Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1C1CHX8

Protein Details
Accession A0A1C1CHX8    Localization Confidence High Confidence Score 15.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
85-112FYGSAYRERQQSKKKRKREQTSNDGAVVHydrophilic
935-959FNITSAKKSKARSEKKDRPLKKNRHBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
97-102KKKRKR
941-959KKSKARSEKKDRPLKKNRH
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto_nucl 10.833, mito 6.5, cyto_mito 6.166, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007148  SSU_processome_Utp12  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
Pfam View protein in Pfam  
PF04003  Utp12  
Amino Acid Sequences MGRKDAPVAVSKSSASAPAVTASNNARKSSVLKSAFTPSQFQLHLFASVIQSFDSHQLRIHDTSTGRLRSQHETKSKITSLDWGFYGSAYRERQQSKKKRKREQTSNDGAVVAYGTDTSQICMFSPAEGRVVGTLSGGHERGIKAFKFSPTDYLQAWSIGEDANLIQWDLLKDQPIRTINLPDPTISLLASPCQVAPEILCASSTPFAIDITSSDDFRIDRFDSFKNTIHSLCRSDDYQTFLAADSDRYINIYSISEKKLSRTLVASSGVTAVALSSPPKDAPDYIRRQQMLCAITRDGAVELFPHPFTESKAINGDLKSSRKNLTRKASASVRLVSPDSKTKSVPIVAAFLQGSDLVIVSADGGVDLAFQKVRWQDEGNGELLFDGVKEVVKVKSASTLNTATLNGVKDTGKTRVDESKTVVINGGAGGPSVADAIELSSGESEDDVDEDDSGDEASAKADNKEEDEEADEDEDSSEASGSDEEMPDAEEKDAQEDKEEPSFGDLLAARHPTEISIPAALPADTTALAIPKVPAMALPAGMSLSTVLTQSLRTNDTSLLEAVLHTTDASIVKSTIQRLDSTLAGLLLSKLAERLASRPGRYGHLITWVQWTCIAHGGAIASMPDVISKVKTLYAVLNERMRTLDDLLVLKGKLDLLDAQVQFRKSIAAQRGEREAGQGQPGVILLEGQDNWDSDDDLDEDGFTVRPTKRARRGTKLDDLIGASHEDEDDEEDVEDDEILANGVESSDEEEEEEDDDDDDEILANGVESSDEEEEEEDDDDDDDDEDDDEEESDEEGLPNGTRLVDDEASVSSAGESDPDDVAPSPAEAASSSASSVSGSDDESGEGEDGEEDEGSDLDSFINDGSVDFEEEADDDDGNEIKVAGDNSDGEGEDEDEDNEDVEEPEPEPEPEPMPLLKPSKSKPQRDAMDLDVGFNITSAKKSKARSEKKDRPLKKNRH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.2
3 0.18
4 0.16
5 0.17
6 0.18
7 0.16
8 0.2
9 0.23
10 0.3
11 0.33
12 0.33
13 0.31
14 0.32
15 0.36
16 0.38
17 0.41
18 0.37
19 0.35
20 0.38
21 0.45
22 0.48
23 0.46
24 0.44
25 0.36
26 0.38
27 0.37
28 0.35
29 0.31
30 0.28
31 0.27
32 0.23
33 0.23
34 0.19
35 0.19
36 0.19
37 0.14
38 0.14
39 0.13
40 0.2
41 0.21
42 0.19
43 0.21
44 0.24
45 0.29
46 0.31
47 0.31
48 0.29
49 0.27
50 0.34
51 0.39
52 0.4
53 0.36
54 0.4
55 0.43
56 0.46
57 0.53
58 0.55
59 0.56
60 0.57
61 0.6
62 0.62
63 0.6
64 0.54
65 0.47
66 0.46
67 0.41
68 0.38
69 0.35
70 0.29
71 0.26
72 0.24
73 0.25
74 0.18
75 0.22
76 0.23
77 0.26
78 0.32
79 0.38
80 0.47
81 0.56
82 0.65
83 0.7
84 0.77
85 0.84
86 0.87
87 0.92
88 0.94
89 0.94
90 0.94
91 0.93
92 0.93
93 0.86
94 0.76
95 0.65
96 0.54
97 0.43
98 0.32
99 0.21
100 0.11
101 0.06
102 0.05
103 0.07
