Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1G001

Protein Details
Accession C1G001    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
603-624AFSPSKRRSKKLTIDLHPNRLDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
376-377RR
Subcellular Location(s) nucl 14, cyto_nucl 11, cyto 6, mito 2, plas 1, pero 1, golg 1, cysk 1, vacu 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019313  Mediator_Med17  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG pbn:PADG_00191  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF10156  Med17  
Amino Acid Sequences MAESFTLPLRPLSQKPLDESDSLPIRIAQINAQRGSFRNVTEQSLQEEIEARRAAEETGQELDGVESQEAKPTDRLKHVFKSRAQIVDFAMQAHAEANYALDFVSLLLSKYTPRQAEISMSPYLKQSAPLGSLETDVVKVPEKTAAAQKEIDNLSRGWKLESFDAAASKLLQSATRLEEEVAAETKYWAGILDIKEKGWKVCRLPRERQTLGVQFGFLEATPSFRDRGLAALRQGDGGQLTLDRGLQTSKPRSLRVRVHQDNQIVGASKLIRLVLSPDDPIECRIRLARDALYEEELFHEINREARTLLQHGVESKQNLIQFQANESQQILIDMVGLEDGILDLDQQEHVEDALAETVAQSLRLLLSHAHRLKYRRRTRIPPPVTEKRRPDPEYSLLKPTVGYLQHKSALRWLKSFLDSTTKTLQLAGLKCKYDTAPLVSVQLPPISSGAGAAFESDNPPFVERLVDSFLSPLESIITGTFLSPASSFKIRVTTSTNANALGTEFEIATNITSAPRSNSKSSRTGLRSDLQQIILHLFTIDLVFLIPHLAGTSESFPSTLTQPINHSQPPKDSKDDFNPPTPLPESYLTSWEPIFPENGELAAFSPSKRRSKKLTIDLHPNRLDVQCHWLDGPDTDSDYALFDGAVDVTAKLKGPPKGLIAHSWRVDANDAGGFDLQGGEKMLQDVLRDMSRGEIKEEL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.47
3 0.52
4 0.5
5 0.46
6 0.44
7 0.44
8 0.42
9 0.39
10 0.34
11 0.28
12 0.27
13 0.28
14 0.27
15 0.26
16 0.28
17 0.35
18 0.36
19 0.37
20 0.37
21 0.36
22 0.42
23 0.38
24 0.32
25 0.33
26 0.34
27 0.38
28 0.39
29 0.39
30 0.36
31 0.36
32 0.34
33 0.26
34 0.3
35 0.25
36 0.27
37 0.26
38 0.22
39 0.21
40 0.22
41 0.21
42 0.19
43 0.2
44 0.16
45 0.17
46 0.17
47 0.16
48 0.16
49 0.16
50 0.14
51 0.14
52 0.11
53 0.11
54 0.11
55 0.17
56 0.18
57 0.19
58 0.23
59 0.27
60 0.33
61 0.4
62 0.46
63 0.47
64 0.56
65 0.63
66 0.65
67 0.64
68 0.67
69 0.65
70 0.66
71 0.61
72 0.53
73 0.47
74 0.44
75 0.39
76 0.31
77 0.25
78 0.18
79 0.17
80 0.15
81 0.12
82 0.07
83 0.07
84 0.06
85 0.06
86 0.06
87 0.06
88 0.05
89 0.05
90 0.05
91 0.07
92 0.06
93 0.07
94 0.07
95 0.08
96 0.1
97 0.14
98 0.21
99 0.2
100 0.22
101 0.24
102 0.25
103 0.3
104 0.31
105 0.3
106 0.29
107 0.28
108 0.27
109 0.26
110 0.27
111 0.22
112 0.21
113 0.19
114 0.17
115 0.19
116 0.19
117 0.19
118 0.17
119 0.18
120 0.16
121 0.15
122 0.12
123 0.11
124 0.11
125 0.12
126 0.12
127 0.12
128 0.14
129 0.15
130 0.16
131 0.23
132 0.25
133 0.25
134 0.28
135 0.28
