Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1GMA3

Protein Details
Accession C1GMA3    Localization Confidence High Confidence Score 20.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
707-733DDPPSAKAEKRKYTKRKKPDSTSNDMAHydrophilic
749-772EDVPKQTPIKKRKPSKSPSPDYPPHydrophilic
860-881GASVDKEKKRRPSPPPPSHTTSHydrophilic
1039-1059QQSQQQQQRQQQQQQTPQRMPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
648-724PARRRGPGRPPKDGIMSKRERAEIAREQKLAAKREANGGVTPPPLGRGKTGKTGKESGQDDPPSAKAEKRKYTKRKK
758-762KKRKP
867-870KKRR
Subcellular Location(s) mito_nucl 12, nucl 11.5, mito 11.5, plas 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000253  FHA_dom  
IPR045178  Fhl1/FHA1  
IPR001766  Fork_head_dom  
IPR008984  SMAD_FHA_dom_sf  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
IPR036390  WH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003700  F:DNA-binding transcription factor activity  
GO:0043565  F:sequence-specific DNA binding  
GO:0045892  P:negative regulation of DNA-templated transcription  
GO:0045893  P:positive regulation of DNA-templated transcription  
GO:0060962  P:regulation of ribosomal protein gene transcription by RNA polymerase II  
KEGG pbn:PADG_08189  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00498  FHA  
PF00250  Forkhead  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50006  FHA_DOMAIN  
PS50039  FORK_HEAD_3  
Amino Acid Sequences MRPGGLYRSKPKYARSSSVCLRLTAAAQGETLQGLTAFLQLHRFELEQVGLVPGNCMQMSSSQTLTTSLMGHPPHDAAPDRSAYNLSDCSRDLPADVPNKVAALSALSDDYKKQTDREKQSAASALLAQLFANKPTANDTTQDALPTKLAADDPRKDKDVLPEQPSNVSEPPAQLENNVNGTGAGAVDVNDPAMEPGWGVNNNGVNEGMKKEQDILADVLQGVPEANISKDLDMRLDTLRNNNDKMESELEKLCSGLLPLGTPKNTKEALRQNELLTDAYFNGDVHFGPTPRIVNYPEPPPHTDGENSQAATESIAGSEPRIQAFAKLEFDDGHFYVNTYSFILGRDVRAARAALQRELQVRQARAQSSSGGNKSYNTPNRVKHEGSAIMGSVVSDRGGIMGFDPDVPQQFPPQVSWKSSNSSHGDQRRPTLHMAAAEVPSASLETPEITKDYNALAMQSLRSRNDPKPVDTLSLLPSPDACPTIPIHPPAPSNGSVATHRGISRKHVKIAYNFDRNLFEMEVIGRNGAFMGADWLAPGQVRPLHSGDFIQIGGVRVRFVLPDVPVGETGADQDEPEIIDGDEEEVAGNQGEQDARAGSDAEVVDNMDRDGSEFSGAEDRPTPMKANKEPAPKSKVTAEVSPESSAQPARRRGPGRPPKDGIMSKRERAEIAREQKLAAKREANGGVTPPPLGRGKTGKTGKESGQDDPPSAKAEKRKYTKRKKPDSTSNDMAIPSIEGGDANATIGAEDVPKQTPIKKRKPSKSPSPDYPPESFYTSEDLAKPPYNYAVLIFDALSESQTPMTLKQIYRALKLKYPYFRFRCETEGWTSSVRHNLNGNAHLFEHAERDGKGWSWKLTPGASVDKEKKRRPSPPPPSHTTSQSTHNLTNSQSYLAPTSGTQFNTPRPNVPDRHNSHPFALPTIGNGQSPLGGGPALSHNSPYSIPNPAALSLPPALRKNLLPTFANSTTSTYRSPYASAPPPEILQAQQQQKQQRPPPSIPPLQQQQQNLPQQQSSAPVPPQLQQSQKDPTQQPQPQLQQSQQQQQRQQQQQQTPQRMPPPEQYKFLNHTPHPIQSTRPPSSNSVPSKPPSAPPTNQPQPQYQPQTLPPSQPPNTHPNTHTHTQPPSALPPQNPTTHSPPAPPPAPEPEPEPEPEPSFLDRANQAIDNFEAVLMEDYEDKEYISKVLRSARNRVLNGATESSFPGGEPKDESVIIDALKGIIAGLNEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.72
2 0.7
3 0.71
4 0.7
