Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1C1CFJ0

Protein Details
Accession A0A1C1CFJ0    Localization Confidence High Confidence Score 16.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
187-211GNTAPAKRPKAKKGRASRASRASRSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
192-212AKRPKAKKGRASRASRASRSS
271-299KGKRKGAGGRSKTAKSKKAKTTRSTKTKK
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001370  BIR_rpt  
Pfam View protein in Pfam  
PF00653  BIR  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50143  BIR_REPEAT_2  
CDD cd00022  BIR  
Amino Acid Sequences MEYATLDSRLATFEPPTKRSKIGWPHKTPTPEEVARAGFYYKPSKSSNDNTICYLCESQLGGWEPDDDPVEEHLKHSPQCGWAILMSASQEAKQHTETMEDPTGQLLTDARRATFAAGWPHEPKRAWKCKIERMVEAGWHFAPVAEGEDYVSCAYCKLSLDGWEPKDDPFEEHYKRSPDCVFFQFAGNTAPAKRPKAKKGRASRASRASRSSKASTRLSTQSNSQDVTSLSEAPSVALEDIPDLEDSIDEGEMSTMSVVSVMSTASTATTKGKRKGAGGRSKTAKSKKAKTTRSTKTKKEESQPEIELEEQPEPVQEIAETSKGVVAESVPLQAEEVYQTPEIEEREEQVVPGPELTPTAEVAYPTIPLRNTPPRISNSPRHLSPVAAQDQSPTPIKPRSNRSSLASAQKSTPKSATTKSHQQPKSATARSSSRTQPQTQQADNLSSSPSPSPATSDLENAPPSTRSPRSRPPIATSSISPIPPNPKPNVTSTSSSTPNTLMPHWMPADVELIFAPTTPARAENEVLLALTGSQLSSPEKEMTVQEWIEFIAARAEEGLRTEAERVVSVFEREGQRAMGVLEAIPCV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.34
3 0.4
4 0.42
5 0.45
6 0.46
7 0.53
8 0.56
9 0.6
10 0.67
11 0.7
12 0.72
13 0.75
14 0.78
15 0.72
16 0.66
17 0.64
18 0.56
19 0.5
20 0.48
21 0.42
22 0.37
23 0.34
24 0.3
25 0.24
26 0.26
27 0.31
28 0.28
29 0.32
30 0.34
31 0.37
32 0.43
33 0.48
34 0.54
35 0.54
36 0.54
37 0.53
38 0.51
39 0.48
40 0.44
41 0.38
42 0.27
43 0.22
44 0.2
45 0.17
46 0.21
47 0.23
48 0.2
49 0.19
50 0.21
51 0.19
52 0.2
53 0.21
54 0.16
55 0.14
56 0.16
57 0.2
58 0.18
59 0.19
60 0.22
61 0.26
62 0.26
63 0.28
64 0.28
65 0.27
66 0.29
67 0.29
68 0.25
69 0.2
70 0.21
71 0.19
72 0.16
73 0.14
74 0.13
75 0.13
76 0.12
77 0.15
78 0.15
79 0.17
80 0.18
81 0.19
82 0.18
83 0.21
84 0.21
85 0.25
86 0.26
87 0.23
88 0.22
89 0.21
90 0.2
91 0.16
92 0.16
93 0.11
94 0.11
95 0.16
96 0.17
97 0.16
98 0.17
99 0.18
100 0.19
101 0.19
102 0.21
103 0.23
104 0.25
105 0.29
106 0.33
107 0.35
108 0.39
109 0.38
110 0.43
111 0.46
112 0.54
113 0.55
114 0.59
115 0.65
116 0.7
117 0.78
118 0.73
119 0.66
120 0.61
121 0.57
122 0.52
123 0.45
124 0.38
125 0.28
126 0.24
127 0.2
128 0.15
129 0.13
130 0.09
131 0.1
132 0.08
133 0.08
134 0.08
135 0.08
136 0.09
137 0.09
138 0.09
139 0.06
140 0.06
141 0.07
142 0.08
143 0.09
144 0.09
145 0.11
146 0.14
147 0.19
148 0.26
149 0.28
150 0.29
151 0.29
152 0.28
153 0.3
154 0.27
155 0.24
156 0.22
157 0.28
158 0.29
159 0.31
160 0.36
161 0.37
162 0.37
163 0.39
164 0.38
165 0.34
166 0.35
167 0.35
168 0.34
169 0.29
170 0.31
171 0.27
172 0.23
173 0.21
174 0.17
175 0.15
176 0.13
177 0.18
178 0.21
179 0.26
180 0.33
181 0.39
182 0.49
183 0.59
184 0.66
185 0.7
186 0.77
187 0.82
188 0.84
189 0.84
190 0.83
191 0.82
192 0.8
193 0.74
194 0.69
195 0.64
196 0.59
197 0.57
198 0.54
199 0.49
200 0.47
201 0.48
202 0.44
203 0.44
204 0.43
205 0.41
206 0.37
207 0.36
208 0.36
209 0.33
210 0.32
211 0.27
212 0.23
213 0.21
214 0.22
215 0.19
216 0.14
217 0.12
218 0.12
219 0.12
220 0.1
221 0.1
222 0.07
223 0.06
224 0.05
225 0.05
226 0.04
227 0.05
228 0.05
229 0.05
230 0.05
231 0.04
232 0.04
233 0.04
234 0.05
235 0.04
236 0.04
237 0.04
238 0.04
239 0.03
240 0.04
241 0.03
242 0.03
243 0.03
244 0.03
245 0.03
246 0.03
247 0.03
248 0.03
249 0.03
250 0.03
251 0.03
252 0.04
253 0.04
254 0.05
255 0.09
256 0.15
257 0.21
258 0.26
259 0.3
260 0.32
261 0.36
262 0.43
263 0.49
264 0.53
265 0.51
266 0.53
267 0.54
268 0.55
269 0.59
270 0.56
271 0.55
272 0.52
273 0.57
274 0.6
275 0.65
276 0.71
277 0.71
278 0.75
279 0.77
280 0.8
281 0.78
282 0.76
283 0.74
284 0.75
285 0.74
286 0.72
287 0.71
288 0.65
289 0.63
290 0.57
291 0.49
292 0.41
293 0.36
294 0.28
295 0.2
296 0.16
297 0.11
298 0.09
299 0.08
300 0.08
301 0.07
302 0.06
303 0.05
304 0.05
305 0.06
306 0.07
307 0.07
308 0.06
309 0.07
310 0.07
311 0.07
312 0.06
313 0.05
314 0.06
315 0.06
316 0.07
317 0.06
318 0.06
319 0.06
320 0.06
321 0.06
322 0.06
323 0.06
324 0.07
325 0.08
326 0.08
327 0.08
328 0.09
329 0.1
330 0.1
331 0.1
332 0.1
333 0.12
334 0.12
335 0.12
336 0.13
337 0.13
338 0.12
339 0.12
340 0.1
341 0.08
342 0.09
343 0.09
344 0.07
345 0.06
346 0.08
347 0.08
348 0.07
349 0.08
350 0.08
351 0.09
352 0.08
353 0.1
354 0.09
355 0.1
356 0.16
357 0.24
358 0.28
359 0.3
360 0.35
361 0.37
362 0.44
363 0.5
364 0.52
365 0.51
366 0.53
367 0.51
368 0.5
369 0.46
370 0.41
371 0.38
372 0.37
373 0.32
374 0.27
375 0.27
376 0.23
377 0.24
378 0.26
379 0.24
380 0.17
381 0.17
382 0.23
383 0.28
384 0.33
385 0.42
386 0.46
387 0.5
388 0.52
389 0.53
390 0.53
391 0.53
392 0.56
393 0.49
394 0.44
395 0.42
396 0.45
397 0.43
398 0.39
399 0.36
400 0.29
401 0.3
402 0.34
403 0.39
404 0.39
405 0.48
406 0.52
407 0.6
408 0.6
409 0.61
410 0.58
411 0.58
412 0.61
413 0.55
414 0.49
415 0.44
416 0.46
417 0.45
418 0.47
419 0.45
420 0.44
421 0.45
422 0.48
423 0.51
424 0.54
425 0.58
426 0.54
427 0.53
428 0.47
429 0.44
430 0.41
431 0.34
432 0.27
433 0.2
434 0.2
435 0.16
436 0.16
437 0.14
438 0.13
439 0.16
440 0.17
441 0.2
442 0.19
443 0.22
444 0.22
445 0.24
446 0.25
447 0.22
448 0.21
449 0.18
450 0.2
451 0.24
452 0.3
453 0.33
454 0.39
455 0.48
456 0.55
457 0.62
458 0.64
459 0.64
460 0.62
461 0.61
462 0.57
463 0.48
464 0.46
465 0.42
466 0.38
467 0.32
468 0.3
469 0.33
470 0.36
471 0.4
472 0.39
473 0.4
474 0.42
475 0.46
476 0.47
477 0.45
478 0.43
479 0.42
480 0.43
481 0.42
482 0.4
483 0.37
484 0.33
485 0.31
486 0.29
487 0.25
488 0.25
489 0.22
490 0.26
491 0.25
492 0.25
493 0.22
494 0.2
495 0.22
496 0.16
497 0.15
498 0.1
499 0.11
500 0.1
501 0.1
502 0.11
503 0.08
504 0.1
505 0.1
506 0.12
507 0.14
508 0.17
509 0.18
510 0.17
511 0.19
512 0.18
513 0.17
514 0.14
515 0.11
516 0.08
517 0.08
518 0.07
519 0.05
520 0.05
521 0.07
522 0.09
523 0.11
524 0.14
525 0.16
526 0.16
527 0.18
528 0.2
529 0.21
530 0.24
531 0.23
532 0.2
533 0.19
534 0.18
535 0.17
536 0.15
537 0.13
538 0.11
539 0.11
540 0.11
541 0.11
542 0.12
543 0.12
544 0.14
545 0.15
546 0.12
547 0.13
548 0.15
549 0.16
550 0.17
551 0.17
552 0.15
553 0.18
554 0.19
555 0.19
556 0.19
557 0.23
558 0.26
559 0.26
560 0.27
561 0.24
562 0.22
563 0.21
564 0.2
565 0.16
566 0.12
567 0.11