FuNGI

A0A1C1CWC2

Protein Details

Accession

A0A1C1CWC2

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
211-234	GSTVEATGRKRKKRWDVSSESTPA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
219-223	RKRKK

Subcellular Location(s)

plas 14, cyto 5, nucl 3, cyto_mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011989 ARM-like IPR016024 ARM-type_fold IPR015016 SF3b_su1 IPR038737 SF3b_su1-like
Gene Ontology	GO:0005681 C:spliceosomal complex GO:0003729 F:mRNA binding GO:0000245 P:spliceosomal complex assembly
Pfam	View protein in Pfam PF08920 SF3b1

Amino Acid Sequences

MSDALPADFETVRRLQAERNSQAAGKKGSKAFDPSTQRTDSSTKASVTESFDTTLYDRDGGDKYAGYHTSLPADGDDDDMPNADDSRRLVGQYTATKDQMNEFATGGAEEEDILLGREKSARIADRESDYQKRRFDRGPLTPTRADPFAANKHAAVAGGATYREVMQLQDLEREEERVKKLIADKQAAGDDSVEHKPTLKEEADKENADAGSTVEATGRKRKKRWDVSSESTPAPNDADAKKRSRWDQAPGPDTAPAPTKRSRWDQAPALGSATPMGNAGLATPVPGTFGEISARSAPWSDEELDMMLPTEGYTILEPPPGYAPLRHIARKAMPTPAQAASTAGFGGFMMQEPENPRMMGKQMPTEIPGVGDLQFLKAEDMTYFGKLVDGADENAMSVEELKERKIMRLLLKVKNGTPPMRKTALRQLTDNARQFGAGPLFNQILPLLMEKTLEDQERHLLVKVIDRVLYKLDDLIRPYVHKILVVIEPLLIDQDYYARVEGREIISNLAKAAGLAHMISTMRPDIDHVDEYVRNTTARAFAVVASALGIPALLPFLRAVCRSKKSWQARHTGVKIVQQIPILMGCAVLPHLKGLVDCIADNLSDEQAKVRTVTSLAIAALAEAANPYGIESFDDILNPLWTGARKQRGKGLAGFLKAVGYIIPLMDEEYANYYTSQIMEILLREFASPDEEMKKVVLKVVSQCASTDGVTAGYLKEHVLQEFFKSFWVRRMALDKRNYRQVVETTVDLGQKVGVSEIVERIVNNLKDESEAYRKMTVETIEKVVASLGAADIGERLEERLVDGILHAFQEQSIEDVVMLNGFGTVVNALGTRCKPYLPQIVSTILWRLNNKSATVRQQAADLISRIAMVMKQCGEDALMGKLGVVLYEYLGEEYPEVLGSILGALRSIVTVVGINQMQPPIKDLLPRLTPILRNRHEKVQENTIDLVGRIADRGPESVNAREWMRICFELLDMLKAHKKGIRRAANNTFGFIAKAIGPQDVLATLLNNLRVQERQSRVCTAVAIGIVAETCAPFTVLPALMNEYRVPELNVQNGVLKSLSFLFEYIGEMAKDYVYAVTPLLEDALIDRDQVHRQTAASVVKHVALGVVGLGCEDAMVHLLNLLYPNLFETSPHVIDRIIEAIEAIRMAVGTGIVMNYVWAGLFHPARKVRTPYWRLYNDAYVHSADAMVPYYPNMKDEGLPRDELFIMV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.23
2	0.26
3	0.34
4	0.44
5	0.43
6	0.45
7	0.45
8	0.46
9	0.49
10	0.49
11	0.47
12	0.42
13	0.44
14	0.45
15	0.45
16	0.46
17	0.49
18	0.47
19	0.49
20	0.54
21	0.53
22	0.55
23	0.55
24	0.52
25	0.5
26	0.49
27	0.44
28	0.41
29	0.39
30	0.34
31	0.33
32	0.34
33	0.34
34	0.35
35	0.35
36	0.3
37	0.27
38	0.26
39	0.26
40	0.25
41	0.24
42	0.2
43	0.17
44	0.16
45	0.18
46	0.19
47	0.19
48	0.2
49	0.18
50	0.18
51	0.23
52	0.24
53	0.23
54	0.24
55	0.23
56	0.25
57	0.24
58	0.23
59	0.17
60	0.18
61	0.16
62	0.16
63	0.15
64	0.13
65	0.13
66	0.13
67	0.13
68	0.12
69	0.13
70	0.11
71	0.12
72	0.13
73	0.17
74	0.18
75	0.18
76	0.18
77	0.2
78	0.27
79	0.31
80	0.36
81	0.36
82	0.36
83	0.37
84	0.36
85	0.37
86	0.36
