FuNGI

A0A1C1CI93

Protein Details

Accession

A0A1C1CI93

Localization Confidence

High

Confidence Score

24.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
8-32	NGGPANKPVIRRKKPAADPFFKGPK	Hydrophilic
201-220	SQNAGKRTNFKKKTQQVFKS	Hydrophilic
528-550	GTDASVRKKKLKSKHLSSTQPTP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
14-36	KPVIRRKKPAADPFFKGPKVKAA
147-147	R
417-436	KREAEAKKKNFRDLRKALER
534-539	RKKKLK

Subcellular Location(s)

nucl 22, mito 2, cyto 2, cyto_mito 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MNPGSAPNGGPANKPVIRRKKPAADPFFKGPKVKAAATKYPPAGRENGHPTPPTINGQPKPQTPPVLARPRAPSPSRPAVPEHERVSGFTDPRVTAEGIPYRDYRLVTTKKDLLKGWRYHILQLAGEKPIDIRNEAEFAKPARLHRRDPRAPPPGHQEKKEEDEQLDSKDGLNAAEREELSRRKEARQKEREANLAQIAPSQNAGKRTNFKKKTQQVFKSEFSAEEKRRIQTNYEEKLPWHLEDFDNKHSLIGHHQPGSRDSNAALVYEPAVDASTGKFRLIPIEKIYQFKPKRDDLQKMTIEEVEAAMKKGGSDPEWLVRSREARIQEQMRERAAKESRGLFLGASKTTAFAGRTGEEADLDFEEDFADDEEGDLFMDKDEDQKLADARIKEDQLQANFLDFKDLNEYDEAEAREKREAEAKKKNFRDLRKALERRERNYNHGSDSEYESSTDTDEEEERLERERLANKQKEEDEARKSNLPSSGTNTPSGRKEKRDTDREEGGMKKSTSSRSLKRPASPNASDASGTDASVRKKKLKSKHLSSTQPTPGHSRPGSPANVPSSSAPAGSFDPLAAKIRRRGVAGSPAGSDTETDGAAMSDASRARRIKLNVGGSPPAPSSRAGSPVPNPATVPRSPAFPSEQDIRNAIPPEGISVRDLIRKIPHPPERKTEFVNLVKAITRLDKDRGLLLPK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.41
2	0.48
3	0.53
4	0.6
5	0.67
6	0.74
7	0.76
8	0.82
9	0.86
10	0.86
11	0.82
12	0.8
13	0.8
14	0.79
15	0.73
16	0.66
17	0.57
18	0.55
19	0.53
20	0.52
21	0.51
22	0.49
23	0.55
24	0.57
25	0.63
26	0.6
27	0.6
28	0.58
29	0.53
30	0.5
31	0.43
32	0.46
33	0.48
34	0.48
35	0.48
36	0.47
37	0.45
38	0.44
39	0.45
40	0.41
41	0.4
42	0.43
43	0.41
44	0.49
45	0.54
46	0.55
47	0.59
48	0.6
49	0.57
50	0.51
51	0.56
52	0.58
53	0.61
54	0.59
55	0.57
56	0.58
57	0.6
58	0.64
59	0.6
60	0.57
61	0.55
62	0.62
63	0.59
64	0.55
65	0.53
66	0.54
67	0.56
68	0.57
69	0.52
70	0.47
71	0.45
72	0.43
73	0.44
74	0.41
75	0.35
76	0.3
77	0.31
78	0.25
79	0.26
80	0.28
81	0.24
82	0.2
83	0.25
84	0.29
85	0.27
86	0.3
87	0.29
88	0.29
89	0.31
90	0.3
91	0.27
92	0.31
93	0.35
94	0.37
95	0.43
96	0.47
97	0.48
98	0.52
99	0.53
100	0.52
101	0.55
102	0.56
103	0.55
104	0.56
105	0.53
106	0.52
107	0.53
108	0.47
109	0.39
110	0.37
111	0.34
112	0.28
113	0.26
114	0.23
115	0.19
116	0.2
117	0.2
118	0.17
119	0.16
120	0.16
121	0.2
122	0.2
123	0.21
124	0.2
125	0.2
126	0.25
127	0.26
128	0.31
129	0.38
130	0.43
131	0.5
132	0.56
133	0.66
134	0.67
135	0.73
136	0.76
137	0.76
138	0.73
139	0.69
140	0.7
