Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1C1C7V0

Protein Details
Accession A0A1C1C7V0    Localization Confidence High Confidence Score 23.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
28-52AAEISKARRTSKRRKIQHEYTDQEDHydrophilic
128-157EPATSSQKEEKKKKKVKDKDKKKPTPGVVYBasic
292-321VEEGRRREGMKRKREQKKKAPQSGGRAEQEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
36-41RTSKRR
136-151EEKKKKKVKDKDKKKP
295-316GRRREGMKRKREQKKKAPQSGG
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 13
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039119  ABT1/Esf2  
IPR034353  ABT1/ESF2_RRM  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
CDD cd12263  RRM_ABT1_like  
Amino Acid Sequences MAVERRNTYLDAGVSDESDRDTGYDSEAAEISKARRTSKRRKIQHEYTDQEDEDDEDDEDEIDSRTERRTNSTLEKHGAVQAHAELKQQREVDENNDSAGEDDNAEPSEQDEEPERKDRQTLTHPQSEPATSSQKEEKKKKKVKDKDKKKPTPGVVYLSSLPPYLKPSALRNLLDQRGFSPIARIFLSPASKSNKSHSAGGKNSRQLYTEGWIEFASKKTAKRCAETLNASTVGGKKGGYYRDDVWNMKYLRGMRWEELMAGVREEKREMEGRRDEERRTIARETKMFVEGVEEGRRREGMKRKREQKKKAPQSGGRAEQEGDGPGDPKRTWRQNEVLGSKRKDQTGGDDKISDDVRQVLGKIF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.18
3 0.17
4 0.14
5 0.13
6 0.12
7 0.1
8 0.12
9 0.12
10 0.14
11 0.16
12 0.14
13 0.16
14 0.16
15 0.16
16 0.14
17 0.16
18 0.15
19 0.2
20 0.23
21 0.27
22 0.36
23 0.46
24 0.56
25 0.64
26 0.73
27 0.77
28 0.85
29 0.88
30 0.9
31 0.91
32 0.9
33 0.84
34 0.79
35 0.75
36 0.64
37 0.55
38 0.44
39 0.35
40 0.26
41 0.21
42 0.15
43 0.1
44 0.1
45 0.09
46 0.09
47 0.08
48 0.08
49 0.07
50 0.08
51 0.08
52 0.12
53 0.16
54 0.17
55 0.23
56 0.26
57 0.32
58 0.4
59 0.46
60 0.48
61 0.48
62 0.48
63 0.43
64 0.44
65 0.39
66 0.3
67 0.24
68 0.21
69 0.21
70 0.2
71 0.23
72 0.23
73 0.23
74 0.29
75 0.28
76 0.26
77 0.26
78 0.27
79 0.28
80 0.3
81 0.28
82 0.23
83 0.22
84 0.21
85 0.17
86 0.16
87 0.12
88 0.08
89 0.08
90 0.09
91 0.09
92 0.09
93 0.08
94 0.08
95 0.11
96 0.09
97 0.1
98 0.14
99 0.16
100 0.19
101 0.26
102 0.27
103 0.25
104 0.28
105 0.29
106 0.29
107 0.36
108 0.42
109 0.42
110 0.49
111 0.49
112 0.48
113 0.48
114 0.43
115 0.36
116 0.3
117 0.3
118 0.21
119 0.24
120 0.3
121 0.35
122 0.43
123 0.52
124 0.58
125 0.63
126 0.71
127 0.77
128 0.81
129 0.85
130 0.87
131 0.88
132 0.9
133 0.9
134 0.93
135 0.93
136 0.9
137 0.88
138 0.82
139 0.79
140 0.71
141 0.65
142 0.55
143 0.47
144 0.4
145 0.32
146 0.27
147 0.19
148 0.16
149 0.11
150 0.13
151 0.12
152 0.13
153 0.14
154 0.16
155 0.23
156 0.27
157 0.27
158 0.27
159 0.32
160 0.33
161 0.32
162 0.29
163 0.23
164 0.22
165 0.22
166 0.18
167 0.16
168 0.14
169 0.15
170 0.16
171 0.15
172 0.12
173 0.14
174 0.17
175 0.13
176 0.17
177 0.21
178 0.22
179 0.24
180 0.27
181 0.31
182 0.31
183 0.36
184 0.37
185 0.39
186 0.42
187 0.47
188 0.49
189 0.46
190 0.47
191 0.42
192 0.39
193 0.33
194 0.29
195 0.25
196 0.23
197 0.18
198 0.16
199 0.16
200 0.16
201 0.15
202 0.15
203 0.16
204 0.16
205 0.19
206 0.23
207 0.32
208 0.34
209 0.36
210 0.38
211 0.39
212 0.43
213 0.43
214 0.41
215 0.35
216 0.33
217 0.29
218 0.27
219 0.23
220 0.18
221 0.14
222 0.12
223 0.1
224 0.14
225 0.17
226 0.17
227 0.19
228 0.21
229 0.28
230 0.33
231 0.33
232 0.31
233 0.35
234 0.34
235 0.31
236 0.32
237 0.26
238 0.25
239 0.31
240 0.32
241 0.26
242 0.28
243 0.27
244 0.24
245 0.24
246 0.23
247 0.17
248 0.15
249 0.16
250 0.15
251 0.16
252 0.16
253 0.15
254 0.16
255 0.22
256 0.24
257 0.29
258 0.35
259 0.39
260 0.46
261 0.49
262 0.47
263 0.46
264 0.51
265 0.46
266 0.44
267 0.46
268 0.44
269 0.47
270 0.48
271 0.45
272 0.41
273 0.39
274 0.34
275 0.28
276 0.24
277 0.19
278 0.2
279 0.25
280 0.23
281 0.22
282 0.24
283 0.26
284 0.24
285 0.31
286 0.37
287 0.41
288 0.5
289 0.6
290 0.69
291 0.78
292 0.87
293 0.9
294 0.91
295 0.92
296 0.93
297 0.93
298 0.92
299 0.89
300 0.88
301 0.87
302 0.84
303 0.75
304 0.66
305 0.56
306 0.47
307 0.41
308 0.33
309 0.25
310 0.17
311 0.15
312 0.15
313 0.18
314 0.17
315 0.23
316 0.32
317 0.39
318 0.45
319 0.51
320 0.57
321 0.61
322 0.71
323 0.72
324 0.71
325 0.71
326 0.7
327 0.71
328 0.69
329 0.62
330 0.56
331 0.5
332 0.51
333 0.51
334 0.52
335 0.47
336 0.43
337 0.42
338 0.43
339 0.43
340 0.33
341 0.25
342 0.22
343 0.21
344 0.21