5 0.75
6 0.69
7 0.59
8 0.53
9 0.45
10 0.39
11 0.35
12 0.3
13 0.2
14 0.19
15 0.19
16 0.17
17 0.15
18 0.14
19 0.1
20 0.07
21 0.07
22 0.07
23 0.09
24 0.1
25 0.1
26 0.16
27 0.16
28 0.18
29 0.19
30 0.19
31 0.18
32 0.19
33 0.19
34 0.15
35 0.16
36 0.16
37 0.15
38 0.15
39 0.14
40 0.13
41 0.15
42 0.13
43 0.13
44 0.11
45 0.14
46 0.18
47 0.21
48 0.2
49 0.18
50 0.19
51 0.21
52 0.21
53 0.19
54 0.16
55 0.14
56 0.19
57 0.19
58 0.2
59 0.2
60 0.2
61 0.2
62 0.22
63 0.25
64 0.23
65 0.26
66 0.29
67 0.27
68 0.27
69 0.28
70 0.25
71 0.25
72 0.27
73 0.25
74 0.25
75 0.25
76 0.27
77 0.27
78 0.26
79 0.23
80 0.2
81 0.25
82 0.29
83 0.29
84 0.28
85 0.27
86 0.26
87 0.25
88 0.23
89 0.16
90 0.1
91 0.11
92 0.1
93 0.11
94 0.12
95 0.13
96 0.14
97 0.18
98 0.22
99 0.22
100 0.25
101 0.33
102 0.43
103 0.52
104 0.58
105 0.6
106 0.56
107 0.59
108 0.6
109 0.51
110 0.43
111 0.34
112 0.27
113 0.22
114 0.21
115 0.16
116 0.15
117 0.15
118 0.14
119 0.16
120 0.15
121 0.15
122 0.2
123 0.23
124 0.2
125 0.21
126 0.24
127 0.25
128 0.26
129 0.28
130 0.24
131 0.21
132 0.2
133 0.19
134 0.16
135 0.13
136 0.14
137 0.18
138 0.25
139 0.31
140 0.37
141 0.41
142 0.44
143 0.44
144 0.45
145 0.48
146 0.51
147 0.51
148 0.52
149 0.53
150 0.51
151 0.53
152 0.51
153 0.46
154 0.37
155 0.32
156 0.26
157 0.22
158 0.24
159 0.23
160 0.22
161 0.2
162 0.23
163 0.23
164 0.25
165 0.24
166 0.21
167 0.17
168 0.17
169 0.15
170 0.11
171 0.08
172 0.05
173 0.05
174 0.06
175 0.06
176 0.06
177 0.06
178 0.06
179 0.06
180 0.06
181 0.05
182 0.05
183 0.06
184 0.1
185 0.11
186 0.11
187 0.14
188 0.18
189 0.19
190 0.19
191 0.19
192 0.16
193 0.17
194 0.19
195 0.19
196 0.15
197 0.16
198 0.17
199 0.18
200 0.18
201 0.2
202 0.19
203 0.17
204 0.17
205 0.16
206 0.14
207 0.12
208 0.11
209 0.08
210 0.06
211 0.06
212 0.06
213 0.06
214 0.09
215 0.1
216 0.11
217 0.13
218 0.14
219 0.14
220 0.14
221 0.16
222 0.16
223 0.19
224 0.2
225 0.25
226 0.32
227 0.35
228 0.36
229 0.36
230 0.35
231 0.34
232 0.36
233 0.33
234 0.28
235 0.27
236 0.28
237 0.28
238 0.26
239 0.24
240 0.2
241 0.15
242 0.13
243 0.11
244 0.09
245 0.08
246 0.12
247 0.16
248 0.18
249 0.19
250 0.2
251 0.24
252 0.27
253 0.27
254 0.32
255 0.38
256 0.43
257 0.48
258 0.49
259 0.44
260 0.44
261 0.44
262 0.36
263 0.26
264 0.21
265 0.14
266 0.13
267 0.12
268 0.1
269 0.09
270 0.09
271 0.08
272 0.09
273 0.11
274 0.11
275 0.12
276 0.15
277 0.15
278 0.16
279 0.19
280 0.2
281 0.24
282 0.27
283 0.34
284 0.37
285 0.39
286 0.41
287 0.41
288 0.39
289 0.36
290 0.34
291 0.27
292 0.27
293 0.27
294 0.24
295 0.2
296 0.2
297 0.17
298 0.16
299 0.14
300 0.09
301 0.06
302 0.07
303 0.07
304 0.07
305 0.11
306 0.12
307 0.12
308 0.13
309 0.13
310 0.15
311 0.18
312 0.2
313 0.19
314 0.18
315 0.19
316 0.18
317 0.19
318 0.2
319 0.17
320 0.16
