Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1GC90

Protein Details
Accession C1GC90    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-41MAKEKSEIERKKKDKKRSESDGVHKKSKKDKKKDTSLLAEABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
8-33IERKKKDKKRSESDGVHKKSKKDKKK
92-119KKVLKSVKKAAVNKSLKRGVKEVVKALR
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 12.833, mito_nucl 11.833, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002415  H/ACA_rnp_Nhp2-like  
IPR029064  L30e-like  
IPR004038  Ribosomal_L7Ae/L30e/S12e/Gad45  
IPR004037  Ribosomal_L7Ae_CS  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0042254  P:ribosome biogenesis  
KEGG pbn:PADG_04612  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01248  Ribosomal_L7Ae  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS01082  RIBOSOMAL_L7AE  
Amino Acid Sequences MAKEKSEIERKKKDKKRSESDGVHKKSKKDKKKDTSLLAEAAEKDLTKKVLDQLEQPAVVAAEITSKKSAADRPIGALVPFANPLAEDKVAKKVLKSVKKAAVNKSLKRGVKEVVKALRKSPVPPPNAVIDSPSAVVVLAADISPMDVISHIPVLCEDHGIPYVYVTSRAELGSAGATKRPTSVVMVLPRSSGKNKKDNDKHADDKEDKEYYAELVKVVQKEAKRVKI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.87
2 0.89
3 0.89
4 0.88
5 0.89
6 0.87
7 0.89
8 0.88
9 0.84
10 0.83
11 0.78
12 0.75
13 0.76
14 0.77
15 0.77
16 0.77
17 0.82
18 0.82
19 0.89
20 0.91
21 0.89
22 0.86
23 0.79
24 0.71
25 0.6
26 0.52
27 0.41
28 0.34
29 0.26
30 0.18
31 0.15
32 0.15
33 0.15
34 0.13
35 0.15
36 0.19
37 0.23
38 0.24
39 0.26
40 0.3
41 0.32
42 0.31
43 0.29
44 0.24
45 0.19
46 0.17
47 0.13
48 0.07
49 0.09
50 0.1
51 0.12
52 0.12
53 0.12
54 0.12
55 0.15
56 0.19
57 0.19
58 0.23
59 0.23
60 0.24
61 0.26
62 0.26
63 0.24
64 0.2
65 0.16
66 0.11
67 0.11
68 0.09
69 0.06
70 0.06
71 0.07
72 0.09
73 0.09
74 0.09
75 0.1
76 0.16
77 0.2
78 0.2
79 0.19
80 0.24
81 0.32
82 0.38
83 0.42
84 0.43
85 0.46
86 0.54
87 0.58
88 0.57
89 0.59
90 0.58
91 0.56
92 0.56
93 0.56
94 0.51
95 0.48
96 0.44
97 0.38
98 0.36
99 0.36
100 0.34
101 0.34
102 0.38
103 0.37
104 0.36
105 0.37
106 0.33
107 0.33
108 0.37
109 0.37
110 0.34
111 0.34
112 0.35
113 0.33
114 0.33
115 0.31
116 0.23
117 0.16
118 0.15
119 0.14
120 0.12
121 0.08
122 0.06
123 0.06
124 0.05
125 0.04
126 0.03
127 0.03
128 0.03
129 0.02
130 0.03
131 0.03
132 0.03
133 0.03
134 0.03
135 0.03
136 0.04
137 0.06
138 0.06
139 0.06
140 0.07
141 0.09
142 0.09
143 0.1
144 0.09
145 0.09
146 0.1
147 0.11
148 0.11
149 0.09
150 0.11
151 0.1
152 0.12
153 0.11
154 0.1
155 0.1
156 0.1
157 0.1
158 0.09
159 0.09
160 0.09
161 0.1
162 0.1
163 0.12
164 0.13
165 0.13
166 0.14
167 0.15
168 0.14
169 0.15
170 0.18
171 0.21
172 0.27
173 0.31
174 0.3
175 0.3
176 0.31
177 0.32
178 0.36
179 0.38
180 0.39
181 0.44
182 0.5
183 0.6
184 0.67
185 0.74
186 0.75
187 0.76
188 0.77
189 0.74
190 0.77
191 0.7
192 0.65
193 0.62
194 0.55
195 0.47
196 0.4
197 0.35
198 0.27
199 0.27
200 0.23
201 0.16
202 0.18
203 0.23
204 0.23
205 0.25
206 0.28
207 0.26
208 0.36