87	0.31
88	0.26
89	0.22
90	0.21
91	0.2
92	0.19
93	0.16
94	0.1
95	0.08
96	0.07
97	0.07
98	0.06
99	0.06
100	0.07
101	0.08
102	0.08
103	0.09
104	0.12
105	0.12
106	0.15
107	0.21
108	0.25
109	0.27
110	0.32
111	0.36
112	0.39
113	0.45
114	0.49
115	0.52
116	0.54
117	0.57
118	0.6
119	0.61
120	0.61
121	0.59
122	0.62
123	0.62
124	0.64
125	0.67
126	0.67
127	0.69
128	0.66
129	0.64
130	0.59
131	0.51
132	0.42
133	0.35
134	0.34
135	0.35
136	0.36
137	0.35
138	0.31
139	0.31
140	0.3
141	0.28
142	0.2
143	0.13
144	0.1
145	0.1
146	0.1
147	0.09
148	0.09
149	0.09
150	0.1
151	0.1
152	0.09
153	0.1
154	0.13
155	0.14
156	0.19
157	0.19
158	0.22
159	0.22
160	0.25
161	0.25
162	0.28
163	0.3
164	0.28
165	0.28
166	0.29
167	0.35
168	0.38
169	0.44
170	0.42
171	0.4
172	0.4
173	0.43
174	0.39
175	0.33
176	0.26
177	0.2
178	0.2
179	0.22
180	0.2
181	0.17
182	0.19
183	0.19
184	0.21
185	0.25
186	0.23
187	0.26
188	0.29
189	0.37
190	0.4
191	0.4
192	0.39
193	0.37
194	0.34
195	0.29
196	0.25
197	0.17
198	0.13
199	0.12
200	0.11
201	0.09
202	0.12
203	0.15
204	0.25
205	0.33
206	0.4
207	0.47
208	0.57
209	0.66
210	0.74
211	0.81
212	0.81
213	0.82
214	0.81
215	0.83
216	0.77
217	0.68
218	0.59
219	0.49
220	0.4
221	0.32
222	0.25
223	0.21
224	0.2
225	0.26
226	0.3
227	0.35
228	0.39
229	0.44
230	0.48
231	0.53
232	0.54
233	0.55
234	0.58
235	0.62
236	0.61
237	0.57
238	0.53
239	0.45
240	0.4
241	0.34
242	0.32
243	0.25
244	0.27
245	0.3
246	0.33
247	0.37
248	0.44
249	0.48
250	0.47
251	0.52
252	0.53
253	0.54
254	0.53
255	0.47
256	0.41
257	0.36
258	0.3
259	0.23
260	0.17
261	0.11
262	0.08
263	0.07
264	0.06
265	0.05
266	0.06
267	0.06
268	0.05
269	0.06
270	0.06
271	0.06
272	0.07
273	0.07
274	0.09
275	0.08
276	0.09
277	0.1
278	0.11
279	0.13
280	0.14
281	0.14
282	0.12
283	0.13
284	0.12
285	0.13
286	0.15
287	0.14
288	0.13
289	0.13
290	0.14
291	0.13
292	0.12
293	0.11
294	0.08
295	0.06
296	0.05
297	0.05
298	0.05
299	0.05
300	0.06
301	0.07
302	0.07
303	0.1
304	0.1
305	0.1
306	0.12
307	0.13
308	0.14
309	0.13
310	0.16
311	0.22
312	0.27
313	0.28
314	0.28
315	0.3
316	0.35
317	0.4
318	0.38
319	0.38
320	0.36
321	0.36
322	0.38
323	0.35
324	0.31
325	0.25
326	0.24
327	0.17
328	0.14
329	0.12
330	0.08
331	0.07
332	0.06
333	0.06
334	0.05
335	0.05
336	0.07
337	0.07
338	0.1
339	0.13
340	0.15
341	0.16
342	0.16
343	0.16
344	0.15
345	0.17
346	0.18
347	0.17
348	0.2
349	0.21
350	0.22
351	0.23
352	0.23
353	0.21
354	0.17
355	0.16
356	0.12
357	0.1
358	0.1
359	0.09
360	0.08
361	0.09
362	0.08
363	0.08
364	0.07
365	0.07
366	0.06
367	0.09
368	0.09
369	0.1
370	0.1
371	0.09
