Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1GCX6

Protein Details
Accession C1GCX6    Localization Confidence High Confidence Score 22.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
26-47QTKPSAQKPIEKTKPKKQLTIEHydrophilic
222-242LTKPVRKQPKHLKMRYKPFGAHydrophilic
287-311VEPDNEQRERRKKHKRIHSHSAAGGBasic
341-376GEQLREKGNKKHRNETSQERRARKEERKRRKQALTSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
278-282KKRRK
294-303RERRKKHKRI
344-372LREKGNKKHRNETSQERRARKEERKRRKQ
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013240  DNA-dir_RNA_pol1_su_RPA34  
Gene Ontology GO:0006360  P:transcription by RNA polymerase I  
KEGG pbn:PADG_05112  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08208  RNA_polI_A34  
Amino Acid Sequences MAPPLSKEIITDSDSSSEESSESELQTKPSAQKPIEKTKPKKQLTIEAKEKANPESSSPSSESEPGEESESSDGEEPSALEMVSTLAIAVPAQEFKAPDGFKVIPTMAPRSSDVSKAFSDLREKQLWHITAPASVPMNSIQEFAFDAVAQGQSIFNHKGINYKLHEGQMGADKNKALLLPDKEGNTYHRSHVNIAQTFHLERIVDLANGVTYSEQSVQISELTKPVRKQPKHLKMRYKPFGASVEDEPETSGFGSEESEGEGASFRMPPTLSLDGEGKKRRKSSMEVEPDNEQRERRKKHKRIHSHSAAGGPEDISLTEDVAPSPRSKNAVDAGIARGRTGEQLREKGNKKHRNETSQERRARKEERKRRKQALTS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.25
3 0.22
4 0.18
5 0.15
6 0.14
7 0.16
8 0.16
9 0.16
10 0.18
11 0.18
12 0.2
13 0.23
14 0.26
15 0.29
16 0.33
17 0.4
18 0.39
19 0.47
20 0.53
21 0.62
22 0.67
23 0.72
24 0.74
25 0.77
26 0.85
27 0.81
28 0.81
29 0.76
30 0.76
31 0.75
32 0.77
33 0.75
34 0.71
35 0.68
36 0.64
37 0.6
38 0.53
39 0.49
40 0.39
41 0.35
42 0.36
43 0.35
44 0.36
45 0.36
46 0.35
47 0.31
48 0.33
49 0.3
50 0.25
51 0.25
52 0.21
53 0.22
54 0.19
55 0.18
56 0.17
57 0.16
58 0.15
59 0.14
60 0.13
61 0.1
62 0.1
63 0.09
64 0.08
65 0.09
66 0.07
67 0.06
68 0.06
69 0.06
70 0.06
71 0.05
72 0.04
73 0.04
74 0.04
75 0.04
76 0.04
77 0.05
78 0.05
79 0.06
80 0.07
81 0.08
82 0.09
83 0.16
84 0.15
85 0.15
86 0.2
87 0.2
88 0.19
89 0.21
90 0.21
91 0.17
92 0.19
93 0.23
94 0.19
95 0.2
96 0.21
97 0.23
98 0.24
99 0.25
100 0.25
101 0.24
102 0.23
103 0.24
104 0.24
105 0.21
106 0.26
107 0.26
108 0.3
109 0.3
110 0.31
111 0.31
112 0.37
113 0.36
114 0.3
115 0.29
116 0.24
117 0.22
118 0.22
119 0.2
120 0.15
121 0.14
122 0.14
123 0.12
124 0.14
125 0.12
126 0.13
127 0.11
128 0.1
129 0.1
130 0.1
131 0.09
132 0.06
133 0.06
134 0.06
135 0.06
136 0.05
137 0.05
138 0.05
139 0.05
140 0.09
141 0.1
142 0.1
143 0.11
144 0.11
145 0.16
146 0.17
147 0.23
148 0.22
149 0.24
150 0.26
151 0.25
152 0.26
153 0.21
154 0.2
155 0.21
156 0.22
157 0.19
158 0.17
159 0.16
160 0.16
161 0.17
162 0.15
163 0.1
164 0.12
165 0.14
166 0.16
167 0.18
168 0.19
169 0.19
170 0.19
171 0.21
172 0.2
173 0.19
174 0.18
175 0.2
176 0.2
177 0.22
178 0.25
179 0.29
180 0.28
181 0.27
182 0.26
183 0.24
184 0.23
185 0.22
186 0.18
187 0.11
188 0.08
189 0.1
190 0.1
191 0.08
192 0.08
193 0.07
194 0.06
195 0.06
196 0.06
197 0.04
198 0.03
199 0.05
200 0.06
201 0.06
202 0.06
203 0.07
204 0.07
205 0.09
206 0.1
207 0.09
208 0.12
209 0.14
210 0.17
211 0.18
212 0.26
213 0.35
214 0.36
215 0.45
216 0.53
217 0.61
218 0.69
219 0.76
220 0.79
221 0.78
222 0.87
223 0.84
224 0.77
225 0.67
226 0.59
227 0.55
228 0.47
229 0.41
230 0.31
231 0.28
232 0.25
233 0.24
234 0.21
235 0.17
236 0.14
237 0.11
238 0.09
239 0.05
240 0.05
241 0.06
242 0.06
243 0.06
244 0.06
245 0.06
246 0.06
247 0.06
248 0.06
249 0.06
250 0.06
251 0.07
252 0.06
253 0.08
254 0.08
255 0.09
256 0.15
257 0.17
258 0.17
259 0.18
260 0.21
261 0.23
262 0.3
263 0.38
264 0.38
265 0.41
266 0.44
267 0.47
268 0.48
269 0.52
270 0.52
271 0.55
272 0.59
273 0.57
274 0.57
275 0.57
276 0.56
277 0.53
278 0.48
279 0.4
280 0.39
281 0.46
282 0.51
283 0.57
284 0.65
285 0.71
286 0.79
287 0.86
288 0.88
289 0.88
290 0.9
291 0.89
292 0.84
293 0.77
294 0.72
295 0.61
296 0.51
297 0.42
298 0.31
299 0.22
300 0.16
301 0.13
302 0.1
303 0.09
304 0.08
305 0.08
306 0.09
307 0.09
308 0.11
309 0.13
310 0.14
311 0.16
312 0.19
313 0.22
314 0.22
315 0.26
316 0.28
317 0.29
318 0.29
319 0.28
320 0.3
321 0.31
322 0.3
323 0.25
324 0.22
325 0.2
326 0.23
327 0.24
328 0.27
329 0.3
330 0.36
331 0.43
332 0.52
333 0.57
334 0.62
335 0.7
336 0.72
337 0.71
338 0.76
339 0.79
340 0.8
341 0.82
342 0.83
343 0.83
344 0.83
345 0.86
346 0.82
347 0.8
348 0.78
349 0.81
350 0.8
351 0.8
352 0.82
353 0.84
354 0.88
355 0.91
356 0.93