Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1FYU3

Protein Details
Accession C1FYU3    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-23MPRDKQKRGRRAEAKRKRDDVITBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
5-18KQKRGRRAEAKRKR
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 12.5, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011989  ARM-like  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR040000  NOP9  
IPR001313  Pumilio_RNA-bd_rpt  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG pbn:PADG_00969  -  
Amino Acid Sequences MPRDKQKRGRRAEAKRKRDDVITDPTVLKRQKSSDVCNYPNPSYEQLEIRGDYIPLDEEPVDYTGTPFYGLLDIEEQEYFSHASGLLELNQFETEEEKSIFIERVYEEANGKELKIACSQSCSRLMEKLISASTVSQIKRLFSKFIGHFLNLVQHRFASHCCECLFIHAAQHVTSEMKKKSSKEKENLEEDSTSELQLEDLFLKAISELEGNWGYLLTERFASHTIRLLLLVLAGKPLRNSSTTTVIASRKKEYLASKVGTQLDPSISEKRAVPTSFNKALEKMMKDLVAGLDNTYLRALATHPVGNPVLQLLLSVELSHMGKSKAKDPDSLLRRLVPDENLQGDGESANFLKGLFYDPVGSRLLETIVQDAPGKFFRLFYKILVRERIGSFSRNEIAGHVVVRILERLSKDDLKSAMDMILPEVAPLVERSRLTVIKALIERGIVRGVDLGPLAAALLSAYGDDAVSRINNMLKLQRSNQESDGTTSSSNTSSPEQLHGSLLAQAMLKSTGPLSELVQSSLLAVTTETLISIAQDPVVSHVLQDALTLPTSTPQFRRQITSRFSGKIAELALHSSGSHVVDALWPATKDLLFVKQRFAEELVVHERALRDSFVGRAVWRNWSMDLYKRKRGSWIAIAKGLEDSTDINPNALTHKPKSNIDLARARFAAKANGSKAPS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.92
2 0.92
3 0.88
4 0.8
5 0.76
6 0.7
7 0.66
8 0.64
9 0.57
10 0.51
11 0.48
12 0.47
13 0.49
14 0.46
15 0.43
16 0.39
17 0.4
18 0.46
19 0.51
20 0.57
21 0.59
22 0.65
23 0.67
24 0.7
25 0.71
26 0.63
27 0.6
28 0.56
29 0.49
30 0.43
31 0.42
32 0.36
33 0.34
34 0.36
35 0.33
36 0.3
37 0.27
38 0.23
39 0.2
40 0.18
41 0.15
42 0.11
43 0.13
44 0.12
45 0.11
46 0.13
47 0.14
48 0.14
49 0.12
50 0.13
51 0.11
52 0.11
53 0.11
54 0.09
55 0.09
56 0.1
57 0.09
58 0.1
59 0.11
60 0.11
61 0.12
62 0.12
63 0.12
64 0.1
65 0.12
66 0.11
67 0.09
68 0.1
69 0.08
70 0.09
71 0.1
72 0.11
73 0.13
74 0.13
75 0.13
76 0.14
77 0.14
78 0.14
79 0.13
80 0.13
81 0.11
82 0.13
83 0.14
84 0.13
85 0.13
86 0.15
87 0.15
88 0.13
89 0.15
90 0.13
91 0.14
92 0.15
93 0.17
94 0.16
95 0.16
96 0.2
97 0.17
98 0.17
99 0.19
100 0.19
101 0.2
102 0.23
103 0.26
104 0.23
105 0.29
106 0.31
107 0.31
108 0.35
109 0.36
110 0.32
111 0.33
112 0.34
113 0.32
114 0.31
115 0.29
116 0.23
117 0.21
118 0.2
119 0.16
120 0.18
121 0.21
122 0.2
123 0.22
124 0.22
125 0.24
126 0.29
127 0.31
128 0.3
129 0.26
130 0.35
