Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1C1C9A4

Protein Details
Accession A0A1C1C9A4    Localization Confidence Low Confidence Score 5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
125-151KMYLEFRVKHLKKKNPVRDKAEYNKVNHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 7cyto 7cyto_mito 7, E.R. 4, cyto_pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR045075  Syf1-like  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Gene Ontology GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF13181  TPR_8  
Amino Acid Sequences MPSRNRRNIIPTLAALKVKVVCVFLGVKLRRLVLDNPLRAMPGIVRQSHGNSAVTMASLKAAKPDLYLIANEDAIYEQDIIRNPGSIRPWLTYIDFKMRNGTILEQAFVQERACIQLPRSYKLWKMYLEFRVKHLKKKNPVRDKAEYNKVNALFERALILLNKMPVIWEMYLRFLLRQPHVTKTRRTFDRALRALPVTQHNRIWKLYKSFANSAGGETAVKIWKRYVQIHPEDMEDFIDLLIETGHYLEAVKRYMQILDNPKFRSKHIKSEFQLWSEMVELMVNKAREIGDSAVSGFDPDTIIRSGIERFADQRGRLWAGLATYWITRGDFERARDVFEEGITTVMTVRDFTMVFDAYVEFEESILSTLMDAASARAAKGVVDAEKDFDLDLKMMRFEHLMDRRPFLVNDVLLRQNPNNVVEWEKRVALWNDNKQEVVQTYTDAIAAIQPKRAVGKFHELWLNYAKFYEENGDLDTARIILDKAVKVPYKSVAELADTWVGWAEMELRNENFDNALKVMATATKAPKRSTVDYFDETLSPQQRVHKSWKVWSFYVDLVESVGSLDETRAVYDRIFELRIATPQTVVNYANLLEEHGYFEESFKVYERGLDVFTYPVAFELWNLYLTKAVTRKIGLERLRDLFEQAVENVPPQFAKPIYLMYGDLEEERGLARSAMRIYERATRAVSDEDRLPMFEFYITKSATNFGLTSTRPIYERAIAALPDSDAKAMCLKFAEMERRLGEIDRARAIYGHASQYADPRVDKPFWETWEKFEVAHGNEDTFKEMLRIKRSVAAQFNTDVAFIASQAVARGQAAAATNADSGAHRDGEERGAATDAMAALERQARAPVGFVAASTGPEGGNRPSKTAEGGDGDGQANGKEKATVSANPDAIDVDIDDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.45
2 0.37
3 0.34
4 0.29
5 0.26
6 0.25
7 0.21
8 0.17
9 0.2
10 0.21
11 0.2
12 0.28
13 0.28
14 0.31
15 0.32
16 0.34
17 0.32
18 0.35
19 0.34
20 0.35
21 0.43
22 0.41
23 0.41
24 0.41
25 0.39
26 0.35
27 0.33
28 0.25
29 0.24
30 0.27
31 0.26
32 0.27
33 0.29
34 0.33
35 0.36
36 0.37
37 0.3
38 0.23
39 0.24
40 0.22
41 0.2
42 0.17
43 0.12
44 0.12
45 0.12
46 0.12
47 0.14
48 0.17
49 0.17
50 0.17
51 0.19
52 0.2
53 0.2
54 0.21
55 0.2
56 0.2
57 0.19
58 0.18
59 0.16
60 0.13
61 0.12
62 0.13
63 0.11
64 0.09
65 0.12
66 0.14
67 0.17
68 0.17
69 0.2
70 0.19
71 0.23
72 0.26
73 0.28
74 0.29
75 0.28
76 0.3
77 0.3
78 0.32
79 0.32
80 0.34
81 0.39
82 0.39
83 0.37
84 0.41
85 0.38
86 0.37
87 0.34
88 0.32
89 0.29
90 0.27
91 0.27
92 0.21
93 0.22
94 0.21
95 0.2
96 0.18
97 0.12
98 0.11
99 0.14
100 0.17
101 0.17
102 0.17