372	0.09
373	0.09
374	0.09
375	0.08
376	0.08
377	0.08
378	0.08
379	0.08
380	0.08
381	0.08
382	0.07
383	0.05
384	0.05
385	0.05
386	0.08
387	0.09
388	0.1
389	0.14
390	0.15
391	0.17
392	0.2
393	0.24
394	0.26
395	0.35
396	0.42
397	0.44
398	0.49
399	0.49
400	0.47
401	0.49
402	0.48
403	0.45
404	0.45
405	0.42
406	0.42
407	0.45
408	0.44
409	0.42
410	0.48
411	0.5
412	0.45
413	0.43
414	0.41
415	0.45
416	0.52
417	0.51
418	0.42
419	0.33
420	0.31
421	0.3
422	0.29
423	0.23
424	0.15
425	0.12
426	0.13
427	0.14
428	0.14
429	0.13
430	0.1
431	0.08
432	0.08
433	0.09
434	0.07
435	0.07
436	0.07
437	0.07
438	0.1
439	0.12
440	0.13
441	0.13
442	0.13
443	0.16
444	0.18
445	0.18
446	0.16
447	0.15
448	0.14
449	0.18
450	0.2
451	0.18
452	0.18
453	0.18
454	0.18
455	0.18
456	0.18
457	0.13
458	0.13
459	0.14
460	0.14
461	0.15
462	0.17
463	0.16
464	0.17
465	0.18
466	0.18
467	0.16
468	0.15
469	0.13
470	0.14
471	0.14
472	0.13
473	0.12
474	0.09
475	0.09
476	0.09
477	0.09
478	0.06
479	0.04
480	0.03
481	0.04
482	0.05
483	0.05
484	0.06
485	0.06
486	0.06
487	0.07
488	0.09
489	0.1
490	0.12
491	0.12
492	0.14
493	0.14
494	0.14
495	0.13
496	0.12
497	0.1
498	0.07
499	0.07
500	0.05
501	0.05
502	0.04
503	0.04
504	0.05
505	0.05
506	0.05
507	0.06
508	0.06
509	0.05
510	0.05
511	0.06
512	0.08
513	0.1
514	0.11
515	0.1
516	0.13
517	0.14
518	0.15
519	0.16
520	0.14
521	0.11
522	0.11
523	0.11
524	0.11
525	0.1
526	0.1
527	0.09
528	0.08
529	0.09
530	0.08
531	0.07
532	0.06
533	0.05
534	0.04
535	0.04
536	0.03
537	0.03
538	0.03
539	0.03
540	0.02
541	0.03
542	0.03
543	0.04
544	0.06
545	0.08
546	0.11
547	0.16
548	0.2
549	0.23
550	0.28
551	0.37
552	0.45
553	0.53
554	0.56
555	0.58
556	0.61
557	0.65
558	0.62
559	0.57
560	0.5
561	0.45
562	0.44
563	0.38
564	0.33
565	0.26
566	0.24
567	0.19
568	0.17
569	0.13
570	0.08
571	0.06
572	0.04
573	0.04
574	0.04
575	0.05
576	0.05
577	0.04
578	0.05
579	0.05
580	0.05
581	0.06
582	0.07
583	0.07
584	0.07
585	0.07
586	0.07
587	0.07
588	0.08
589	0.07
590	0.06
591	0.06
592	0.06
593	0.06
594	0.07
595	0.07
596	0.07
597	0.07
598	0.07
599	0.07
600	0.08
601	0.07
602	0.07
603	0.07
604	0.06
605	0.06
606	0.05
607	0.05
608	0.04
609	0.04
610	0.03
611	0.03
612	0.02
613	0.03
614	0.03
615	0.03
616	0.03
617	0.04
618	0.04
619	0.05
620	0.05
621	0.06
622	0.06
623	0.06
624	0.06
625	0.06
626	0.05
627	0.05
628	0.06
629	0.08
630	0.13
631	0.22
632	0.24
633	0.25
634	0.31
635	0.34
636	0.36
637	0.36
638	0.37
639	0.32
640	0.3
641	0.29
642	0.24
643	0.2
644	0.18
645	0.15
646	0.08
647	0.05
648	0.04
649	0.03
650	0.04
651	0.03
652	0.04
653	0.05
