Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1C1CYH0

Protein Details
Accession A0A1C1CYH0    Localization Confidence High Confidence Score 16
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
96-115PPPPAPRTPRSRKSKSDLAAHydrophilic
121-144RAPSTSKRTKTPSRRSVTRTPRASHydrophilic
293-317VPGRTSTLVRRKKKKPTGPIAKTAPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
302-309RRKKKKPT
Subcellular Location(s) cyto_nucl 12, nucl 11, cyto 11, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR025856  HeH/LEM_domain  
IPR044780  Heh2/Src1  
IPR041885  MAN1_winged_helix_dom  
IPR018996  MSC  
IPR036361  SAP_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005637  C:nuclear inner membrane  
GO:0003682  F:chromatin binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF12949  HeH  
PF09402  MSC  
CDD cd12935  LEM_like  
Amino Acid Sequences MADEDELYYLQPGFDLNTLTVPRLRSILVAHNIHYPSSAKKSQLLEILGNELLPKREKLLRAQARVRRTSKGITDVPSSQESTISSDEGDDRQLMPPPPAPRTPRSRKSKSDLAAEESVGRAPSTSKRTKTPSRRSVTRTPRASDTEHTEPEEAKSTVRRPRKSAPTQPVLEPAVKIEEPDARLKRESLEAGTSPFSDENPFQSGSSPPSASDRRKSASRSRKSLSSTTTTKRGQTSSTSLKPEDSPPSRSTVSFPISRVMSADTEDGVTTTEEFTPDAARELAEDEQNGQLVPGRTSTLVRRKKKKPTGPIAKTAPLAILTSVLGALGAWYRQEKINVGYCGVGEPNWSLASNPHIPAWVHENFQPSCEPCPQHAVCYPNMEVECETDFVLKPHPLSLNGGVPLPPTCEPDSEKQRRIKAVADRAIEELRERRAAYECGEEVTAPSNAVARETQAAKAVAKPTKSQLEITEEDLKQTVSKMKRRGMTDEEFEDLWRGALGDILGRDEVQVTQDRSGRQLVSSSSLARLPFTCAIRRSVLRAIAENRIPIAILILLVSGLAYGRNQIITHKQNTARIPGLVATTLDRLATQASLNQEGRVSEPFISIGQLRDDVLRSVFSASERERVWRSVRRIVEGNSNVRAGNREGGKTGEVSRVWEWIGPVDLAPGLEGRRSGGLITDGRAGGSSSPGEDGVVKAEDRSNMETRRWDEGRAIY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.12
3 0.11
4 0.16
5 0.18
6 0.2
7 0.23
8 0.22
9 0.22
10 0.22
11 0.22
12 0.19
13 0.21
14 0.28
15 0.33
16 0.34
17 0.34
18 0.39
19 0.39
20 0.38
21 0.36
22 0.29
23 0.27
24 0.33
25 0.36
26 0.32
27 0.37
28 0.4
29 0.43
30 0.47
31 0.44
32 0.39
33 0.35
34 0.36
35 0.3
36 0.27
37 0.23
38 0.19
39 0.19
40 0.19
41 0.19
42 0.2
43 0.26
44 0.29
45 0.36
46 0.46
47 0.52
48 0.58
49 0.67
50 0.69
51 0.72
52 0.78
53 0.74
54 0.68
55 0.63
56 0.61
57 0.57
58 0.58
59 0.53
60 0.48
61 0.5
62 0.46
63 0.46
64 0.42
65 0.38
66 0.31
67 0.27
68 0.24
69 0.23
70 0.22
71 0.18
72 0.16
73 0.15
74 0.17
75 0.16
76 0.17
77 0.14
78 0.14
79 0.15
80 0.21
81 0.21
82 0.22
83 0.26
84 0.29
85 0.33
86 0.39
87 0.43
88 0.45
89 0.54
90 0.62
91 0.67
92 0.72
93 0.76
94 0.78
95 0.8
96 0.82
97 0.76
98 0.75
99 0.69
100 0.65
101 0.58
102 0.5
103 0.43
104 0.34
105 0.3
106 0.21
107 0.17
108 0.11
109 0.11
110 0.17
111 0.25
112 0.33
113 0.35
114 0.42
115 0.51
116 0.61
117 0.7
118 0.74
119 0.76
