FuNGI

A0A1C1CH88

Protein Details

Accession

A0A1C1CH88

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
30-54	SGDVSDQWKRKKQTPEEKRAAKMAK	Hydrophilic
110-171	AQQPKQKKRKVDVNTKTEPETPEDRRRRKAEERAAKRERKKEKKAKAKEKAERQRAKKREAQ	Basic
459-527	DSSLLKKALKRQQGQKKKSEKEWTERMEGVKKAQETKQKKRTENLARRKEEKRAGKGKKVKRPGFEGSF	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
40-41	KK
47-48	KR
133-169	DRRRRKAEERAAKRERKKEKKAKAKEKAERQRAKKRE
312-312	K
318-343	LDQRRRKEEARKAAKKEQRAREKEEE
464-538	KKALKRQQGQKKKSEKEWTERMEGVKKAQETKQKKRTENLARRKEEKRAGKGKKVKRPGFEGSFKGRTGGGRKKS

Subcellular Location(s)

nucl 21.5, cyto_nucl 13.5, cyto 2.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR029190 Rrp14/SURF6_C IPR029188 Rrp14_N IPR007019 SURF6
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus
Pfam	View protein in Pfam PF15459 RRP14 PF04935 SURF6

Amino Acid Sequences

MDDELTERLKGHARSFDSLLSLIPAKLYYSGDVSDQWKRKKQTPEEKRAAKMAKLDPDNWKSAKDIMDERAAAAALKRKREAGEDEDESAESPNRGDGDDLEPTKAVLDAQQPKQKKRKVDVNTKTEPETPEDRRRRKAEERAAKRERKKEKKAKAKEKAERQRAKKREAQGQFNPPSNDTSPAKRKKDAKELQLKTAVDLTTPEGRAEEAAHDDRPHRAESPSTASSEAEEEAEEVFSPQHESGVSSTSSIQPASIDETIKPDEQTNSFPPPTTSTNQVDTSKDPRQRLQEALSQFRAERKADGTDGRPPKNRQELLDQRRRKEEARKAAKKEQRAREKEEEARRQDEEIARRFSPGGSGSLLASPRSPIIGDNNSSNNFTFGRIAFSDGTSLDPSTSDVVDPHKKKGPRDVASQLQLAQAKKARLAGLDEEKRSEIEQKDMWLNAKRRAHGEHVRDDSSLLKKALKRQQGQKKKSEKEWTERMEGVKKAQETKQKKRTENLARRKEEKRAGKGKKVKRPGFEGSFKGRTGGGRKKS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.42
2	0.43
3	0.42
4	0.37
5	0.34
6	0.29
7	0.24
8	0.21
9	0.17
10	0.15
11	0.14
12	0.12
13	0.14
14	0.15
15	0.14
16	0.15
17	0.16
18	0.16
19	0.2
20	0.23
21	0.3
22	0.37
23	0.44
24	0.5
25	0.55
26	0.62
27	0.69
28	0.75
29	0.77
30	0.8
31	0.83
32	0.85
33	0.87
34	0.83
35	0.81
36	0.74
37	0.66
38	0.64
39	0.59
40	0.58
41	0.54
42	0.56
43	0.56
44	0.57
45	0.6
46	0.52
47	0.47
48	0.4
49	0.4
50	0.38
51	0.33
52	0.33
53	0.31
54	0.35
55	0.34
56	0.32
57	0.29
58	0.25
59	0.21
60	0.19
61	0.23
62	0.22
63	0.27
64	0.28
65	0.3
66	0.32
67	0.37
68	0.4
69	0.39
70	0.42
71	0.4
72	0.4
73	0.38
74	0.36
75	0.32
76	0.27
77	0.22
78	0.14
79	0.12
80	0.11
81	0.11
82	0.11
83	0.11
84	0.12
85	0.15
86	0.21
87	0.22
88	0.21
89	0.21
90	0.2
91	0.2
92	0.18
93	0.14
94	0.1
95	0.18
96	0.25
97	0.32
98	0.4
99	0.46
100	0.54
101	0.64
102	0.66
103	0.67
104	0.67
105	0.7
106	0.72
107	0.78
108	0.79
109	0.78
110	0.8
111	0.74
112	0.68
113	0.62
114	0.54
115	0.48
116	0.46
117	0.44
118	0.48
119	0.56
120	0.6
121	0.65
122	0.68
123	0.71
124	0.73
125	0.76
126	0.76
127	0.76
128	0.79
129	0.81
130	0.86
131	0.86
132	0.85
133	0.84
134	0.85
135	0.85
136	0.86
137	0.86
138	0.87
139	0.89
140	0.92
141	0.93
142	0.93
143	0.93
144	0.91
145	0.91
146	0.91
147	0.91
148	0.89
149	0.87
150	0.87
151	0.84
152	0.81
153	0.77
154	0.73
155	0.72
156	0.7
157	0.69
158	0.67
159	0.69
160	0.67
161	0.65
162	0.59
163	0.5
164	0.47
165	0.4
166	0.37
167	0.29
168	0.33
169	0.38
170	0.46
171	0.5
172	0.52
173	0.59
174	0.61
175	0.7
176	0.7
177	0.69
178	0.71
179	0.69
180	0.68
181	0.66
182	0.59
183	0.48
184	0.44
185	0.34
186	0.23
187	0.21
188	0.19