654	0.05
655	0.04
656	0.07
657	0.08
658	0.08
659	0.08
660	0.08
661	0.08
662	0.08
663	0.08
664	0.06
665	0.06
666	0.06
667	0.06
668	0.06
669	0.06
670	0.06
671	0.06
672	0.06
673	0.06
674	0.07
675	0.07
676	0.08
677	0.1
678	0.1
679	0.11
680	0.11
681	0.13
682	0.11
683	0.13
684	0.13
685	0.12
686	0.15
687	0.2
688	0.21
689	0.19
690	0.19
691	0.18
692	0.18
693	0.17
694	0.14
695	0.09
696	0.08
697	0.08
698	0.08
699	0.06
700	0.05
701	0.06
702	0.05
703	0.08
704	0.09
705	0.09
706	0.1
707	0.1
708	0.12
709	0.13
710	0.13
711	0.12
712	0.14
713	0.14
714	0.18
715	0.23
716	0.22
717	0.23
718	0.31
719	0.35
720	0.41
721	0.49
722	0.5
723	0.5
724	0.58
725	0.57
726	0.49
727	0.46
728	0.4
729	0.36
730	0.31
731	0.27
732	0.2
733	0.21
734	0.2
735	0.16
736	0.15
737	0.1
738	0.09
739	0.08
740	0.07
741	0.05
742	0.05
743	0.06
744	0.07
745	0.07
746	0.07
747	0.07
748	0.09
749	0.14
750	0.14
751	0.15
752	0.15
753	0.14
754	0.15
755	0.16
756	0.18
757	0.18
758	0.19
759	0.2
760	0.22
761	0.22
762	0.22
763	0.23
764	0.21
765	0.19
766	0.19
767	0.19
768	0.17
769	0.17
770	0.16
771	0.14
772	0.12
773	0.08
774	0.06
775	0.04
776	0.03
777	0.03
778	0.03
779	0.04
780	0.03
781	0.04
782	0.04
783	0.04
784	0.04
785	0.04
786	0.05
787	0.06
788	0.06
789	0.06
790	0.06
791	0.06
792	0.06
793	0.07
794	0.06
795	0.05
796	0.05
797	0.06
798	0.06
799	0.06
800	0.06
801	0.05
802	0.05
803	0.06
804	0.06
805	0.05
806	0.05
807	0.04
808	0.03
809	0.03
810	0.03
811	0.03
812	0.03
813	0.03
814	0.04
815	0.04
816	0.04
817	0.08
818	0.09
819	0.12
820	0.12
821	0.13
822	0.14
823	0.2
824	0.3
825	0.29
826	0.31
827	0.3
828	0.33
829	0.33
830	0.32
831	0.29
832	0.22
833	0.22
834	0.21
835	0.22
836	0.25
837	0.26
838	0.27
839	0.29
840	0.32
841	0.37
842	0.4
843	0.39
844	0.33
845	0.33
846	0.32
847	0.29
848	0.26
849	0.19
850	0.14
851	0.12
852	0.12
853	0.1
854	0.1
855	0.09
856	0.08
857	0.1
858	0.1
859	0.1
860	0.1
861	0.11
862	0.11
863	0.1
864	0.11
865	0.09
866	0.09
867	0.08
868	0.08
869	0.09
870	0.08
871	0.07
872	0.06
873	0.05
874	0.04
875	0.05
876	0.06
877	0.06
878	0.06
879	0.06
880	0.06
881	0.06
882	0.06
883	0.05
884	0.05
885	0.04
886	0.04
887	0.04
888	0.04
889	0.05
890	0.04
891	0.04
892	0.04
893	0.04
894	0.04
895	0.04
896	0.04
897	0.04
898	0.04
899	0.05
900	0.08
901	0.08
902	0.09
903	0.1
904	0.13
905	0.14
906	0.13
907	0.16
908	0.15
909	0.16
910	0.19
911	0.2
912	0.24
913	0.26
914	0.27
915	0.27
916	0.29
917	0.33
918	0.37
919	0.46
920	0.45
921	0.5
922	0.53
923	0.59
924	0.62
925	0.64
926	0.61
927	0.61
928	0.57
929	0.53
930	0.5
931	0.42
932	0.35
933	0.28
934	0.23
935	0.14
936	0.11