120 0.77
121 0.82
122 0.82
123 0.84
124 0.84
125 0.83
126 0.79
127 0.73
128 0.69
129 0.65
130 0.61
131 0.55
132 0.52
133 0.49
134 0.45
135 0.43
136 0.38
137 0.35
138 0.33
139 0.33
140 0.26
141 0.21
142 0.24
143 0.28
144 0.36
145 0.44
146 0.47
147 0.49
148 0.58
149 0.67
150 0.72
151 0.75
152 0.76
153 0.75
154 0.73
155 0.68
156 0.64
157 0.56
158 0.47
159 0.37
160 0.28
161 0.24
162 0.21
163 0.19
164 0.16
165 0.17
166 0.19
167 0.27
168 0.29
169 0.28
170 0.29
171 0.3
172 0.3
173 0.29
174 0.29
175 0.22
176 0.23
177 0.21
178 0.22
179 0.22
180 0.2
181 0.18
182 0.16
183 0.15
184 0.14
185 0.14
186 0.14
187 0.16
188 0.17
189 0.16
190 0.17
191 0.18
192 0.19
193 0.21
194 0.19
195 0.16
196 0.21
197 0.28
198 0.31
199 0.36
200 0.37
201 0.38
202 0.43
203 0.48
204 0.52
205 0.56
206 0.6
207 0.62
208 0.61
209 0.63
210 0.63
211 0.62
212 0.56
213 0.52
214 0.5
215 0.47
216 0.51
217 0.47
218 0.45
219 0.43
220 0.4
221 0.35
222 0.33
223 0.36
224 0.36
225 0.39
226 0.4
227 0.37
228 0.37
229 0.37
230 0.37
231 0.38
232 0.34
233 0.34
234 0.31
235 0.35
236 0.35
237 0.34
238 0.32
239 0.29
240 0.29
241 0.27
242 0.27
243 0.26
244 0.25
245 0.24
246 0.22
247 0.18
248 0.14
249 0.13
250 0.13
251 0.09
252 0.09
253 0.09
254 0.08
255 0.07
256 0.07
257 0.06
258 0.07
259 0.06
260 0.06
261 0.07
262 0.07
263 0.07
264 0.07
265 0.08
266 0.07
267 0.07
268 0.07
269 0.09
270 0.1
271 0.09
272 0.09
273 0.09
274 0.09
275 0.1
276 0.09
277 0.07
278 0.09
279 0.09
280 0.09
281 0.09
282 0.09
283 0.1
284 0.12
285 0.18
286 0.26
287 0.35
288 0.43
289 0.52
290 0.6
291 0.7
292 0.79
293 0.81
294 0.81
295 0.83
296 0.85
297 0.81
298 0.8
299 0.74
300 0.66
301 0.57
302 0.47
303 0.36
304 0.25
305 0.2
306 0.12
307 0.09
308 0.06
309 0.05
310 0.05
311 0.04
312 0.03
313 0.03
314 0.03
315 0.03
316 0.03
317 0.03
318 0.04
319 0.05
320 0.07
321 0.08
322 0.09
323 0.12
324 0.18
325 0.18
326 0.18
327 0.17
328 0.16
329 0.16
330 0.15
331 0.12
332 0.06
333 0.06
334 0.06
335 0.06
336 0.06
337 0.06
338 0.06
339 0.11
340 0.13
341 0.13
342 0.12
343 0.13
344 0.13
345 0.14
346 0.19
347 0.16
348 0.15
349 0.16
350 0.21
351 0.19
352 0.2
353 0.21
354 0.17
355 0.18
356 0.21
357 0.2
358 0.17
359 0.24
360 0.23
361 0.24
362 0.27
363 0.27
364 0.24
365 0.26
366 0.25
367 0.21
368 0.2
369 0.18
370 0.15
371 0.14
372 0.14
373 0.11
374 0.11
375 0.09
376 0.09
377 0.09
378 0.11
379 0.1
380 0.1
381 0.12
382 0.12
383 0.12
384 0.15
385 0.16
386 0.16
387 0.16
388 0.16
389 0.13
390 0.13
391 0.12
392 0.12
393 0.11
394 0.12
395 0.12
396 0.14
397 0.17
398 0.23
399 0.33
400 0.38
401 0.44
402 0.47
403 0.51
404 0.52
405 0.51
406 0.5
407 0.47
408 0.49
409 0.48
410 0.44
411 0.41
412 0.4
413 0.38
414 0.32
415 0.26
416 0.2
417 0.16
418 0.17
419 0.16
420 0.15
421 0.18
422 0.19
423 0.19
424 0.2
425 0.18
426 0.17
427 0.17
428 0.15
429 0.12
430 0.13
431 0.11
432 0.08
433 0.08
434 0.08
435 0.08
436 0.1
437 0.09
438 0.08
439 0.11
440 0.12
441 0.13
442 0.14
443 0.15
444 0.14
445 0.18
446 0.23
447 0.23
448 0.23
449 0.24
450 0.26
451 0.3
452 0.31
453 0.29
454 0.26
455 0.3
456 0.29
457 0.32
458 0.36
459 0.3
460 0.29
461 0.28
462 0.25
463 0.19
464 0.19
465 0.22
466 0.21
467 0.28
468 0.35
469 0.4
470 0.46
471 0.49
472 0.53
473 0.53
474 0.5
475 0.48
476 0.43
477 0.39
478 0.33
479 0.31
480 0.26
481 0.19
482 0.14
483 0.09
484 0.08
485 0.05
486 0.06
487 0.06
488 0.06
489 0.06
490 0.07
491 0.07
492 0.07
493 0.07
494 0.07
495 0.07
496 0.08
497 0.12
498 0.13
499 0.16
500 0.2
501 0.2
502 0.22
503 0.25
504 0.23
505 0.19
506 0.2
507 0.17
508 0.19
509 0.2
510 0.19
511 0.17
512 0.19
513 0.19
514 0.18
515 0.17
516 0.17
517 0.21
518 0.23
519 0.26
520 0.26
521 0.29
522 0.32
523 0.33
524 0.33
525 0.32
526 0.34
527 0.31
528 0.34
529 0.34
530 0.35
531 0.36
532 0.32
533 0.27
534 0.23
535 0.21
536 0.16
537 0.13
538 0.07
539 0.06
540 0.05
541 0.04
542 0.04
543 0.04
544 0.04
545 0.03
546 0.03
547 0.03
548 0.03
549 0.05
550 0.06
551 0.07
552 0.08
553 0.11
554 0.2
555 0.26
556 0.3
557 0.36
558 0.39
559 0.44
560 0.47
561 0.49
562 0.43
563 0.37
564 0.34
565 0.28
566 0.26
567 0.2
568 0.18
569 0.14
570 0.13
571 0.13
572 0.12
573 0.1
574 0.09
575 0.1
576 0.1
577 0.08
578 0.1
579 0.13
580 0.19
581 0.2
582 0.2
583 0.2
584 0.2
585 0.22
586 0.21
587 0.2
588 0.15
589 0.15
590 0.15
591 0.14
592 0.15
593 0.14
594 0.14
595 0.13
596 0.13
597 0.13
598 0.14
599 0.15
600 0.15
601 0.15
602 0.14
603 0.13
604 0.14
605 0.14
606 0.13
607 0.18
608 0.19
609 0.24
610 0.24
611 0.28
612 0.3
613 0.33
614 0.4
615 0.42
616 0.47
617 0.5
618 0.53
619 0.54
620 0.56
621 0.54
622 0.57
623 0.55
624 0.53
625 0.47
626 0.45
627 0.4
628 0.36
629 0.36
630 0.28
631 0.28
632 0.27
633 0.26
634 0.26
635 0.28
636 0.28
637 0.27
638 0.27
639 0.27
640 0.23
641 0.26
642 0.26
643 0.26
644 0.25
645 0.24
646 0.22
647 0.18
648 0.19
649 0.15
650 0.14
651 0.13
652 0.13
653 0.11
654 0.11
655 0.11
656 0.1
657 0.11
658 0.11
659 0.11
660 0.12
661 0.13
662 0.12
663 0.12
664 0.17
665 0.17
666 0.19
667 0.21
668 0.2
669 0.2
670 0.2
671 0.19
672 0.14
673 0.15
674 0.14
675 0.11
676 0.12
677 0.12
678 0.13
679 0.13
680 0.13
681 0.13
682 0.15
683 0.14
684 0.14
685 0.18
686 0.2
687 0.24
688 0.29
689 0.33
690 0.35
691 0.39
692 0.45
693 0.46
694 0.52
695 0.49
696 0.45