104 0.07
105 0.08
106 0.09
107 0.1
108 0.1
109 0.13
110 0.13
111 0.13
112 0.16
113 0.16
114 0.16
115 0.16
116 0.16
117 0.14
118 0.14
119 0.12
120 0.09
121 0.09
122 0.1
123 0.13
124 0.13
125 0.13
126 0.15
127 0.15
128 0.19
129 0.24
130 0.22
131 0.24
132 0.28
133 0.31
134 0.34
135 0.34
136 0.37
137 0.34
138 0.37
139 0.33
140 0.32
141 0.28
142 0.24
143 0.23
144 0.17
145 0.14
146 0.11
147 0.1
148 0.08
149 0.07
150 0.08
151 0.08
152 0.08
153 0.07
154 0.08
155 0.09
156 0.11
157 0.12
158 0.15
159 0.17
160 0.18
161 0.25
162 0.26
163 0.29
164 0.29
165 0.33
166 0.33
167 0.36
168 0.36
169 0.29
170 0.28
171 0.26
172 0.24
173 0.19
174 0.15
175 0.1
176 0.11
177 0.11
178 0.1
179 0.09
180 0.09
181 0.09
182 0.09
183 0.08
184 0.12
185 0.12
186 0.11
187 0.11
188 0.11
189 0.13
190 0.14
191 0.13
192 0.1
193 0.09
194 0.09
195 0.09
196 0.09
197 0.07
198 0.12
199 0.13
200 0.13
201 0.13
202 0.14
203 0.14
204 0.14
205 0.18
206 0.14
207 0.14
208 0.18
209 0.2
210 0.25
211 0.29
212 0.32
213 0.31
214 0.33
215 0.33
216 0.34
217 0.35
218 0.32
219 0.31
220 0.3
221 0.27
222 0.28
223 0.28
224 0.29
225 0.26
226 0.23
227 0.21
228 0.19
229 0.19
230 0.16
231 0.14
232 0.11
233 0.11
234 0.1
235 0.11
236 0.11
237 0.1
238 0.11
239 0.11
240 0.13
241 0.16
242 0.19
243 0.22
244 0.22
245 0.24
246 0.28
247 0.28
248 0.27
249 0.25
250 0.25
251 0.24
252 0.26
253 0.23
254 0.18
255 0.18
256 0.15
257 0.13
258 0.1
259 0.07
260 0.05
261 0.05
262 0.06
263 0.06
264 0.07
265 0.08
266 0.09
267 0.1
268 0.12
269 0.19
270 0.27
271 0.34
272 0.38
273 0.45
274 0.45
275 0.44
276 0.45
277 0.44
278 0.37
279 0.31
280 0.29
281 0.23
282 0.22
283 0.22
284 0.2
285 0.14
286 0.12
287 0.09
288 0.08
289 0.08
290 0.09
291 0.09
292 0.09
293 0.1
294 0.1
295 0.12
296 0.16
297 0.15
298 0.16
299 0.18
300 0.19
301 0.21
302 0.2
303 0.23
304 0.23
305 0.26
306 0.27
307 0.28
308 0.32
309 0.36
310 0.42
311 0.47
312 0.5
313 0.54
314 0.53
315 0.57
316 0.57
317 0.54
318 0.52
319 0.45
320 0.37
321 0.32
322 0.31
323 0.26
324 0.23
325 0.25
326 0.26
327 0.25
328 0.25
329 0.25
330 0.26
331 0.26
332 0.26
333 0.19
334 0.18
335 0.16
336 0.18
337 0.16
338 0.13
339 0.11
340 0.09
341 0.08
342 0.06
343 0.05
344 0.03
345 0.03
346 0.03
347 0.03
348 0.03
349 0.03
350 0.02
351 0.02
352 0.02
353 0.03
354 0.03
355 0.04
356 0.04
357 0.04
358 0.08
359 0.1
360 0.12
361 0.14
362 0.16
363 0.19
364 0.23
365 0.25
366 0.22
367 0.19
368 0.18
369 0.15
370 0.14
371 0.1
372 0.05
373 0.04
374 0.03
375 0.03
376 0.04
377 0.06
378 0.06
379 0.08
380 0.09
381 0.09
