Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1FYM1

Protein Details
Accession C1FYM1    Localization Confidence High Confidence Score 22.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
71-99KASQRREAEQEPRHRKRRRIAGENDTDRDBasic
259-303EERREKLRDLKKEEERKQRRYSSRHRKERRRRRRRGSDASRDSLEBasic
314-369AENARERESSKKRNSHRDRRERSRDRSPRHSRSHDDRHSHRSSRNHDKERGKRSSGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
67-89EAKPKASQRREAEQEPRHRKRRR
245-294HQLKAVEKERKKWEEERREKLRDLKKEEERKQRRYSSRHRKERRRRRRRG
320-366RESSKKRNSHRDRRERSRDRSPRHSRSHDDRHSHRSSRNHDKERGKR
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 13, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019339  CIR_N_dom  
IPR039875  LENG1-like  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0008380  P:RNA splicing  
KEGG pbn:PADG_00897  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF10197  Cir_N  
Amino Acid Sequences MVLHLLGKKSWNVYNTDNTARVRRDEAEAKTREEEEQRRLQKADAEKRIQILRGQRSPSNSPPPSLEAKPKASQRREAEQEPRHRKRRRIAGENDTDRDIRFAREDAQLAEATREEDVVLFRKEAKDAPLIDESGHINLFPPSAVANDPSGNSGKNPEAEMEAARKKREYEDQYTMRFSNAAGFRQSLDKNPWYSSSNVDIAAQTAEDMLPNKDVWGNEDPRRQERERERITSNDPLAAMKKGIHQLKAVEKERKKWEEERREKLRDLKKEEERKQRRYSSRHRKERRRRRRRGSDASRDSLEGFSLDADVPLAENARERESSKKRNSHRDRRERSRDRSPRHSRSHDDRHSHRSSRNHDKERGKRSSGDDQSSGWVPAPGKRYSAQFANV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.46
3 0.48
4 0.48
5 0.47
6 0.52
7 0.5
8 0.48
9 0.44
10 0.4
11 0.42
12 0.44
13 0.48
14 0.5
15 0.5
16 0.51
17 0.5
18 0.49
19 0.46
20 0.47
21 0.47
22 0.45
23 0.52
24 0.54
25 0.55
26 0.55
27 0.52
28 0.5
29 0.54
30 0.57
31 0.56
32 0.56
33 0.53
34 0.57
35 0.58
36 0.53
37 0.48
38 0.47
39 0.47
40 0.48
41 0.51
42 0.49
43 0.52
44 0.57
45 0.6
46 0.61
47 0.54
48 0.49
49 0.47
50 0.48
51 0.48
52 0.46
53 0.47
54 0.43
55 0.47
56 0.51
57 0.56
58 0.62
59 0.62
60 0.67
61 0.64
62 0.67
63 0.67
64 0.68
65 0.69
66 0.68
67 0.74
68 0.76
69 0.79
70 0.8
71 0.81
72 0.82
73 0.82
74 0.84
75 0.83
76 0.82
77 0.81
78 0.81
79 0.84
80 0.82
81 0.74
82 0.66
83 0.56
84 0.46
85 0.4
86 0.3
87 0.22
88 0.17
89 0.16
90 0.17
91 0.2
92 0.21
93 0.19
94 0.2
95 0.19
96 0.18
97 0.18
98 0.14
99 0.12
100 0.11
101 0.1
102 0.07
103 0.07
104 0.08
105 0.11
106 0.12
107 0.12
108 0.14
109 0.15
110 0.16
111 0.17
112 0.18
113 0.19
114 0.19
115 0.23
116 0.23
117 0.22
118 0.21
119 0.21
120 0.19
121 0.15
122 0.14
123 0.1
124 0.08
125 0.08
126 0.08
127 0.06
128 0.06
129 0.05
130 0.06
131 0.07
132 0.07
133 0.09
134 0.09
135 0.1
136 0.11
137 0.12
138 0.11
139 0.11
140 0.13
141 0.13
142 0.13
143 0.13
144 0.12
145 0.12
146 0.13
147 0.14
148 0.16
149 0.21
150 0.22
151 0.22
152 0.23
153 0.23
154 0.25
155 0.33
156 0.34
157 0.35
158 0.42
159 0.46
160 0.47
161 0.49
162 0.46
163 0.37
164 0.31
165 0.23
166 0.21
167 0.18
168 0.17
169 0.16
170 0.16
171 0.16
172 0.21
173 0.21
174 0.17
175 0.2
176 0.22
177 0.22
178 0.23
179 0.25
180 0.22
181 0.22
182 0.22
183 0.2
184 0.18
185 0.17
186 0.16
187 0.14
188 0.13
189 0.11
190 0.09
191 0.06
192 0.05
193 0.04
194 0.04
195 0.05
196 0.05
197 0.06
198 0.06
199 0.07
200 0.09
201 0.09
202 0.12
203 0.17
204 0.21
205 0.25
206 0.3
207 0.33
208 0.36
209 0.42
210 0.4
211 0.43
212 0.47
213 0.53
214 0.54
215 0.56
216 0.53
217 0.5
218 0.53
219 0.51
220 0.43
221 0.34
222 0.28
223 0.25
224 0.24
225 0.21
226 0.17
227 0.11
228 0.14
229 0.19
230 0.22
231 0.22
232 0.22
233 0.25
234 0.32
235 0.4
236 0.42
237 0.45
238 0.45
239 0.52
240 0.6
241 0.6
242 0.58
243 0.59
244 0.63
245 0.66
246 0.73
247 0.75
248 0.74
249 0.75
250 0.73
251 0.74
252 0.71
253 0.69
254 0.67
255 0.67
256 0.68
257 0.73
258 0.79
259 0.81
260 0.82
261 0.81
262 0.82
263 0.83
264 0.82
265 0.81
266 0.84
267 0.84
268 0.85
269 0.88
270 0.89
271 0.91
272 0.93
273 0.95
274 0.96
275 0.95
276 0.96
277 0.96
278 0.96
279 0.96
280 0.96
281 0.95
282 0.95
283 0.91
284 0.85
285 0.75
286 0.64
287 0.55
288 0.44
289 0.33
290 0.22
291 0.14
292 0.09
293 0.09
294 0.08
295 0.06
296 0.06
297 0.06
298 0.06
299 0.06
300 0.07
301 0.06
302 0.09
303 0.11
304 0.14
305 0.16
306 0.17
307 0.27
308 0.36
309 0.47
310 0.54
311 0.61
312 0.67
313 0.77
314 0.86
315 0.87
316 0.89
317 0.9
318 0.9
319 0.92
320 0.95
321 0.93
322 0.91
323 0.91
324 0.9
325 0.87
326 0.88
327 0.88
328 0.87
329 0.87
330 0.87
331 0.84
332 0.84
333 0.86
334 0.85
335 0.83
336 0.8
337 0.79
338 0.8
339 0.77
340 0.74
341 0.72
342 0.72
343 0.74
344 0.78
345 0.77
346 0.78
347 0.83
348 0.86
349 0.86
350 0.86
351 0.79
352 0.74
353 0.72
354 0.74
355 0.71
356 0.68
357 0.59
358 0.52
359 0.51
360 0.47
361 0.41
362 0.31
363 0.26
364 0.21
365 0.25
366 0.29
367 0.26
368 0.28
369 0.3
370 0.34
371 0.36