136 0.31
137 0.32
138 0.31
139 0.26
140 0.23
141 0.25
142 0.25
143 0.25
144 0.21
145 0.21
146 0.22
147 0.22
148 0.23
149 0.21
150 0.19
151 0.19
152 0.17
153 0.16
154 0.14
155 0.12
156 0.12
157 0.1
158 0.1
159 0.1
160 0.13
161 0.15
162 0.16
163 0.16
164 0.15
165 0.16
166 0.16
167 0.16
168 0.14
169 0.12
170 0.11
171 0.1
172 0.1
173 0.08
174 0.08
175 0.06
176 0.05
177 0.1
178 0.12
179 0.18
180 0.19
181 0.19
182 0.22
183 0.23
184 0.26
185 0.27
186 0.31
187 0.31
188 0.38
189 0.48
190 0.53
191 0.61
192 0.66
193 0.69
194 0.65
195 0.63
196 0.62
197 0.57
198 0.53
199 0.44
200 0.36
201 0.26
202 0.25
203 0.2
204 0.14
205 0.11
206 0.07
207 0.09
208 0.1
209 0.11
210 0.12
211 0.11
212 0.13
213 0.1
214 0.15
215 0.17
216 0.19
217 0.2
218 0.21
219 0.21
220 0.21
221 0.21
222 0.16
223 0.12
224 0.1
225 0.08
226 0.06
227 0.06
228 0.06
229 0.06
230 0.06
231 0.06
232 0.07
233 0.1
234 0.17
235 0.22
236 0.28
237 0.31
238 0.36
239 0.4
240 0.47
241 0.53
242 0.55
243 0.61
244 0.6
245 0.62
246 0.63
247 0.6
248 0.52
249 0.44
250 0.36
251 0.26
252 0.2
253 0.18
254 0.12
255 0.11
256 0.11
257 0.1
258 0.08
259 0.07
260 0.1
261 0.1
262 0.11
263 0.11
264 0.1
265 0.11
266 0.12
267 0.14
268 0.15
269 0.12
270 0.12
271 0.14
272 0.15
273 0.15
274 0.17
275 0.17
276 0.16
277 0.18
278 0.18
279 0.19
280 0.17
281 0.16
282 0.15
283 0.14
284 0.12
285 0.09
286 0.1
287 0.08
288 0.12
289 0.12
290 0.11
291 0.11
292 0.12
293 0.14
294 0.14
295 0.15
296 0.13
297 0.12
298 0.13
299 0.15
300 0.16
301 0.15
302 0.13
303 0.15
304 0.14
305 0.14
306 0.14
307 0.15
308 0.13
309 0.15
310 0.19
311 0.16
312 0.16
313 0.16
314 0.14
315 0.11
316 0.12
317 0.09
318 0.05
319 0.05
320 0.04
321 0.04
322 0.03
323 0.03
324 0.03
325 0.02
326 0.02
327 0.02
328 0.02
329 0.02
330 0.02
331 0.03
332 0.03
333 0.03
334 0.03
335 0.03
336 0.03
337 0.03
338 0.03
339 0.03
340 0.03
341 0.03
342 0.03
343 0.03
344 0.04
345 0.04
346 0.04
347 0.03
348 0.03
349 0.04
350 0.04
351 0.05
352 0.06
353 0.08
354 0.16
355 0.19
356 0.21
357 0.24
358 0.29
359 0.38
360 0.47
361 0.54
362 0.56
363 0.61
364 0.67
365 0.74
366 0.8
367 0.76
368 0.73
369 0.73
370 0.73
371 0.74
372 0.74
373 0.7
374 0.66
375 0.7
376 0.65
377 0.6
378 0.55
379 0.55
380 0.55
381 0.51
382 0.49
383 0.4
384 0.37
385 0.32
386 0.27
387 0.24
388 0.19
389 0.2
390 0.18
391 0.2
392 0.25
393 0.26
394 0.25
395 0.28
396 0.33
397 0.32
398 0.3
399 0.3
400 0.29
401 0.29
402 0.3
403 0.24
404 0.24
405 0.24
406 0.27
407 0.28
408 0.25