103 0.23
104 0.26
105 0.29
106 0.32
107 0.33
108 0.35
109 0.41
110 0.44
111 0.42
112 0.44
113 0.48
114 0.54
115 0.59
116 0.55
117 0.53
118 0.59
119 0.58
120 0.62
121 0.64
122 0.65
123 0.66
124 0.76
125 0.82
126 0.82
127 0.88
128 0.87
129 0.86
130 0.86
131 0.84
132 0.84
133 0.76
134 0.69
135 0.66
136 0.59
137 0.53
138 0.44
139 0.39
140 0.29
141 0.26
142 0.23
143 0.16
144 0.17
145 0.15
146 0.16
147 0.13
148 0.14
149 0.14
150 0.12
151 0.12
152 0.11
153 0.14
154 0.12
155 0.13
156 0.14
157 0.16
158 0.18
159 0.18
160 0.19
161 0.19
162 0.25
163 0.25
164 0.33
165 0.33
166 0.4
167 0.49
168 0.53
169 0.58
170 0.6
171 0.67
172 0.64
173 0.68
174 0.66
175 0.66
176 0.72
177 0.66
178 0.6
179 0.54
180 0.5
181 0.45
182 0.42
183 0.42
184 0.37
185 0.37
186 0.39
187 0.41
188 0.43
189 0.45
190 0.45
191 0.42
192 0.43
193 0.46
194 0.46
195 0.47
196 0.46
197 0.46
198 0.46
199 0.41
200 0.35
201 0.29
202 0.24
203 0.18
204 0.15
205 0.15
206 0.15
207 0.15
208 0.15
209 0.16
210 0.2
211 0.25
212 0.31
213 0.36
214 0.41
215 0.46
216 0.49
217 0.49
218 0.46
219 0.42
220 0.36
221 0.28
222 0.19
223 0.14
224 0.09
225 0.08
226 0.06
227 0.05
228 0.05
229 0.04
230 0.04
231 0.04
232 0.04
233 0.04
234 0.04
235 0.06
236 0.09
237 0.1
238 0.1
239 0.12
240 0.13
241 0.15
242 0.16
243 0.21
244 0.29
245 0.34
246 0.4
247 0.42
248 0.47
249 0.46
250 0.47
251 0.51
252 0.46
253 0.5
254 0.51
255 0.57
256 0.53
257 0.62
258 0.63
259 0.54
260 0.51
261 0.4
262 0.34
263 0.25
264 0.23
265 0.13
266 0.1
267 0.09
268 0.08
269 0.12
270 0.11
271 0.1
272 0.11
273 0.11
274 0.11
275 0.13
276 0.13
277 0.11
278 0.11
279 0.12
280 0.1
281 0.1
282 0.1
283 0.08
284 0.06
285 0.06
286 0.05
287 0.07
288 0.07
289 0.08
290 0.08
291 0.09
292 0.09
293 0.11
294 0.12
295 0.11
296 0.12
297 0.18
298 0.21
299 0.2
300 0.22
301 0.24
302 0.25
303 0.24
304 0.23
305 0.18
306 0.15
307 0.14
308 0.13
309 0.1
310 0.08
311 0.09
312 0.09
313 0.08
314 0.08
315 0.09
316 0.15
317 0.16
318 0.18
319 0.25
320 0.25
321 0.26
322 0.27
323 0.26
324 0.2
325 0.18
326 0.17
327 0.09
328 0.09
329 0.07
330 0.06
331 0.06
332 0.06
333 0.06
334 0.05
335 0.06
336 0.06
337 0.07
338 0.07
339 0.09
340 0.08
341 0.08
342 0.08
343 0.08
344 0.07
345 0.07
346 0.08
347 0.05
348 0.05
349 0.05
350 0.05
351 0.05
352 0.05
353 0.04
354 0.04
355 0.04
356 0.04
357 0.04
358 0.04
359 0.03
360 0.05