321 0.13
322 0.13
323 0.13
324 0.13
325 0.13
326 0.1
327 0.1
328 0.09
329 0.1
330 0.12
331 0.12
332 0.12
333 0.17
334 0.16
335 0.17
336 0.18
337 0.17
338 0.19
339 0.24
340 0.25
341 0.22
342 0.23
343 0.26
344 0.27
345 0.28
346 0.31
347 0.3
348 0.29
349 0.31
350 0.35
351 0.33
352 0.31
353 0.31
354 0.27
355 0.27
356 0.31
357 0.29
358 0.27
359 0.26
360 0.25
361 0.28
362 0.35
363 0.37
364 0.37
365 0.41
366 0.45
367 0.51
368 0.56
369 0.53
370 0.45
371 0.43
372 0.39
373 0.34
374 0.28
375 0.22
376 0.16
377 0.15
378 0.13
379 0.08
380 0.07
381 0.05
382 0.04
383 0.04
384 0.04
385 0.04
386 0.04
387 0.04
388 0.05
389 0.05
390 0.06
391 0.06
392 0.07
393 0.08
394 0.09
395 0.1
396 0.1
397 0.12
398 0.13
399 0.14
400 0.2
401 0.22
402 0.25
403 0.29
404 0.29
405 0.32
406 0.32
407 0.37
408 0.36
409 0.37
410 0.41
411 0.44
412 0.48
413 0.46
414 0.5
415 0.46
416 0.43
417 0.41
418 0.36
419 0.3
420 0.24
421 0.24
422 0.21
423 0.19
424 0.16
425 0.14
426 0.11
427 0.09
428 0.09
429 0.07
430 0.04
431 0.04
432 0.04
433 0.05
434 0.06
435 0.07
436 0.07
437 0.07
438 0.08
439 0.08
440 0.1
441 0.09
442 0.09
443 0.09
444 0.09
445 0.1
446 0.13
447 0.16
448 0.15
449 0.19
450 0.24
451 0.26
452 0.35
453 0.36
454 0.35
455 0.38
456 0.38
457 0.36
458 0.31
459 0.3
460 0.24
461 0.24
462 0.21
463 0.16
464 0.15
465 0.14
466 0.14
467 0.13
468 0.1
469 0.09
470 0.11
471 0.14
472 0.16
473 0.17
474 0.17
475 0.18
476 0.19
477 0.2
478 0.22
479 0.19
480 0.18
481 0.16
482 0.17
483 0.15
484 0.17
485 0.15
486 0.14
487 0.14
488 0.16
489 0.16
490 0.22
491 0.31
492 0.32
493 0.36
494 0.39
495 0.41
496 0.44
497 0.53
498 0.54
499 0.51
500 0.48
501 0.45
502 0.42
503 0.39
504 0.35
505 0.26
506 0.17
507 0.11
508 0.11
509 0.11
510 0.1
511 0.09
512 0.07
513 0.06
514 0.06
515 0.06
516 0.04
517 0.03
518 0.05
519 0.05
520 0.05
521 0.05
522 0.05
523 0.05
524 0.05
525 0.05
526 0.05
527 0.07
528 0.08
529 0.11
530 0.12
531 0.13
532 0.13
533 0.14
534 0.13
535 0.12
536 0.11
537 0.08
538 0.08
539 0.08
540 0.09
541 0.08
542 0.08
543 0.07
544 0.07
545 0.07
546 0.07
547 0.08
548 0.07
549 0.09
550 0.1
551 0.1
552 0.1
553 0.1
554 0.1
555 0.07
556 0.07
557 0.06
558 0.06
559 0.05
560 0.05
561 0.05
562 0.05
563 0.05
564 0.05
565 0.04
566 0.04
567 0.04
568 0.04
569 0.04
570 0.04
571 0.04
572 0.03
573 0.03
574 0.03
575 0.03
576 0.03
577 0.03
578 0.03
579 0.03
580 0.04
581 0.04
582 0.04
583 0.04
584 0.05
585 0.04
586 0.07
587 0.07
588 0.06
589 0.06
590 0.07
591 0.06
592 0.06
593 0.06
594 0.04
595 0.03
596 0.04
597 0.05
598 0.05
599 0.05
600 0.05
601 0.06
602 0.1
603 0.1
604 0.1
605 0.1
606 0.11
607 0.11
608 0.13
609 0.14
610 0.13
611 0.19
612 0.21
613 0.27
614 0.31
615 0.39
616 0.42
617 0.46
618 0.5
619 0.45
620 0.44
621 0.4
622 0.4
623 0.34
624 0.32