141	0.7
142	0.68
143	0.63
144	0.59
145	0.54
146	0.58
147	0.58
148	0.52
149	0.41
150	0.41
151	0.4
152	0.37
153	0.33
154	0.27
155	0.23
156	0.21
157	0.2
158	0.15
159	0.16
160	0.13
161	0.13
162	0.16
163	0.16
164	0.16
165	0.21
166	0.25
167	0.26
168	0.33
169	0.34
170	0.39
171	0.46
172	0.54
173	0.6
174	0.65
175	0.7
176	0.71
177	0.73
178	0.72
179	0.66
180	0.6
181	0.51
182	0.43
183	0.34
184	0.29
185	0.25
186	0.18
187	0.18
188	0.17
189	0.16
190	0.21
191	0.24
192	0.25
193	0.33
194	0.41
195	0.51
196	0.55
197	0.6
198	0.66
199	0.72
200	0.79
201	0.81
202	0.8
203	0.78
204	0.78
205	0.73
206	0.66
207	0.57
208	0.48
209	0.43
210	0.44
211	0.37
212	0.39
213	0.4
214	0.37
215	0.41
216	0.41
217	0.39
218	0.39
219	0.47
220	0.43
221	0.44
222	0.43
223	0.38
224	0.43
225	0.42
226	0.33
227	0.25
228	0.23
229	0.2
230	0.27
231	0.3
232	0.27
233	0.28
234	0.27
235	0.25
236	0.24
237	0.23
238	0.21
239	0.24
240	0.24
241	0.26
242	0.28
243	0.29
244	0.32
245	0.36
246	0.31
247	0.25
248	0.21
249	0.2
250	0.19
251	0.18
252	0.14
253	0.1
254	0.1
255	0.09
256	0.08
257	0.05
258	0.05
259	0.04
260	0.04
261	0.05
262	0.08
263	0.09
264	0.09
265	0.1
266	0.09
267	0.17
268	0.19
269	0.21
270	0.21
271	0.28
272	0.3
273	0.32
274	0.34
275	0.37
276	0.38
277	0.4
278	0.42
279	0.39
280	0.46
281	0.5
282	0.56
283	0.52
284	0.58
285	0.56
286	0.51
287	0.48
288	0.39
289	0.32
290	0.24
291	0.19
292	0.12
293	0.09
294	0.08
295	0.07
296	0.07
297	0.07
298	0.08
299	0.09
300	0.08
301	0.1
302	0.11
303	0.15
304	0.18
305	0.18
306	0.18
307	0.19
308	0.19
309	0.19
310	0.22
311	0.2
312	0.21
313	0.26
314	0.28
315	0.31
316	0.35
317	0.37
318	0.35
319	0.34
320	0.32
321	0.33
322	0.32
323	0.28
324	0.25
325	0.24
326	0.23
327	0.22
328	0.21
329	0.14
330	0.14
331	0.14
332	0.11
333	0.1
334	0.1
335	0.09
336	0.09
337	0.11
338	0.09
339	0.08
340	0.09
341	0.09
342	0.09
343	0.1
344	0.09
345	0.08
346	0.08
347	0.08
348	0.06
349	0.07
350	0.06
351	0.05
352	0.05
353	0.05
354	0.05
355	0.04
356	0.04
357	0.03
358	0.04
359	0.04
360	0.04
361	0.04
362	0.04
363	0.03
364	0.03
365	0.04
366	0.04
367	0.06
368	0.07
369	0.07
370	0.07
371	0.08
372	0.09
373	0.11
374	0.14
375	0.13
376	0.14
377	0.17
378	0.18
379	0.18
380	0.22
381	0.23
382	0.21
383	0.22
384	0.2
385	0.18
386	0.18
387	0.16
388	0.16
389	0.12
390	0.12
391	0.15
392	0.15
393	0.15
394	0.14
395	0.16
396	0.12
397	0.16
398	0.16
399	0.14
400	0.15
401	0.15
402	0.17
403	0.17
404	0.17
405	0.21
406	0.26
407	0.32
408	0.42
409	0.49
410	0.56
411	0.59
412	0.67
413	0.67
414	0.68
415	0.69
416	0.65
417	0.66
418	0.67
419	0.7
420	0.69
421	0.72
422	0.72
423	0.65
424	0.7
425	0.63
426	0.59
427	0.6
428	0.54
429	0.47
430	0.42
431	0.4
432	0.31
433	0.34
434	0.29
435	0.23
436	0.21
437	0.18
438	0.17
439	0.16
440	0.14
441	0.09
442	0.08
443	0.09
444	0.09
445	0.09
446	0.1
447	0.1
448	0.13
449	0.13
450	0.12
451	0.16
452	0.2
453	0.27
454	0.36
455	0.42
456	0.41
457	0.47
458	0.47
459	0.49
460	0.5
461	0.49
462	0.47
463	0.45
464	0.46
465	0.45
466	0.44
467	0.41
468	0.39
469	0.35
470	0.29
471	0.3
472	0.33
473	0.31
474	0.34
475	0.32
476	0.32
477	0.36
478	0.43
479	0.42
480	0.43
481	0.48
482	0.54
483	0.62
484	0.68
485	0.69
486	0.67
487	0.67
488	0.62
489	0.6
490	0.53
491	0.47
492	0.43
493	0.36
494	0.32
495	0.3
496	0.32
497	0.35
498	0.4
499	0.44
500	0.48
501	0.57
502	0.6
503	0.63
504	0.68
505	0.68
506	0.69
507	0.64
508	0.56
509	0.49
510	0.44
511	0.37
512	0.29
513	0.27
514	0.19
515	0.17
516	0.17
517	0.19
518	0.23
519	0.29
520	0.33
521	0.35
522	0.41
523	0.5
524	0.57
525	0.64
526	0.7
527	0.73
528	0.8
529	0.82
530	0.84
531	0.81
532	0.8
533	0.77
534	0.7
535	0.62
536	0.59
537	0.52
538	0.51
539	0.46
540	0.4
541	0.36
542	0.4
543	0.41
544	0.36
545	0.39
546	0.35
547	0.35
548	0.33
549	0.3
550	0.28
551	0.25
552	0.23
553	0.18
554	0.16
555	0.16
556	0.16
557	0.15
558	0.11
559	0.12
560	0.13
561	0.19
562	0.2
563	0.23
564	0.28
565	0.35
566	0.37
567	0.37
568	0.39
569	0.38
570	0.45
571	0.44
572	0.4
573	0.34
574	0.32
575	0.31
576	0.28
577	0.23
578	0.15
579	0.12
580	0.1
581	0.09
582	0.08
583	0.08
584	0.08
585	0.07
586	0.06
587	0.08
588	0.1
589	0.13
590	0.19
591	0.21
592	0.24
593	0.31
594	0.34
595	0.39
596	0.46
597	0.51
598	0.48
599	0.52
600	0.52
601	0.45
602	0.44
603	0.37
604	0.31
605	0.25
606	0.22
607	0.21
608	0.2
609	0.25
610	0.24
611	0.28
612	0.3
613	0.38
614	0.4
615	0.37
616	0.35
617	0.35
618	0.38
619	0.34
620	0.37
621	0.28
622	0.29
623	0.3
624	0.33
625	0.33
626	0.3
627	0.34
628	0.35
629	0.39
630	0.38
631	0.38
632	0.36
633	0.37
634	0.37
635	0.32
636	0.26
637	0.22
638	0.24
639	0.24
640	0.23
641	0.18
642	0.18
643	0.21
644	0.24
645	0.25
646	0.24
647	0.29
648	0.33
649	0.4
650	0.48
651	0.55
652	0.58
653	0.64
654	0.7
655	0.7
656	0.7
657	0.68
658	0.66
659	0.65
660	0.62
661	0.62
662	0.53
663	0.48
664	0.46
665	0.41
666	0.36
667	0.32
668	0.3
669	0.29
670	0.33
671	0.35
672	0.34
673	0.38

A0A1C1CI93

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer