Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1C1CHH0

Protein Details
Accession A0A1C1CHH0    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
536-556EPMSKAAKKNAKKREAKKAAAHydrophilic
610-635LEPPTGPKKERSRSNSRRQRGDTNSSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
540-559KAAKKNAKKREAKKAAAAAA
581-627GGRGKSPSRSPDGRGHQRSRSRNYVPAPGLEPPTGPKKERSRSNSRR
Subcellular Location(s) mito 7.5, cyto_mito 7.333, cyto_nucl 6.833, nucl 6.5, cyto 6, pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011387  TIF2A  
IPR013979  TIF_beta_prop-like  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
Gene Ontology GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF08662  eIF2A  
Amino Acid Sequences MALTQFAFRTLKGIGVVNGAPDYQPLPAFEKPEGNLRCCTYSPCGRYFAWAHPEKVNIINADTGDIISSLPAENVFELGFSPKGTYIITWQRPSKDENGDAVKNLKVWLVHDEKALAEGVDKEPLARFVQKNQTGWNLQYTYDEAFCARVVTNEVQIYESHDLTTVWNKIRVEGVVDFAVSPGESHTIAVFVPERKGQPAAVRVYNVPNFTVPASQKNFFKGDKVQLKWNDNGTSLIVLAQTEVDKTGKSYYGETTLYLLSANGGVDSRIDLDKEGPIHDVAWSPKSNSFAVVYGYMPAKTVIFNAKAQVVHTLPLGPRNTVLFSPHGRFMLLAGFGNLAGQMDIYDLEKDFTKVCTIEASNASVCEWSPDGVHILTATTSPRLRVDNGVRIWHASGPLMYNEDMNELYHVCWRPQPADAHPLGANPLASVPTPHISATEYTATRKTPSKPVGAYRPPGARGQVTPLAFKREDEGGAAFVRDGVSSFASNINGFGKSRQRAVPGAEPVDEKKPLPPGAAPGGGVSLTGTGEGADGEPMSKAAKKNAKKREAKKAAAAAAAAKGQQGDGAAANSLAPDQRNGGRGKSPSRSPDGRGHQRSRSRNYVPAPGLEPPTGPKKERSRSNSRRQRGDTNSSLWDRNHHQANGTPKGPTSNTAQGQQKTARANAPTNINTTIPFPPPPPIPQGEHNPPELEVTSPMTPGGDPRDKKIRGLLKKIRAIEDLKMRFAGGEKLEDTQMRKISSEDSVRKELQGLGYFG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.2
3 0.2
4 0.19
5 0.19
6 0.17
7 0.15
8 0.14
9 0.14
10 0.12
11 0.13
12 0.14
13 0.18
14 0.21
15 0.24
16 0.26
17 0.3
18 0.29
19 0.38
20 0.4
21 0.38
22 0.41
23 0.41
24 0.43
25 0.38
26 0.42
27 0.4
28 0.44
29 0.46
30 0.45
31 0.46
32 0.42
33 0.47
34 0.46
35 0.46
36 0.47
37 0.47
38 0.47
39 0.45
40 0.48
41 0.44
42 0.44
43 0.41
44 0.32
45 0.28
46 0.27
47 0.23
48 0.22
49 0.2
50 0.15
51 0.12
52 0.11
53 0.09
54 0.07
55 0.07
56 0.06
57 0.06
58 0.07
59 0.07
60 0.07
61 0.08
62 0.08
63 0.07
64 0.07
65 0.1
66 0.1
67 0.1
68 0.11
69 0.11
70 0.12
71 0.12
72 0.12
73 0.18
74 0.27
75 0.34
76 0.39
77 0.44
78 0.47
79 0.49
80 0.53
81 0.52
82 0.5
83 0.46
84 0.46
85 0.49
86 0.46
87 0.45
88 0.43
89 0.37
90 0.3
91 0.27
92 0.22
93 0.16
94 0.16
95 0.22
96 0.25
97 0.25
98 0.25
99 0.25
100 0.23
101 0.24
102 0.23
103 0.15
104 0.11
105 0.12
106 0.12
107 0.14
108 0.13
109 0.13
110 0.13
111 0.16
112 0.18
113 0.23
114 0.23
115 0.29
116 0.39
117 0.44
118 0.45
119 0.46
120 0.5
121 0.46
122 0.45
123 0.44
124 0.35
125 0.3
126 0.3
127 0.28
128 0.23
129 0.21
130 0.2
131 0.13
132 0.13
133 0.13
134 0.12
135 0.1
136 0.09
137 0.13
138 0.15
139 0.18
140 0.19
141 0.19