189	0.17
190	0.17
191	0.16
192	0.13
193	0.13
194	0.13
195	0.13
196	0.11
197	0.11
198	0.12
199	0.13
200	0.14
201	0.15
202	0.17
203	0.19
204	0.19
205	0.16
206	0.16
207	0.16
208	0.18
209	0.24
210	0.23
211	0.22
212	0.21
213	0.19
214	0.19
215	0.18
216	0.15
217	0.09
218	0.08
219	0.07
220	0.06
221	0.06
222	0.06
223	0.05
224	0.04
225	0.04
226	0.06
227	0.05
228	0.06
229	0.06
230	0.07
231	0.07
232	0.09
233	0.09
234	0.08
235	0.09
236	0.1
237	0.11
238	0.1
239	0.09
240	0.07
241	0.08
242	0.1
243	0.11
244	0.1
245	0.09
246	0.12
247	0.14
248	0.15
249	0.15
250	0.13
251	0.13
252	0.14
253	0.17
254	0.18
255	0.2
256	0.2
257	0.2
258	0.19
259	0.21
260	0.24
261	0.22
262	0.24
263	0.22
264	0.25
265	0.28
266	0.29
267	0.27
268	0.26
269	0.3
270	0.32
271	0.35
272	0.33
273	0.34
274	0.38
275	0.39
276	0.39
277	0.37
278	0.35
279	0.34
280	0.36
281	0.34
282	0.29
283	0.26
284	0.27
285	0.27
286	0.22
287	0.2
288	0.17
289	0.18
290	0.19
291	0.21
292	0.2
293	0.26
294	0.32
295	0.35
296	0.39
297	0.4
298	0.45
299	0.52
300	0.52
301	0.45
302	0.49
303	0.55
304	0.58
305	0.66
306	0.64
307	0.58
308	0.62
309	0.63
310	0.57
311	0.56
312	0.56
313	0.57
314	0.62
315	0.68
316	0.69
317	0.76
318	0.76
319	0.76
320	0.77
321	0.76
322	0.75
323	0.73
324	0.74
325	0.71
326	0.73
327	0.71
328	0.72
329	0.7
330	0.64
331	0.62
332	0.55
333	0.48
334	0.46
335	0.43
336	0.4
337	0.37
338	0.37
339	0.34
340	0.34
341	0.33
342	0.28
343	0.26
344	0.2
345	0.16
346	0.12
347	0.12
348	0.12
349	0.14
350	0.15
351	0.13
352	0.12
353	0.1
354	0.1
355	0.1
356	0.09
357	0.08
358	0.13
359	0.17
360	0.19
361	0.21
362	0.25
363	0.26
364	0.27
365	0.26
366	0.22
367	0.18
368	0.18
369	0.17
370	0.13
371	0.16
372	0.15
373	0.18
374	0.16
375	0.16
376	0.16
377	0.14
378	0.16
379	0.13
380	0.13
381	0.1
382	0.09
383	0.1
384	0.1
385	0.1
386	0.09
387	0.09
388	0.15
389	0.25
390	0.26
391	0.3
392	0.36
393	0.4
394	0.43
395	0.52
396	0.56
397	0.52
398	0.57
399	0.59
400	0.59
401	0.59
402	0.57
403	0.48
404	0.42
405	0.41
406	0.34
407	0.32
408	0.29
409	0.27
410	0.27
411	0.29
412	0.26
413	0.23
414	0.26
415	0.28
416	0.33
417	0.38
418	0.38
419	0.37
420	0.36
421	0.36
422	0.34
423	0.34
424	0.26
425	0.25
426	0.25
427	0.27
428	0.3
429	0.31
430	0.34
431	0.36
432	0.39
433	0.42
434	0.46
435	0.45
436	0.46
437	0.49
438	0.53
439	0.54
440	0.56
441	0.56
442	0.56
443	0.55
444	0.51
445	0.47
446	0.44
447	0.39
448	0.37
449	0.29
450	0.3
451	0.32
452	0.41
453	0.49
454	0.53
455	0.58
456	0.63
457	0.73
458	0.78
459	0.83
460	0.84
461	0.85
462	0.84
463	0.85
464	0.86
465	0.83
466	0.81
467	0.83
468	0.78
469	0.73
470	0.69
471	0.64
472	0.6
473	0.54
474	0.5
475	0.46
476	0.44
477	0.44
478	0.47
479	0.52
480	0.56
481	0.64
482	0.69
483	0.72
484	0.75
485	0.77
486	0.81
487	0.82
488	0.83
489	0.83
490	0.84
491	0.83
492	0.84
493	0.82
494	0.81
495	0.79
496	0.78
497	0.78
498	0.78
499	0.79
500	0.83
501	0.87
502	0.88
503	0.89
504	0.9
505	0.87
506	0.83
507	0.81
508	0.8
509	0.79
510	0.76
511	0.72
512	0.7
513	0.67
514	0.6
515	0.54
516	0.46
517	0.43
518	0.45

A0A1C1CH88

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer