Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1C1C6Q4

Protein Details
Accession A0A1C1C6Q4    Localization Confidence High Confidence Score 15.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
96-115LVHFWGTRTNRRKARKWIAVHydrophilic
415-437EERLRQLDKMKKEERDRKMKGMSBasic
439-464EEQRKFLDRENEKQRKKNEKKMTRRGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
402-464KSKLKKISDKEAEEERLRQLDKMKKEERDRKMKGMSAEEQRKFLDRENEKQRKKNEKKMTRRG
Subcellular Location(s) cyto 13, cyto_nucl 11.5, nucl 8, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012879  CCDC47  
Gene Ontology GO:0005783  C:endoplasmic reticulum  
GO:0016020  C:membrane  
GO:0005509  F:calcium ion binding  
GO:0032469  P:endoplasmic reticulum calcium ion homeostasis  
Pfam View protein in Pfam  
PF07946  CCDC47  
Amino Acid Sequences MDYFKSLVGGKPSQAPIVAEDADFADFAAAPPPSPVSIPGSPADAQAASATGANLAAGDLPRKMIYTKWYRVWERTQLSDFTMEAILIPFILLAMLVHFWGTRTNRRKARKWIAVHEPLLEREFALVGYASAPQETTEAASSPVDASLFKEVVKKSGNGVSEDLLKEKSAWEFETYATGRQNVAFADIKISLKRRMNPLVLIAEELTGLFIESVKPKPERVEAVIYTFDGKEKDFVPPPVPGSEETGKQKGVGNSSYDPFVFAVVNKLAMRRLRDERYDLSLTFTKDNAKLPEWTTVMSESAEISEWLLTKDLVDAVKEAGPDHFQYLIITDQPHDKPTNLNETAQKKRLHLALNLPSSEEHYLHTLPLFALFLRLPDFLVSNAKLRPEVLRKINAIRDQEKSKLKKISDKEAEEERLRQLDKMKKEERDRKMKGMSAEEQRKFLDRENEKQRKKNEKKMTRRG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.3
3 0.25
4 0.27
5 0.26
6 0.18
7 0.17
8 0.17
9 0.16
10 0.15
11 0.12
12 0.08
13 0.07
14 0.07
15 0.11
16 0.1
17 0.09
18 0.11
19 0.12
20 0.13
21 0.13
22 0.15
23 0.18
24 0.19
25 0.22
26 0.22
27 0.25
28 0.24
29 0.24
30 0.24
31 0.17
32 0.16
33 0.13
34 0.13
35 0.09
36 0.09
37 0.09
38 0.07
39 0.07
40 0.06
41 0.06
42 0.05
43 0.06
44 0.06
45 0.08
46 0.08
47 0.1
48 0.1
49 0.12
50 0.12
51 0.14
52 0.22
53 0.3
54 0.37
55 0.43
56 0.51
57 0.55
58 0.6
59 0.65
60 0.66
61 0.61
62 0.6
63 0.56
64 0.49
65 0.46
66 0.42
67 0.34
68 0.26
69 0.22
70 0.15
71 0.12
72 0.11
73 0.09
74 0.07
75 0.06
76 0.04
77 0.04
78 0.04
79 0.03
80 0.02
81 0.03
82 0.04
83 0.04
84 0.04
85 0.04
86 0.05
87 0.11
88 0.16
89 0.25
90 0.33
91 0.42
92 0.51
93 0.6
94 0.69
95 0.74
96 0.8
97 0.8
98 0.79
99 0.78
100 0.79
101 0.78
102 0.71
103 0.64
104 0.55
105 0.47
106 0.41
107 0.33
108 0.23
109 0.15
110 0.14
111 0.1
112 0.08
113 0.06
114 0.05
115 0.06
116 0.07
117 0.07
118 0.07
119 0.07
120 0.06
121 0.07
122 0.07
123 0.07
124 0.07
125 0.07
126 0.08
127 0.08
128 0.08
129 0.08
130 0.08
131 0.07
132 0.07
133 0.08
134 0.1
135 0.1
136 0.11
137 0.15
138 0.15
139 0.2
140 0.22
141 0.21
142 0.21
143 0.25
144 0.26
145 0.22
146 0.23
147 0.2
148 0.22
149 0.21
150 0.2
151 0.16
152 0.15
153 0.13
154 0.13
155 0.13
156 0.11
157 0.12
158 0.12
159 0.13
160 0.13
161 0.19
162 0.18
163 0.19
164 0.19
165 0.18
166 0.17
167 0.16
168 0.17
169 0.1
170 0.13
171 0.12
172 0.11
173 0.12
174 0.13
175 0.14
176 0.16
177 0.19
178 0.22
179 0.25
180 0.28
181 0.32
182 0.36
183 0.37
184 0.35
185 0.36
186 0.31
187 0.27
188 0.24
189 0.18
190 0.13
191 0.1
192 0.09
193 0.06
194 0.04
195 0.04
196 0.03
197 0.03
198 0.04
199 0.07
200 0.08
201 0.12
202 0.13
203 0.14
204 0.16
205 0.19
206 0.2
207 0.21
208 0.25
209 0.22
210 0.23
211 0.22
212 0.2
213 0.19
214 0.16
215 0.14
216 0.09
217 0.09
218 0.08
219 0.09
220 0.12
221 0.13
222 0.14
223 0.15
224 0.16
225 0.17
226 0.17
227 0.17
228 0.15
229 0.17
230 0.18
231 0.19
232 0.21
233 0.22
234 0.21
235 0.21
236 0.23
237 0.2
238 0.21
239 0.19
240 0.2
241 0.2
242 0.2
243 0.2
244 0.17
245 0.16
246 0.13
247 0.12
248 0.09
249 0.07
250 0.09
251 0.08
252 0.11
253 0.1
254 0.11
255 0.13
256 0.15
257 0.18
258 0.21
259 0.27
260 0.29
261 0.32
262 0.35
263 0.35
264 0.38
265 0.38
266 0.33
267 0.31
268 0.3
269 0.29
270 0.26
271 0.24
272 0.21
273 0.21
274 0.25
275 0.23
276 0.22
277 0.23
278 0.23
279 0.28
280 0.25
281 0.24
282 0.21
283 0.19
284 0.17
285 0.15
286 0.13
287 0.08
288 0.08
289 0.08
290 0.06
291 0.06
292 0.06
293 0.06
294 0.07
295 0.07
296 0.07
297 0.06
298 0.07
299 0.09
300 0.08
301 0.08
302 0.08
303 0.09
304 0.11
305 0.11
306 0.1
307 0.1
308 0.11
309 0.11
310 0.12
311 0.11
312 0.1
313 0.1
314 0.11
315 0.11
316 0.11
317 0.11
318 0.1
319 0.16
320 0.17
321 0.21
322 0.21
323 0.2
324 0.23
325 0.27
326 0.35
327 0.3
328 0.33
329 0.36
330 0.43
331 0.5
332 0.52
333 0.51
334 0.43
335 0.46
336 0.48
337 0.45
338 0.41
339 0.42
340 0.44
341 0.46
342 0.45
343 0.41
344 0.36
345 0.35
346 0.33
347 0.24
348 0.17
349 0.16
350 0.16
351 0.16
352 0.16
353 0.14
354 0.12
355 0.12
356 0.11
357 0.08
358 0.09
359 0.09
360 0.1
361 0.11
362 0.11
363 0.11
364 0.11
365 0.12
366 0.11
367 0.16
368 0.17
369 0.18
370 0.2
371 0.21
372 0.21
373 0.21
374 0.27
375 0.29
376 0.36
377 0.39
378 0.44
379 0.46
380 0.52
381 0.58
382 0.57
383 0.57
384 0.53
385 0.52
386 0.51
387 0.56
388 0.59
389 0.58
390 0.59
391 0.6
392 0.6
393 0.63
394 0.64
395 0.67
396 0.67
397 0.66
398 0.63
399 0.63
400 0.65
401 0.59
402 0.56
403 0.49
404 0.46
405 0.42
406 0.39
407 0.4
408 0.42
409 0.47
410 0.54
411 0.58
412 0.61
413 0.71
414 0.79
415 0.8
416 0.83
417 0.81
418 0.8
419 0.79
420 0.75
421 0.7
422 0.67
423 0.65
424 0.64
425 0.68
426 0.62
427 0.58
428 0.55
429 0.54
430 0.49
431 0.48
432 0.48
433 0.44
434 0.52
435 0.6
436 0.69
437 0.73
438 0.79
439 0.82
440 0.83
441 0.87
442 0.88
443 0.88
444 0.88