FuNGI

A0A1C1CNS3

Protein Details

Accession

A0A1C1CNS3

Localization Confidence

High

Confidence Score

17.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
608-629	GVRKLGALRKRKQQPHGDDDTS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
341-373	PKPSKIGGLGKRDATKAFGASKSSAKASPPVKR
448-457	KPKPRGPNKK
604-619	ARKAGVRKLGALRKRK
664-711	SGSRSKRRASSAEPSPPKETAEEAASRRRMQLKRTIEAGAVGKKKRRF

Subcellular Location(s)

nucl 22.5, cyto_nucl 14, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR015381 XLF_N IPR038051 XRCC4-like_N_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0006302 P:double-strand break repair
Pfam	View protein in Pfam PF09302 XLF
CDD	cd22285 HD_XLF_N

Amino Acid Sequences

MSEPGREGWRELQTSSRRQCPKLFYQFSTTRESLTLLVTDLISIWETSLDSYDIKAAAARQHTTIDPSASARQFEVLLSKLRQSLSDGANTITRGSEKSSQTLHLRTTIDLPHPLKPLDWTFTLEPQTSSELAERILRPSLHEVAVSQSKINSLLSIVREKDHVISKLLDRIGNSAVDLSLVFPGIAGLASRKGSHVSVADAKKRVPGMAEFDEEGWIKQFANDDGYEGADRTGLSNLVRGCEKCFVHSKSEHENWVKDLPTTYAMQRGAKEGAQPKSPPVTSAKMKSGADDESTDDEFERQPTPPHLKATSPAAKRVTRPAVTTDDEETQGEESTLPKSPKPSKIGGLGKRDATKAFGASKSSAKASPPVKRTASPVRRGSPASTEPDTATATATATATATATATATATATATATASEDEDEDVDLDDEDIRLPSQRGTKSPQSAQKPKPRGPNKKTATTRSPSATPSPSLSPSPLPTRSHPKHSSPASLPRGKKEDDEAETETETETETEDDDEGENKDKANDRDQTPSSSGSPAPRPKSLKSPTPATARPSHRLGRLGARKTVTTPEPTPDLAAAAASASASASDKEEPAPSSQRDKAQTARKAGVRKLGALRKRKQQPHGDDDTSSPPMTRPDADADADADSDTRASQPPRHAGPSRSTSGSRSKRRASSAEPSPPKETAEEAASRRRMQLKRTIEAGAVGKKKRRF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.54
2	0.58
3	0.6
4	0.6
5	0.63
6	0.69
7	0.68
8	0.7
9	0.71
10	0.71
11	0.65
12	0.67
13	0.69
14	0.66
15	0.66
16	0.56
17	0.46
18	0.4
19	0.38
20	0.3
21	0.25
22	0.22
23	0.15
24	0.15
25	0.13
26	0.12
27	0.1
28	0.1
29	0.09
30	0.08
31	0.07
32	0.07
33	0.07
34	0.08
35	0.09
36	0.1
37	0.09
38	0.1
39	0.12
40	0.12
41	0.11
42	0.12
43	0.13
44	0.18
45	0.22
46	0.23
47	0.23
48	0.25
49	0.26
50	0.29
51	0.29
52	0.26
53	0.22
54	0.24
55	0.3
56	0.29
57	0.29
58	0.25
59	0.24
60	0.22
61	0.21
62	0.21
63	0.17
64	0.21
65	0.21
66	0.23
67	0.25
68	0.25
69	0.26
70	0.26
71	0.31
72	0.28
73	0.31
74	0.29
75	0.27
76	0.29
77	0.28
78	0.24
79	0.19
80	0.17
81	0.14
82	0.18
83	0.24
84	0.24
85	0.28
86	0.3
87	0.34
88	0.39
89	0.41
90	0.39
91	0.37
92	0.36
93	0.33
94	0.34
95	0.33
96	0.31
97	0.35
98	0.36
99	0.35
100	0.37
101	0.36
102	0.32
103	0.33
104	0.33
105	0.29
106	0.28
107	0.28
108	0.27
109	0.32
110	0.34
111	0.31
112	0.27
113	0.25
114	0.27
115	0.23
116	0.22
117	0.18
118	0.15
119	0.15
120	0.2
121	0.19
122	0.18
123	0.22
124	0.2
125	0.22
126	0.26
127	0.28
128	0.24
129	0.23
130	0.21
131	0.23
