Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1C1CH16

Protein Details
Accession A0A1C1CH16    Localization Confidence High Confidence Score 15.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-20MRKGKRSKKRNETVTGSEQQHydrophilic
313-335QSENEYEKEKRKRKERALIVIDAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
3-10KGKRSKKR
322-327KRKRKE
Subcellular Location(s) nucl 10.5, cyto_nucl 8.5, mito 8, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001214  SET_dom  
IPR046341  SET_dom_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF00856  SET  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50280  SET  
CDD cd20071  SET_SMYD  
Amino Acid Sequences MRKGKRSKKRNETVTGSEQQHGPGSHDILVRDKRGVDEKPTPQVEVEVGIERLTLDDDNLDGSALLVSLLEDNTSSTDASCSSASTSTITSPQDTLLEVVSTPDRGLAVFTTRKIKAGTLILAERPLIALSKTEETDPQSIERHFAALPRPEQKVYLSLFDAQKSRMSRVVSIYYSNCYNCEGEGSTRDGSAIGALSSRINHSCVPNVQFSYHAGKGEMRFFALKDIPRGREVCGNYERDVCHRVAERQRRQRMYYGFACACEACVPRTEFWARSDERRRGMYDALGRVKGLEKRWAAEERGQERREEEGVGQSENEYEKEKRKRKERALIVIDALDALTRLEGLLIKEGLVGVPLANTYRRMAKWAERKGETATQDVVKWKTRELQVCITCFGDDGQRAQDIKTRLGELSRREKPYVMSHSC
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.83
2 0.8
3 0.72
4 0.64
5 0.55
6 0.48
7 0.45
8 0.37
9 0.32
10 0.27
11 0.26
12 0.28
13 0.29
14 0.29
15 0.32
16 0.36
17 0.35
18 0.33
19 0.32
20 0.32
21 0.36
22 0.39
23 0.38
24 0.42
25 0.46
26 0.53
27 0.54
28 0.51
29 0.44
30 0.42
31 0.35
32 0.28
33 0.24
34 0.18
35 0.16
36 0.15
37 0.14
38 0.13
39 0.12
40 0.12
41 0.09
42 0.07
43 0.07
44 0.07
45 0.08
46 0.08
47 0.08
48 0.06
49 0.06
50 0.06
51 0.05
52 0.05
53 0.04
54 0.04
55 0.05
56 0.05
57 0.05
58 0.05
59 0.06
60 0.07
61 0.08
62 0.08
63 0.07
64 0.08
65 0.09
66 0.11
67 0.1
68 0.1
69 0.1
70 0.11
71 0.12
72 0.12
73 0.13
74 0.12
75 0.16
76 0.17
77 0.17
78 0.17
79 0.17
80 0.16
81 0.15
82 0.14
83 0.11
84 0.1
85 0.08
86 0.1
87 0.09
88 0.09
89 0.09
90 0.08
91 0.08
92 0.07
93 0.08
94 0.08
95 0.12
96 0.15
97 0.17
98 0.23
99 0.24
100 0.26
101 0.26
102 0.26
103 0.24
104 0.25
105 0.25
106 0.21
107 0.23
108 0.22
109 0.21
110 0.21
111 0.16
112 0.13
113 0.11
114 0.08
115 0.07
116 0.07
117 0.09
118 0.12
119 0.12
120 0.13
121 0.14
122 0.17
123 0.2
124 0.2
125 0.19
126 0.2
127 0.2
128 0.21
129 0.19
130 0.18
131 0.15
132 0.16
133 0.19
134 0.21
135 0.25
136 0.28
137 0.3
138 0.29
139 0.29
140 0.28
141 0.28
142 0.25
143 0.23
144 0.19
145 0.21
146 0.22
147 0.23
148 0.24
149 0.2
150 0.22
151 0.22
152 0.22
153 0.22
154 0.22
155 0.22
156 0.24
157 0.27
158 0.24
159 0.25
160 0.24
161 0.22
162 0.23
163 0.21
164 0.18
165 0.15
166 0.15
167 0.12
168 0.12
169 0.11
170 0.1
171 0.12
172 0.15
173 0.13
174 0.13
175 0.13
176 0.11
177 0.1
178 0.09
179 0.07
180 0.04
181 0.04
182 0.05
183 0.05
184 0.05
185 0.07
186 0.07
187 0.09
188 0.1
189 0.11
190 0.13
191 0.16
192 0.18
193 0.19
194 0.19
195 0.18
196 0.17
197 0.18
198 0.21
199 0.19
200 0.17
201 0.15
202 0.16
203 0.17
204 0.19
205 0.17
206 0.13
207 0.12
208 0.12
209 0.14
210 0.16
211 0.15
212 0.19
213 0.23
214 0.24
215 0.26
216 0.27
217 0.25
218 0.28
219 0.28
220 0.28
221 0.29
222 0.29
223 0.28
224 0.3
225 0.29
226 0.26
227 0.27
228 0.21
229 0.2
230 0.2
231 0.25
232 0.32
233 0.42
234 0.49
235 0.56
236 0.65
237 0.66
238 0.67
239 0.68
240 0.62
241 0.58
242 0.51
243 0.47
244 0.39
245 0.35
246 0.33
247 0.26
248 0.23
249 0.2
250 0.17
251 0.11
252 0.15
253 0.16
254 0.15
255 0.2
256 0.23
257 0.21
258 0.22
259 0.29
260 0.26
261 0.34
262 0.42
263 0.43
264 0.44
265 0.46
266 0.46
267 0.41
268 0.41
269 0.37
270 0.34
271 0.35
272 0.34
273 0.32
274 0.29
275 0.27
276 0.3
277 0.29
278 0.26
279 0.27
280 0.25
281 0.26
282 0.31
283 0.34
284 0.33
285 0.34
286 0.4
287 0.39
288 0.46
289 0.46
290 0.42
291 0.4
292 0.4
293 0.36
294 0.29
295 0.23
296 0.21
297 0.21
298 0.21
299 0.2
300 0.16
301 0.17
302 0.16
303 0.17
304 0.14
305 0.16
306 0.25
307 0.35
308 0.44
309 0.51
310 0.6
311 0.7
312 0.76
313 0.83
314 0.84
315 0.84
316 0.81
317 0.75
318 0.66
319 0.56
320 0.45
321 0.35
322 0.25
323 0.14
324 0.08
325 0.06
326 0.04
327 0.03
328 0.03
329 0.04
330 0.06
331 0.07
332 0.1
333 0.1
334 0.1
335 0.11
336 0.11
337 0.1
338 0.09
339 0.08
340 0.05
341 0.05
342 0.05
343 0.07
344 0.08
345 0.1
346 0.12
347 0.19
348 0.19
349 0.22
350 0.27
351 0.35
352 0.44
353 0.51
354 0.58
355 0.54
356 0.56
357 0.58
358 0.6
359 0.53
360 0.46
361 0.41
362 0.34
363 0.34
364 0.38
365 0.37
366 0.37
367 0.36
368 0.36
369 0.4
370 0.45
371 0.5
372 0.51
373 0.56
374 0.54
375 0.55
376 0.54
377 0.48
378 0.4
379 0.33
380 0.28
381 0.24
382 0.2
383 0.2
384 0.21
385 0.24
386 0.25
387 0.26
388 0.31
389 0.28
390 0.31
391 0.32
392 0.32
393 0.29
394 0.34
395 0.39
396 0.42
397 0.49
398 0.53
399 0.55
400 0.55
401 0.55
402 0.54
403 0.58