Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1C1CMY1

Protein Details
Accession A0A1C1CMY1    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
400-420AEEMRRQKRIKRRTVAKDEASHydrophilic
436-455LEAEKKTTKKERKLAETKFTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
405-412RQKRIKRR
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto_nucl 12.5, cyto 6, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007900  TAF4_C  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF05236  TAF4  
Amino Acid Sequences MAHSPPATSRPPLPQTQTSFPRDFSAPNGRPSPLGPQSPPMAMNYASSSPQAFSPQQYFQPPAAKRPRLSPDIQSPSATQSFPGTPTGLPSTPASNTPVNGAPAPTARTATLMPPPQRPPDKEDRSHEDILAGTGINIEEESRLLVQNDYFGGSSNSQAAKGSFQYNNNSFPQPGSSGVVGAPTSGQTDGLNPSQEPQPSEEEMKQRLEERADWEASRHSQHPLWDMFLLGGALNERIRNISITEHLVDPQSGVLVNTQKHMPPPTVRVNGLEGASRVIDKGQAILDTQGKGERLSDIMKIINLATQSRITGLLSASSRLAKERRQHSKGKVPDEWQDIAAPPKAMADPLDGAPSPAGSASLKRTHSQAISEPSFSNDPAQVPERLISTFDKVSQTEKSAEEMRRQKRIKRRTVAKDEASATPAADGTPDAASAALEAEKKTTKKERKLAETKFTEQQQHKSANEAARMAVAGILGNRKKAGRTFDWMNAGKAGASPAATPGRPPLSGPTSTAGTPAPERARAAPKDNQFGHWDEDKDARIQARDVLLILESDGRASRSFLRGVSLPEKSDS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.56
2 0.59
3 0.64
4 0.68
5 0.66
6 0.63
7 0.57
8 0.54
9 0.48
10 0.42
11 0.4
12 0.43
13 0.4
14 0.44
15 0.46
16 0.43
17 0.42
18 0.42
19 0.44
20 0.4
21 0.42
22 0.37
23 0.38
24 0.4
25 0.42
26 0.41
27 0.33
28 0.29
29 0.23
30 0.23
31 0.22
32 0.21
33 0.2
34 0.2
35 0.2
36 0.17
37 0.18
38 0.22
39 0.2
40 0.23
41 0.27
42 0.29
43 0.33
44 0.37
45 0.39
46 0.37
47 0.44
48 0.42
49 0.47
50 0.54
51 0.56
52 0.53
53 0.58
54 0.62
55 0.59
56 0.61
57 0.59
58 0.59
59 0.6
60 0.6
61 0.53
62 0.47
63 0.46
64 0.45
65 0.38
66 0.28
67 0.23
68 0.23
69 0.22
70 0.23
71 0.19
72 0.16
73 0.2
74 0.24
75 0.21
76 0.21
77 0.21
78 0.22
79 0.22
80 0.24
81 0.24
82 0.21
83 0.21
84 0.22
85 0.24
86 0.23
87 0.22
88 0.21
89 0.18
90 0.19
91 0.21
92 0.19
93 0.17
94 0.15
95 0.16
96 0.17
97 0.18
98 0.23
99 0.28
100 0.3
101 0.36
102 0.4
103 0.47
104 0.53
105 0.53
106 0.54
107 0.58
108 0.63
109 0.64
110 0.67
111 0.67
112 0.66
113 0.65
114 0.57
115 0.47
116 0.38
117 0.31
118 0.25
119 0.16
120 0.09
121 0.07
122 0.07
123 0.06
124 0.06
125 0.05
126 0.05
127 0.05
128 0.06
129 0.06
130 0.08
131 0.08
132 0.09
133 0.09
134 0.1
135 0.1
136 0.11
137 0.1
138 0.09
139 0.11
140 0.11
141 0.12
142 0.14
143 0.14
144 0.14
145 0.14
146 0.14
147 0.14
148 0.16
149 0.2
150 0.2
151 0.23
152 0.3
153 0.32
154 0.35
155 0.36
156 0.35
157 0.31
158 0.27
159 0.26
160 0.2
161 0.19
162 0.17
163 0.14
164 0.13
165 0.13
166 0.13
167 0.11
168 0.09
169 0.08
170 0.06
171 0.07
172 0.07
173 0.07
174 0.06
175 0.08
176 0.11
177 0.12
178 0.13
179 0.12
180 0.14
181 0.17
182 0.18
183 0.18
184 0.18
185 0.2
186 0.21
187 0.24
188 0.26
189 0.28
190 0.29
191 0.3
192 0.29
193 0.27
194 0.27
195 0.26
196 0.24
197 0.24
198 0.25
199 0.25
200 0.24
201 0.22
202 0.23
203 0.23
204 0.24
205 0.21
206 0.19
207 0.19
208 0.21
209 0.25
210 0.23
211 0.22
212 0.2
213 0.18
214 0.15
215 0.13
216 0.11
217 0.06