132	0.28
133	0.25
134	0.21
135	0.18
136	0.18
137	0.19
138	0.19
139	0.13
140	0.1
141	0.13
142	0.15
143	0.2
144	0.2
145	0.2
146	0.21
147	0.22
148	0.25
149	0.27
150	0.25
151	0.23
152	0.24
153	0.25
154	0.3
155	0.31
156	0.28
157	0.23
158	0.24
159	0.23
160	0.2
161	0.19
162	0.13
163	0.11
164	0.1
165	0.09
166	0.07
167	0.06
168	0.06
169	0.05
170	0.05
171	0.05
172	0.04
173	0.04
174	0.04
175	0.05
176	0.07
177	0.08
178	0.08
179	0.09
180	0.11
181	0.11
182	0.14
183	0.13
184	0.15
185	0.22
186	0.27
187	0.32
188	0.32
189	0.32
190	0.34
191	0.33
192	0.3
193	0.24
194	0.21
195	0.22
196	0.23
197	0.25
198	0.22
199	0.22
200	0.23
201	0.21
202	0.19
203	0.14
204	0.11
205	0.09
206	0.1
207	0.11
208	0.1
209	0.13
210	0.12
211	0.12
212	0.12
213	0.13
214	0.12
215	0.11
216	0.1
217	0.07
218	0.07
219	0.07
220	0.08
221	0.08
222	0.07
223	0.11
224	0.11
225	0.12
226	0.14
227	0.14
228	0.15
229	0.21
230	0.21
231	0.21
232	0.29
233	0.3
234	0.34
235	0.36
236	0.39
237	0.41
238	0.44
239	0.48
240	0.43
241	0.41
242	0.38
243	0.38
244	0.34
245	0.26
246	0.24
247	0.18
248	0.17
249	0.18
250	0.15
251	0.17
252	0.18
253	0.2
254	0.19
255	0.2
256	0.2
257	0.19
258	0.24
259	0.25
260	0.26
261	0.28
262	0.28
263	0.27
264	0.31
265	0.3
266	0.27
267	0.24
268	0.27
269	0.28
270	0.31
271	0.32
272	0.32
273	0.32
274	0.32
275	0.29
276	0.25
277	0.22
278	0.19
279	0.17
280	0.15
281	0.15
282	0.15
283	0.13
284	0.12
285	0.11
286	0.12
287	0.12
288	0.1
289	0.11
290	0.16
291	0.23
292	0.24
293	0.28
294	0.27
295	0.27
296	0.28
297	0.34
298	0.37
299	0.32
300	0.35
301	0.36
302	0.37
303	0.37
304	0.43
305	0.41
306	0.35
307	0.34
308	0.33
309	0.33
310	0.32
311	0.32
312	0.27
313	0.22
314	0.21
315	0.2
316	0.17
317	0.13
318	0.11
319	0.09
320	0.07
321	0.06
322	0.07
323	0.11
324	0.12
325	0.12
326	0.18
327	0.24
328	0.3
329	0.34
330	0.35
331	0.34
332	0.42
333	0.49
334	0.49
335	0.49
336	0.45
337	0.43
338	0.42
339	0.4
340	0.32
341	0.26
342	0.2
343	0.16
344	0.16
345	0.15
346	0.15
347	0.16
348	0.17
349	0.16
350	0.17
351	0.16
352	0.14
353	0.19
354	0.23
355	0.28
356	0.3
357	0.34
358	0.35
359	0.35
360	0.4
361	0.45
362	0.47
363	0.48
364	0.51
365	0.48
366	0.49
367	0.49
368	0.45
369	0.4
370	0.35
371	0.32
372	0.28
373	0.26
374	0.23
375	0.23
376	0.22
377	0.17
378	0.14
379	0.09
380	0.08
381	0.07
382	0.07
383	0.05
384	0.05
385	0.05
386	0.04
387	0.04
388	0.04
389	0.04
390	0.04
391	0.04
392	0.04
393	0.04
394	0.04
395	0.04
396	0.04
397	0.04
398	0.04
399	0.04
400	0.04
401	0.04
402	0.04
403	0.04
404	0.04
405	0.05
406	0.05
407	0.05
408	0.05
409	0.05
410	0.05
411	0.05
412	0.05
413	0.05
414	0.05
