Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1GIJ4

Protein Details
Accession C1GIJ4    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
199-222VQKVGGKRVKKEDRKRPPTDEKYSBasic
322-346AKAIEVSKKTSKKRKSIGEEEPTKSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
199-215VQKVGGKRVKKEDRKRP
329-349KKTSKKRKSIGEEEPTKSKKS
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 11.666, cyto 9.5, cyto_mito 7.333, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR023674  Ribosomal_L1-like  
IPR028364  Ribosomal_L1/biogenesis  
IPR016095  Ribosomal_L1_3-a/b-sand  
Gene Ontology GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
KEGG pbn:PADG_07080  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00687  Ribosomal_L1  
CDD cd00403  Ribosomal_L1  
Amino Acid Sequences MAVTSGVLTLKPASGTPYQLNNDQVTRASTALLRHIKAQERKEAEKSTKKDLLATNNDDDGSDAGESAADGTPVWLVVTTKKHVVDKNRLKPGKIPVPHSLNTSPSLRICLITADPQRAVKDVIADPQFPTSLSSHITKIIGYTKLKTRYQSFESRRQLLSEHDVFLADDRIIMRLVQTLGKIFYKSSKRPIPIRIAEVQKVGGKRVKKEDRKRPPTDEKYSAVASAAVVAKEIEKTLASVPVHLASAATTSVRVGWANFVPEKLVENVEAVVQGLAEKFISKGWRNIKSLHLKGANTMAMPIWLASELWVDEGDVREDEDAKAIEVSKKTSKKRKSIGEEEPTKSKKSKTGEGGDDDDAELNASRKLKLRAQKMRALSDVEKDAGKKVTVVSAASKGASTPNKKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.22
3 0.25
4 0.32
5 0.34
6 0.38
7 0.41
8 0.4
9 0.39
10 0.36
11 0.33
12 0.28
13 0.26
14 0.23
15 0.2
16 0.19
17 0.19
18 0.27
19 0.31
20 0.3
21 0.33
22 0.39
23 0.47
24 0.53
25 0.56
26 0.57
27 0.57
28 0.62
29 0.64
30 0.66
31 0.66
32 0.68
33 0.67
34 0.66
35 0.65
36 0.6
37 0.59
38 0.56
39 0.57
40 0.55
41 0.57
42 0.51
43 0.46
44 0.46
45 0.39
46 0.34
47 0.25
48 0.18
49 0.12
50 0.09
51 0.07
52 0.07
53 0.06
54 0.08
55 0.07
56 0.06
57 0.06
58 0.06
59 0.06
60 0.06
61 0.06
62 0.05
63 0.06
64 0.11
65 0.16
66 0.18
67 0.23
68 0.26
69 0.31
70 0.36
71 0.44
72 0.5
73 0.56
74 0.64
75 0.7
76 0.7
77 0.66
78 0.67
79 0.67
80 0.66
81 0.6
82 0.56
83 0.53
84 0.57
85 0.57
86 0.57
87 0.49
88 0.42
89 0.4
90 0.36
91 0.31
92 0.24
93 0.26
94 0.21
95 0.2
96 0.18
97 0.17
98 0.16
99 0.21
100 0.24
101 0.23
102 0.24
103 0.26
104 0.26
105 0.25
106 0.25
107 0.18
108 0.19
109 0.17
110 0.22
111 0.22
112 0.22
113 0.22
114 0.22
115 0.21
116 0.17
117 0.18
118 0.12
119 0.12
120 0.13
121 0.15
122 0.14
123 0.16
124 0.16
125 0.14
126 0.15
127 0.18
128 0.21
129 0.2
130 0.23
131 0.28
132 0.35
133 0.37
134 0.39
135 0.39
136 0.4
137 0.44
138 0.51
139 0.51
140 0.54
141 0.58
142 0.59
143 0.54
144 0.49
145 0.45
146 0.37
147 0.38
148 0.29
149 0.24
150 0.2
151 0.19
152 0.18
153 0.18
154 0.16
155 0.09
156 0.07
157 0.06
158 0.07
159 0.07
160 0.07
161 0.06
162 0.07
163 0.08
164 0.09
165 0.09
166 0.09
167 0.1
168 0.11
169 0.12
170 0.1
171 0.16
172 0.22
173 0.25
174 0.32
175 0.37
176 0.4
177 0.45
178 0.5
179 0.52
180 0.48
181 0.49
182 0.47
183 0.44
184 0.41
185 0.37
186 0.32
187 0.26
188 0.24
189 0.22
190 0.2
191 0.19
192 0.21
193 0.31
194 0.39
195 0.47
196 0.56
197 0.65
198 0.73
199 0.8
200 0.83
201 0.82
202 0.82
203 0.81
204 0.78
205 0.72
206 0.63
207 0.56
208 0.51
209 0.42
210 0.31
211 0.23
212 0.15
213 0.12
214 0.11
215 0.07
216 0.07
217 0.07
218 0.07
219 0.07
220 0.08
221 0.06
222 0.05
223 0.06
224 0.07
225 0.12
226 0.11
227 0.12
228 0.12
229 0.12
230 0.13
231 0.11
232 0.11
233 0.05
234 0.06
235 0.06
236 0.05
237 0.04
238 0.05
239 0.05
240 0.06
241 0.06
242 0.05
243 0.08
244 0.09
245 0.12
246 0.12
247 0.12
248 0.12
249 0.12
250 0.14
251 0.12
252 0.12
253 0.1
254 0.1
255 0.1
256 0.09
257 0.09
258 0.07
259 0.06
260 0.05
261 0.05
262 0.04
263 0.04
264 0.04
265 0.04
266 0.05
267 0.07
268 0.13
269 0.14
270 0.22
271 0.3
272 0.37
273 0.39
274 0.42
275 0.49
276 0.53
277 0.54
278 0.54
279 0.51
280 0.43
281 0.43
282 0.44
283 0.36
284 0.26
285 0.24
286 0.17
287 0.12
288 0.12
289 0.1
290 0.06
291 0.06
292 0.05
293 0.05
294 0.06
295 0.06
296 0.07
297 0.07
298 0.06
299 0.07
300 0.08
301 0.09
302 0.08
303 0.09
304 0.09
305 0.1
306 0.1
307 0.11
308 0.1
309 0.1
310 0.11
311 0.12
312 0.16
313 0.16
314 0.21
315 0.28
316 0.36
317 0.45
318 0.54
319 0.62
320 0.67
321 0.75
322 0.8
323 0.81
324 0.82
325 0.83
326 0.84
327 0.83
328 0.77
329 0.78
330 0.7
331 0.65
332 0.59
333 0.53
334 0.49
335 0.48
336 0.52
337 0.52
338 0.58
339 0.6
340 0.61
341 0.62
342 0.56
343 0.5
344 0.41
345 0.33
346 0.24
347 0.18
348 0.14
349 0.11
350 0.13
351 0.14
352 0.15
353 0.2
354 0.26
355 0.33
356 0.41
357 0.51
358 0.58
359 0.63
360 0.69
361 0.7
362 0.7
363 0.66
364 0.64
365 0.56
366 0.51
367 0.47
368 0.41
369 0.37
370 0.32
371 0.33
372 0.29
373 0.27
374 0.23
375 0.2
376 0.23
377 0.23
378 0.24
379 0.24
380 0.25
381 0.26
382 0.25
383 0.23
384 0.19
385 0.25
386 0.32