382 0.16
383 0.16
384 0.17
385 0.19
386 0.2
387 0.19
388 0.19
389 0.19
390 0.13
391 0.14
392 0.14
393 0.11
394 0.11
395 0.1
396 0.11
397 0.13
398 0.17
399 0.16
400 0.16
401 0.19
402 0.25
403 0.27
404 0.27
405 0.29
406 0.3
407 0.29
408 0.28
409 0.26
410 0.18
411 0.16
412 0.14
413 0.11
414 0.05
415 0.04
416 0.04
417 0.03
418 0.03
419 0.03
420 0.03
421 0.02
422 0.02
423 0.03
424 0.03
425 0.03
426 0.03
427 0.03
428 0.03
429 0.03
430 0.03
431 0.03
432 0.03
433 0.03
434 0.04
435 0.04
436 0.04
437 0.04
438 0.04
439 0.04
440 0.04
441 0.04
442 0.03
443 0.03
444 0.04
445 0.05
446 0.06
447 0.06
448 0.08
449 0.08
450 0.09
451 0.11
452 0.1
453 0.09
454 0.11
455 0.11
456 0.1
457 0.1
458 0.08
459 0.07
460 0.07
461 0.06
462 0.04
463 0.04
464 0.03
465 0.03
466 0.03
467 0.03
468 0.04
469 0.05
470 0.05
471 0.05
472 0.05
473 0.05
474 0.06
475 0.06
476 0.06
477 0.06
478 0.06
479 0.09
480 0.11
481 0.1
482 0.11
483 0.11
484 0.13
485 0.13
486 0.14
487 0.1
488 0.1
489 0.11
490 0.09
491 0.1
492 0.09
493 0.08
494 0.1
495 0.11
496 0.1
497 0.1
498 0.1
499 0.09
500 0.09
501 0.09
502 0.08
503 0.08
504 0.07
505 0.08
506 0.08
507 0.08
508 0.07
509 0.06
510 0.06
511 0.05
512 0.05
513 0.05
514 0.05
515 0.05
516 0.05
517 0.05
518 0.05
519 0.05
520 0.04
521 0.04
522 0.05
523 0.06
524 0.06
525 0.06
526 0.05
527 0.05
528 0.05
529 0.05
530 0.04
531 0.04
532 0.04
533 0.04
534 0.04
535 0.04
536 0.06
537 0.07
538 0.09
539 0.1
540 0.11
541 0.12
542 0.12
543 0.13
544 0.13
545 0.12
546 0.1
547 0.09
548 0.08
549 0.07
550 0.07
551 0.06
552 0.04
553 0.04
554 0.05
555 0.05
556 0.06
557 0.06
558 0.06
559 0.08
560 0.1
561 0.11
562 0.14
563 0.14
564 0.14
565 0.15
566 0.17
567 0.15
568 0.14
569 0.13
570 0.09
571 0.08
572 0.08
573 0.06
574 0.05
575 0.05
576 0.04
577 0.04
578 0.04
579 0.05
580 0.06
581 0.08
582 0.15
583 0.19
584 0.2
585 0.24
586 0.25
587 0.27
588 0.29
589 0.29
590 0.22
591 0.26
592 0.26
593 0.23
594 0.29
595 0.26
596 0.24
597 0.24
598 0.23
599 0.17
600 0.2
601 0.19
602 0.11
603 0.11
604 0.11
605 0.09
606 0.09
607 0.08
608 0.04
609 0.04
610 0.04
611 0.03
612 0.04
613 0.05
614 0.05
615 0.06
616 0.07
617 0.07
618 0.08
619 0.09
620 0.11
621 0.15
622 0.19
623 0.22
624 0.25
625 0.25
626 0.25
627 0.24
628 0.23
629 0.2
630 0.18
631 0.16
632 0.13
633 0.14
634 0.14
635 0.16
636 0.15
637 0.13
638 0.12
639 0.11
640 0.08
641 0.08
642 0.08
643 0.09
644 0.16
645 0.16
646 0.18
647 0.21
648 0.21
649 0.2
650 0.2
651 0.18
652 0.13
653 0.19
654 0.23
655 0.29
656 0.31
657 0.33
658 0.37
659 0.37