361 0.05
362 0.05
363 0.05
364 0.05
365 0.05
366 0.06
367 0.07
368 0.07
369 0.09
370 0.09
371 0.1
372 0.1
373 0.1
374 0.09
375 0.08
376 0.08
377 0.06
378 0.07
379 0.06
380 0.07
381 0.07
382 0.08
383 0.08
384 0.08
385 0.16
386 0.2
387 0.27
388 0.27
389 0.29
390 0.3
391 0.31
392 0.3
393 0.24
394 0.22
395 0.15
396 0.15
397 0.16
398 0.17
399 0.16
400 0.17
401 0.15
402 0.15
403 0.16
404 0.16
405 0.14
406 0.13
407 0.17
408 0.17
409 0.2
410 0.19
411 0.18
412 0.17
413 0.18
414 0.19
415 0.21
416 0.26
417 0.3
418 0.32
419 0.32
420 0.32
421 0.29
422 0.29
423 0.23
424 0.19
425 0.12
426 0.09
427 0.1
428 0.1
429 0.1
430 0.08
431 0.07
432 0.07
433 0.1
434 0.1
435 0.1
436 0.1
437 0.11
438 0.13
439 0.14
440 0.14
441 0.14
442 0.21
443 0.21
444 0.24
445 0.27
446 0.25
447 0.26
448 0.29
449 0.27
450 0.19
451 0.18
452 0.16
453 0.12
454 0.13
455 0.14
456 0.09
457 0.09
458 0.1
459 0.1
460 0.1
461 0.1
462 0.09
463 0.07
464 0.06
465 0.05
466 0.05
467 0.05
468 0.08
469 0.08
470 0.1
471 0.14
472 0.15
473 0.15
474 0.17
475 0.19
476 0.19
477 0.19
478 0.18
479 0.15
480 0.15
481 0.15
482 0.15
483 0.12
484 0.1
485 0.1
486 0.08
487 0.08
488 0.06
489 0.05
490 0.06
491 0.08
492 0.09
493 0.11
494 0.11
495 0.12
496 0.13
497 0.13
498 0.11
499 0.09
500 0.09
501 0.08
502 0.08
503 0.07
504 0.07
505 0.07
506 0.07
507 0.07
508 0.09
509 0.15
510 0.19
511 0.21
512 0.22
513 0.28
514 0.31
515 0.35
516 0.36
517 0.37
518 0.38
519 0.37
520 0.38
521 0.34
522 0.29
523 0.26
524 0.26
525 0.21
526 0.17
527 0.16
528 0.22
529 0.25
530 0.28
531 0.36
532 0.38
533 0.39
534 0.46
535 0.52
536 0.49
537 0.46
538 0.44
539 0.39
540 0.33
541 0.32
542 0.24
543 0.17
544 0.12
545 0.12
546 0.09
547 0.07
548 0.06
549 0.04
550 0.04
551 0.04
552 0.05
553 0.05
554 0.06
555 0.07
556 0.08
557 0.08
558 0.09
559 0.1
560 0.1
561 0.11
562 0.11
563 0.12
564 0.13
565 0.15
566 0.16
567 0.15
568 0.14
569 0.14
570 0.15
571 0.15
572 0.14
573 0.12
574 0.11
575 0.11
576 0.1
577 0.09
578 0.09
579 0.07
580 0.07
581 0.08
582 0.08
583 0.09
584 0.08
585 0.09
586 0.1
587 0.1
588 0.1
589 0.1
590 0.11
591 0.1
592 0.11
593 0.12
594 0.12
595 0.12
596 0.12
597 0.11
598 0.1
599 0.11
600 0.09
601 0.08
602 0.07
603 0.06
604 0.06
605 0.06
606 0.08
607 0.08
608 0.1
609 0.1
610 0.1
611 0.11
612 0.11
613 0.16
614 0.16
615 0.16
616 0.17
617 0.18
618 0.22
619 0.24
