
48 0.75
49 0.74
50 0.72
51 0.7
52 0.72
53 0.74
54 0.74
55 0.72
56 0.7
57 0.65
58 0.62
59 0.57
60 0.47
61 0.39
62 0.35
63 0.27
64 0.22
65 0.16
66 0.09
67 0.07
68 0.08
69 0.07
70 0.06
71 0.07
72 0.08
73 0.09
74 0.09
75 0.09
76 0.09
77 0.09
78 0.09
79 0.08
80 0.06
81 0.05
82 0.05
83 0.05
84 0.05
85 0.05
86 0.05
87 0.06
88 0.07
89 0.08
90 0.08
91 0.07
92 0.07
93 0.07
94 0.07
95 0.06
96 0.05
97 0.05
98 0.05
99 0.05
100 0.05
101 0.04
102 0.04
103 0.04
104 0.04
105 0.04
106 0.04
107 0.04
108 0.05
109 0.04
110 0.04
111 0.04
112 0.04
113 0.04
114 0.04
115 0.04
116 0.04
117 0.05
118 0.05
119 0.05
120 0.04
121 0.04
122 0.04
123 0.04
124 0.04
125 0.04
126 0.05
127 0.06
128 0.1
129 0.1
130 0.11
131 0.11
132 0.13
133 0.17
134 0.27
135 0.34
136 0.37
137 0.4
138 0.4
139 0.45
140 0.47
141 0.42
142 0.35
143 0.33
144 0.28
145 0.29
146 0.3
147 0.24
148 0.2
149 0.2
150 0.18
151 0.12
152 0.11
153 0.07
154 0.06
155 0.07
156 0.07
157 0.06
158 0.05
159 0.06
160 0.08
161 0.08
162 0.08
163 0.09
164 0.17
165 0.19
166 0.2
167 0.19
168 0.25
169 0.32
170 0.39
171 0.46
172 0.44
173 0.51
174 0.56
175 0.61
176 0.6
177 0.63
178 0.63
179 0.59
180 0.6
181 0.59
182 0.58
183 0.55
184 0.52
185 0.45
186 0.43
187 0.42
188 0.41
189 0.42
190 0.44
191 0.43
192 0.42
193 0.45
194 0.41
195 0.41
196 0.4
197 0.41
198 0.41
199 0.42
200 0.43
201 0.38
202 0.39
203 0.37
204 0.31
205 0.22
206 0.16
207 0.13
208 0.1
209 0.08
210 0.05
211 0.05
212 0.04
213 0.04
214 0.04
215 0.03
216 0.04
217 0.03
218 0.03
219 0.03
220 0.04
221 0.04
222 0.05
223 0.06
224 0.05
225 0.05
226 0.06
227 0.07
228 0.08
229 0.11
230 0.11
231 0.13
232 0.14
233 0.14
234 0.14
235 0.13
236 0.15
237 0.12
238 0.14
239 0.12
240 0.13
241 0.14
242 0.14
243 0.13
244 0.1
245 0.09
246 0.1
247 0.11
248 0.11
249 0.14
250 0.16
251 0.16
252 0.16
253 0.17
254 0.15
255 0.19
256 0.23
257 0.26
258 0.3
259 0.32
260 0.33
261 0.38
262 0.38
263 0.35
264 0.3
265 0.26
266 0.28
267 0.34
268 0.44
269 0.47
270 0.52
271 0.59
272 0.68
273 0.72
274 0.69
275 0.67
276 0.63
277 0.59
278 0.59
279 0.55
280 0.5
281 0.46
282 0.43
283 0.37
284 0.31
285 0.26
286 0.2
287 0.16
288 0.13
289 0.18
290 0.18
291 0.19
292 0.2
293 0.22
294 0.27
295 0.35
296 0.4
297 0.35
298 0.4