142 0.18
143 0.18
144 0.23
145 0.21
146 0.2
147 0.16
148 0.15
149 0.15
150 0.16
151 0.21
152 0.21
153 0.2
154 0.25
155 0.25
156 0.25
157 0.27
158 0.25
159 0.24
160 0.19
161 0.2
162 0.15
163 0.16
164 0.14
165 0.12
166 0.12
167 0.08
168 0.07
169 0.05
170 0.07
171 0.07
172 0.07
173 0.07
174 0.07
175 0.07
176 0.09
177 0.11
178 0.11
179 0.13
180 0.16
181 0.17
182 0.18
183 0.2
184 0.2
185 0.22
186 0.27
187 0.3
188 0.29
189 0.29
190 0.29
191 0.34
192 0.35
193 0.31
194 0.26
195 0.21
196 0.2
197 0.19
198 0.23
199 0.18
200 0.23
201 0.27
202 0.29
203 0.3
204 0.33
205 0.36
206 0.31
207 0.34
208 0.31
209 0.36
210 0.42
211 0.43
212 0.47
213 0.51
214 0.54
215 0.54
216 0.53
217 0.45
218 0.37
219 0.36
220 0.28
221 0.21
222 0.17
223 0.14
224 0.1
225 0.08
226 0.07
227 0.06
228 0.06
229 0.05
230 0.07
231 0.07
232 0.06
233 0.08
234 0.09
235 0.11
236 0.12
237 0.14
238 0.14
239 0.18
240 0.18
241 0.18
242 0.17
243 0.15
244 0.14
245 0.12
246 0.1
247 0.07
248 0.07
249 0.06
250 0.05
251 0.05
252 0.05
253 0.05
254 0.05
255 0.07
256 0.06
257 0.07
258 0.07
259 0.08
260 0.1
261 0.11
262 0.11
263 0.11
264 0.1
265 0.1
266 0.11
267 0.12
268 0.12
269 0.15
270 0.15
271 0.16
272 0.18
273 0.21
274 0.2
275 0.18
276 0.18
277 0.15
278 0.15
279 0.14
280 0.13
281 0.12
282 0.12
283 0.11
284 0.1
285 0.09
286 0.08
287 0.07
288 0.09
289 0.11
290 0.13
291 0.13
292 0.14
293 0.16
294 0.16
295 0.16
296 0.18
297 0.15
298 0.13
299 0.13
300 0.14
301 0.12
302 0.17
303 0.18
304 0.14
305 0.15
306 0.15
307 0.16
308 0.14
309 0.16
310 0.14
311 0.16
312 0.18
313 0.19
314 0.18
315 0.17
316 0.16
317 0.15
318 0.13
319 0.11
320 0.09
321 0.07
322 0.07
323 0.07
324 0.07
325 0.06
326 0.04
327 0.03
328 0.03
329 0.03
330 0.03
331 0.03
332 0.04
333 0.04
334 0.04
335 0.05
336 0.06
337 0.06
338 0.07
339 0.07
340 0.08
341 0.08
342 0.08
343 0.1
344 0.1
345 0.12
346 0.12
347 0.14
348 0.12
349 0.12
350 0.12
351 0.1
352 0.09
353 0.08
354 0.07
355 0.06
356 0.06
357 0.06
358 0.07
359 0.07
360 0.07
361 0.05
362 0.05
363 0.05
364 0.05
365 0.06
366 0.07
367 0.07
368 0.08
369 0.09
370 0.11
371 0.12
372 0.17
373 0.2
374 0.25
375 0.26
376 0.27
377 0.26
378 0.25
379 0.25
380 0.2
381 0.17
382 0.1
383 0.09
384 0.08
385 0.08
386 0.09
387 0.08
388 0.08
389 0.08
390 0.08
391 0.08
392 0.07
393 0.07
394 0.06
395 0.07
396 0.11
397 0.11
398 0.11
399 0.13
400 0.14
401 0.15
402 0.18
403 0.21
404 0.19
405 0.26
406 0.25
407 0.25
408 0.24
409 0.23
410 0.2
411 0.18
412 0.15
413 0.08
414 0.08
415 0.06
416 0.06
417 0.06
418 0.07
419 0.08
420 0.08
421 0.08
422 0.09
423 0.09
424 0.1
425 0.12
426 0.14
427 0.13
428 0.14
429 0.16
430 0.16
431 0.18
432 0.22
433 0.23
434 0.28
435 0.31
436 0.35
437 0.36
438 0.41
439 0.48