218 0.06
219 0.04
220 0.05
221 0.06
222 0.06
223 0.06
224 0.06
225 0.07
226 0.08
227 0.08
228 0.08
229 0.1
230 0.12
231 0.13
232 0.12
233 0.13
234 0.12
235 0.11
236 0.1
237 0.08
238 0.06
239 0.05
240 0.05
241 0.06
242 0.09
243 0.1
244 0.11
245 0.12
246 0.13
247 0.15
248 0.16
249 0.17
250 0.16
251 0.21
252 0.28
253 0.3
254 0.29
255 0.28
256 0.29
257 0.28
258 0.26
259 0.21
260 0.13
261 0.11
262 0.1
263 0.09
264 0.07
265 0.06
266 0.06
267 0.05
268 0.06
269 0.06
270 0.06
271 0.06
272 0.08
273 0.1
274 0.09
275 0.09
276 0.1
277 0.1
278 0.1
279 0.1
280 0.08
281 0.08
282 0.09
283 0.09
284 0.09
285 0.09
286 0.09
287 0.09
288 0.08
289 0.08
290 0.08
291 0.08
292 0.08
293 0.08
294 0.08
295 0.08
296 0.09
297 0.07
298 0.08
299 0.07
300 0.09
301 0.09
302 0.09
303 0.1
304 0.1
305 0.1
306 0.13
307 0.15
308 0.18
309 0.25
310 0.34
311 0.44
312 0.48
313 0.55
314 0.59
315 0.66
316 0.67
317 0.66
318 0.61
319 0.54
320 0.55
321 0.52
322 0.46
323 0.37
324 0.31
325 0.25
326 0.23
327 0.21
328 0.16
329 0.11
330 0.11
331 0.1
332 0.09
333 0.09
334 0.09
335 0.09
336 0.09
337 0.11
338 0.1
339 0.1
340 0.1
341 0.09
342 0.07
343 0.06
344 0.06
345 0.05
346 0.07
347 0.11
348 0.17
349 0.19
350 0.2
351 0.22
352 0.24
353 0.25
354 0.25
355 0.26
356 0.28
357 0.28
358 0.29
359 0.27
360 0.26
361 0.26
362 0.24
363 0.21
364 0.15
365 0.14
366 0.15
367 0.17
368 0.15
369 0.15
370 0.16
371 0.15
372 0.14
373 0.15
374 0.14
375 0.15
376 0.15
377 0.17
378 0.18
379 0.18
380 0.2
381 0.2
382 0.22
383 0.21
384 0.21
385 0.22
386 0.26
387 0.28
388 0.34
389 0.42
390 0.45
391 0.52
392 0.55
393 0.6
394 0.64
395 0.72
396 0.74
397 0.74
398 0.79
399 0.8
400 0.86
401 0.87
402 0.8
403 0.75
404 0.68
405 0.59
406 0.5
407 0.4
408 0.3
409 0.21
410 0.18
411 0.11
412 0.09
413 0.07
414 0.06
415 0.06
416 0.06
417 0.06
418 0.06
419 0.06
420 0.05
421 0.06
422 0.06
423 0.07
424 0.07
425 0.1
426 0.15
427 0.16
428 0.23
429 0.33
430 0.41
431 0.5
432 0.58
433 0.64
434 0.7
435 0.79
436 0.8
437 0.8
438 0.76
439 0.72
440 0.7
441 0.65
442 0.63
443 0.58
444 0.57
445 0.54
446 0.54
447 0.49
448 0.48
449 0.49
450 0.45
451 0.44
452 0.38
453 0.31
454 0.25
455 0.25
456 0.2
457 0.14
458 0.09
459 0.07
460 0.08
461 0.15
462 0.15
463 0.17
464 0.19
465 0.19
466 0.22
467 0.27
468 0.32
469 0.3
470 0.36
471 0.41
472 0.45
473 0.53
474 0.51
475 0.48
476 0.42
477 0.37
478 0.3
479 0.25
480 0.2
481 0.12
482 0.11
483 0.09
484 0.13
485 0.17
486 0.17
487 0.17
488 0.22
489 0.24
490 0.24
491 0.25
492 0.27
493 0.29
494 0.3
495 0.32
496 0.29
497 0.28
498 0.28
499 0.28
500 0.22
501 0.19
502 0.2
503 0.25
504 0.25
505 0.25
506 0.28
507 0.32
508 0.41
509 0.42
510 0.47
511 0.48
512 0.51
513 0.58
514 0.57
515 0.55
516 0.5
517 0.48
518 0.47
519 0.45
520 0.4
521 0.34
522 0.37
523 0.35
524 0.33
525 0.34
526 0.32
527 0.28
528 0.27
529 0.29
530 0.26
531 0.25
532 0.23
533 0.2
534 0.18
535 0.15
536 0.15
537 0.13
538 0.11
539 0.11
540 0.12
541 0.13
542 0.13
543 0.16
544 0.2
545 0.22
546 0.24
547 0.23
548 0.26
549 0.27
550 0.33
551 0.38
552 0.37