409 0.23
410 0.23
411 0.23
412 0.21
413 0.22
414 0.25
415 0.25
416 0.25
417 0.25
418 0.26
419 0.24
420 0.22
421 0.21
422 0.18
423 0.17
424 0.17
425 0.19
426 0.19
427 0.19
428 0.17
429 0.16
430 0.12
431 0.1
432 0.1
433 0.08
434 0.07
435 0.06
436 0.06
437 0.06
438 0.05
439 0.06
440 0.06
441 0.06
442 0.07
443 0.07
444 0.08
445 0.08
446 0.09
447 0.08
448 0.08
449 0.1
450 0.09
451 0.11
452 0.13
453 0.13
454 0.12
455 0.12
456 0.12
457 0.12
458 0.11
459 0.09
460 0.07
461 0.06
462 0.07
463 0.06
464 0.07
465 0.06
466 0.06
467 0.07
468 0.06
469 0.07
470 0.07
471 0.08
472 0.11
473 0.12
474 0.13
475 0.14
476 0.19
477 0.19
478 0.21
479 0.26
480 0.25
481 0.28
482 0.31
483 0.31
484 0.26
485 0.26
486 0.23
487 0.18
488 0.15
489 0.11
490 0.07
491 0.07
492 0.06
493 0.06
494 0.06
495 0.06
496 0.06
497 0.06
498 0.06
499 0.07
500 0.07
501 0.11
502 0.17
503 0.21
504 0.27
505 0.33
506 0.37
507 0.43
508 0.45
509 0.51
510 0.48
511 0.47
512 0.45
513 0.43
514 0.43
515 0.41
516 0.42
517 0.34
518 0.32
519 0.28
520 0.26
521 0.22
522 0.18
523 0.13
524 0.09
525 0.08
526 0.07
527 0.06
528 0.04
529 0.04
530 0.04
531 0.04
532 0.04
533 0.04
534 0.04
535 0.04
536 0.04
537 0.05
538 0.07
539 0.09
540 0.1
541 0.1
542 0.1
543 0.11
544 0.12
545 0.13
546 0.16
547 0.15
548 0.16
549 0.21
550 0.25
551 0.3
552 0.33
553 0.36
554 0.34
555 0.42
556 0.47
557 0.48
558 0.51
559 0.49
560 0.51
561 0.56
562 0.63
563 0.58
564 0.57
565 0.56
566 0.5
567 0.51
568 0.46
569 0.38
570 0.32
571 0.31
572 0.29
573 0.26
574 0.3
575 0.26
576 0.26
577 0.25
578 0.22
579 0.21
580 0.18
581 0.17
582 0.13
583 0.15
584 0.13
585 0.13
586 0.11
587 0.1
588 0.1
589 0.12
590 0.12
591 0.11
592 0.19
593 0.26
594 0.36
595 0.42
596 0.47
597 0.52
598 0.63
599 0.72
600 0.74
601 0.77
602 0.75
603 0.81
604 0.83
605 0.83
606 0.74
607 0.65
608 0.58
609 0.5
610 0.45
611 0.35
612 0.35
613 0.27
614 0.27
615 0.26
616 0.24
617 0.23
618 0.21
619 0.22
620 0.16
621 0.17
622 0.16
623 0.16
624 0.15
625 0.15
626 0.14
627 0.11
628 0.09
629 0.07
630 0.07
631 0.07
632 0.07
633 0.06
634 0.06
635 0.07
636 0.09
637 0.1
638 0.13
639 0.19
640 0.23
641 0.26
642 0.3
643 0.33
644 0.38
645 0.4
646 0.45
647 0.46
648 0.49
649 0.47
650 0.46
651 0.42
652 0.38
653 0.38
654 0.29
655 0.25
656 0.19
657 0.18
658 0.17
659 0.16
660 0.14
661 0.12
662 0.13
663 0.11
664 0.09
665 0.1
666 0.09
667 0.1
668 0.11
669 0.13
670 0.12
671 0.13
672 0.15
673 0.17
674 0.18
675 0.18
676 0.17
677 0.22
678 0.26
679 0.27