440 0.48
441 0.48
442 0.44
443 0.43
444 0.39
445 0.37
446 0.34
447 0.26
448 0.22
449 0.24
450 0.25
451 0.22
452 0.24
453 0.23
454 0.27
455 0.26
456 0.25
457 0.22
458 0.19
459 0.18
460 0.16
461 0.16
462 0.12
463 0.12
464 0.12
465 0.09
466 0.08
467 0.08
468 0.06
469 0.06
470 0.06
471 0.07
472 0.07
473 0.08
474 0.09
475 0.09
476 0.1
477 0.1
478 0.1
479 0.1
480 0.11
481 0.14
482 0.2
483 0.21
484 0.24
485 0.26
486 0.27
487 0.29
488 0.33
489 0.35
490 0.32
491 0.32
492 0.3
493 0.29
494 0.28
495 0.29
496 0.26
497 0.2
498 0.18
499 0.22
500 0.22
501 0.22
502 0.2
503 0.21
504 0.23
505 0.23
506 0.21
507 0.16
508 0.15
509 0.14
510 0.13
511 0.09
512 0.05
513 0.04
514 0.04
515 0.04
516 0.03
517 0.04
518 0.04
519 0.04
520 0.04
521 0.04
522 0.04
523 0.04
524 0.05
525 0.06
526 0.09
527 0.1
528 0.18
529 0.28
530 0.36
531 0.46
532 0.56
533 0.65
534 0.72
535 0.78
536 0.82
537 0.83
538 0.79
539 0.76
540 0.71
541 0.64
542 0.55
543 0.47
544 0.37
545 0.28
546 0.25
547 0.18
548 0.13
549 0.1
550 0.08
551 0.08
552 0.07
553 0.07
554 0.07
555 0.07
556 0.07
557 0.07
558 0.07
559 0.06
560 0.06
561 0.07
562 0.07
563 0.07
564 0.1
565 0.13
566 0.18
567 0.2
568 0.22
569 0.26
570 0.31
571 0.37
572 0.4
573 0.43
574 0.43
575 0.49
576 0.5
577 0.49
578 0.54
579 0.58
580 0.63
581 0.66
582 0.67
583 0.69
584 0.74
585 0.78
586 0.76
587 0.76
588 0.69
589 0.68
590 0.65
591 0.65
592 0.58
593 0.52
594 0.47
595 0.41
596 0.4
597 0.33
598 0.29
599 0.24
600 0.31
601 0.32
602 0.32
603 0.37
604 0.43
605 0.52
606 0.61
607 0.66
608 0.69
609 0.75
610 0.84
611 0.86
612 0.85
613 0.86
614 0.82
615 0.83
616 0.8
617 0.79
618 0.72
619 0.66
620 0.65
621 0.58
622 0.56
623 0.47
624 0.44
625 0.41
626 0.43
627 0.45
628 0.39
629 0.38
630 0.39
631 0.47
632 0.49
633 0.45
634 0.38
635 0.32
636 0.36
637 0.35
638 0.32
639 0.3
640 0.32
641 0.33
642 0.4
643 0.46
644 0.43
645 0.48
646 0.5
647 0.48
648 0.43
649 0.44
650 0.43
651 0.4
652 0.42
653 0.4
654 0.45
655 0.41
656 0.41
657 0.39
658 0.35
659 0.31
660 0.3
661 0.3
662 0.25
663 0.25
664 0.23
665 0.26
666 0.29
667 0.32
668 0.34
669 0.35
670 0.36
671 0.4
672 0.48
673 0.52
674 0.52
675 0.51
676 0.46
677 0.42
678 0.4
679 0.35
680 0.27
681 0.2
682 0.21
683 0.19
684 0.18
685 0.17
686 0.15
687 0.15
688 0.16
689 0.23
690 0.28
691 0.28
692 0.35
693 0.45
694 0.46
695 0.48
696 0.54
697 0.55
698 0.56
699 0.65
700 0.69
701 0.68
702 0.75
703 0.77
704 0.72
705 0.68
706 0.61
707 0.58
708 0.58
709 0.52
710 0.47
711 0.43
712 0.38
713 0.34
714 0.32
715 0.31
716 0.23
717 0.24
718 0.22
719 0.24
720 0.27
721 0.3
722 0.32
723 0.32
724 0.35
725 0.32
726 0.32
727 0.31
728 0.31
729 0.35
730 0.42
731 0.42
732 0.44
733 0.49
734 0.5
735 0.5
736 0.48
737 0.44
738 0.41