Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1C1C8H0

Protein Details
Accession A0A1C1C8H0    Localization Confidence High Confidence Score 16.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
5-32KTAPAQPSQPSRKGKKAWRKHVDITAVQHydrophilic
290-327VTESEMRKRKRPERKTPAQKNKLKRRKEAERLAKHEAKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
16-23RKGKKAWR
296-330RKRKRPERKTPAQKNKLKRRKEAERLAKHEAKMGA
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 11.5, mito 5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011687  Nop53/GLTSCR2  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0005654  C:nucleoplasm  
GO:0000027  P:ribosomal large subunit assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF07767  Nop53  
Amino Acid Sequences MSASKTAPAQPSQPSRKGKKAWRKHVDITAVQAGLETLREEIIQHGRPLAEKAHGEIFALDTVGSSKEEVFKKAKDGHKIKVLKMDEILGRRSAVPALPSGKKRPLDARVTDGVVATKRQKTDWVSKKEVARVRSKLDKPSHLDLEDIHGEPSNFDLWDTTDNAVQPASASALASSEDQQGNEYIPRPKPKIAPPTIRRPPIALTHNGLPTHAVPTPDAGHSYNPSFEDWDTLLTREGEREIQAEQKRLAEAQLAAEKQARIDALAAQPERQPGDDGESEWEGFETETEVTESEMRKRKRPERKTPAQKNKLKRRKEAERLAKHEAKMGAQQKRGEEIIKALISRQEKEEQGAIQAAEPSRGTSALRRKTTLGPSRASILPPRLELVLPDELQDSLRRLKPEGNLLEDRFRNLLVNGKLEARKPVSYAASRKKQVKFTEKWWSKDFAIGA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.65
2 0.69
3 0.75
4 0.8
5 0.82
6 0.83
7 0.85
8 0.87
9 0.87
10 0.88
11 0.86
12 0.85
13 0.82
14 0.73
15 0.68
16 0.62
17 0.52
18 0.43
19 0.35
20 0.27
21 0.19
22 0.17
23 0.11
24 0.07
25 0.07
26 0.07
27 0.08
28 0.12
29 0.19
30 0.22
31 0.22
32 0.24
33 0.24
34 0.25
35 0.27
36 0.25
37 0.24
38 0.21
39 0.23
40 0.25
41 0.25
42 0.24
43 0.22
44 0.2
45 0.15
46 0.15
47 0.12
48 0.07
49 0.08
50 0.09
51 0.09
52 0.08
53 0.09
54 0.16
55 0.18
56 0.23
57 0.27
58 0.28
59 0.34
60 0.42
61 0.47
62 0.51
63 0.54
64 0.56
65 0.61
66 0.65
67 0.61
68 0.62
69 0.57
70 0.49
71 0.44
72 0.42
73 0.37
74 0.34
75 0.34
76 0.26
77 0.25
78 0.23
79 0.23
80 0.2
81 0.16
82 0.14
83 0.16
84 0.21
85 0.26
86 0.3
87 0.35
88 0.41
89 0.42
90 0.44
91 0.48
92 0.5
93 0.52
94 0.51
95 0.51
96 0.46
97 0.46
98 0.43
99 0.35
100 0.3
101 0.23
102 0.23
103 0.23
104 0.23
105 0.23
106 0.23
107 0.29
108 0.32
109 0.42
110 0.48
111 0.51
112 0.54
113 0.58
114 0.62
115 0.64
116 0.63
117 0.57
118 0.56
119 0.52
120 0.51
121 0.56
122 0.55
123 0.57
124 0.58
125 0.6
126 0.57
127 0.6
128 0.58
129 0.48
130 0.45
131 0.36
132 0.35
133 0.3
134 0.24
135 0.18
136 0.15
137 0.15
138 0.14
139 0.15
140 0.11
141 0.08
142 0.07
143 0.08
144 0.08
145 0.1
146 0.12
147 0.11
148 0.11
149 0.12
150 0.12