415	0.04
416	0.04
417	0.05
418	0.05
419	0.05
420	0.06
421	0.06
422	0.09
423	0.15
424	0.17
425	0.2
426	0.26
427	0.33
428	0.37
429	0.43
430	0.48
431	0.51
432	0.59
433	0.65
434	0.68
435	0.7
436	0.7
437	0.75
438	0.78
439	0.8
440	0.77
441	0.79
442	0.74
443	0.76
444	0.77
445	0.73
446	0.71
447	0.64
448	0.61
449	0.54
450	0.5
451	0.43
452	0.41
453	0.36
454	0.3
455	0.28
456	0.27
457	0.26
458	0.24
459	0.24
460	0.21
461	0.22
462	0.26
463	0.28
464	0.29
465	0.31
466	0.41
467	0.43
468	0.51
469	0.53
470	0.52
471	0.56
472	0.56
473	0.58
474	0.52
475	0.58
476	0.57
477	0.6
478	0.56
479	0.54
480	0.55
481	0.5
482	0.47
483	0.42
484	0.41
485	0.36
486	0.38
487	0.35
488	0.32
489	0.31
490	0.29
491	0.23
492	0.16
493	0.14
494	0.09
495	0.07
496	0.06
497	0.06
498	0.07
499	0.07
500	0.07
501	0.07
502	0.09
503	0.1
504	0.12
505	0.12
506	0.12
507	0.15
508	0.2
509	0.23
510	0.28
511	0.33
512	0.33
513	0.4
514	0.42
515	0.43
516	0.39
517	0.39
518	0.34
519	0.3
520	0.29
521	0.26
522	0.33
523	0.37
524	0.39
525	0.43
526	0.46
527	0.47
528	0.55
529	0.56
530	0.56
531	0.54
532	0.56
533	0.55
534	0.59
535	0.59
536	0.54
537	0.57
538	0.55
539	0.54
540	0.54
541	0.53
542	0.49
543	0.49
544	0.46
545	0.48
546	0.51
547	0.5
548	0.5
549	0.46
550	0.43
551	0.42
552	0.45
553	0.38
554	0.35
555	0.32
556	0.31
557	0.32
558	0.31
559	0.3
560	0.24
561	0.22
562	0.15
563	0.13
564	0.1
565	0.06
566	0.06
567	0.04
568	0.04
569	0.03
570	0.04
571	0.05
572	0.05
573	0.08
574	0.09
575	0.1
576	0.12
577	0.14
578	0.15
579	0.19
580	0.25
581	0.27
582	0.33
583	0.36
584	0.42
585	0.44
586	0.47
587	0.5
588	0.54
589	0.57
590	0.57
591	0.59
592	0.57
593	0.59
594	0.58
595	0.59
596	0.51
597	0.5
598	0.53
599	0.55
600	0.58
601	0.61
602	0.65
603	0.67
604	0.75
605	0.78
606	0.78
607	0.8
608	0.81
609	0.8
610	0.82
611	0.74
612	0.66
613	0.6
614	0.57
615	0.49
616	0.4
617	0.32
618	0.24
619	0.25
620	0.26
621	0.24
622	0.22
623	0.24
624	0.27
625	0.28
626	0.27
627	0.25
628	0.22
629	0.21
630	0.18
631	0.12
632	0.09
633	0.08
634	0.08
635	0.09
636	0.13
637	0.17
638	0.22
639	0.3
640	0.38
641	0.43
642	0.5
643	0.54
644	0.53
645	0.58
646	0.59
647	0.56
648	0.53
649	0.49
650	0.47
651	0.52
652	0.58
653	0.6
654	0.62
655	0.65
656	0.68
657	0.73
658	0.75
659	0.71
660	0.7
661	0.7
662	0.72
663	0.72
664	0.7
665	0.68
666	0.62
667	0.57
668	0.49
669	0.42
670	0.34
671	0.32
672	0.33
673	0.32
674	0.4
675	0.44
676	0.44
677	0.47
678	0.53
679	0.52
680	0.53
681	0.59
682	0.58
683	0.58
684	0.6
685	0.56
686	0.47
687	0.48
688	0.47
689	0.45
690	0.45
691	0.45

A0A1C1CNS3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer