Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1GGT9

Protein Details
Accession C1GGT9    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
14-38ETSAGNGVKRHKKKNFPDAEPDSSPHydrophilic
42-68SSSNTAKQRTKTQSRLQKLQKLTRKLLHydrophilic
433-458SIPPPHHHHHPPPKPRQRDKPTYHTTBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 13.5, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR029058  AB_hydrolase  
IPR000073  AB_hydrolase_1  
IPR014720  dsRBD_dom  
IPR000999  RNase_III_dom  
IPR036389  RNase_III_sf  
Gene Ontology GO:0004525  F:ribonuclease III activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006396  P:RNA processing  
KEGG pbn:PADG_06526  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00561  Abhydrolase_1  
PF00636  Ribonuclease_3  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50137  DS_RBD  
PS50142  RNASE_3_2  
CDD cd00593  RIBOc  
Amino Acid Sequences METKRKLEPGTSEETSAGNGVKRHKKKNFPDAEPDSSPTSPSSSNTAKQRTKTQSRLQKLQKLTRKLLNHPEQIPEAPINGSAPGPDLLQSLTALNNSLSLSLSLSLSSSSPQTHNPQDPPSYYSQSPLDRLYTPSLHLHAQNILPPLPPVPDKSLQTAIFTHEGVNDPTNTTTTTASTEKNYERLELLGDAYIEIFATRLVWDTFPRLRAGRLSQIREMLVKNETLAEYATRYGLDRRLQVAAEIRRQAKTWTKVRGDLFEAYVAAVILSHPKRGVEMVEEWLTQLWIPRLEGVERERPVLRYKEELAKMVMDKGVRVRYVDEREGVQRKGGLQTFFVGVYLDGWGFRDVCLGTGTGMSKVIAGNEAARKALENPVAREAAERKRAFHAGDRKGSDTGHVVSIQSPFDVLTEKRHRTPLPSHQHNIAYRGISIPPPHHHHHPPPKPRQRDKPTYHTTMGLRMPIPCGVSLRRTIPYLYRPFSSSPTPSSKPELAYQIWPSLDNSTAIDEDRNPIVFMHGLFGSKQNNRSISKALAAKLRRRIWVVDLRNHGDSPHLSPHDYMSMSDDVEAFIQRFKLHKPALIGHSMGAKTAMTLALRSPQLISSLISVDNAPVSAKLSSQFVNYVKAMQEIERAGVTKQSEADKILERYEESLPIRQFLLTNLIRNPTSHILKFRLPLSTLASSLDELASFPYNPATAPADLKFEGPALFIRGTRSGYVKDSMLPAINRFFPRYQIVDVEAGHWVISENGVGFKDAVTEFLKDN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.32
3 0.27
4 0.23
5 0.18
6 0.19
7 0.27
8 0.37
9 0.46
10 0.56
11 0.64
12 0.72
13 0.8
14 0.87
15 0.88
16 0.84
17 0.86
18 0.83
19 0.81
20 0.74
21 0.67
22 0.61
23 0.51
24 0.45
25 0.35
26 0.31
27 0.25
28 0.24
29 0.28
30 0.28
31 0.35
32 0.42
33 0.51
34 0.54
35 0.58
36 0.66
37 0.69
38 0.74
39 0.76
40 0.77
41 0.78
42 0.8
43 0.86
44 0.85
45 0.84
46 0.83
47 0.84
48 0.83
49 0.81
50 0.79
51 0.78
52 0.74
53 0.74
54 0.75
55 0.74
56 0.73
57 0.67
58 0.64
59 0.59
60 0.54
61 0.49
62 0.39
63 0.31
64 0.23
65 0.21
66 0.17
67 0.15
68 0.14
69 0.1
70 0.11
71 0.11
72 0.1
73 0.1
74 0.1
75 0.1
76 0.1
77 0.11
78 0.1
79 0.1
80 0.1
81 0.1
82 0.09
83 0.11
84 0.1
85 0.1
86 0.1
87 0.09
88 0.1
89 0.09
90 0.1
91 0.08
92 0.08
93 0.09
94 0.08
95 0.09
96 0.1
97 0.12
98 0.14
99 0.19
100 0.25
101 0.32
102 0.38
103 0.41
104 0.45
105 0.47
106 0.47
107 0.47
108 0.46
109 0.44
110 0.38
111 0.37
112 0.37
113 0.36
114 0.37
115 0.34
116 0.32
117 0.28
118 0.31
119 0.32
120 0.28
121 0.27
122 0.28
123 0.28
124 0.27
125 0.27
126 0.25
127 0.24
128 0.23
129 0.24
130 0.24
131 0.22
132 0.2
133 0.19
134 0.18
135 0.18
136 0.18
137 0.18
138 0.22
139 0.26
140 0.28
141 0.32
142 0.37
143 0.35
144 0.35
145 0.33
146 0.3
147 0.27
148 0.26
149 0.21
150 0.17
151 0.18
152 0.18
153 0.19
154 0.16
155 0.15
156 0.15
157 0.16
158 0.15
159 0.15
160 0.13
161 0.12
162 0.16
163 0.17
164 0.18
165 0.19
166 0.24
167 0.24
168 0.29
169 0.29
170 0.27
171 0.25
172 0.24
173 0.23
174 0.18
175 0.17
176 0.12
177 0.11
178 0.09
179 0.09
180 0.08
181 0.06
182 0.05
183 0.04
184 0.03
185 0.04
186 0.04
187 0.06
188 0.07
189 0.08
190 0.1
191 0.15
192 0.19
193 0.2
194 0.23
195 0.22
196 0.23
197 0.26
198 0.29
199 0.33
200 0.37
201 0.4
202 0.39
203 0.41
204 0.4
205 0.38
206 0.35
207 0.28
208 0.22
209 0.18
210 0.15
211 0.15
212 0.14
213 0.11
214 0.11
215 0.09
216 0.09
217 0.09
218 0.09
219 0.08
220 0.09
221 0.11
222 0.16
223 0.18
224 0.2
225 0.21
226 0.23
227 0.22
228 0.23
229 0.28
230 0.28
231 0.3
232 0.33
233 0.32
234 0.32
235 0.32
236 0.35
237 0.37
238 0.4
239 0.41
240 0.45
241 0.46
242 0.51
243 0.52
244 0.51
245 0.46
246 0.39
247 0.34
248 0.25
249 0.22
250 0.16
251 0.14
252 0.11
253 0.07
254 0.05
255 0.04
256 0.1
257 0.11
258 0.12
259 0.12
260 0.12
261 0.13
262 0.14
263 0.14
264 0.11
265 0.12
266 0.15
267 0.16
268 0.16
269 0.16
270 0.15
271 0.14
272 0.11
273 0.11
274 0.09
275 0.08
276 0.08
277 0.1
278 0.11
279 0.11
280 0.14
281 0.17
282 0.22
283 0.22
284 0.25
285 0.25
286 0.25
287 0.29
288 0.3
289 0.28
290 0.24
291 0.27
292 0.32
293 0.32
294 0.32
295 0.28
296 0.26
297 0.25
298 0.22
299 0.21
300 0.13
301 0.12
302 0.15
303 0.16
304 0.15
305 0.15
306 0.16
307 0.21
308 0.25
309 0.26
310 0.23
311 0.22
312 0.28
313 0.32
314 0.29
315 0.24
316 0.2
317 0.2
318 0.23
319 0.24
320 0.19
321 0.15
322 0.16
323 0.16
324 0.15
325 0.14
326 0.1
327 0.07
328 0.06
329 0.06
330 0.05
331 0.04
332 0.05
333 0.06
334 0.06
335 0.06
336 0.07
337 0.06
338 0.07
339 0.08
340 0.07
341 0.06
342 0.08
343 0.08
344 0.07
345 0.07
346 0.06
347 0.06
348 0.06
349 0.06
350 0.06
351 0.05
352 0.07
353 0.09
354 0.09
355 0.09
356 0.09
357 0.09
358 0.1
359 0.14
360 0.17
361 0.17
362 0.18
363 0.2
364 0.21
365 0.2
366 0.21
367 0.21
368 0.22
369 0.29
370 0.28
371 0.27
372 0.29
373 0.31
374 0.31
375 0.33
376 0.37
377 0.34
378 0.39
379 0.39
380 0.38
381 0.37
382 0.36
383 0.3
384 0.22
385 0.17
386 0.13
387 0.12
388 0.1
389 0.11
390 0.12
391 0.11
392 0.09
393 0.08
394 0.07
395 0.07
396 0.09
397 0.08
398 0.15
399 0.23
400 0.26
401 0.28
402 0.32
403 0.33
404 0.35
405 0.42
406 0.44
407 0.46
408 0.51
409 0.51
410 0.5
411 0.55
412 0.51
413 0.47
414 0.39
415 0.29
416 0.22
417 0.21
418 0.18
419 0.15
420 0.15
421 0.15
422 0.18
423 0.23
424 0.26
425 0.3
426 0.35
427 0.43
428 0.52
429 0.59
430 0.64
431 0.7
432 0.76
433 0.81
434 0.84
435 0.86
436 0.84
437 0.86
438 0.82
439 0.81
440 0.79
441 0.74
442 0.67
443 0.6
444 0.51
445 0.46
446 0.4
447 0.32
448 0.26
449 0.21
450 0.2
451 0.18
452 0.17
453 0.12
454 0.13
455 0.13
456 0.14
457 0.16
458 0.18
459 0.18
460 0.19
461 0.19
462 0.21
463 0.28
464 0.32
465 0.32
466 0.3
467 0.31
468 0.31
469 0.33
470 0.34
471 0.28
472 0.26
473 0.31
474 0.33
475 0.33
476 0.36
477 0.36
478 0.34
479 0.34
480 0.34
481 0.28
482 0.29
483 0.29
484 0.26
485 0.24
486 0.22
487 0.21
488 0.17
489 0.16
490 0.13
491 0.12
492 0.11
493 0.11
494 0.11
495 0.11
496 0.1
497 0.11
498 0.12
499 0.12
500 0.11
501 0.1
502 0.11
503 0.11
504 0.1
505 0.1
506 0.09
507 0.09
508 0.1
509 0.13
510 0.17
511 0.2
512 0.24
513 0.26
514 0.31
515 0.33
516 0.35
517 0.35
518 0.31
519 0.33
520 0.33
521 0.31
522 0.33
523 0.36
524 0.4
525 0.46
526 0.49
527 0.47
528 0.45
529 0.45
530 0.44
531 0.49
532 0.48
533 0.47
534 0.49
535 0.49
536 0.48
537 0.46
538 0.39
539 0.33
540 0.28
541 0.25
542 0.26
543 0.24
544 0.23
545 0.23
546 0.25
547 0.26
548 0.25
549 0.2
550 0.17
551 0.16
552 0.16
553 0.16
554 0.14
555 0.11
556 0.11
557 0.11
558 0.08
559 0.08
560 0.09
561 0.1
562 0.12
563 0.14
564 0.22
565 0.23
566 0.25
567 0.28
568 0.33
569 0.36
570 0.37
571 0.35
572 0.27
573 0.3
574 0.27
575 0.24
576 0.18
577 0.14
578 0.11
579 0.11
580 0.12
581 0.07
582 0.08
583 0.09
584 0.13
585 0.14
586 0.14
587 0.14
588 0.13
589 0.15
590 0.15
591 0.15
592 0.11
593 0.13
594 0.12
595 0.12
596 0.12
597 0.1
598 0.09
599 0.09
600 0.08
601 0.06
602 0.08
603 0.08
604 0.09
605 0.09
606 0.12
607 0.12
608 0.13
609 0.18
610 0.18
611 0.22
612 0.21
613 0.23
614 0.21
615 0.22
616 0.22
617 0.18
618 0.2
619 0.17
620 0.18
621 0.16
622 0.16
623 0.15
624 0.18
625 0.18
626 0.15
627 0.18
628 0.2
629 0.2
630 0.22
631 0.25
632 0.27
633 0.28
634 0.28
635 0.26
636 0.24
637 0.25
638 0.25
639 0.28
640 0.24
641 0.29
642 0.28
643 0.28
644 0.28
645 0.25
646 0.24
647 0.2
648 0.26
649 0.22
650 0.25
651 0.26
652 0.3
653 0.29
654 0.29
655 0.34
656 0.32
657 0.36
658 0.35
659 0.38
660 0.39
661 0.43
662 0.46
663 0.43
664 0.4
665 0.35
666 0.34
667 0.35
668 0.32
669 0.29
670 0.27
671 0.26
672 0.21
673 0.2
674 0.18
675 0.12
676 0.1
677 0.12
678 0.12
679 0.11
680 0.11
681 0.12
682 0.12
683 0.12
684 0.14
685 0.16
686 0.15
687 0.19
688 0.2
689 0.23
690 0.23
691 0.24
692 0.21
693 0.19
694 0.17
695 0.15
696 0.15
697 0.15
698 0.16
699 0.16
700 0.19
701 0.21
702 0.23
703 0.24
704 0.26
705 0.25
706 0.28
707 0.3
708 0.27
709 0.26
710 0.27
711 0.27
712 0.29
713 0.27
714 0.27
715 0.28
716 0.34
717 0.34
718 0.37
719 0.35
720 0.34
721 0.38
722 0.39
723 0.38
724 0.34
725 0.35
726 0.33
727 0.32
728 0.3
729 0.25
730 0.22
731 0.18
732 0.15
733 0.12
734 0.09
735 0.09
736 0.08
737 0.08
738 0.1
739 0.11
740 0.12
741 0.11
742 0.11
743 0.14
744 0.13
745 0.16
746 0.15