Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1C1CAS5

Protein Details
Accession A0A1C1CAS5    Localization Confidence High Confidence Score 25
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
21-40PDEYSQPSKKPRFDVRNPSAHydrophilic
84-106NARADRKAKAKEKAEKEKSRDEEBasic
305-333LARLGKSKEKKAKWLNKNKHKKQNGASEDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
89-101RKAKAKEKAEKEK
255-275KKDMKKAKEAAEKREEERRKR
308-326LGKSKEKKAKWLNKNKHKK
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039905  CD2BP2/Lin1  
IPR003169  GYF  
IPR035445  GYF-like_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005682  C:U5 snRNP  
Pfam View protein in Pfam  
PF02213  GYF  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50829  GYF  
Amino Acid Sequences MAYNAPRNKRAAEDYVRTHDPDEYSQPSKKPRFDVRNPSALAPDALEDDAVLQADVIGARGQQVKRGAVNIDGYDSDSDNDNFNARADRKAKAKEKAEKEKSRDEEENDMFADLDDDFKDGDDSEGDAGRRDGKKRAVRFIDADEIEGQIQSSKSGGHVSADFSLNGRGKGKGREQDNDVESSSESEVDDEIRADTGDLDPELGAGSKKDHAPKLDAFNMRAEQEEGRFDDQGNYIRKAVDPDTIYDIWLEGTSKKDMKKAKEAAEKREEERRKRDFADELKSTGDVLAELIPLLNRGETVIEALARLGKSKEKKAKWLNKNKHKKQNGASEDQPLLEDDAAEQLRKQKIETITGAADFLLTKGQAEVYDDEREMLIRQYRRETGNDWIDPPQPNDDDAHDGAAMVQMWEYRWTDARDGGAINGPYDAHTMRQWNDAGYFGEGVEFRKKDSGGGWTRVAEFA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.55
2 0.59
3 0.6
4 0.55
5 0.5
6 0.45
7 0.4
8 0.37
9 0.37
10 0.36
11 0.39
12 0.43
13 0.47
14 0.53
15 0.59
16 0.6
17 0.62
18 0.67
19 0.71
20 0.76
21 0.82
22 0.79
23 0.8
24 0.75
25 0.68
26 0.6
27 0.51
28 0.41
29 0.3
30 0.24
31 0.17
32 0.15
33 0.13
34 0.1
35 0.09
36 0.09
37 0.08
38 0.07
39 0.05
40 0.05
41 0.06
42 0.06
43 0.06
44 0.05
45 0.05
46 0.08
47 0.15
48 0.16
49 0.2
50 0.24
51 0.27
52 0.28
53 0.31
54 0.3
55 0.26
56 0.29
57 0.25
58 0.23
59 0.2
60 0.2
61 0.18
62 0.17
63 0.15
64 0.15
65 0.15
66 0.14
67 0.15
68 0.15
69 0.14
70 0.14
71 0.21
72 0.19
73 0.26
74 0.27
75 0.31
76 0.38
77 0.47
78 0.54
79 0.56
80 0.64
81 0.66
82 0.73
83 0.8
84 0.83
85 0.82
86 0.81
87 0.81
88 0.77
89 0.74
90 0.69
91 0.62
92 0.6
93 0.53
94 0.49
95 0.39
96 0.34
97 0.27
98 0.22
99 0.19
100 0.1
101 0.09
102 0.07
103 0.07
104 0.07
105 0.07
106 0.07
107 0.07
108 0.07
109 0.06
110 0.07
111 0.08
112 0.1
113 0.1
114 0.1
115 0.11
116 0.17
117 0.21
118 0.23
119 0.27
120 0.34
121 0.43
122 0.47
123 0.56
124 0.54
125 0.54
126 0.54
127 0.52
128 0.5
129 0.42
130 0.38
131 0.29
132 0.25
133 0.21
134 0.18
135 0.14
136 0.08
137 0.08
138 0.07
139 0.07
140 0.06
141 0.07
142 0.08
143 0.09
144 0.09
145 0.09
146 0.11
147 0.13
148 0.14
149 0.13
150 0.12
151 0.17
152 0.17
153 0.17
154 0.17
155 0.17
156 0.19