625 0.3
626 0.26
627 0.27
628 0.26
629 0.24
630 0.18
631 0.17
632 0.16
633 0.16
634 0.2
635 0.24
636 0.26
637 0.33
638 0.35
639 0.38
640 0.48
641 0.54
642 0.54
643 0.55
644 0.54
645 0.49
646 0.54
647 0.54
648 0.47
649 0.46
650 0.44
651 0.4
652 0.41
653 0.39
654 0.33
655 0.31
656 0.33
657 0.32
658 0.35
659 0.36
660 0.34
661 0.34
662 0.38
663 0.41
664 0.38
665 0.33
666 0.28
667 0.24
668 0.29
669 0.3
670 0.26
671 0.21
672 0.2
673 0.18
674 0.16
675 0.15
676 0.11
677 0.12
678 0.12
679 0.12
680 0.14
681 0.16
682 0.18
683 0.27
684 0.32
685 0.32
686 0.35
687 0.38
688 0.38
689 0.41
690 0.4
691 0.34
692 0.36
693 0.33
694 0.3
695 0.28
696 0.27
697 0.22
698 0.21
699 0.22
700 0.22
701 0.3
702 0.37
703 0.45
704 0.54
705 0.63
706 0.73
707 0.8
708 0.84
709 0.87
710 0.88
711 0.89
712 0.89
713 0.86
714 0.83
715 0.77
716 0.68
717 0.59
718 0.49
719 0.4
720 0.29
721 0.21
722 0.12
723 0.08
724 0.06
725 0.04
726 0.04
727 0.04
728 0.04
729 0.04
730 0.04
731 0.03
732 0.03
733 0.04
734 0.04
735 0.04
736 0.05
737 0.06
738 0.07
739 0.09
740 0.1
741 0.16
742 0.25
743 0.34
744 0.44
745 0.52
746 0.62
747 0.7
748 0.8
749 0.82
750 0.85
751 0.85
752 0.83
753 0.81
754 0.8
755 0.76
756 0.71
757 0.65
758 0.56
759 0.47
760 0.42
761 0.35
762 0.27
763 0.25
764 0.21
765 0.2
766 0.19
767 0.18
768 0.18
769 0.19
770 0.19
771 0.15
772 0.16
773 0.15
774 0.14
775 0.13
776 0.12
777 0.1
778 0.1
779 0.09
780 0.08
781 0.08
782 0.08
783 0.07
784 0.06
785 0.06
786 0.06
787 0.07
788 0.07
789 0.07
790 0.11
791 0.15
792 0.15
793 0.19
794 0.26
795 0.27
796 0.31
797 0.36
798 0.35
799 0.35
800 0.39
801 0.41
802 0.43
803 0.47
804 0.52
805 0.51
806 0.55
807 0.54
808 0.52
809 0.51
810 0.46
811 0.43
812 0.38
813 0.36
814 0.32
815 0.31
816 0.3
817 0.27
818 0.31
819 0.28
820 0.24
821 0.24
822 0.26
823 0.28
824 0.31
825 0.3
826 0.24
827 0.23
828 0.22
829 0.21
830 0.17
831 0.16
832 0.13
833 0.13
834 0.12
835 0.13
836 0.13
837 0.14
838 0.17
839 0.17
840 0.18
841 0.18
842 0.2
843 0.21
844 0.21
845 0.21
846 0.21
847 0.24
848 0.25
849 0.3
850 0.36
851 0.43
852 0.51
853 0.56
854 0.62
855 0.65
856 0.72
857 0.74
858 0.77
859 0.8
860 0.82
861 0.83
862 0.81
863 0.79
864 0.73
865 0.68
866 0.62
867 0.52
868 0.48
869 0.47
870 0.44
871 0.4
872 0.38
873 0.35
874 0.31
875 0.33
876 0.27
877 0.22
878 0.19
879 0.18
880 0.17
881 0.16
882 0.15
883 0.11
884 0.14
885 0.16
886 0.17
887 0.19
888 0.19
889 0.25
890 0.33
891 0.34
892 0.35
893 0.37
894 0.43
895 0.44
896 0.48
897 0.52
898 0.5
899 0.57
900 0.59
901 0.56
902 0.52
903 0.53
904 0.47
905 0.39
906 0.36
907 0.27
908 0.22
909 0.24
910 0.22
911 0.17
912 0.17
913 0.14
914 0.12
915 0.12
916 0.11
917 0.07
918 0.05
919 0.05
920 0.06
921 0.09
922 0.1
923 0.1
924 0.11
925 0.11
926 0.13
927 0.14
928 0.16
929 0.14
930 0.17
931 0.17
932 0.18
933 0.19
934 0.18
935 0.18
936 0.16
937 0.17
938 0.15
939 0.17
940 0.2
941 0.2
942 0.21
943 0.22
944 0.23
945 0.28
946 0.3
947 0.31
948 0.28
949 0.29
950 0.36
951 0.35
952 0.37
953 0.3
954 0.3
955 0.29
956 0.31
957 0.29
958 0.23
959 0.24
960 0.22
961 0.23
962 0.22
963 0.27
964 0.31
965 0.33
966 0.34
967 0.33
968 0.32
969 0.32
970 0.3
971 0.24
972 0.24
973 0.29
974 0.32
975 0.36
976 0.41
977 0.48
978 0.54
979 0.62
980 0.63
981 0.64
982 0.65
983 0.65
984 0.69
985 0.7
986 0.7
987 0.64
988 0.64
989 0.63
990 0.62
991 0.62
992 0.55
993 0.54
994 0.56
995 0.61
996 0.58
997 0.52
998 0.46
999 0.43
1000 0.4
1001 0.37
1002 0.31
1003 0.28
1004 0.24
1005 0.26
1006 0.27
1007 0.29
1008 0.34
1009 0.36
1010 0.39
1011 0.37
1012 0.42
1013 0.45
1014 0.47
1015 0.53
1016 0.49
1017 0.5
1018 0.54
1019 0.55
1020 0.55
1021 0.57
1022 0.61
1023 0.59
1024 0.61
1025 0.58
1026 0.56
1027 0.59
1028 0.63
1029 0.62
1030 0.62
1031 0.63
1032 0.66
1033 0.73
1034 0.74
1035 0.76
1036 0.75
1037 0.76
1038 0.79
1039 0.81
1040 0.81
1041 0.76
1042 0.73
1043 0.72
1044 0.68
1045 0.64
1046 0.63
1047 0.63
1048 0.58
1049 0.57
1050 0.55
1051 0.54
1052 0.55
1053 0.57
1054 0.56
1055 0.47
1056 0.51
1057 0.51
1058 0.53
1059 0.51
1060 0.47
1061 0.45
1062 0.45
1063 0.53
1064 0.5
1065 0.5
1066 0.47
1067 0.48
1068 0.53
1069 0.58
1070 0.56
1071 0.52
1072 0.54
1073 0.52
1074 0.54
1075 0.51
1076 0.5
1077 0.49
1078 0.5
1079 0.47
1080 0.48
1081 0.56
1082 0.59
1083 0.62
1084 0.6
1085 0.59
1086 0.59
1087 0.65
1088 0.66
1089 0.59
1090 0.56
1091 0.56
1092 0.62
1093 0.58
1094 0.56
1095 0.53
1096 0.54
1097 0.55
1098 0.56
1099 0.54
1100 0.54
1101 0.58
1102 0.58
1103 0.53
1104 0.51
1105 0.55
1106 0.53
1107 0.54
1108 0.51
1109 0.5
1110 0.48
1111 0.5
1112 0.45
1113 0.45
1114 0.49
1115 0.48
1116 0.44
1117 0.46
1118 0.48
1119 0.49
1120 0.48
1121 0.47
1122 0.47
1123 0.49
1124 0.49
1125 0.47
1126 0.48
1127 0.51
1128 0.52
1129 0.48
1130 0.45
1131 0.46
1132 0.47
1133 0.43
1134 0.42
1135 0.39
1136 0.38
1137 0.39
1138 0.38
1139 0.34
1140 0.34
1141 0.34
1142 0.33
1143 0.3
1144 0.29
1145 0.27
1146 0.28
1147 0.25
1148 0.24
1149 0.25
1150 0.25
1151 0.22
1152 0.23
1153 0.23
1154 0.19
1155 0.18
1156 0.16
1157 0.12
1158 0.1
1159 0.12
1160 0.09
1161 0.09
1162 0.1
1163 0.11
1164 0.13
1165 0.13
1166 0.13
1167 0.12
1168 0.13
1169 0.15
1170 0.19
1171 0.19
1172 0.22
1173 0.31
1174 0.39
1175 0.44
1176 0.52
1177 0.58
1178 0.63
1179 0.62
1180 0.62
1181 0.57
1182 0.54
1183 0.53
1184 0.49
1185 0.4
1186 0.32
1187 0.32
1188 0.29
1189 0.24
1190 0.19
1191 0.2
1192 0.18
1193 0.19
1194 0.21
1195 0.22
1196 0.23
1197 0.24
1198 0.24
1199 0.21
1200 0.22
1201 0.2
1202 0.17
1203 0.14
1204 0.11
1205 0.11
1206 0.1
1207 0.07
1208 0.07