151 0.11
152 0.1
153 0.08
154 0.06
155 0.07
156 0.05
157 0.05
158 0.05
159 0.05
160 0.06
161 0.07
162 0.08
163 0.11
164 0.11
165 0.11
166 0.12
167 0.12
168 0.12
169 0.13
170 0.15
171 0.16
172 0.2
173 0.26
174 0.28
175 0.31
176 0.36
177 0.42
178 0.5
179 0.52
180 0.58
181 0.58
182 0.66
183 0.7
184 0.68
185 0.6
186 0.52
187 0.46
188 0.43
189 0.41
190 0.33
191 0.28
192 0.28
193 0.31
194 0.29
195 0.26
196 0.2
197 0.17
198 0.17
199 0.16
200 0.13
201 0.1
202 0.11
203 0.13
204 0.12
205 0.13
206 0.11
207 0.11
208 0.12
209 0.12
210 0.12
211 0.11
212 0.11
213 0.11
214 0.1
215 0.11
216 0.1
217 0.11
218 0.11
219 0.1
220 0.11
221 0.11
222 0.11
223 0.09
224 0.1
225 0.09
226 0.09
227 0.09
228 0.09
229 0.16
230 0.18
231 0.19
232 0.19
233 0.19
234 0.19
235 0.19
236 0.18
237 0.12
238 0.11
239 0.11
240 0.14
241 0.13
242 0.13
243 0.15
244 0.15
245 0.13
246 0.13
247 0.11
248 0.08
249 0.08
250 0.1
251 0.09
252 0.14
253 0.14
254 0.14
255 0.16
256 0.17
257 0.17
258 0.15
259 0.15
260 0.11
261 0.15
262 0.15
263 0.14
264 0.15
265 0.16
266 0.15
267 0.14
268 0.13
269 0.09
270 0.08
271 0.07
272 0.06
273 0.05
274 0.06
275 0.06
276 0.06
277 0.07
278 0.1
279 0.11
280 0.17
281 0.25
282 0.28
283 0.35
284 0.44
285 0.53
286 0.61
287 0.71
288 0.75
289 0.77
290 0.86
291 0.9
292 0.92
293 0.94
294 0.94
295 0.91
296 0.91
297 0.91
298 0.9
299 0.87
300 0.85
301 0.83
302 0.83
303 0.85
304 0.85
305 0.85
306 0.85
307 0.83
308 0.83
309 0.78
310 0.67
311 0.62
312 0.53
313 0.43
314 0.42
315 0.43
316 0.41
317 0.41
318 0.43
319 0.4
320 0.42
321 0.41
322 0.34
323 0.27
324 0.23
325 0.23
326 0.21
327 0.2
328 0.18
329 0.22
330 0.24
331 0.24
332 0.26
333 0.26
334 0.25
335 0.28
336 0.3
337 0.24
338 0.24
339 0.24
340 0.2
341 0.16
342 0.18
343 0.16
344 0.15
345 0.15
346 0.14
347 0.12
348 0.13
349 0.13
350 0.18
351 0.28
352 0.35
353 0.39
354 0.4
355 0.43
356 0.49
357 0.59
358 0.6
359 0.56
360 0.5
361 0.48
362 0.5
363 0.48
364 0.44
365 0.39
366 0.36
367 0.33
368 0.31
369 0.31
370 0.27
371 0.25
372 0.24
373 0.23
374 0.22
375 0.2
376 0.2
377 0.19
378 0.18
379 0.19
380 0.2
381 0.19
382 0.21
383 0.25
384 0.26
385 0.27
386 0.32
387 0.36
388 0.44
389 0.45
390 0.45
391 0.47
392 0.49
393 0.55
394 0.5
395 0.48
396 0.4
397 0.35
398 0.3
399 0.25
400 0.3
401 0.25
402 0.27
403 0.26
404 0.32
405 0.34
406 0.34
407 0.41
408 0.37
409 0.36
410 0.34
411 0.38
412 0.38
413 0.43
414 0.51
415 0.54
416 0.59
417 0.65
418 0.72
419 0.74
420 0.75
421 0.78
422 0.78
423 0.74
424 0.73
425 0.77
426 0.76
427 0.75
428 0.71
429 0.67
430 0.58