131 0.32
132 0.37
133 0.38
134 0.33
135 0.32
136 0.29
137 0.35
138 0.29
139 0.29
140 0.22
141 0.19
142 0.2
143 0.2
144 0.21
145 0.21
146 0.2
147 0.22
148 0.22
149 0.24
150 0.23
151 0.26
152 0.28
153 0.2
154 0.21
155 0.2
156 0.2
157 0.18
158 0.18
159 0.15
160 0.13
161 0.16
162 0.21
163 0.21
164 0.26
165 0.3
166 0.34
167 0.44
168 0.53
169 0.6
170 0.61
171 0.69
172 0.7
173 0.73
174 0.72
175 0.64
176 0.54
177 0.44
178 0.41
179 0.32
180 0.24
181 0.18
182 0.14
183 0.11
184 0.11
185 0.11
186 0.06
187 0.06
188 0.06
189 0.05
190 0.05
191 0.05
192 0.06
193 0.05
194 0.05
195 0.05
196 0.09
197 0.09
198 0.09
199 0.09
200 0.09
201 0.08
202 0.1
203 0.11
204 0.08
205 0.08
206 0.09
207 0.1
208 0.12
209 0.14
210 0.13
211 0.16
212 0.16
213 0.15
214 0.15
215 0.14
216 0.12
217 0.11
218 0.11
219 0.07
220 0.08
221 0.08
222 0.09
223 0.09
224 0.1
225 0.11
226 0.11
227 0.14
228 0.15
229 0.21
230 0.22
231 0.22
232 0.25
233 0.29
234 0.33
235 0.33
236 0.32
237 0.28
238 0.28
239 0.31
240 0.3
241 0.31
242 0.32
243 0.31
244 0.3
245 0.33
246 0.35
247 0.3
248 0.28
249 0.23
250 0.17
251 0.17
252 0.19
253 0.17
254 0.16
255 0.17
256 0.18
257 0.19
258 0.23
259 0.21
260 0.22
261 0.24
262 0.31
263 0.35
264 0.36
265 0.34
266 0.3
267 0.33
268 0.34
269 0.3
270 0.25
271 0.21
272 0.19
273 0.18
274 0.18
275 0.15
276 0.11
277 0.1
278 0.08
279 0.09
280 0.08
281 0.09
282 0.08
283 0.07
284 0.06
285 0.06
286 0.07
287 0.07
288 0.09
289 0.1
290 0.1
291 0.12
292 0.13
293 0.12
294 0.11
295 0.09
296 0.08
297 0.06
298 0.06
299 0.04
300 0.04
301 0.04
302 0.04
303 0.04
304 0.05
305 0.06
306 0.06
307 0.07
308 0.08
309 0.11
310 0.12
311 0.18
312 0.24
313 0.25
314 0.27
315 0.29
316 0.37
317 0.39
318 0.41
319 0.35
320 0.3
321 0.3
322 0.29
323 0.27
324 0.2
325 0.17
326 0.16
327 0.16
328 0.15
329 0.14
330 0.12
331 0.11
332 0.09
333 0.07
334 0.06
335 0.05
336 0.04
337 0.04
338 0.04
339 0.04
340 0.04
341 0.07
342 0.06
343 0.07
344 0.09
345 0.09
346 0.11
347 0.12
348 0.12
349 0.09
350 0.1
351 0.1
352 0.09
353 0.09
354 0.09
355 0.08
356 0.09
357 0.1
358 0.09
359 0.11
360 0.1
361 0.12
362 0.1
363 0.12
364 0.13
365 0.16
366 0.17
367 0.17
368 0.25
369 0.28
370 0.31
371 0.33
372 0.32
373 0.32
374 0.32
375 0.34
376 0.26
377 0.24
378 0.21
379 0.21
380 0.21
381 0.18
382 0.17
383 0.14
384 0.14
385 0.13
386 0.12
387 0.09
388 0.08
389 0.08
390 0.08
391 0.08
392 0.06
393 0.08
394 0.08
395 0.1
396 0.14
397 0.17
398 0.18
399 0.2
400 0.21
401 0.2
402 0.2
403 0.18
404 0.15
405 0.12
406 0.11
407 0.09
408 0.09
409 0.08
410 0.07
411 0.07
412 0.06
413 0.05
414 0.06
415 0.07
416 0.08
417 0.09
418 0.1
419 0.14
420 0.15
421 0.16
422 0.19
423 0.18
424 0.2
425 0.21
426 0.2
427 0.17
428 0.17
429 0.16
430 0.13
431 0.14
432 0.1
433 0.09
434 0.09
435 0.09
436 0.09
437 0.08
438 0.07
439 0.05
440 0.05
441 0.05
442 0.03
443 0.03
444 0.02
445 0.02
446 0.02
447 0.02
448 0.02
449 0.03
450 0.03
451 0.03
452 0.03
453 0.04
454 0.04
455 0.05
456 0.06
457 0.07
458 0.09
459 0.11
460 0.16
461 0.19
462 0.23
463 0.26
464 0.32
465 0.34
466 0.36
467 0.37
468 0.36
469 0.33
470 0.32
471 0.31
472 0.26
473 0.22
474 0.2
475 0.19
476 0.15
477 0.15
478 0.13
479 0.14
480 0.15
481 0.16
482 0.18
483 0.19
484 0.19
485 0.19
486 0.17
487 0.16
488 0.15
489 0.14
490 0.12
491 0.11
492 0.1
493 0.1
494 0.1
495 0.09
496 0.08
497 0.08
498 0.07
499 0.07
500 0.08
501 0.09
502 0.13
503 0.14
504 0.14
505 0.14
506 0.14
507 0.13
508 0.13
509 0.11
510 0.07
511 0.06
512 0.06
513 0.06
514 0.06
515 0.05
516 0.05
517 0.05
518 0.06
519 0.07
520 0.07
521 0.07
522 0.07
523 0.07
524 0.1
525 0.12
526 0.11
527 0.1
528 0.1
529 0.11
530 0.1
531 0.11
532 0.09
533 0.08
534 0.09
535 0.09
536 0.08
537 0.11
538 0.14
539 0.17
540 0.2
541 0.26
542 0.32
543 0.35
544 0.42
545 0.44
546 0.51
547 0.52
548 0.56
549 0.55
550 0.5
551 0.49
552 0.44
553 0.39
554 0.33
555 0.28
556 0.22
557 0.17
558 0.17
559 0.16
560 0.14
561 0.13
562 0.11
563 0.12
564 0.11
565 0.11
566 0.08
567 0.08
568 0.09
569 0.11
570 0.11
571 0.12
572 0.11
573 0.12
574 0.14
575 0.13
576 0.13
577 0.14
578 0.22
579 0.27
580 0.28
581 0.33
582 0.36
583 0.37
584 0.38
585 0.38
586 0.33
587 0.26
588 0.3
589 0.3
590 0.27
591 0.26
592 0.26
593 0.24
594 0.23
595 0.24
596 0.19
597 0.15
598 0.15
599 0.16
600 0.17
601 0.18
602 0.17
603 0.22
604 0.24
605 0.29
606 0.3
607 0.31
608 0.29
609 0.32
610 0.34
611 0.36
612 0.45
613 0.46
614 0.53
615 0.55
616 0.55
617 0.59
618 0.61
619 0.6
620 0.6
621 0.61
622 0.57
623 0.58
624 0.57
625 0.5
626 0.45
627 0.37
628 0.27
629 0.19
630 0.16
631 0.14
632 0.21
633 0.2
634 0.19
635 0.19
636 0.2
637 0.22
638 0.25
639 0.29
640 0.27
641 0.35
642 0.4
643 0.44
644 0.48
645 0.54
646 0.54
647 0.56
648 0.6
649 0.55
650 0.57
651 0.54
652 0.5
653 0.44
654 0.41
655 0.4
656 0.38
657 0.42
658 0.39