157 0.25
158 0.3
159 0.31
160 0.34
161 0.36
162 0.39
163 0.43
164 0.42
165 0.38
166 0.32
167 0.27
168 0.23
169 0.21
170 0.17
171 0.11
172 0.09
173 0.07
174 0.07
175 0.07
176 0.07
177 0.06
178 0.06
179 0.06
180 0.06
181 0.05
182 0.06
183 0.05
184 0.05
185 0.05
186 0.05
187 0.05
188 0.05
189 0.05
190 0.05
191 0.04
192 0.04
193 0.06
194 0.08
195 0.11
196 0.15
197 0.17
198 0.18
199 0.22
200 0.25
201 0.29
202 0.34
203 0.33
204 0.3
205 0.3
206 0.3
207 0.26
208 0.23
209 0.19
210 0.13
211 0.12
212 0.13
213 0.12
214 0.12
215 0.12
216 0.12
217 0.13
218 0.13
219 0.18
220 0.2
221 0.19
222 0.19
223 0.19
224 0.19
225 0.2
226 0.19
227 0.17
228 0.15
229 0.15
230 0.19
231 0.19
232 0.19
233 0.16
234 0.15
235 0.11
236 0.1
237 0.1
238 0.06
239 0.08
240 0.1
241 0.13
242 0.15
243 0.2
244 0.26
245 0.29
246 0.38
247 0.42
248 0.48
249 0.55
250 0.58
251 0.6
252 0.63
253 0.61
254 0.54
255 0.58
256 0.57
257 0.54
258 0.6
259 0.57
260 0.54
261 0.53
262 0.55
263 0.52
264 0.5
265 0.5
266 0.43
267 0.38
268 0.34
269 0.32
270 0.28
271 0.21
272 0.16
273 0.08
274 0.07
275 0.06
276 0.05
277 0.05
278 0.05
279 0.04
280 0.05
281 0.05
282 0.05
283 0.04
284 0.04
285 0.05
286 0.05
287 0.06
288 0.06
289 0.05
290 0.06
291 0.06
292 0.08
293 0.08
294 0.09
295 0.09
296 0.15
297 0.2
298 0.3
299 0.39
300 0.4
301 0.5
302 0.6
303 0.69
304 0.74
305 0.81
306 0.82
307 0.84
308 0.92
309 0.92
310 0.92
311 0.89
312 0.87
313 0.84
314 0.84
315 0.79
316 0.74
317 0.67
318 0.61
319 0.54
320 0.45
321 0.37
322 0.27
323 0.22
324 0.15
325 0.12
326 0.07
327 0.11
328 0.12
329 0.11
330 0.12
331 0.17
332 0.21
333 0.22
334 0.22
335 0.24
336 0.26
337 0.32
338 0.33
339 0.3
340 0.28
341 0.28
342 0.27
343 0.2
344 0.17
345 0.12
346 0.1
347 0.08
348 0.06
349 0.06
350 0.06
351 0.07
352 0.07
353 0.1
354 0.12
355 0.14
356 0.17
357 0.17
358 0.17
359 0.16
360 0.17
361 0.15
362 0.17
363 0.2
364 0.21
365 0.25
366 0.3
367 0.35
368 0.38
369 0.4
370 0.39
371 0.41
372 0.46
373 0.45
374 0.41
375 0.4
376 0.42
377 0.42
378 0.41
379 0.38
380 0.3
381 0.29
382 0.28
383 0.27
384 0.27
385 0.25
386 0.24
387 0.18
388 0.17
389 0.16
390 0.16
391 0.14
392 0.08
393 0.08
394 0.07
395 0.08
396 0.12
397 0.13
398 0.14
399 0.18
400 0.21
401 0.23
402 0.25
403 0.26
404 0.24
405 0.24
406 0.23
407 0.24
408 0.22
409 0.2
410 0.18
411 0.16
412 0.15
413 0.17
414 0.16
415 0.13
416 0.16
417 0.21
418 0.22
419 0.28
420 0.28
421 0.27
422 0.27
423 0.27
424 0.26
425 0.22
426 0.21
427 0.15
428 0.17
429 0.16
430 0.18
431 0.24
432 0.22
433 0.22
434 0.27
435 0.27
436 0.27
437 0.29
438 0.36
439 0.35
440 0.4
441 0.42
442 0.39