660 0.36
661 0.32
662 0.28
663 0.21
664 0.2
665 0.18
666 0.14
667 0.12
668 0.12
669 0.1
670 0.08
671 0.06
672 0.05
673 0.06
674 0.06
675 0.07
676 0.08
677 0.08
678 0.09
679 0.09
680 0.09
681 0.08
682 0.09
683 0.09
684 0.08
685 0.08
686 0.07
687 0.07
688 0.07
689 0.07
690 0.06
691 0.11
692 0.11
693 0.18
694 0.25
695 0.34
696 0.43
697 0.54
698 0.62
699 0.66
700 0.75
701 0.75
702 0.78
703 0.73
704 0.64
705 0.56
706 0.49
707 0.39
708 0.31
709 0.24
710 0.15
711 0.11
712 0.1
713 0.08
714 0.07
715 0.08
716 0.08
717 0.08
718 0.07
719 0.08
720 0.08
721 0.08
722 0.08
723 0.06
724 0.05
725 0.04
726 0.05
727 0.04
728 0.03
729 0.03
730 0.03
731 0.03
732 0.03
733 0.06
734 0.07
735 0.07
736 0.07
737 0.08
738 0.08
739 0.09
740 0.1
741 0.08
742 0.07
743 0.08
744 0.08
745 0.07
746 0.07
747 0.06
748 0.05
749 0.05
750 0.04
751 0.04
752 0.04
753 0.03
754 0.04
755 0.04
756 0.06
757 0.07
758 0.07
759 0.07
760 0.08
761 0.08
762 0.09
763 0.1
764 0.08
765 0.07
766 0.08
767 0.08
768 0.08
769 0.08
770 0.07
771 0.07
772 0.07
773 0.07
774 0.07
775 0.07
776 0.07
777 0.07
778 0.07
779 0.07
780 0.07
781 0.07
782 0.07
783 0.07
784 0.07
785 0.07
786 0.07
787 0.07
788 0.07
789 0.07
790 0.08
791 0.13
792 0.13
793 0.13
794 0.14
795 0.14
796 0.15
797 0.15
798 0.13
799 0.07
800 0.07
801 0.07
802 0.07
803 0.07
804 0.08
805 0.08
806 0.08
807 0.1
808 0.1
809 0.11
810 0.1
811 0.1
812 0.09
813 0.08
814 0.08
815 0.07
816 0.09
817 0.09
818 0.09
819 0.09
820 0.08
821 0.09
822 0.08
823 0.08
824 0.09
825 0.08
826 0.09
827 0.1
828 0.1
829 0.1
830 0.1
831 0.11
832 0.09
833 0.08
834 0.08
835 0.07
836 0.07
837 0.07
838 0.06
839 0.06
840 0.06
841 0.06
842 0.07
843 0.06
844 0.06
845 0.06
846 0.06
847 0.06
848 0.05
849 0.06
850 0.05
851 0.05
852 0.07
853 0.08
854 0.1
855 0.1
856 0.1
857 0.1
858 0.1
859 0.12
860 0.11
861 0.1
862 0.08
863 0.1
864 0.1
865 0.1
866 0.1
867 0.07
868 0.07
869 0.09
870 0.1
871 0.09
872 0.1
873 0.11
874 0.12
875 0.13
876 0.13
877 0.11
878 0.12
879 0.12
880 0.12
881 0.12
882 0.11
883 0.11
884 0.11
885 0.11
886 0.1
887 0.1
888 0.09
889 0.09
890 0.1
891 0.09
892 0.11
893 0.13
894 0.13
895 0.15
896 0.16
897 0.17
898 0.17
899 0.2
900 0.19
901 0.21
902 0.26
903 0.29
904 0.32
905 0.38
906 0.42
907 0.5
908 0.59
909 0.65
910 0.66
911 0.72
912 0.73
913 0.71
914 0.71
915 0.64
916 0.63
917 0.54
918 0.47
919 0.38
920 0.31
921 0.25
922 0.21
923 0.18
924 0.1
925 0.14
926 0.16
927 0.22
928 0.28
929 0.33
930 0.43
931 0.53
932 0.63
933 0.7
934 0.78
935 0.82
936 0.87
937 0.93
938 0.92
939 0.92