620 0.32
621 0.32
622 0.34
623 0.37
624 0.38
625 0.4
626 0.36
627 0.33
628 0.26
629 0.22
630 0.19
631 0.15
632 0.15
633 0.12
634 0.13
635 0.12
636 0.11
637 0.1
638 0.09
639 0.12
640 0.1
641 0.11
642 0.11
643 0.13
644 0.14
645 0.15
646 0.15
647 0.12
648 0.13
649 0.12
650 0.11
651 0.1
652 0.09
653 0.08
654 0.08
655 0.08
656 0.07
657 0.07
658 0.07
659 0.09
660 0.1
661 0.13
662 0.14
663 0.15
664 0.17
665 0.26
666 0.27
667 0.27
668 0.27
669 0.24
670 0.25
671 0.29
672 0.27
673 0.22
674 0.22
675 0.22
676 0.22
677 0.22
678 0.21
679 0.16
680 0.15
681 0.14
682 0.13
683 0.13
684 0.17
685 0.17
686 0.16
687 0.17
688 0.18
689 0.17
690 0.17
691 0.15
692 0.12
693 0.15
694 0.15
695 0.19
696 0.2
697 0.2
698 0.2
699 0.22
700 0.23
701 0.22
702 0.22
703 0.2
704 0.2
705 0.19
706 0.19
707 0.17
708 0.15
709 0.13
710 0.13
711 0.11
712 0.09
713 0.1
714 0.14
715 0.14
716 0.14
717 0.13
718 0.13
719 0.15
720 0.2
721 0.28
722 0.25
723 0.29
724 0.3
725 0.3
726 0.31
727 0.29
728 0.3
729 0.27
730 0.28
731 0.28
732 0.27
733 0.26
734 0.25
735 0.25
736 0.24
737 0.22
738 0.21
739 0.2
740 0.2
741 0.21
742 0.26
743 0.28
744 0.25
745 0.24
746 0.23
747 0.27
748 0.27
749 0.27
750 0.28
751 0.3
752 0.33
753 0.41
754 0.39
755 0.39
756 0.43
757 0.43
758 0.37
759 0.35
760 0.36
761 0.29
762 0.34
763 0.29
764 0.25
765 0.27
766 0.27
767 0.27
768 0.21
769 0.19
770 0.16
771 0.21
772 0.26
773 0.29
774 0.31
775 0.3
776 0.36
777 0.4
778 0.44
779 0.47
780 0.43
781 0.39
782 0.38
783 0.38
784 0.32
785 0.28
786 0.21
787 0.14
788 0.12
789 0.09
790 0.09
791 0.08
792 0.08
793 0.08
794 0.08
795 0.08
796 0.08
797 0.08
798 0.07
799 0.09
800 0.1
801 0.11
802 0.11
803 0.12
804 0.12
805 0.11
806 0.12
807 0.1
808 0.12
809 0.13
810 0.14
811 0.13
812 0.14
813 0.16
814 0.18
815 0.19
816 0.17
817 0.15
818 0.16
819 0.15
820 0.13
821 0.13
822 0.1
823 0.09
824 0.09
825 0.08
826 0.09
827 0.13
828 0.13
829 0.13
830 0.15
831 0.15
832 0.15
833 0.17
834 0.16
835 0.14
836 0.14
837 0.13
838 0.15
839 0.14
840 0.14
841 0.13
842 0.13
843 0.1
844 0.11
845 0.14
846 0.16
847 0.25
848 0.25
849 0.27
850 0.29
851 0.31
852 0.33
853 0.33
854 0.31
855 0.27
856 0.28
857 0.27
858 0.27
859 0.26
860 0.24
861 0.22
862 0.18
863 0.18
864 0.16
865 0.15
866 0.14
867 0.15
868 0.19
869 0.22
870 0.26
871 0.28
872 0.34
873 0.35
874 0.34
875 0.33
876 0.29
877 0.25
878 0.22