937	0.08
938	0.08
939	0.08
940	0.09
941	0.1
942	0.11
943	0.14
944	0.17
945	0.2
946	0.22
947	0.23
948	0.23
949	0.25
950	0.25
951	0.24
952	0.24
953	0.22
954	0.21
955	0.19
956	0.18
957	0.19
958	0.19
959	0.19
960	0.15
961	0.18
962	0.22
963	0.22
964	0.24
965	0.22
966	0.27
967	0.33
968	0.43
969	0.49
970	0.5
971	0.59
972	0.65
973	0.72
974	0.67
975	0.6
976	0.51
977	0.41
978	0.36
979	0.28
980	0.2
981	0.11
982	0.13
983	0.13
984	0.12
985	0.11
986	0.11
987	0.11
988	0.1
989	0.1
990	0.07
991	0.07
992	0.08
993	0.1
994	0.12
995	0.12
996	0.13
997	0.14
998	0.16
999	0.19
1000	0.26
1001	0.31
1002	0.35
1003	0.38
1004	0.42
1005	0.42
1006	0.41
1007	0.38
1008	0.29
1009	0.25
1010	0.19
1011	0.15
1012	0.11
1013	0.09
1014	0.08
1015	0.07
1016	0.06
1017	0.04
1018	0.04
1019	0.04
1020	0.05
1021	0.05
1022	0.06
1023	0.09
1024	0.1
1025	0.1
1026	0.11
1027	0.16
1028	0.16
1029	0.18
1030	0.18
1031	0.17
1032	0.18
1033	0.18
1034	0.19
1035	0.2
1036	0.23
1037	0.25
1038	0.26
1039	0.25
1040	0.28
1041	0.27
1042	0.26
1043	0.2
1044	0.17
1045	0.14
1046	0.14
1047	0.15
1048	0.11
1049	0.11
1050	0.11
1051	0.11
1052	0.13
1053	0.12
1054	0.12
1055	0.11
1056	0.11
1057	0.11
1058	0.1
1059	0.1
1060	0.09
1061	0.08
1062	0.07
1063	0.08
1064	0.08
1065	0.08
1066	0.08
1067	0.08
1068	0.08
1069	0.07
1070	0.06
1071	0.07
1072	0.1
1073	0.1
1074	0.1
1075	0.11
1076	0.14
1077	0.19
1078	0.21
1079	0.23
1080	0.2
1081	0.2
1082	0.22
1083	0.27
1084	0.3
1085	0.27
1086	0.27
1087	0.26
1088	0.26
1089	0.25
1090	0.23
1091	0.18
1092	0.11
1093	0.1
1094	0.08
1095	0.06
1096	0.05
1097	0.05
1098	0.05
1099	0.04
1100	0.04
1101	0.04
1102	0.03
1103	0.04
1104	0.05
1105	0.05
1106	0.06
1107	0.06
1108	0.07
1109	0.09
1110	0.09
1111	0.08
1112	0.08
1113	0.1
1114	0.11
1115	0.11
1116	0.1
1117	0.14
1118	0.21
1119	0.23
1120	0.24
1121	0.23
1122	0.21
1123	0.22
1124	0.23
1125	0.21
1126	0.14
1127	0.11
1128	0.11
1129	0.11
1130	0.11
1131	0.1
1132	0.08
1133	0.06
1134	0.05
1135	0.05
1136	0.05
1137	0.05
1138	0.04
1139	0.05
1140	0.05
1141	0.05
1142	0.05
1143	0.05
1144	0.05
1145	0.05
1146	0.05
1147	0.04
1148	0.06
1149	0.11
1150	0.15
1151	0.17
1152	0.25
1153	0.31
1154	0.36
1155	0.43
1156	0.49
1157	0.52
1158	0.59
1159	0.65
1160	0.66
1161	0.7
1162	0.7
1163	0.68
1164	0.66
1165	0.66
1166	0.58
1167	0.54
1168	0.48
1169	0.39
1170	0.35
1171	0.3
1172	0.25
1173	0.17
1174	0.15
1175	0.13
1176	0.11
1177	0.1
1178	0.1
1179	0.15
1180	0.15
1181	0.16
1182	0.17
1183	0.18
1184	0.21
1185	0.27
1186	0.33
1187	0.32
1188	0.35
1189	0.34
1190	0.35

A0A1C1CWC2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer